<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927214.4	1	GGCCAGTCACATGGCCATACCTGGTTGCATAAGATGCTGAAAAATGTAAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122331	GGCCAGTCACATGGCCATACCTGGTTGCATAAGATGCTGAAAAATGTAAC	122380

BX927214.4	51	TTGTATTCAGCCAGCCATGTGCCCAGCTAAAATTTTTTATTCAGGAAGAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122381	TTGTATTCAGCCAGCCATGTGCCCAGCTAAAATTTTTTATTCAGGAAGAA	122430

BX927214.4	101	GAGGAAGACAGGTACTGGAAGATAACCAGCAATCTCTCCCACCCCCACGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122431	GAGGAAGACAGGTACTGGAAGATAACCAGCAATCTCTCCCACCCCCACGC	122480

BX927214.4	151	TTGTCTTTTTCAAACAGAAGCAGCCCAATCTGGCAAAAGTACCGATCCTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122481	TTGTCTTTTTCAAACAGAAGCAGCCCAATCTGGCAAAAGTACCGATCCTT	122530

BX927214.4	201	AGATCTGGAGACAAAACTCAACAACGGGCTTCTCTGACTTTTGTCAGACA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122531	AGATCTGGAGACAAAACTCAACAACGGGCTTCTCTGACTTTTGTCAGACA	122580

BX927214.4	251	TCTTGCACATCACATGTAGATAGAGCCAGAGACTGTAACGAATCATTGTC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122581	TCTTGCACATCACATGTAGATAGAGCCAGAGACTGTAACGAATCATTGTC	122630

BX927214.4	301	AGCGGGAAGAAGATACAAGCTTGGAGATATGCATCAGAATGACTACCCAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122631	AGCGGGAAGAAGATACAAGCTTGGAGATATGCATCAGAATGACTACCCAT	122680

BX927214.4	351	GCAAATTCTTGAATTTTCACCTGAGGGAGGTGTTGGAGGAATAAATTGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122681	GCAAATTCTTGAATTTTCACCTGAGGGAGGTGTTGGAGGAATAAATTGTT	122730

BX927214.4	401	CTACGGGACAAAATCAGGTGCAATATCAAAATTCCATGTACCCACTCTAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122731	CTACGGGACAAAATCAGGTGCAATATCAAAATTCCATGTACCCACTCTAG	122780

BX927214.4	451	TTGACTGAATACAGTGAAGCATTTCCAGTACAACAATATAGGAAAACTTC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122781	TTGACTGAATACAGTGAAGCATTTCCAGTACAACAATATAGGAAAACTTC	122830

BX927214.4	501	AAATAAAGGGGTATTCTCTAAATTCCACTAAATACATCATCTTTGGCCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122831	AAATAAAGGGGTATTCTCTAAATTCCACTAAATACATCATCTTTGGCCTG	122880

BX927214.4	551	AAACTATCTTGTTAAGCTACTTGTTGAGACTCTTCACTCTAGATATGCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122881	AAACTATCTTGTTAAGCTACTTGTTGAGACTCTTCACTCTAGATATGCTT	122930

BX927214.4	601	GGTGCTGCCTTTGCATTCAAGTCCTGTTTTCCAGACGAAATACAGACATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122931	GGTGCTGCCTTTGCATTCAAGTCCTGTTTTCCAGACGAAATACAGACATA	122980

BX927214.4	651	ATCCAATTGTAATTTCATCACCATGCATCTTGGATGCTGCAGTTAGCCTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	122981	ATCCAATTGTAATTTCATCACCATGCATCTTGGATGCTGCAGTTAGCCTA	123030

BX927214.4	701	AATGAAATAAAATATACTAATCATGAGTGACAGTGATTTTTTTAATCGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123031	AATGAAATAAAATATACTAATCATGAGTGACAGTGATTTTTTTAATCGTA	123080

BX927214.4	751	AAACGTATTATCAAGCTATTTATAAGTAAATTTCACATTACAAATAAGGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123081	AAACGTATTATCAAGCTATTTATAAGTAAATTTCACATTACAAATAAGGC	123130

BX927214.4	801	ATTAACTAAACCACTGCTTTACAGAAAATCACTTAATGACACTCTAGTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123131	ATTAACTAAACCACTGCTTTACAGAAAATCACTTAATGACACTCTAGTAT	123180

BX927214.4	851	TATATACTGTTTACAGATTAAAAACTTAAGTTTAAAAAGGTAATTTGTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123181	TATATACTGTTTACAGATTAAAAACTTAAGTTTAAAAAGGTAATTTGTTT	123230

BX927214.4	901	GAAGTCACATAGCTAGTAAACTACTAGTTATAACTTAATTAAGAGTACAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123231	GAAGTCACATAGCTAGTAAACTACTAGTTATAACTTAATTAAGAGTACAT	123280

BX927214.4	951	TGAATTAAGTTATAACTAGTAAAGGACTAAACTTCTAGACTTGAACTTCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123281	TGAATTAAGTTATAACTAGTAAAGGACTAAACTTCTAGACTTGAACTTCT	123330

BX927214.4	1001	GATGGTCTGACTTCAAAAATATCTTATTTTTAAAATTATAGCACGGAGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123331	GATGGTCTGACTTCAAAAATATCTTATTTTTAAAATTATAGCACGGAGCA	123380

BX927214.4	1051	CCTTGTATATCATGATATAGCTATATTACTTTGCAGGGTTTTTATGTCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123381	CCTTGTATATCATGATATAGCTATATTACTTTGCAGGGTTTTTATGTCTA	123430

BX927214.4	1101	AGTTATTTTCTCCTCCTGTTCCACTTCCACCCTCCCATTCACTCTCTTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123431	AGTTATTTTCTCCTCCTGTTCCACTTCCACCCTCCCATTCACTCTCTTCT	123480

BX927214.4	1151	CTCCTAGTAGACAAAGTCCTTACCTGTCTGCCAGTCCCCAACCCCATGCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123481	CTCCTAGTAGACAAAGTCCTTACCTGTCTGCCAGTCCCCAACCCCATGCA	123530

BX927214.4	1201	TGCAATTACCTCATGGAAGGACGGAAGGGGGGCAGGGAAGAGGGGACCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123531	TGCAATTACCTCATGGAAGGACGGAAGGGGGGCAGGGAAGAGGGGACCTC	123580

BX927214.4	1251	CTAGCCCACCACCTTCCAACACACCTCTGCAGAGCCCAGGCCCTTTCAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123581	CTAGCCCACCACCTTCCAACACACCTCTGCAGAGCCCAGGCCCTTTCAGG	123630

BX927214.4	1301	CACCCCAGTCACAGCCACACAAAGCTTCTAGCTACTGCTCAGCACACACT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123631	CACCCCAGTCACAGCCACACAAAGCTTCTAGCTACTGCTCAGCACACACT	123680

BX927214.4	1351	TACCACCTGGTTTCCCTGTGCTTCTCATTTGTAATTTTGGATTTTAGTCT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123681	TACCACCTGGTTTCCCTGTGCTTCTCATTTGTAATTTTGGATTTTAGTCT	123730

BX927214.4	1401	AGTTCAGACATTCCTTCAATTCACATTAAGCATCCATTTCCTCTCTGATA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123731	AGTTCAGACATTCCTTCAATTCACATTAAGCATCCATTTCCTCTCTGATA	123780

BX927214.4	1451	TTCTTGTCTCTGGTCCCTTTTTTGTCTTATCCATTTGGACATCTATTCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123781	TTCTTGTCTCTGGTCCCTTTTTTGTCTTATCCATTTGGACATCTATTCCT	123830

BX927214.4	1501	AAGCAAAACATTCTAAATTCTATTTTCATTATCTTACTCCTTAGCCCAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123831	AAGCAAAACATTCTAAATTCTATTTTCATTATCTTACTCCTTAGCCCAGA	123880

BX927214.4	1551	TCACCAGAAGCTCCCTACTATCAACACAAATTGGAAAATCTCTGGTGTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123881	TCACCAGAAGCTCCCTACTATCAACACAAATTGGAAAATCTCTGGTGTGA	123930

BX927214.4	1601	TTATGAGGAGACCATTCAGTATTTTCTTTGACACTATTAAACAACATTGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123931	TTATGAGGAGACCATTCAGTATTTTCTTTGACACTATTAAACAACATTGA	123980

BX927214.4	1651	GTTTGCCTAATGTCAGTACTAAAGGCCAGGTTGTAAAATAGTAAAACCTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	123981	GTTTGCCTAATGTCAGTACTAAAGGCCAGGTTGTAAAATAGTAAAACCTG	124030

BX927214.4	1701	CAGTGGTCTCTAAGGCAACTAGCTGTTTATTATAGTAGTTGGGGAAAGGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	124031	CAGTGGTCTCTAAGGCAACTAGCTGTTTATTATAGTAGTTGGGGAAAGGA	124080

BX927214.4	1751	AGATATAAAAAATCTTCTAAGGAACTTTATTATAGATCTGTTTACTTAAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	124081	AGATATAAAAAATCTTCTAAGGAACTTTATTATAGATCTGTTTACTTAAG	124130

BX927214.4	1801	TAAAGCATATACAGGAAGATGCGGGAATCATAATAAATGCTTATGAAGCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	124131	TAAAGCATATACAGGAAGATGCGGGAATCATAATAAATGCTTATGAAGCA	124180

BX927214.4	1851	AAACTAAATGCACCTGTACTACTACATCCAGATTCACATACAAACGACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	124181	AAACTAAATGCACCTGTACTACTACATCCAGATTCACATACAAACGACAA	124230

BX927214.4	1901	AGAGCTTATATCCAGACTGCATGTGTCTGTTTTTGCACTGCTATAAAGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	124231	AGAGCTTATATCCAGACTGCATGTGTCTGTTTTTGCACTGCTATAAAGAA	124280

BX927214.4	1951	ATACCTGAGACTGGGTAGTTCAGTTTATAAAGAAAAGAGGTTTAACTGGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927189.6	124281	ATACCTGAGACTGGGTAGTTCAGTTTATAAAGAAAAGAGGTTTAACTGGC	124330

Overview

Query
BX927214.4 - 113690 bps
Hit
BX927189.6 - 124330 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link