<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927141.7	1	GGCCGGGGGCGCAGGTCACTACCCCTCCACATCCCCCACGGACCGCCCGG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49650	GGCCGGGGGCGCAGGTCACTACCCCTCCACATCCCCCACGGACCGCCCGG	49699

BX927141.7	51	GTCTCCCCGAGTCTCTGGGTCCGAGATCCACGCCGAGGCAGCGGGACCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49700	GTCTCCCCGAGTCTCTGGGTCCGAGATCCACGCCGAGGCAGCGGGACCTG	49749

BX927141.7	101	GAGACCCTTGACCCGGGAGAGGCCCAGGAGCCGTTACCCGGTTTCATTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49750	GAGACCCTTGACCCGGGAGAGGCCCAGGAGCCGTTACCCGGTTTCATTTT	49799

BX927141.7	151	CAGCCAAAATCCCCGCAGGTTGGTCCTGGCGAGGGCGGGGCTCGGTGGGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49800	CAGCCAAAATCCCCGCAGGTTGGTCCTGGCGAGGGCGGGGCTCGGTGGGC	49849

BX927141.7	201	GGGGCTGGCCGCGGGGGCGGGGCCAGGGTCTCACACCCATCTAGAGGATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49850	GGGGCTGGCCGCGGGGGCGGGGCCAGGGTCTCACACCCATCTAGAGGATG	49899

BX927141.7	251	TCTGTCTGCGACGTGGGGTCGGACGGGCGCCTACTCCGCGGGTATCACCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49900	TCTGTCTGCGACGTGGGGTCGGACGGGCGCCTACTCCGCGGGTATCACCA	49949

BX927141.7	301	GCTTGCTTACGATGGCAAGGATTACATCGTCCTGAACGAGGACCTGTGCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	49950	GCTTGCTTACGATGGCAAGGATTACATCGTCCTGAACGAGGACCTGTGCT	49999

BX927141.7	351	CCTTGACAGCCGCAGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCTCAAGTGGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50000	CCTTGACAGCCGCAGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCTCAAGTGGGAG	50049

BX927141.7	401	GCGGCCCGGGGGGCGGAGGTTCATCCTCACAGGGATAGGCACCTATTAGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50050	GCGGCCCGGGGGGCGGAGGTTCATCCTCACAGGGATAGGCACCTATTAGA	50099

BX927141.7	451	TGTGGTGTGGTTTTCCTCTCTACTCTTAGACCCTCAGCCAGTATCACTAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50100	TGTGGTGTGGTTTTCCTCTCTACTCTTAGACCCTCAGCCAGTATCACTAT	50149

BX927141.7	501	TGGCATTCCTGAGCCACTGGCTCAGAATTTCAGTACATTATCTGCCCGCG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50150	TGGCATTCCTGAGCCACTGGCTCAGAATTTCAGTACATTATCTGCCCGCG	50199

BX927141.7	551	GGACACACCTCAGAGGAAAGGGGATGAAGCGTGGTCCATGACCATGGCAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50200	GGACACACCTCAGAGGAAAGGGGATGAAGCGTGGTCCATGACCATGGCAC	50249

BX927141.7	601	CCCCTGGTCTTATCACCACCTGCACCTCCCAGGGGCTGCCAGCCACACAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50250	CCCCTGGTCTTATCACCACCTGCACCTCCCAGGGGCTGCCAGCCACACAG	50299

BX927141.7	651	AGTCATGGACAGGTCTCTACAGACACAACTTAGTGCCAGCTTGGATGAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50300	AGTCATGGACAGGTCTCTACAGACACAACTTAGTGCCAGCTTGGATGAAA	50349

BX927141.7	701	CCCTCTGAGGAATGGGTGCCATCTTTCAGGATGTGGTGCATGTATTGAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50350	CCCTCTGAGGAATGGGTGCCATCTTTCAGGATGTGGTGCATGTATTGAAT	50399

BX927141.7	751	CAAAGATGTCTCTATAGTGCTGTGTTTACAGAAGGAAGAATACGTGGGTC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50400	CAAAGATGTCTCTATAGTGCTGTGTTTACAGAAGGAAGAATACGTGGGTC	50449

BX927141.7	801	CAAAAACCAAGAAGTAGAAGCAGGTGTGGCTCCATATCTAAACCCTTATA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50450	CAAAAACCAAGAAGTAGAAGCAGGTGTGGCTCCATATCTAAACCCTTATA	50499

BX927141.7	851	TTCACCTTCAGGGTGATTTTGCACTTCTCATCTCCAATATCTGGGCTCTG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50500	TTCACCTTCAGGGTGATTTTGCACTTCTCATCTCCAATATCTGGGCTCTG	50549

BX927141.7	901	TAGGGGAGGAGGTCCTGGTTTCCCAAAGGGGGCACCCTGGCAAGGAGACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50550	TAGGGGAGGAGGTCCTGGTTTCCCAAAGGGGGCACCCTGGCAAGGAGACA	50599

BX927141.7	951	TTTAAATGAGAGTCCATGGAAATACACATTATGGCTGCCCCCAGGGATGT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50600	TTTAAATGAGAGTCCATGGAAATACACATTATGGCTGCCCCCAGGGATGT	50649

BX927141.7	1001	TTGAATAGTATGTGTCCAGATACAAGCAGGTGAGAAGAGGAGGAGGCAGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50650	TTGAATAGTATGTGTCCAGATACAAGCAGGTGAGAAGAGGAGGAGGCAGG	50699

BX927141.7	1051	GCTGCTATCACACAAGGAGGGCAGGAGATGTGTGTGTGGAAATAAGAGAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50700	GCTGCTATCACACAAGGAGGGCAGGAGATGTGTGTGTGGAAATAAGAGAT	50749

BX927141.7	1101	CCACTTGGAGACCTTATGGTTCCCCTTGTCCTGTTGTAAGTGTGAGCAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50750	CCACTTGGAGACCTTATGGTTCCCCTTGTCCTGTTGTAAGTGTGAGCAGA	50799

BX927141.7	1151	ATCATCCAGCAACCCAGCCTGAGAGGGTTTCATATTCAAGAGCCCAGAAC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50800	ATCATCCAGCAACCCAGCCTGAGAGGGTTTCATATTCAAGAGCCCAGAAC	50849

BX927141.7	1201	CCTCAGGAAGGAAGGATTGAGTGATACTCACAGGTAATGTCCCAAGGCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50850	CCTCAGGAAGGAAGGATTGAGTGATACTCACAGGTAATGTCCCAAGGCTG	50899

BX927141.7	1251	TGCTCCTGTGCTCTGACATCCTCAGCAGGATTGGTGCAAAGCCCTGCTTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50900	TGCTCCTGTGCTCTGACATCCTCAGCAGGATTGGTGCAAAGCCCTGCTTC	50949

BX927141.7	1301	CCATGGGCTGTTCCCAGCCAGTGACTGGTCACAGCAGGCATTAAGGCAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	50950	CCATGGGCTGTTCCCAGCCAGTGACTGGTCACAGCAGGCATTAAGGCAAG	50999

BX927141.7	1351	CCATTCCTGGGAGACACGGGACTCCTCTGATGGCTAACTGTAGCTGGAAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51000	CCATTCCTGGGAGACACGGGACTCCTCTGATGGCTAACTGTAGCTGGAAG	51049

BX927141.7	1401	ACTCCTCCACGGCCTTGCTCAACTCTCCTTAGATTGCCTGTGCTCTAGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51050	ACTCCTCCACGGCCTTGCTCAACTCTCCTTAGATTGCCTGTGCTCTAGGA	51099

BX927141.7	1451	TGCGTCAAACAAACTTTCTCTCCTTCTGTCCAGCACTTGGGGTCACACTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51100	TGCGTCAAACAAACTTTCTCTCCTTCTGTCCAGCACTTGGGGTCACACTT	51149

BX927141.7	1501	GCATCGTGGTCTGCCGCCTTTTCTCAGGGATTTCTGGCTCACTTCCCATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51150	GCATCGTGGTCTGCCGCCTTTTCTCAGGGATTTCTGGCTCACTTCCCATA	51199

BX927141.7	1551	TTCCCTTACGGGTGTGTCCCCTTATAAGATGTCGCAGACTTTAAGCTCAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51200	TTCCCTTACGGGTGTGTCCCCTTATAAGATGTCGCAGACTTTAAGCTCAT	51249

BX927141.7	1601	CTTGGCATCTGCTCCTTGAAGGACTTGGACTAAAAATTATTTCCATCTGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51250	CTTGGCATCTGCTCCTTGAAGGACTTGGACTAAAAATTATTTCCATCTGC	51299

BX927141.7	1651	ATATCAATAACTCTTATTCCAACCTGTAAAATCCTTCTCTTTATCCAACT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51300	ATATCAATAACTCTTATTCCAACCTGTAAAATCCTTCTCTTTATCCAACT	51349

BX927141.7	1701	TCTGCCACCCCCACAGAATCTATTTTACTTGTGTGTGTAGTATCTCTTTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51350	TCTGCCACCCCCACAGAATCTATTTTACTTGTGTGTGTAGTATCTCTTTG	51399

BX927141.7	1751	AGTTAACAGATATTTGTTCTATTAAGCTACTAAATTTTGAGGTAGTTTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51400	AGTTAACAGATATTTGTTCTATTAAGCTACTAAATTTTGAGGTAGTTTGT	51449

BX927141.7	1801	GACACAGCACTTGATAACTATTAAGGCTTTCTTAAGTTTCCATTATTCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51450	GACACAGCACTTGATAACTATTAAGGCTTTCTTAAGTTTCCATTATTCCA	51499

BX927141.7	1851	TGGATATTATCTACATATCTTTTAATCCCTTGCATTTTAATAACATTAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51500	TGGATATTATCTACATATCTTTTAATCCCTTGCATTTTAATAACATTAGC	51549

BX927141.7	1901	TATACTTGCTGTTTCCAACTCTTTCCTCCTATTTTTGAACATTTTAAATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51550	TATACTTGCTGTTTCCAACTCTTTCCTCCTATTTTTGAACATTTTAAATT	51599

BX927141.7	1951	TTGTCTTTCTCTGTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTCCTTTCCTCCCTCAGAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927182.6	51600	TTGTCTTTCTCTGTCCTTCCTTCCTTCTTTCCTCCTTTCCTCCCTCAGAG	51649

Overview

Query
BX927141.7 - 125405 bps
Hit
BX927182.6 - 51649 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link