<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX908732.13	1	GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCTTGGCCTCCCAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67475	GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCTTGGCCTCCCAA	67524

BX908732.13	51	AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGCCTGGCCCCAAAACACCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67525	AGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCGCCTGGCCCCAAAACACCTC	67574

BX908732.13	101	TATTAGTGATATTTTCCAAAGGCAAGCAGTGAAAATGATTTTCTCAGGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67575	TATTAGTGATATTTTCCAAAGGCAAGCAGTGAAAATGATTTTCTCAGGAA	67624

BX908732.13	151	TTACTAAATCTCAGTATTCAGGATTAAATATTTTTCACTGCACTGCTGCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67625	TTACTAAATCTCAGTATTCAGGATTAAATATTTTTCACTGCACTGCTGCT	67674

BX908732.13	201	GTACTCTAGCCTCTCCATAAGAACCAGATCTTCTTTTAGGAGATTATTAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67675	GTACTCTAGCCTCTCCATAAGAACCAGATCTTCTTTTAGGAGATTATTAA	67724

BX908732.13	251	CCCTGTTTTAGCATAACCACTTCATTCTTGCTTTTCATTGTAGGTGTTGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67725	CCCTGTTTTAGCATAACCACTTCATTCTTGCTTTTCATTGTAGGTGTTGG	67774

BX908732.13	301	AGATGAGATCCTTAATTGTATTCCTTTCCATATTCCCCCAGTGTTTTTCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67775	AGATGAGATCCTTAATTGTATTCCTTTCCATATTCCCCCAGTGTTTTTCC	67824

BX908732.13	351	TCAGATCACTCTGTTTCACTCTCAGCTATCTTTATGTTCTTGTTCATTTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67825	TCAGATCACTCTGTTTCACTCTCAGCTATCTTTATGTTCTTGTTCATTTC	67874

BX908732.13	401	TTATATTCTTTTCCAGATTCGATTACACCTTTGCCTTAGGAAGTTATTCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67875	TTATATTCTTTTCCAGATTCGATTACACCTTTGCCTTAGGAAGTTATTCT	67924

BX908732.13	451	AATGATTACTGACAAGCCACTATAATCATTATTAGAACAATGCCTATCTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67925	AATGATTACTGACAAGCCACTATAATCATTATTAGAACAATGCCTATCTA	67974

BX908732.13	501	TTATGAATTTTAAGGTAATGGAATTTCCATTTTCTAAAATATAATTGGTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	67975	TTATGAATTTTAAGGTAATGGAATTTCCATTTTCTAAAATATAATTGGTT	68024

BX908732.13	551	GCCCAGAGAGATGGTTAGTGTTAATCCAAACTGCACCATTTTGTAAGCCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68025	GCCCAGAGAGATGGTTAGTGTTAATCCAAACTGCACCATTTTGTAAGCCT	68074

BX908732.13	601	CCAGCAATTTGAAGACCTTGGTAAAAGTGAAACATTCCACGGGGGTTCGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68075	CCAGCAATTTGAAGACCTTGGTAAAAGTGAAACATTCCACGGGGGTTCGG	68124

BX908732.13	651	GCTGTGAGAAACATTCTGCCTAACCACCTGAACACAAGGTGGACAAAGGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68125	GCTGTGAGAAACATTCTGCCTAACCACCTGAACACAAGGTGGACAAAGGG	68174

BX908732.13	701	CCAACTAAAGAAACATCCCTGTCATATTCAGCTGGGAGAAAGTGCAAGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68175	CCAACTAAAGAAACATCCCTGTCATATTCAGCTGGGAGAAAGTGCAAGGA	68224

BX908732.13	751	ACACTACATTCTGCAGGAACAAGGGCCAGAACCCCCTCATCATGGGAACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68225	ACACTACATTCTGCAGGAACAAGGGCCAGAACCCCCTCATCATGGGAACA	68274

BX908732.13	801	TCTTATCAATATCCTGCCGGCCAGCAAGCCATACTACCCAGACCCCTCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68275	TCTTATCAATATCCTGCCGGCCAGCAAGCCATACTACCCAGACCCCTCCC	68324

BX908732.13	851	GCCTATACCTATAAGTACCCCCAGCCTGTAAGCAGCAGTGGGCACTGGCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68325	GCCTATACCTATAAGTACCCCCAGCCTGTAAGCAGCAGTGGGCACTGGCA	68374

BX908732.13	901	TTAGGCTGGTTCCCCACTTCTGTAGGTCTTATGCTGGACGTAAAGCCTAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68375	TTAGGCTGGTTCCCCACTTCTGTAGGTCTTATGCTGGACGTAAAGCCTAC	68424

BX908732.13	951	ATTTGCTGTACAGCCGCCACTCTCTCTGTGTCTTTTCTTTAACCCTCGCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68425	ATTTGCTGTACAGCCGCCACTCTCTCTGTGTCTTTTCTTTAACCCTCGCC	68474

BX908732.13	1001	TTCCCTCCAAAACCTAACAGTTACGATATGGGGAAATGAAAGTCTAAGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68475	TTCCCTCCAAAACCTAACAGTTACGATATGGGGAAATGAAAGTCTAAGAA	68524

BX908732.13	1051	ATATGATTTTCAGCTTCTTTAACCCAGATACTTAAACAGTTGGAGCCAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68525	ATATGATTTTCAGCTTCTTTAACCCAGATACTTAAACAGTTGGAGCCAGT	68574

BX908732.13	1101	CTCCTTCAGACATAGTAAGAAGCCAGTAGAGATAAGTTGATATATACAGG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68575	CTCCTTCAGACATAGTAAGAAGCCAGTAGAGATAAGTTGATATATACAGG	68624

BX908732.13	1151	CAGCTTACCAATAGGTCCTGGAGTTTGCACTAAAAAGAAATTCAAATTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68625	CAGCTTACCAATAGGTCCTGGAGTTTGCACTAAAAAGAAATTCAAATTGG	68674

BX908732.13	1201	CATATTAGTACAGTTATTTGGAGAGTGTATTTTTCACTAATTTTATCCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68675	CATATTAGTACAGTTATTTGGAGAGTGTATTTTTCACTAATTTTATCCTA	68724

BX908732.13	1251	GAAGTGAGGCTTTGAGAGGTAGAGCAGGGGAGAGGAAGTGATATCAGTTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68725	GAAGTGAGGCTTTGAGAGGTAGAGCAGGGGAGAGGAAGTGATATCAGTTA	68774

BX908732.13	1301	TGAGATCATTAGGGAGACTTAATCCAACTATATTAACTATAGAAAAAAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68775	TGAGATCATTAGGGAGACTTAATCCAACTATATTAACTATAGAAAAAAGG	68824

BX908732.13	1351	AAAAAGGATATTTAGCATTTACTGCAATATTTCAGCCCAAGGTGAAGGTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68825	AAAAAGGATATTTAGCATTTACTGCAATATTTCAGCCCAAGGTGAAGGTT	68874

BX908732.13	1401	TTTATAGGATCCTTGCCAACCTAAGGGATACTAGGGAAAGGCAAAACTTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68875	TTTATAGGATCCTTGCCAACCTAAGGGATACTAGGGAAAGGCAAAACTTT	68924

BX908732.13	1451	GTTATTAGGTATTAACATTACTGATGGTAGGGAAAGGTGAAACACTTCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68925	GTTATTAGGTATTAACATTACTGATGGTAGGGAAAGGTGAAACACTTCCT	68974

BX908732.13	1501	GTCAGTAAGAGTAGAAGATATTTCTTTCTCAAGGGACTGTTCTTTCACTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	68975	GTCAGTAAGAGTAGAAGATATTTCTTTCTCAAGGGACTGTTCTTTCACTA	69024

BX908732.13	1551	AAATCTTTATTTCTGATCAACTAATATGTTCCAGAGGTAGACATTAGAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69025	AAATCTTTATTTCTGATCAACTAATATGTTCCAGAGGTAGACATTAGAAT	69074

BX908732.13	1601	AGGAGGTAAGAATCTAGTTTCTTCTTCTCACAGCTTCCAGCTTATTGGAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69075	AGGAGGTAAGAATCTAGTTTCTTCTTCTCACAGCTTCCAGCTTATTGGAG	69124

BX908732.13	1651	AGTGATAGAGCAGTGACTGCTGCTTTGATTAGCTTTAGAGTCTGTGAGCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69125	AGTGATAGAGCAGTGACTGCTGCTTTGATTAGCTTTAGAGTCTGTGAGCA	69174

BX908732.13	1701	AAGAGTCAACAAAACCTTCTGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69175	AAGAGTCAACAAAACCTTCTGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	69224

BX908732.13	1751	TTGAGATAAGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGTGCAAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69225	TTGAGATAAGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGTGCAAT	69274

BX908732.13	1801	CCTAGCTCACTACAGTCTCGACCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69275	CCTAGCTCACTACAGTCTCGACCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCT	69324

BX908732.13	1851	CAGCCTCTTGAGTAGCTAGGACTACAGCTGCATGCCACTATTCCTGGCTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69325	CAGCCTCTTGAGTAGCTAGGACTACAGCTGCATGCCACTATTCCTGGCTA	69374

BX908732.13	1901	ATTAAAAAAAATTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTCTGTTGTTGCTCAGGC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69375	ATTAAAAAAAATTTTGTAGAGATGGGGTCTTGCTCTGTTGTTGCTCAGGC	69424

BX908732.13	1951	TGATCTTGAACTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927180.9	69425	TGATCTTGAACTCCTGGTCTCAAGTGATCCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAA	69474

Overview

Query
BX908732.13 - 101860 bps
Hit
BX927180.9 - 69474 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link