<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927160.7	1	AATTTTCCGTATTTTTATGGAGGAAGGCGCCCACAAAAGCAACAGTGCTC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107327	AATTTTCCGTATTTTTATGGAGGAAGGCGCCCACAAAAGCAACAGTGCTC	107376

BX927160.7	51	GGGGCTCACAAGTCAGAATTCAGCCCTGGGCATCCCTGATCCTGGGCTTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107377	GGGGCTCACAAGTCAGAATTCAGCCCTGGGCATCCCTGATCCTGGGCTTT	107426

BX927160.7	101	GCGTGGTTCTGCTACCTGGGTGCCTGTCAGTCTTCCCCAAAATCTATGTA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107427	GCGTGGTTCTGCTACCTGGGTGCCTGTCAGTCTTCCCCAAAATCTATGTA	107476

BX927160.7	151	ATTGTCAAAAATTGCAATTGTCATTCAATACACATGTTTGAGCACACAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107477	ATTGTCAAAAATTGCAATTGTCATTCAATACACATGTTTGAGCACACAAT	107526

BX927160.7	201	GAGCTAACTTTTGGGAATTCAAAGATAAAAAATCATGCTGTCTGCCTTGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107527	GAGCTAACTTTTGGGAATTCAAAGATAAAAAATCATGCTGTCTGCCTTGC	107576

BX927160.7	251	AGAGGGTGCACAAACCAGTGATGGAAACAGTATGGGGCACAGGAAAGCAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107577	AGAGGGTGCACAAACCAGTGATGGAAACAGTATGGGGCACAGGAAAGCAG	107626

BX927160.7	301	AAGGCCCTGCTGAGCAGGACAGTGGCCCAGCAGAGGCTGAAACTATAAAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107627	AAGGCCCTGCTGAGCAGGACAGTGGCCCAGCAGAGGCTGAAACTATAAAA	107676

BX927160.7	351	ATGACTTGGTTCCAGCTGGGCCAGTAGAGTGATGTCCTCCAGCAACACTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107677	ATGACTTGGTTCCAGCTGGGCCAGTAGAGTGATGTCCTCCAGCAACACTC	107726

BX927160.7	401	AGCACCCAGGACAAGTACCAGATGAAAAGAAGGATTGCATGTATTCCACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107727	AGCACCCAGGACAAGTACCAGATGAAAAGAAGGATTGCATGTATTCCACA	107776

BX927160.7	451	TATATTCATGTTTGAACAAGGAGTCAAAGTTTATTGTAAGGATAAGGAGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107777	TATATTCATGTTTGAACAAGGAGTCAAAGTTTATTGTAAGGATAAGGAGT	107826

BX927160.7	501	CTTTGTTGGTGGCCTGTTAAGTAACCAACCAGGGCAGTCATGCTGGGTAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107827	CTTTGTTGGTGGCCTGTTAAGTAACCAACCAGGGCAGTCATGCTGGGTAG	107876

BX927160.7	551	GGAAGAAGGTGAGCTGGAGGAGGAACAGACAAACTTGGAGAGCCAGACAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107877	GGAAGAAGGTGAGCTGGAGGAGGAACAGACAAACTTGGAGAGCCAGACAT	107926

BX927160.7	601	TGAGATTCCATTGAGGCGTTGGAGGTCACAACGCGGTCAAAAACATGTTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107927	TGAGATTCCATTGAGGCGTTGGAGGTCACAACGCGGTCAAAAACATGTTG	107976

BX927160.7	651	AGAGCACTTAGCTGCAAAGTTGTTAACTAAGTAGAAACCTCAAGGATGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	107977	AGAGCACTTAGCTGCAAAGTTGTTAACTAAGTAGAAACCTCAAGGATGAA	108026

BX927160.7	701	TTTTAGGATTTCTCCAGGAAATCCTAAAAGATAACTTATTTCAGGGAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108027	TTTTAGGATTTCTCCAGGAAATCCTAAAAGATAACTTATTTCAGGGAGAA	108076

BX927160.7	751	AAAACAGACCCTTGCAAAGACATGAAAGGAAATGTAGTTTGGTTTGATTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108077	AAAACAGACCCTTGCAAAGACATGAAAGGAAATGTAGTTTGGTTTGATTG	108126

BX927160.7	801	GCAGATAGTTGTGAAGAATGTCGGACTGTAAGGCTGTCGATATCCTCCTC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108127	GCAGATAGTTGTGAAGAATGTCGGACTGTAAGGCTGTCGATATCCTCCTC	108176

BX927160.7	851	ACAGAACTCCCCAAAGTACATTGTATTTGCTCCCTTACCGACCTGATTCT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108177	ACAGAACTCCCCAAAGTACATTGTATTTGCTCCCTTACCGACCTGATTCT	108226

BX927160.7	901	CCCACTATTCAGTTCATTCCTTGATGCTGTTTTAAGCAACCCCTGCTCTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108227	CCCACTATTCAGTTCATTCCTTGATGCTGTTTTAAGCAACCCCTGCTCTG	108276

BX927160.7	951	TCTGACACTTTTGGATGCTCAGTAAATGAGGAAGGAAGGAAGGAAAGATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108277	TCTGACACTTTTGGATGCTCAGTAAATGAGGAAGGAAGGAAGGAAAGATA	108326

BX927160.7	1001	AAATGGTAAAGGGCTCACACATGTCTTAACAAAAATGTCCAGTTCGGCTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108327	AAATGGTAAAGGGCTCACACATGTCTTAACAAAAATGTCCAGTTCGGCTC	108376

BX927160.7	1051	ATTTGGCTATACTTCATGGCTGCTGCTCTGCCCTTGCATCCTCGGATAAG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108377	ATTTGGCTATACTTCATGGCTGCTGCTCTGCCCTTGCATCCTCGGATAAG	108426

BX927160.7	1101	CTCACTGCCCATTAGAGGAAAAAGGGTTTAATTTACCTGAGTCCTCGAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108427	CTCACTGCCCATTAGAGGAAAAAGGGTTTAATTTACCTGAGTCCTCGAGT	108476

BX927160.7	1151	GAATGTAATTGTTGAATCAGAACACTATAGACATTTAGTAACCTCCTTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108477	GAATGTAATTGTTGAATCAGAACACTATAGACATTTAGTAACCTCCTTCA	108526

BX927160.7	1201	GAGGAAAAAAAAAAAAGTGGGGGCAATGACAGAAATTAAAAAACCAGTCG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108527	GAGGAAAAAAAAAAAAGTGGGGGCAATGACAGAAATTAAAAAACCAGTCG	108576

BX927160.7	1251	AGCTTCCACTTTTCATTTCAGAAGAAATCAGGTGCTCTCCTCTAAGGACC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108577	AGCTTCCACTTTTCATTTCAGAAGAAATCAGGTGCTCTCCTCTAAGGACC	108626

BX927160.7	1301	ACTACTATTAACAAAACAGAGACCTTAGAAGAATTGTTTATTTGTTATAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108627	ACTACTATTAACAAAACAGAGACCTTAGAAGAATTGTTTATTTGTTATAA	108676

BX927160.7	1351	ATGTATAATGTTGCTATTCTTGTAATAGTCTTTCTCGTACCCTATAATTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108677	ATGTATAATGTTGCTATTCTTGTAATAGTCTTTCTCGTACCCTATAATTG	108726

BX927160.7	1401	TTAGAAGAAATTCTTTTAAGTTAATACGTTCCTACATGCTTTTCTTTGGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108727	TTAGAAGAAATTCTTTTAAGTTAATACGTTCCTACATGCTTTTCTTTGGT	108776

BX927160.7	1451	TTAAAAAAAAAAGAATAAAGGAAACTCTGTGTAGAAAGTGTCCTGTTCTG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108777	TTAAAAAAAAAAGAATAAAGGAAACTCTGTGTAGAAAGTGTCCTGTTCTG	108826

BX927160.7	1501	ATCTAGTCCTGACAGGAAACGAAGTATAATCAACTTGTTATTAACTGAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108827	ATCTAGTCCTGACAGGAAACGAAGTATAATCAACTTGTTATTAACTGAGA	108876

BX927160.7	1551	GAGAAAACTTAGGAAGCAGAGGGAAATAAACTGAATCTCTGAGTAAGAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108877	GAGAAAACTTAGGAAGCAGAGGGAAATAAACTGAATCTCTGAGTAAGAAA	108926

BX927160.7	1601	ACTAAATCCTATGATAACTCATTCATTCCTTCCTTCCTTTGTTTATTGCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108927	ACTAAATCCTATGATAACTCATTCATTCCTTCCTTCCTTTGTTTATTGCA	108976

BX927160.7	1651	ATATTCATCATAAGCTTATGATGTGCCAGGCACTAAGTAGGCACTCAGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	108977	ATATTCATCATAAGCTTATGATGTGCCAGGCACTAAGTAGGCACTCAGGA	109026

BX927160.7	1701	AATAACAGACGTGTGACGTTCTGCCTTTGTGGAGCATATGTTATAGTGAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	109027	AATAACAGACGTGTGACGTTCTGCCTTTGTGGAGCATATGTTATAGTGAG	109076

BX927160.7	1751	AAAGACAGAATCAGTTCTAACCTGATGACTACCAACGTTAGGCAAGGAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	109077	AAAGACAGAATCAGTTCTAACCTGATGACTACCAACGTTAGGCAAGGAGG	109126

BX927160.7	1801	AAGCAGGTGTTAGGAAGATTGTTCAGGGACTGTGCCAAAGATGAAGCCCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	109127	AAGCAGGTGTTAGGAAGATTGTTCAGGGACTGTGCCAAAGATGAAGCCCA	109176

BX927160.7	1851	TAATATTTGAAAGTGAGTTTCTTCAATCACTTTCTGTATTAAGGTTCTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	109177	TAATATTTGAAAGTGAGTTTCTTCAATCACTTTCTGTATTAAGGTTCTTT	109226

BX927160.7	1901	CTCCCTGTGTTCCACCCTCCTGCTTGTCACCTTCACTCGTCAGCTGACCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	109227	CTCCCTGTGTTCCACCCTCCTGCTTGTCACCTTCACTCGTCAGCTGACCA	109276

BX927160.7	1951	TGTTGCCTCCTATGGTGTGAACTTCTACCAGTCTCACGGTCCCTCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927168.11	109277	TGTTGCCTCCTATGGTGTGAACTTCTACCAGTCTCACGGTCCCTCTGGCC	109326

Overview

Query
BX927160.7 - 39608 bps
Hit
BX927168.11 - 109326 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link