<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR547123.3	1	GTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGATAGCGTGAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122345	GTTTTGGTTACTGTAGCCTTGTAGTATAGTTTGAAGTCAGATAGCGTGAT	122394

CR547123.3	51	GCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGAATTGTGTTGGCTATACAGGCTC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122395	GCCTCCAGCTTTGTTCTTTTTGCTTAGAATTGTGTTGGCTATACAGGCTC	122444

CR547123.3	101	TTTTTTGGTGCCATGTGAAATTTAAAGTAGTTTTTCTAATTCTGCGAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122445	TTTTTTGGTGCCATGTGAAATTTAAAGTAGTTTTTCTAATTCTGCGAAGA	122494

CR547123.3	151	AAGTTAATGGTAGCTTGATTGGGATAGCATTGAATCTATAAATTCCTTTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122495	AAGTTAATGGTAGCTTGATTGGGATAGCATTGAATCTATAAATTCCTTTG	122544

CR547123.3	201	GGCAGTATGGCCATTTTCACGATATTGATTCTTCCTATCCATGAACATGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122545	GGCAGTATGGCCATTTTCACGATATTGATTCTTCCTATCCATGAACATGG	122594

CR547123.3	251	AATGTTTTTCCATTTGTTTGTGTCTTCTCTCATTTCCTTGAGCAGTGGTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122595	AATGTTTTTCCATTTGTTTGTGTCTTCTCTCATTTCCTTGAGCAGTGGTT	122644

CR547123.3	301	TGTAGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCACATCCCTTGTAAATTGTACTCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122645	TGTAGTTCTCCTTGAAGAGGTCCTTCACATCCCTTGTAAATTGTACTCCT	122694

CR547123.3	351	AGGTATTTTATTCTCTTTGTAGCAATTGTGAATGAGAGTTCACTCATGAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122695	AGGTATTTTATTCTCTTTGTAGCAATTGTGAATGAGAGTTCACTCATGAT	122744

CR547123.3	401	TTGGCTATTTGTTTGTCTATTACTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122745	TTGGCTATTTGTTTGTCTATTACTGGTGTATAAGAATGCTTGTGATTTTT	122794

CR547123.3	451	GCATGTTGATTTTGTATCCTGAGAGTTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122795	GCATGTTGATTTTGTATCCTGAGAGTTTGCTGAAGTTGCTTATCAGCTTA	122844

CR547123.3	501	AGGAGATTTTGGGCTGAGACGATGGGGTTTTCTAAATATGTAATCATGTC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122845	AGGAGATTTTGGGCTGAGACGATGGGGTTTTCTAAATATGTAATCATGTC	122894

CR547123.3	551	ACCTGCAAACAGAGACAATTTGACATCCTTTCTTCCTATCTGAATACCCC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122895	ACCTGCAAACAGAGACAATTTGACATCCTTTCTTCCTATCTGAATACCCC	122944

CR547123.3	601	TTATTTCTTTCTCTTGCTTGATTGTCCTGGCCAGAACTTCCAATACTATG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122945	TTATTTCTTTCTCTTGCTTGATTGTCCTGGCCAGAACTTCCAATACTATG	122994

CR547123.3	651	TTGAGTAGGCGTGGTGAGAAAGGGCATCTTTGTCTTGTGCTGGTTTTCCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	122995	TTGAGTAGGCGTGGTGAGAAAGGGCATCTTTGTCTTGTGCTGGTTTTCCA	123044

CR547123.3	701	AGAAAATGCTTCCAGCTCTTGCCTATTCAGAATGATACTGGCTGTGGGTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123045	AGAAAATGCTTCCAGCTCTTGCCTATTCAGAATGATACTGGCTGTGGGTT	123094

CR547123.3	751	TGTCATAAACAGCTCTTATTATTTTGAAATATGTTCCATCAATACCTAGT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123095	TGTCATAAACAGCTCTTATTATTTTGAAATATGTTCCATCAATACCTAGT	123144

CR547123.3	801	TTATTGAGTGTTTGTAGCATGAAGGGGTGTTCAATTTTATTGAAGGCCTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123145	TTATTGAGTGTTTGTAGCATGAAGGGGTGTTCAATTTTATTGAAGGCCTT	123194

CR547123.3	851	TTCTGCATTTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCGTTGGTTCTGTTTA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123195	TTCTGCATTTATTGAGATAATCATGTGGTTTTTGTCGTTGGTTCTGTTTA	123244

CR547123.3	901	TCTGATGGATTACGTTTATTGATTTGTGTATGTTGAACCAGCCTTACATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123245	TCTGATGGATTACGTTTATTGATTTGTGTATGTTGAACCAGCCTTACATC	123294

CR547123.3	951	CCAGGGATGAAGCTGACTAGCTCATGGTGAATAAGCTTTTTGATGTGCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123295	CCAGGGATGAAGCTGACTAGCTCATGGTGAATAAGCTTTTTGATGTGCTG	123344

CR547123.3	1001	TTGAATTGTTTGCTAGTATTTTATTGAAGATTTTCACATCAATGTCCATC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123345	TTGAATTGTTTGCTAGTATTTTATTGAAGATTTTCACATCAATGTCCATC	123394

CR547123.3	1051	AGGGATATTGGCCTGAAATTTTCTTTTTTGTTGTTGTTGTGTCTCTGCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123395	AGGGATATTGGCCTGAAATTTTCTTTTTTGTTGTTGTTGTGTCTCTGCCC	123444

CR547123.3	1101	TGTTTTGGTATCAAGATGATGCTGACTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123445	TGTTTTGGTATCAAGATGATGCTGACTTCATAAAATGAGTTAGGGAGGAG	123494

CR547123.3	1151	TCCCTCTTTTTCTATAGTTTGGAATAGTTTCAGAAGGAATGATACCAGGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123495	TCCCTCTTTTTCTATAGTTTGGAATAGTTTCAGAAGGAATGATACCAGGT	123544

CR547123.3	1201	CATCTTAGTACCTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCTGTGTGGTCCTGGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123545	CATCTTAGTACCTCTGGTAGAATTTGGCTGTGAATCTGTGTGGTCCTGGA	123594

CR547123.3	1251	ATTTTTTTGGTTGGTAAGCTGCTAATTATTGCCTCAATTTCAGAGCCTGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123595	ATTTTTTTGGTTGGTAAGCTGCTAATTATTGCCTCAATTTCAGAGCCTGT	123644

CR547123.3	1301	TATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGAGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123645	TATTGGTCTATTCAGAGATTCAACTTCTTCCTGGTTTAGTCTTGGGAGGG	123694

CR547123.3	1351	TGTATGTGTCCAGAAGTTTATCAATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTATTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123695	TGTATGTGTCCAGAAGTTTATCAATTTCTTCTAGATTTTCTGGTTTATTT	123744

CR547123.3	1401	GCGTAGTGGTGTTTATAATATTCTCTGATGGTAGTTTGTATTTCTGTGAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123745	GCGTAGTGGTGTTTATAATATTCTCTGATGGTAGTTTGTATTTCTGTGAG	123794

CR547123.3	1451	ATCAGTGGTGATATCTCTTTATCGTTTTTTGTTGTGTCTGATTCTTCTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123795	ATCAGTGGTGATATCTCTTTATCGTTTTTTGTTGTGTCTGATTCTTCTCT	123844

CR547123.3	1501	CTTTTCTCCCTTTTCATAAAGCATTTCATGGATTCATTGACTTTTTGAAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123845	CTTTTCTCCCTTTTCATAAAGCATTTCATGGATTCATTGACTTTTTGAAG	123894

CR547123.3	1551	GGTTTTTTGTGTCTGTATCTCCTTCAATTTTGCTCTGATTTTAGTTATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123895	GGTTTTTTGTGTCTGTATCTCCTTCAATTTTGCTCTGATTTTAGTTATTT	123944

CR547123.3	1601	CTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123945	CTTGTCTTCTGCTAGCTTTTGAATTTGTTTGCTCTTGCTTCTCTAGTTCT	123994

CR547123.3	1651	TCTAATTGTGATGTTAAGGTGTCAGTTTTAGATCTTTTCCTCTTTCTGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	123995	TCTAATTGTGATGTTAAGGTGTCAGTTTTAGATCTTTTCCTCTTTCTGAT	124044

CR547123.3	1701	GTTGGCATTCAGTGCTATAAATTTTCCTCTAAACACTGCTCTAGCTGTGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	124045	GTTGGCATTCAGTGCTATAAATTTTCCTCTAAACACTGCTCTAGCTGTGT	124094

CR547123.3	1751	CCCAGAGATTCTAGTACATTGTGTCTTTGTTCTCATTGGTTTCAAAGAAC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	124095	CCCAGAGATTCTAGTACATTGTGTCTTTGTTCTCATTGGTTTCAAAGAAC	124144

CR547123.3	1801	TTCTTTATTTCTGCCTTAATTTTGTTATTTACCCAGTAGTCATTCAGGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	124145	TTCTTTATTTCTGCCTTAATTTTGTTATTTACCCAGTAGTCATTCAGGAG	124194

CR547123.3	1851	CAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTGTAGTTTTGAGTGAGTTTCTTAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	124195	CAGGTTGTTCAGTTTCCATGTAGTTGTGTAGTTTTGAGTGAGTTTCTTAA	124244

CR547123.3	1901	TCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTGTGGTCTGAGAGACTGTTTTGTATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	124245	TCTTGAGTTCTAATTTGATTGCACTGTGGTCTGAGAGACTGTTTTGTATG	124294

CR547123.3	1951	ATTTCTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTCTTACTCCCAATTATGTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927167.6	124295	ATTTCTCTTTTGCATTTGCTGAGGAGTGTCTTACTCCCAATTATGTGGCC	124344

Overview

Query
CR547123.3 - 60036 bps
Hit
BX927167.6 - 124344 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link