<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR382280.5	1	TAAAAGGATTAAAAATGGATTATTTGCTTTCAAAAAAAAAGAAATCACCA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57609	TAAAAGGATTAAAAATGGATTATTTGCTTTCAAAAAAAAAGAAATCACCA	57658

CR382280.5	51	CTTGCACAGTTTTTATGTAATGTGAAATATGAATATCCACAATTACATGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57659	CTTGCACAGTTTTTATGTAATGTGAAATATGAATATCCACAATTACATGA	57708

CR382280.5	101	AAAGCTGTTAAAAATAATCCTCCCAGTCCGGGCATGGTAGCTCACACATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57709	AAAGCTGTTAAAAATAATCCTCCCAGTCCGGGCATGGTAGCTCACACATG	57758

CR382280.5	151	TTGTTCCAGCTACTGGGAAGGCTGAGGTGAGAGAATCCCTTGAGCCCAGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57759	TTGTTCCAGCTACTGGGAAGGCTGAGGTGAGAGAATCCCTTGAGCCCAGG	57808

CR382280.5	201	AGTTCTAGGCTGCAGTGAGCTATTATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57809	AGTTCTAGGCTGCAGTGAGCTATTATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGG	57858

CR382280.5	251	TGACAGAGCGAGACCCTGTCTCTAAACAACAGCAATAATAATCCTTCCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57859	TGACAGAGCGAGACCCTGTCTCTAAACAACAGCAATAATAATCCTTCCTT	57908

CR382280.5	301	CCTGAGTCAGACGGGCATGGAGACGCTTCTGGAAGGAACACCGCAATGGC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57909	CCTGAGTCAGACGGGCATGGAGACGCTTCTGGAAGGAACACCGCAATGGC	57958

CR382280.5	351	TGCGCAGGGACAGCCCCAGGTCCAGTTCAAACTTGTATTGGTTGGTGATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	57959	TGCGCAGGGACAGCCCCAGGTCCAGTTCAAACTTGTATTGGTTGGTGATG	58008

CR382280.5	401	GTGGTACTGGAAAAACGACTTTCGTGAAACATCATTTGACTGGTGAATTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58009	GTGGTACTGGAAAAACGACTTTCGTGAAACATCATTTGACTGGTGAATTT	58058

CR382280.5	451	GAGAAGAAGTATGTAGCCACCTTGGGTGTTGAGGTTCATCCCCTAGTGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58059	GAGAAGAAGTATGTAGCCACCTTGGGTGTTGAGGTTCATCCCCTAGTGTT	58108

CR382280.5	501	CCATACCAACAGAGGACCTGTTAAGTTCAATGTATGGGACACAGCCGGCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58109	CCATACCAACAGAGGACCTGTTAAGTTCAATGTATGGGACACAGCCGGCC	58158

CR382280.5	551	TGGAGAAATTCAGTGGACTGAGAGATGGCTATTATATCCAAGCCCAGAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58159	TGGAGAAATTCAGTGGACTGAGAGATGGCTATTATATCCAAGCCCAGAGT	58208

CR382280.5	601	ACCATCATAGTGTTTGATGTAACATCGAGAGTTACTTACAAGAATGTGCC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58209	ACCATCATAGTGTTTGATGTAACATCGAGAGTTACTTACAAGAATGTGCC	58258

CR382280.5	651	TAACTGGCATAGAGATCTGGTATGAGTGTGTGAAAACACCCCCACTGTGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58259	TAACTGGCATAGAGATCTGGTATGAGTGTGTGAAAACACCCCCACTGTGT	58308

CR382280.5	701	TGAGTGGCAACAAAGTGGATATTAAGGACAGGAAAGTGAAGGCGAAATCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58309	TGAGTGGCAACAAAGTGGATATTAAGGACAGGAAAGTGAAGGCGAAATCC	58358

CR382280.5	751	ATTGTCTTCCACCGAAAGAAGAATCTTCAGTACTACGACATTTCTGCCAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58359	ATTGTCTTCCACCGAAAGAAGAATCTTCAGTACTACGACATTTCTGCCAA	58408

CR382280.5	801	AAGTAACTATAACTTTGAAAAGCCCTTCCTCTGGCTTGCTAGGAAGCTCA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58409	AAGTAACTATAACTTTGAAAAGCCCTTCCTCTGGCTTGCTAGGAAGCTCA	58458

CR382280.5	851	TTGGAGACCCTAACTTGGAATTTGTTGCCATGCCTGCTCTCGCCCCACCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58459	TTGGAGACCCTAACTTGGAATTTGTTGCCATGCCTGCTCTCGCCCCACCA	58508

CR382280.5	901	GAAGTTGTCATGGACCCAGCTTTGGCAGCACAGTATGAGCACGACTTAGA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58509	GAAGTTGTCATGGACCCAGCTTTGGCAGCACAGTATGAGCACGACTTAGA	58558

CR382280.5	951	GGTTGCTCAGACAACTGCTCTCCCGGACGAGGATGATGACCTGTGAGAAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58559	GGTTGCTCAGACAACTGCTCTCCCGGACGAGGATGATGACCTGTGAGAAT	58608

CR382280.5	1001	GAAGCTGGAGCCCAGCGTCAGAAGTCTAGTTTTATAGGCAGCTGTCCTGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58609	GAAGCTGGAGCCCAGCGTCAGAAGTCTAGTTTTATAGGCAGCTGTCCTGT	58658

CR382280.5	1051	GATGTCAGTTGTGCAGCGTGTGTGCCACCTCATTATTATCTAGCTAAGCG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58659	GATGTCAGTTGTGCAGCGTGTGTGCCACCTCATTATTATCTAGCTAAGCG	58708

CR382280.5	1101	GAACATGTGCTTCATCTGTGGGATGCTGAAGGAGATGAGTGGGCTTCGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58709	GAACATGTGCTTCATCTGTGGGATGCTGAAGGAGATGAGTGGGCTTCGCA	58758

CR382280.5	1151	GTGAATGTGGCAGTTCAAAAAATACCTTCATTGTTTGGACCTGCATATTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58759	GTGAATGTGGCAGTTCAAAAAATACCTTCATTGTTTGGACCTGCATATTT	58808

CR382280.5	1201	AGCTGTTTTGGAACACAGTTGATTCCTTGAGTTTCAAATATAGACTGCTA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58809	AGCTGTTTTGGAACACAGTTGATTCCTTGAGTTTCAAATATAGACTGCTA	58858

CR382280.5	1251	CAGTCACATCACAATATTCAGCGGTGAAATCTTGTTTGTTACTGTCATTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58859	CAGTCACATCACAATATTCAGCGGTGAAATCTTGTTTGTTACTGTCATTC	58908

CR382280.5	1301	CCATTCCTTTTCGTTTAGAATCAGAATAAAGTTGTATTTCAAATATCTAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58909	CCATTCCTTTTCGTTTAGAATCAGAATAAAGTTGTATTTCAAATATCTAA	58958

CR382280.5	1351	AAACAAAAAATCCTTCCTTTTTCAACTCAATATTTGTGTAAGGCTAGATT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	58959	AAACAAAAAATCCTTCCTTTTTCAACTCAATATTTGTGTAAGGCTAGATT	59008

CR382280.5	1401	TTTTAACATATACACTTCAATCAAAGTAAGAAAATGGCTGGGATGCAGCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59009	TTTTAACATATACACTTCAATCAAAGTAAGAAAATGGCTGGGATGCAGCT	59058

CR382280.5	1451	GGAGGCCATAATCCTAAGTGAATTAATGCAGGAACAGAAAACCAAATACT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59059	GGAGGCCATAATCCTAAGTGAATTAATGCAGGAACAGAAAACCAAATACT	59108

CR382280.5	1501	GCATCTTCTCACTTATAATTGGGAGCTAAACACTGAGCACACATAGACAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59109	GCATCTTCTCACTTATAATTGGGAGCTAAACACTGAGCACACATAGACAT	59158

CR382280.5	1551	AAACATGTGTATAACAGACACTGTAGACGACTAGAGTGGAGAGGGTGGGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59159	AAACATGTGTATAACAGACACTGTAGACGACTAGAGTGGAGAGGGTGGGG	59208

CR382280.5	1601	ACGTGGGTTGAAAAACTACCTGTGGGTACTATGTTCACTACCTGAGTGAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59209	ACGTGGGTTGAAAAACTACCTGTGGGTACTATGTTCACTACCTGAGTGAC	59258

CR382280.5	1651	AGGATCCATACCCCAAACCTCAGCATCAGACAACATACCCATGTAACAAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59259	AGGATCCATACCCCAAACCTCAGCATCAGACAACATACCCATGTAACAAA	59308

CR382280.5	1701	CCGGCACATGTAACCCCTGTATCTATTTTTTTCTGGTTTTTTTTTTTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59309	CCGGCACATGTAACCCCTGTATCTATTTTTTTCTGGTTTTTTTTTTTTTT	59358

CR382280.5	1751	TTTTTTGAGACAATTTCACTCTTGTTGCTCAGGCTGGAGCGCAATGGCGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59359	TTTTTTGAGACAATTTCACTCTTGTTGCTCAGGCTGGAGCGCAATGGCGT	59408

CR382280.5	1801	GATCTCGGCTCATCGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59409	GATCTCGGCTCATCGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTG	59458

CR382280.5	1851	CCTCAGCCTCCTGAGTAGGTGGGATTACAGGTATGCGCCACCACCTCCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59459	CCTCAGCCTCCTGAGTAGGTGGGATTACAGGTATGCGCCACCACCTCCAG	59508

CR382280.5	1901	CTAATTTTGTATTTTTAGTAGACATGGGGTTTCTCCATATTGATAAGGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59509	CTAATTTTGTATTTTTAGTAGACATGGGGTTTCTCCATATTGATAAGGCT	59558

CR382280.5	1951	GGTCTCGAACTCCCGACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927143.4	59559	GGTCTCGAACTCCCGACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCC	59608

Overview

Query
CR382280.5 - 28276 bps
Hit
BX927143.4 - 59608 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link