<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005009.11	184691	ACACAGTATTGAAAGCTCTGCTATGTACGTATTACGTACGGTTCGTCCAA	184740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1	ACACAGTATTGAAAGCTCTGCTATGTACGTATTACGTACGGTTCGTCCAA	50

BX005009.11	184741	TAGACAACACCGGCATCGCGATCCTCCGCCCGCCCCCGTTGCAAATCCGC	184790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	51	TAGACAACACCGGCATCGCGATCCTCCGCCCGCCCCCGTTGCAAATCCGC	100

BX005009.11	184791	TCGCGAAAAAGTAGACACTCAGGCCCTGTTTACACTGTCTTTGTTTTTAA	184840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	101	TCGCGAAAAAGTAGACACTCAGGCCCTGTTTACACTGTCTTTGTTTTTAA	150

BX005009.11	184841	ATGGCATTTTAGAACGACAACGATTTGACATCCACAGTGGCGTGTAGCGT	184890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	151	ATGGCATTTTAGAACGACAACGATTTGACATCCACAGTGGCGTGTAGCGT	200

BX005009.11	184891	TTCTGAGCAGCCCTCCTTCCTCTCTACCTCTGAAAATGCACATCACGTGA	184940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	201	TTCTGAGCAGCCCTCCTTCCTCTCTACCTCTGAAAATGCACATCACGTGA	250

BX005009.11	184941	CCACACAGACACAGACGCCCACACAGCCATATGAGCTTGAGACAGCAGGT	184990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	251	CCACACAGACACAGACGCCCACACAGCCATATGAGCTTGAGACAGCAGGT	300

BX005009.11	184991	CCAGGCAGTCAGAGGACTGCTTCAATCTTTCACTCACTTCTACTTAGTCA	185040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	301	CCAGGCAGTCAGAGGACTGCTTCAATCTTTCACTCACTTCTACTTAGTCA	350

BX005009.11	185041	TTTTAGCGAACACCTCAGATACTGTTGGCTGGTTCCTGTTGGTTCTGCAT	185090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	351	TTTTAGCGAACACCTCAGATACTGTTGGCTGGTTCCTGTTGGTTCTGCAT	400

BX005009.11	185091	CTTTTTTACCGACGCCATTATAACCACACAGATCACTGCCTATTCACGAG	185140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	401	CTTTTTTACCGACGCCATTATAACCACACAGATCACTGCCTATTCACGAG	450

BX005009.11	185141	TCCCGCAGAAAAAGTGATTGACAGGTGGTAATTATATGTGTATCTTGCCT	185190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	451	TCCCGCAGAAAAAGTGATTGACAGGTGGTAATTATATGTGTATCTTGCCT	500

BX005009.11	185191	TTATTCATTTACTAAATGATTTGTTTATGGGTAAAACAAAGACCATGCAG	185240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	501	TTATTCATTTACTAAATGATTTGTTTATGGGTAAAACAAAGACCATGCAG	550

BX005009.11	185241	GTCAGGTAGTTTAAAAGGTAGGCTACAAATAATTAATTGGTCATTAATTA	185290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	551	GTCAGGTAGTTTAAAAGGTAGGCTACAAATAATTAATTGGTCATTAATTA	600

BX005009.11	185291	ATTAATTATTCATAATCGAAAATCGAATCGTGCCTTTAGAATCGAAAATG	185340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	601	ATTAATTATTCATAATCGAAAATCGAATCGTGCCTTTAGAATCGAAAATG	650

BX005009.11	185341	TAATCGAATCGAGGATTTGGAGGATCGTGACACCCTTAGTAACAAAAGAT	185390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	651	TAATCGAATCGAGGATTTGGAGGATCGTGACACCCTTAGTAACAAAAGAT	700

BX005009.11	185391	TCTGTCAAAACAGAATGATCGTGATATGCGGACATCTCCATTTTGGCACT	185440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	701	TCTGTCAAAACAGAATGATCGTGATATGCGGACATCTCCATTTTGGCACT	750

BX005009.11	185441	TTGTTTTCGCGGCTGTCATCTTGCAACATTTGTACACACAAAAACCGCAG	185490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	751	TTGTTTTCGCGGCTGTCATCTTGCAACATTTGTACACACAAAAACCGCAG	800

BX005009.11	185491	CTTGATGATGCAAGCGTACCAAGGTTCAGAAGGAAAAAAGACCAACCAGC	185540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	801	CTTGATGATGCAAGCGTACCAAGGTTCAGAAGGAAAAAAGACCAACCAGC	850

BX005009.11	185541	TGAGGGGGGACAATCTTACTTGGGTTCGGACCAGACATTTAGACCAAGTG	185590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	851	TGAGGGGGGACAATCTTACTTGGGTTCGGACCAGACATTTAGACCAAGTG	900

BX005009.11	185591	TGAAAGCACCCTTACGCATATGTTGAATAACACTAGTCAGTCGACTAGCC	185640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	901	TGAAAGCACCCTTACGCATATGTTGAATAACACTAGTCAGTCGACTAGCC	950

BX005009.11	185641	ATTTAGGCAACCCACTCTCTAGTTGATTAACCCCCCTCCTCGTGTTGTAC	185690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	951	ATTTAGGCAACCCACTCTCTAGTTGATTAACCCCCCTCCTCGTGTTGTAC	1000

BX005009.11	185691	AGTAAGCTGTCATTGGTTCACCTCATGAATGGCTCAGAGGCTCCTTTGTT	185740
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1001	AGTAAGCTGTCATTGGTTCACCTCATGAATGGCTCAGAGGCTCCTTTGTT	1050

BX005009.11	185741	TGAGAGCATGTTTACATAGTGTGCCGTCACAGTGTCTATCTGTACTGTAT	185790
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1051	TGAGAGCATGTTTACATAGTGTGCCGTCACAGTGTCTATCTGTACTGTAT	1100

BX005009.11	185791	ATTCACCACAATCTCTCTTCCTCCTACGTCTTTTATTCGACTCCCTTTCA	185840
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1101	ATTCACCACAATCTCTCTTCCTCCTACGTCTTTTATTCGACTCCCTTTCA	1150

BX005009.11	185841	TTCTCTCCACACTGACAACCCCCACCTTCTAACTTTACATCTGTGACCAT	185890
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1151	TTCTCTCCACACTGACAACCCCCACCTTCTAACTTTACATCTGTGACCAT	1200

BX005009.11	185891	CTCTTCCTTCTCCCTCTCTCGTTCTCCCTGCCCACATTTGGTGGTTGCTT	185940
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1201	CTCTTCCTTCTCCCTCTCTCGTTCTCCCTGCCCACATTTGGTGGTTGCTT	1250

BX005009.11	185941	TAATTCCCAGCGAGTGTATGTTGCTTTTAGGACGGTACATCCCTTTAATG	185990
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1251	TAATTCCCAGCGAGTGTATGTTGCTTTTAGGACGGTACATCCCTTTAATG	1300

BX005009.11	185991	TCAGCTTCACGATGCGTTTCGTCCAGTTTTCAGGCAGATTACATGAGAGC	186040
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1301	TCAGCTTCACGATGCGTTTCGTCCAGTTTTCAGGCAGATTACATGAGAGC	1350

BX005009.11	186041	AGAGGACTAGCACCAATAATGGCCTCCCATCTGTGTGTGTTTATGTGATG	186090
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1351	AGAGGACTAGCACCAATAATGGCCTCCCATCTGTGTGTGTTTATGTGATG	1400

BX005009.11	186091	GGGGAGGATACTGCTCGTTTAATCTGAGAGCTATTCGTGAACTCGGCACT	186140
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1401	GGGGAGGATACTGCTCGTTTAATCTGAGAGCTATTCGTGAACTCGGCACT	1450

BX005009.11	186141	GTTACTGATATGATAGGGACATGTTTGCACGCTCGCTCGTTGTGACTTCA	186190
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1451	GTTACTGATATGATAGGGACATGTTTGCACGCTCGCTCGTTGTGACTTCA	1500

BX005009.11	186191	TAATAGAATCACAGGGCCAGCCTTTAAATAAAACAAGGCTTAAGCAAGCT	186240
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1501	TAATAGAATCACAGGGCCAGCCTTTAAATAAAACAAGGCTTAAGCAAGCT	1550

BX005009.11	186241	GGTAACCTAGATGAAGCTGTCAGTCCCACTGTATTGATCCGATCCAAATT	186290
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1551	GGTAACCTAGATGAAGCTGTCAGTCCCACTGTATTGATCCGATCCAAATT	1600

BX005009.11	186291	AGAGCTTGAGAACCCAGAGCCTGTTCTCATTCTGTAATCTGTGCACTGGT	186340
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1601	AGAGCTTGAGAACCCAGAGCCTGTTCTCATTCTGTAATCTGTGCACTGGT	1650

BX005009.11	186341	GTGCAATAACCCAGCCACATGACCTGATGCTTCAAAGGCATCATGTGAGG	186390
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1651	GTGCAATAACCCAGCCACATGACCTGATGCTTCAAAGGCATCATGTGAGG	1700

BX005009.11	186391	CAATGGAGGAAAACATACAAAAGGGGGAATCCGCTGGACAAAAAATCCCC	186440
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1701	CAATGGAGGAAAACATACAAAAGGGGGAATCCGCTGGACAAAAAATCCCC	1750

BX005009.11	186441	TGCCTTTCTAGTGTGCATGAATCGCTGCATGTTATCTCCCTGGCATCATA	186490
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1751	TGCCTTTCTAGTGTGCATGAATCGCTGCATGTTATCTCCCTGGCATCATA	1800

BX005009.11	186491	TGGCTCCAGGTTTCATCTATATTACATGCACATGCTGCTATAAATATATC	186540
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1801	TGGCTCCAGGTTTCATCTATATTACATGCACATGCTGCTATAAATATATC	1850

BX005009.11	186541	CTCGGTTGAAGGGAGATGCAGTCTGCGCGCTCGCTTAAATATTTAAAAGA	186590
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1851	CTCGGTTGAAGGGAGATGCAGTCTGCGCGCTCGCTTAAATATTTAAAAGA	1900

BX005009.11	186591	TATAAACAAGATCCAAAAACAATGTAAAACAAGCTTATGTGCATTTCTTA	186640
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1901	TATAAACAAGATCCAAAAACAATGTAAAACAAGCTTATGTGCATTTCTTA	1950

BX005009.11	186641	CCAATGCAGGGCTGAGGTGCTGATTCTGCATGGGGAAAACGTGAGAATTC	186690
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927140.10	1951	CCAATGCAGGGCTGAGGTGCTGATTCTGCATGGGGAAAACGTGAGAATTC	2000

Overview

Query
BX005009.11 - 186690 bps
Hit
BX927140.10 - 125248 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100198820001846911866901120001
287.51192031063631065651466248611
389.6613119959868600661480650081
488.56122197162188162384-1480650061
583.24150342160296160637-121610219611
688.21141233162158162390-121764219921
790.311351965986460059121766219611
885.13761475299853144123852239991
986.6281144106363106506123858239991
1088.312253571653616892126044264111
1184.4694197160299160495-138703388951
1287.1715826262456506-141263415271
1392.2511515460936246-141753419071
1489.42124208130576130783-148837490441
1591.676596123603123698148949490441
1692.67781076334863454160809609171
1781.76182561130254130814-169169697271
1882.74721974828148477-11080521082481
1987.14681404805148190-11081071082461
2096.59638810497810506511081591082461
Short-link