<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR847794.5	1	AGTAAAATCCAAACTTGGCCACATCTCGGCCTCGCAGCAGCATCCTTGAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133397	AGTAAAATCCAAACTTGGCCACATCTCGGCCTCGCAGCAGCATCCTTGAG	133446

CR847794.5	51	CATTCTCTACAGAGACCTCCTGGCCTCCACAGGAGCCCACTTCAGGCAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133447	CATTCTCTACAGAGACCTCCTGGCCTCCACAGGAGCCCACTTCAGGCAGG	133496

CR847794.5	101	CCTCTGCACAAGGTCCCCTGCTCAGAGGCCTCTCCCCAGAGTCAGTTTCT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133497	CCTCTGCACAAGGTCCCCTGCTCAGAGGCCTCTCCCCAGAGTCAGTTTCT	133546

CR847794.5	151	ATCATATCATCGTACTGTACTTTCTCTTCAAGCACTTATTTGAAACGATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133547	ATCATATCATCGTACTGTACTTTCTCTTCAAGCACTTATTTGAAACGATC	133596

CR847794.5	201	TCGTTCATCTGTTTAGGTCCCATCTGCTCGCTCGCTCTCCCACTAGGATG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133597	TCGTTCATCTGTTTAGGTCCCATCTGCTCGCTCGCTCTCCCACTAGGATG	133646

CR847794.5	251	TAGGCTCTCAGGGTCCAAGTGGCCCCCAGGCTAATACAGTGCCTGGCTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133647	TAGGCTCTCAGGGTCCAAGTGGCCCCCAGGCTAATACAGTGCCTGGCTCT	133696

CR847794.5	301	GACATTCCTGTTGAACGAGTGAATGTTTCATCTTCCCCACTCCTAGCATT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133697	GACATTCCTGTTGAACGAGTGAATGTTTCATCTTCCCCACTCCTAGCATT	133746

CR847794.5	351	TATCATCTTCCAGAAGAAAAGAGTTTTAAAACAAAAGTTGAGAATAAAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133747	TATCATCTTCCAGAAGAAAAGAGTTTTAAAACAAAAGTTGAGAATAAAGA	133796

CR847794.5	401	AAAGCAGGAGCTTCCCAAACATTTCCAAAGCTGCCTAGAAAAAGGATTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133797	AAAGCAGGAGCTTCCCAAACATTTCCAAAGCTGCCTAGAAAAAGGATTTG	133846

CR847794.5	451	AAAAGGTGCCACCCATAGAGAGAGCTATGGGTGGGACCACTTCTCACAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133847	AAAAGGTGCCACCCATAGAGAGAGCTATGGGTGGGACCACTTCTCACAAT	133896

CR847794.5	501	CTCCAAGAGAGATGGCTGCAGGGAGAATTCCCACAGATTCCCAGAAATAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133897	CTCCAAGAGAGATGGCTGCAGGGAGAATTCCCACAGATTCCCAGAAATAA	133946

CR847794.5	551	CATTTCCAAACAATGGCTCCTTCTGTAGTCGTCTTTATTTAGAGCAGAAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133947	CATTTCCAAACAATGGCTCCTTCTGTAGTCGTCTTTATTTAGAGCAGAAT	133996

CR847794.5	601	TCAGACTCAGCTGGTATCCCCCAGGGCAACCCCAGGATGGGGAAGGGCTG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	133997	TCAGACTCAGCTGGTATCCCCCAGGGCAACCCCAGGATGGGGAAGGGCTG	134046

CR847794.5	651	GTCTGTCCCCACCCACTTCTCCAGGATCCTCCCAGCCCCCAGGCTGGCTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134047	GTCTGTCCCCACCCACTTCTCCAGGATCCTCCCAGCCCCCAGGCTGGCTT	134096

CR847794.5	701	TCCCTCCAACTGTCAGCTGCTTAGCTGCTCATCTGGGGATTGGAGCTGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134097	TCCCTCCAACTGTCAGCTGCTTAGCTGCTCATCTGGGGATTGGAGCTGGA	134146

CR847794.5	751	GCATCTGTCAAGGTTGTCTCCTTGACAAACAGCTTCCTCTTTGGAAATGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134147	GCATCTGTCAAGGTTGTCTCCTTGACAAACAGCTTCCTCTTTGGAAATGG	134196

CR847794.5	801	CTTCACTCAGGTCCTGCAGGTCATCGAGCAGGACAGAGAGGGACCCTGGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134197	CTTCACTCAGGTCCTGCAGGTCATCGAGCAGGACAGAGAGGGACCCTGGG	134246

CR847794.5	851	AAGGAAGACAGCAGATGAGCACCAGACAAGGGAAGGTGCTCGTGGTTACA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134247	AAGGAAGACAGCAGATGAGCACCAGACAAGGGAAGGTGCTCGTGGTTACA	134296

CR847794.5	901	GAGGAAACAGGGCTGGCACAGGAAATGAGGAATGGGAGAGAGGAGGCTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134297	GAGGAAACAGGGCTGGCACAGGAAATGAGGAATGGGAGAGAGGAGGCTCT	134346

CR847794.5	951	TTGGTCCAAGCTGGGCATCGCTAAAAGAGGCTAAGGGCCTCGAAGGACCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134347	TTGGTCCAAGCTGGGCATCGCTAAAAGAGGCTAAGGGCCTCGAAGGACCG	134396

CR847794.5	1001	CAGAGAACAACACTCATCATGCCAGAGTCTGAAGAGGAGATTCCTGAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134397	CAGAGAACAACACTCATCATGCCAGAGTCTGAAGAGGAGATTCCTGAAGT	134446

CR847794.5	1051	GCGCGCATTTGTCCCTTGTCCCTTTGTGCTTGGCCCAAGACCTTTTATGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134447	GCGCGCATTTGTCCCTTGTCCCTTTGTGCTTGGCCCAAGACCTTTTATGG	134496

CR847794.5	1101	ACTCCCTGGTGGGCACTGCTGCTGCTACAGGTGCAGATGCTGAACACTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134497	ACTCCCTGGTGGGCACTGCTGCTGCTACAGGTGCAGATGCTGAACACTCT	134546

CR847794.5	1151	GGAGGCCTGGGGCTGGACACCACAGATTTCTTCTTATCCAGTAGGGAAGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134547	GGAGGCCTGGGGCTGGACACCACAGATTTCTTCTTATCCAGTAGGGAAGG	134596

CR847794.5	1201	AAGAACTGTCAACAGTCGCTGCTGCTTGTAACGGGAGAGGAGACCTTCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134597	AAGAACTGTCAACAGTCGCTGCTGCTTGTAACGGGAGAGGAGACCTTCCT	134646

CR847794.5	1251	GCTGCAAGGTGGCCTGGGAAGGAGAGGGTTAAACCTAGCCCGGATAGAGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134647	GCTGCAAGGTGGCCTGGGAAGGAGAGGGTTAAACCTAGCCCGGATAGAGC	134696

CR847794.5	1301	CTCCCTCACCATCCTCTTTCCACACCTCTAGCCCAGGAACCAGCCCAGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134697	CTCCCTCACCATCCTCTTTCCACACCTCTAGCCCAGGAACCAGCCCAGGA	134746

CR847794.5	1351	TGGGCCCTAGTGTCTGCCTGTCTGCCCTCCTGTCTCCTACCAGCATGAGG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134747	TGGGCCCTAGTGTCTGCCTGTCTGCCCTCCTGTCTCCTACCAGCATGAGG	134796

CR847794.5	1401	TTCTTATCCCTCTCTAGCTCCTGCAAGCGCCGGGCCAGTCGCTGCCCCTC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134797	TTCTTATCCCTCTCTAGCTCCTGCAAGCGCCGGGCCAGTCGCTGCCCCTC	134846

CR847794.5	1451	CTCCTTCCGGGCCTCCTCCTGCAGACGCCTGAGTTCCTGGCTCCGCTCCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134847	CTCCTTCCGGGCCTCCTCCTGCAGACGCCTGAGTTCCTGGCTCCGCTCCT	134896

CR847794.5	1501	TTTCCTGGGCGGCTCTGCGCTGAATCTGGCGCAAGGAGACCACTACAGAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134897	TTTCCTGGGCGGCTCTGCGCTGAATCTGGCGCAAGGAGACCACTACAGAG	134946

CR847794.5	1551	AGGCCAAGGCACAGAGGAGGCAGGTGTGAGTCAGGCCAGAGGCAGCCAGG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134947	AGGCCAAGGCACAGAGGAGGCAGGTGTGAGTCAGGCCAGAGGCAGCCAGG	134996

CR847794.5	1601	CACCATGAAGACAGGAACAAACGCTGGGTCACCAACTCTGTGGCTTGGGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	134997	CACCATGAAGACAGGAACAAACGCTGGGTCACCAACTCTGTGGCTTGGGG	135046

CR847794.5	1651	AGGCTGTTCTGCTCTGTGGATCTGTCTCTTCTGTACAGTTGGAGGGGTGG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135047	AGGCTGTTCTGCTCTGTGGATCTGTCTCTTCTGTACAGTTGGAGGGGTGG	135096

CR847794.5	1701	GCTGATGCTCTAGGAGCCTGGGAATCTGAACCTAAGTATCTTCCTCATCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135097	GCTGATGCTCTAGGAGCCTGGGAATCTGAACCTAAGTATCTTCCTCATCC	135146

CR847794.5	1751	CTGAACCATCCTGGAGTTCCTCAGGGGAAATCTGAACATGAACTGGGTTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135147	CTGAACCATCCTGGAGTTCCTCAGGGGAAATCTGAACATGAACTGGGTTA	135196

CR847794.5	1801	GATTTTGTGCAATTAGTGTTCACTGTCTTAAAGTGTGATGATTGCAGCTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135197	GATTTTGTGCAATTAGTGTTCACTGTCTTAAAGTGTGATGATTGCAGCTA	135246

CR847794.5	1851	TATAGGAGAATTTACTGGCTTTGGGAGATGCGGCTGAACAACTTATGTTT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135247	TATAGGAGAATTTACTGGCTTTGGGAGATGCGGCTGAACAACTTATGTTT	135296

CR847794.5	1901	ACAACTTACTTAGGCGTGGTGGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135297	ACAACTTACTTAGGCGTGGTGGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGG	135346

CR847794.5	1951	ATGCCAAAGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGCTCGAGACCATCCTGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927139.8	135347	ATGCCAAAGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGCTCGAGACCATCCTGGCC	135396

Overview

Query
CR847794.5 - 59046 bps
Hit
BX927139.8 - 135396 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link