<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX908738.4	1	GGCCAACTATATCTAACACATCATGCGTATCAGACAATATGAACAAGAAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91512	GGCCAACTATATCTAACACATCATGCGTATCAGACAATATGAACAAGAAG	91561

BX908738.4	51	TGGTCAATACATTAAAAGCCTTGATAAGACACATGTGATCCAGAGAGTGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91562	TGGTCAATACATTAAAAGCCTTGATAAGACACATGTGATCCAGAGAGTGA	91611

BX908738.4	101	GTGTTGCACTCCATAAAGATTCAGGGACCTAAAGCATAAAAGTTTTAAGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91612	GTGTTGCACTCCATAAAGATTCAGGGACCTAAAGCATAAAAGTTTTAAGT	91661

BX908738.4	151	GTTTATTGGTCTGGGGCACTATGAGACATTCTATCTAAAGTAAAGGATAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91662	GTTTATTGGTCTGGGGCACTATGAGACATTCTATCTAAAGTAAAGGATAC	91711

BX908738.4	201	ATTTTTGCATTATGCATTTCCTATCATAAAAAAGAAGCAAAGTGCCTGGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91712	ATTTTTGCATTATGCATTTCCTATCATAAAAAAGAAGCAAAGTGCCTGGC	91761

BX908738.4	251	AGACCTCTCTGTACTTTGTAGTAAGCATATTTGACACTATCGAGTACTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91762	AGACCTCTCTGTACTTTGTAGTAAGCATATTTGACACTATCGAGTACTGT	91811

BX908738.4	301	TCTAATTCATCCACTAGGTGCTGTATTTGAATGGCCTTCAGGGTAAGAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91812	TCTAATTCATCCACTAGGTGCTGTATTTGAATGGCCTTCAGGGTAAGAAT	91861

BX908738.4	351	GGGCTCTATAGCAAGTCTAAATTTCACCATAAATGAGGTGGAATTTATGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91862	GGGCTCTATAGCAAGTCTAAATTTCACCATAAATGAGGTGGAATTTATGG	91911

BX908738.4	401	CAAGTTTATGGGAAGATCATAACAAAATTCTTAGGGTTTTGATAAAACTC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91912	CAAGTTTATGGGAAGATCATAACAAAATTCTTAGGGTTTTGATAAAACTC	91961

BX908738.4	451	TGCTATCTACAGCACAGGATTGTATACATTTCAAAAATAAAGCCCTGGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	91962	TGCTATCTACAGCACAGGATTGTATACATTTCAAAAATAAAGCCCTGGTG	92011

BX908738.4	501	TTTTACTGAATTCTGGGTAGAGAAATAACATCTGACCATGGAACAACAAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92012	TTTTACTGAATTCTGGGTAGAGAAATAACATCTGACCATGGAACAACAAA	92061

BX908738.4	551	TAACCATGCAGGCAAAACTACCCATATGAGCTGGGGACTGTCTGAACCAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92062	TAACCATGCAGGCAAAACTACCCATATGAGCTGGGGACTGTCTGAACCAT	92111

BX908738.4	601	CAAGTTATTAGGTTGAGTGGATACAGAGCAATCACTGTAACACGGCATTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92112	CAAGTTATTAGGTTGAGTGGATACAGAGCAATCACTGTAACACGGCATTA	92161

BX908738.4	651	GTACATCCAGGATTGACCACAGCATGACTAGAGGGCAGAGGCAAACAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92162	GTACATCCAGGATTGACCACAGCATGACTAGAGGGCAGAGGCAAACAGTA	92211

BX908738.4	701	TGAGCAAGTAGCCCAGGACTTCATGCTATTCACCACTTTTGCATCAATAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92212	TGAGCAAGTAGCCCAGGACTTCATGCTATTCACCACTTTTGCATCAATAT	92261

BX908738.4	751	CTCTTCTTCAGACCACACTTACGCCTCCAAGAGAGAACACTTCCAACTCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92262	CTCTTCTTCAGACCACACTTACGCCTCCAAGAGAGAACACTTCCAACTCT	92311

BX908738.4	801	AATGGAGGAGAAAAATGTCAAGCTTGGTTCATTAATGGGTCAGCTTGGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92312	AATGGAGGAGAAAAATGTCAAGCTTGGTTCATTAATGGGTCAGCTTGGTA	92361

BX908738.4	851	TGTGAGTCCAAGTCAAAAAGGATGAAGATAAATTATAGCCTCGCTTACGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92362	TGTGAGTCCAAGTCAAAAAGGATGAAGATAAATTATAGCCTCGCTTACGG	92411

BX908738.4	901	TGATCTTGAAAAATAGTAGTGAGGAAAACGCCTCCCAATGGACAGAGTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92412	TGATCTTGAAAAATAGTAGTGAGGAAAACGCCTCCCAATGGACAGAGTTT	92461

BX908738.4	951	CAGATGGTACCCAGTCATTCACTTTGTGTGGAAAGAGAAGTAGTTTGAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92462	CAGATGGTACCCAGTCATTCACTTTGTGTGGAAAGAGAAGTAGTTTGAAG	92511

BX908738.4	1001	TTAGAATATGTATAACTCATAGGTAGTGATAAATGGCTTAGGAGGCTTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92512	TTAGAATATGTATAACTCATAGGTAGTGATAAATGGCTTAGGAGGCTTTT	92561

BX908738.4	1051	CAGGTGGCTGGAAAGAAAAAGATAGAAACACTTGGAAAAAAGAAGTCTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92562	CAGGTGGCTGGAAAGAAAAAGATAGAAACACTTGGAAAAAAGAAGTCTGG	92611

BX908738.4	1101	AACAGAGGCACATGCATAAACATATAAGAGTGAAGGTATGAAGTGTTGCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92612	AACAGAGGCACATGCATAAACATATAAGAGTGAAGGTATGAAGTGTTGCA	92661

BX908738.4	1151	TTATTTGTATTACATGCTAAAACTACAAGATGGAATCCATCATAGAAAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92662	TTATTTGTATTACATGCTAAAACTACAAGATGGAATCCATCATAGAAAAT	92711

BX908738.4	1201	GAATTAAGCAACTAGGTAGAAAACGTGACTTGGCGAGCAGTTATTGTCAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92712	GAATTAAGCAACTAGGTAGAAAACGTGACTTGGCGAGCAGTTATTGTCAA	92761

BX908738.4	1251	GAGCTTCTGACATTTGCCCTCATTATCCTACCTGCAATGCTAGAGCAATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92762	GAGCTTCTGACATTTGCCCTCATTATCCTACCTGCAATGCTAGAGCAATG	92811

BX908738.4	1301	AGCTTATGAATGAAGCCACCATGATAGTAGGGATAGAAGCAATGCATGGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92812	AGCTTATGAATGAAGCCACCATGATAGTAGGGATAGAAGCAATGCATGGG	92861

BX908738.4	1351	TTTAACAGCATGCATTATAGCCACTGGTCAAACATCCAGTCTTCCATCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92862	TTTAACAGCATGCATTATAGCCACTGGTCAAACATCCAGTCTTCCATCAA	92911

BX908738.4	1401	TAAGTGTCCCATGCAATGACTGGATAAAATAGTTTCCCATCAAAAGATCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92912	TAAGTGTCCCATGCAATGACTGGATAAAATAGTTTCCCATCAAAAGATCA	92961

BX908738.4	1451	ACCAGTTATTTAATGTCAAGTTGATGACACTGGACTTTTTCTACTTTGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	92962	ACCAGTTATTTAATGTCAAGTTGATGACACTGGACTTTTTCTACTTTGAA	93011

BX908738.4	1501	TGTAGCAATTTTTTTTGGTAGGAATAGATACACATACTCCAGGCATGGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93012	TGTAGCAATTTTTTTTGGTAGGAATAGATACACATACTCCAGGCATGGGT	93061

BX908738.4	1551	TTCTATTCCTGAACATAAGTTCTCAGCCAGCATGACTGTCTAAAGGCTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93062	TTCTATTCCTGAACATAAGTTCTCAGCCAGCATGACTGTCTAAAGGCTTA	93111

BX908738.4	1601	TAGGATGTTTGACGCAGCAGCAGGAGATCCCACATACCATTGTATCAGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93112	TAGGATGTTTGACGCAGCAGCAGGAGATCCCACATACCATTGTATCAGAA	93161

BX908738.4	1651	AAAAGGGCCGACTTAATGGCAAAGAAAGTGTAGGAGTGGACTTATGACCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93162	AAAAGGGCCGACTTAATGGCAAAGAAAGTGTAGGAGTGGACTTATGACCA	93211

BX908738.4	1701	TGGAATCCATTGGCCATATCACATATTGCACTATCATAAGTGATCTATTA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93212	TGGAATCCATTGGCCATATCACATATTGCACTATCATAAGTGATCTATTA	93261

BX908738.4	1751	GAGTCATGGAGGGATCTGTTGAAGCTACACCTGAAATTCCAGCTCAGATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93262	GAGTCATGGAGGGATCTGTTGAAGCTACACCTGAAATTCCAGCTCAGATG	93311

BX908738.4	1801	AAATGTCATCCTTCAAGACCCAGTACTTTAAATCAATTATCTTTCTATGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93312	AAATGTCATCCTTCAAGACCCAGTACTTTAAATCAATTATCTTTCTATGG	93361

BX908738.4	1851	TGCTGTGTCCTCACTAGGAAGAATGCATGGTTTAGAAACCAAAAGGTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93362	TGCTGTGTCCTCACTAGGAAGAATGCATGGTTTAGAAACCAAAAGGTGAA	93411

BX908738.4	1901	AGCCCTTCTTAGAATCCCTACCAGTAACTCATTTGAGAAATTTGTGTTTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93412	AGCCCTTCTTAGAATCCCTACCAGTAACTCATTTGAGAAATTTGTGTTTT	93461

BX908738.4	1951	TTTTCTCCACAATTATAAGCTCTGTGAGTTTAGAGGTTCTAGCTCTCTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927132.7	93462	TTTTCTCCACAATTATAAGCTCTGTGAGTTTAGAGGTTCTAGCTCTCTAA	93511

Overview

Query
BX908738.4 - 94877 bps
Hit
BX927132.7 - 93511 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link