<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL954847.17	1	AAGCTTTTTCTGACCCTGTCAGTCAAAGGCAGATTCGCCAGGTCTCGAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152492	AAGCTTTTTCTGACCCTGTCAGTCAAAGGCAGATTCGCCAGGTCTCGAAA	152541

AL954847.17	51	TGGTCGATGCTTTGAATAGCTTTAGTCACATGACCAGGGGTTTCGAAACA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152542	TGGTCGATGCTTTGAATAGCTTTAGTCACATGACCAGGGGTTTCGAAACA	152591

AL954847.17	101	CTTTAGTCACGTGACCTGGGTTTTTCGGATCATGCTTCGATGCAGTGTTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152592	CTTTAGTCACGTGACCTGGGTTTTTCGGATCATGCTTCGATGCAGTGTTT	152641

AL954847.17	151	CAAAACTATTGCCCTTCGGGCAATCTCGACACTGTCGAAATGTCAGTTTC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152642	CAAAACTATTGCCCTTCGGGCAATCTCGACACTGTCGAAATGTCAGTTTC	152691

AL954847.17	201	CCGTCAGCCATCCCTACCTGTACTGACCATCTGCCTGTTTATCGACCACG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152692	CCGTCAGCCATCCCTACCTGTACTGACCATCTGCCTGTTTATCGACCACG	152741

AL954847.17	251	ACTCTGGATTGCCCATATACATCTCTTTGCCCCTGTGTTGTCTGTTGCTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152742	ACTCTGGATTGCCCATATACATCTCTTTGCCCCTGTGTTGTCTGTTGCTT	152791

AL954847.17	301	GCCTGACCATTCCATTTAATAAACCCTGCATTTGAATTCACACCTCCTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152792	GCCTGACCATTCCATTTAATAAACCCTGCATTTGAATTCACACCTCCTTC	152841

AL954847.17	351	CTGTTCTGAACATCCAAATTAATGTTACAGTGAACATATATTAGTAGATG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152842	CTGTTCTGAACATCCAAATTAATGTTACAGTGAACATATATTAGTAGATG	152891

AL954847.17	401	TTGAACAATGATTAATAAATGTAAATAAAGCACAATAATATAATAAATAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152892	TTGAACAATGATTAATAAATGTAAATAAAGCACAATAATATAATAAATAT	152941

AL954847.17	451	AATCAAATTATGCAGGAGAAGCATTGTTTGTCATGATAGGAAATATGAAT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152942	AATCAAATTATGCAGGAGAAGCATTGTTTGTCATGATAGGAAATATGAAT	152991

AL954847.17	501	TTATATAATATAATATATTGTGTTATGTTATATTATTTAAAGGGTGGCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	152992	TTATATAATATAATATATTGTGTTATGTTATATTATTTAAAGGGTGGCAC	153041

AL954847.17	551	GGTGGCTCAGGGGTTAACACTCAGAGCAAGCCTCAGAGCAAGTAGGTTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153042	GGTGGCTCAGGGGTTAACACTCAGAGCAAGCCTCAGAGCAAGTAGGTTGC	153091

AL954847.17	601	TGGTTCGAGTCCTAGCTGGGCCAGTTGGCGTTGCTAAGTGGAATTTGTAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153092	TGGTTCGAGTCCTAGCTGGGCCAGTTGGCGTTGCTAAGTGGAATTTGTAT	153141

AL954847.17	651	GTTCTCCCTGTGTTGGCGTGTGGTTCCTGAAGGAAATTGAATAACTGAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153142	GTTCTCCCTGTGTTGGCGTGTGGTTCCTGAAGGAAATTGAATAACTGAAT	153191

AL954847.17	701	TATATTAATTACTATTCATTCATTTATTCATTTTATTTTCGGCTTAGTCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153192	TATATTAATTACTATTCATTCATTTATTCATTTTATTTTCGGCTTAGTCC	153241

AL954847.17	751	CTTTATTAATTTGGGCTCGTCACAGTAGAATAAACCGCCAACTTATCCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153242	CTTTATTAATTTGGGCTCGTCACAGTAGAATAAACCGCCAACTTATCCAG	153291

AL954847.17	801	CATATGTTTTACACAGCGGATGCCTTTCCAGATGCAACCCATCTCTGGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153292	CATATGTTTTACACAGCGGATGCCTTTCCAGATGCAACCCATCTCTGGGA	153341

AL954847.17	851	AACATCCATACACACTCATTCACACTCTTACACTATGGTCAATTTAGCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153342	AACATCCATACACACTCATTCACACTCTTACACTATGGTCAATTTAGCTT	153391

AL954847.17	901	ACATAATTCCCCTATAGCGCATGTCTTTGGAATTGTGCCGGCAGCTAGCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153392	ACATAATTCCCCTATAGCGCATGTCTTTGGAATTGTGCCGGCAGCTAGCT	153441

AL954847.17	951	CTCTGCAATTCTCACATGGTCATCCACTGAAGCTAAGCGTGGCTGTACCC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153442	CTCTGCAATTCTCACATGGTCATCCACTGAAGCTAAGCGTGGCTGTACCC	153491

AL954847.17	1001	GGTCAGTACCTGGATAGGAAACCACATGGGAAAGCTAGGTTGCTGCCGAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153492	GGTCAGTACCTGGATAGGAAACCACATGGGAAAGCTAGGTTGCTGCCGAA	153541

AL954847.17	1051	AGGGGTGTTAGTGAGGTTGCAACCTATTGAATAATTTGTTAGTGAGAGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153542	AGGGGTGTTAGTGAGGTTGCAACCTATTGAATAATTTGTTAGTGAGAGGG	153591

AL954847.17	1101	CACTCAACCTGCAGTCTGTATGGGTCGTAAGGGGCCGAAGGGGACTCTAT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153592	CACTCAACCTGCAGTCTGTATGGGTCGTAAGGGGCCGAAGGGGACTCTAT	153641

AL954847.17	1151	ACTGCTCAGTGAGCACTGTTCTTCAGATAAGATGTTAAACTGAGGACCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153642	ACTGCTCAGTGAGCACTGTTCTTCAGATAAGATGTTAAACTGAGGACCTT	153691

AL954847.17	1201	ACTCTTTGTGGTCGTGAAAAATCCCAGAATGTTCTTTAAAAAAGAGTGGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153692	ACTCTTTGTGGTCGTGAAAAATCCCAGAATGTTCTTTAAAAAAGAGTGGG	153741

AL954847.17	1251	GGTTTAACTCTGGCATCCTGGCCAAATTTGCCCACGGGCCTCTGTCAGTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153742	GGTTTAACTCTGGCATCCTGGCCAAATTTGCCCACGGGCCTCTGTCAGTC	153791

AL954847.17	1301	ACGGCCTTATAACCATCCCATATCATAATTGGATTCATCACTCTGTCTCC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153792	ACGGCCTTATAACCATCCCATATCATAATTGGATTCATCACTCTGTCTCC	153841

AL954847.17	1351	TCTCCACCAATCAGCTTGTGTGTGGATGCTGCACACTGGTGGTAGATGAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153842	TCTCCACCAATCAGCTTGTGTGTGGATGCTGCACACTGGTGGTAGATGAC	153891

AL954847.17	1401	AAGATTCCCTCCTAATGTGTAAAGTACTTTGAGTGTCAAGAAAAGGGCTT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153892	AAGATTCCCTCCTAATGTGTAAAGTACTTTGAGTGTCAAGAAAAGGGCTT	153941

AL954847.17	1451	TATAAATGTTAGGAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153942	TATAAATGTTAGGAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT	153991

AL954847.17	1501	ATTATTATTATTATTATTACACCCGGAGGAAGCCCACGCGAACACGGGCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	153992	ATTATTATTATTATTATTACACCCGGAGGAAGCCCACGCGAACACGGGCA	154041

AL954847.17	1551	TGCAAAGTCCACACAGAAATGACAACTGACCCAGCCGATGCTCGAACCAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154042	TGCAAAGTCCACACAGAAATGACAACTGACCCAGCCGATGCTCGAACCAG	154091

AL954847.17	1601	TGATCATGTTACCCACTGCGCCACCGTGACAGCCTATTATTAACTAAATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154092	TGATCATGTTACCCACTGCGCCACCGTGACAGCCTATTATTAACTAAATT	154141

AL954847.17	1651	ATAAAGAAATATAATATATTGTGTTAAAATATGACAAAAGCAGTGAAAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154142	ATAAAGAAATATAATATATTGTGTTAAAATATGACAAAAGCAGTGAAAGA	154191

AL954847.17	1701	AAAAAATAAACTCCATCAAATGAGACATGTTAAACATTCTTTTGATGTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154192	AAAAAATAAACTCCATCAAATGAGACATGTTAAACATTCTTTTGATGTTT	154241

AL954847.17	1751	ACTGTCAATATGTGACATTTTTATAGTGAAATTATGACAATAAATGAGTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154242	ACTGTCAATATGTGACATTTTTATAGTGAAATTATGACAATAAATGAGTT	154291

AL954847.17	1801	GACATCAAAATATTTACATAATTAGTTATACTTTATATGGTTTGAAATTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154292	GACATCAAAATATTTACATAATTAGTTATACTTTATATGGTTTGAAATTG	154341

AL954847.17	1851	AGAAACCATTTTTTATAACAAATTTTGTTATTGACTATCAAGGCTGAGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154342	AGAAACCATTTTTTATAACAAATTTTGTTATTGACTATCAAGGCTGAGAG	154391

AL954847.17	1901	GAGCCTTTCCTTATCTGTAAATATAGCAGGGCTTCTCAAATATTATTGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154392	GAGCCTTTCCTTATCTGTAAATATAGCAGGGCTTCTCAAATATTATTGTC	154441

AL954847.17	1951	TAAAATTATGTTCTACTATTATTGAAAAAACTTTTGTTAAAGATAAAATG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927129.10	154442	TAAAATTATGTTCTACTATTATTGAAAAAACTTTTGTTAAAGATAAAATG	154491

Overview

Query
AL954847.17 - 278040 bps
Hit
BX927129.10 - 154491 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196120001200011524921544911
287.69276497173484173980154431549421
388.89272448173979174426154970554371
489.66278341914193546125158298624841
594.0121862733179091181823158300610701
682.256661614200244201857-158341599631
794.7130933765259931263695-158595623741
885.6455310444823949282159097601341
984.245421134199034200167-160068612281
1086.675209234929250214160181611031
1187.624697695036651134161467622411
1287.27351585198165198749-161530621181
1391.2412311780258145259924-162289640331
1484.557511574196308197881-162494640331
1588.938981466181853183318162552640331
1690.313945854713247716163456640331
1785.473125785184752424163456640331
1885.23907388614186878-195428961701
1994.143724937161372105198619990961
2094.493454747119371666199094995651
2185.2390738861418687811018951026371
Short-link