<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927097.11	1	AAGCTTGATTTTTGCTCTTTCCTTAGCTTAAACAACATTACAGTGGTGAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25054	AAGCTTGATTTTTGCTCTTTCCTTAGCTTAAACAACATTACAGTGGTGAC	25103

BX927097.11	51	ATCTGAGACTTTTGTAAATGGCTCTGGAATACTCTGTCTACTGGCCTCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25104	ATCTGAGACTTTTGTAAATGGCTCTGGAATACTCTGTCTACTGGCCTCTT	25153

BX927097.11	101	TTAAAGGTTTCAAACAGATGGAGGAGATTGAGTATGTATTGTTGTATGCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25154	TTAAAGGTTTCAAACAGATGGAGGAGATTGAGTATGTATTGTTGTATGCA	25203

BX927097.11	151	AATCACATGTACAAGTGCTAGCAGCTTTTGGAAACATGTACATTTTTTTT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25204	AATCACATGTACAAGTGCTAGCAGCTTTTGGAAACATGTACATTTTTTTT	25253

BX927097.11	201	CTTATTTGAAGGTTGGAAAGTTGGCGGATGGGAGATGGTGGTACCAATGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25254	CTTATTTGAAGGTTGGAAAGTTGGCGGATGGGAGATGGTGGTACCAATGA	25303

BX927097.11	251	GCTTGTGAAATACATACCTTCATGGACAGGGCTGGTAAAAATAAGGTATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25304	GCTTGTGAAATACATACCTTCATGGACAGGGCTGGTAAAAATAAGGTATG	25353

BX927097.11	301	GCATCTGCATTGAGCACGAGATTAGGAATAAGCGTTACCTACAACATGAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25354	GCATCTGCATTGAGCACGAGATTAGGAATAAGCGTTACCTACAACATGAG	25403

BX927097.11	351	AGATATTTATAAGGTGTATGATGACCTCTAGTGGAGATCCTTAAACATAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25404	AGATATTTATAAGGTGTATGATGACCTCTAGTGGAGATCCTTAAACATAT	25453

BX927097.11	401	ACTTCAATGGCAAATGAAATGTGTACTTTAAGTTAGTGACAGTAAAGATT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25454	ACTTCAATGGCAAATGAAATGTGTACTTTAAGTTAGTGACAGTAAAGATT	25503

BX927097.11	451	TGTATTAGCGTTAGAACAGTGTATTTGAATTATATCTGAAGAATCATGTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25504	TGTATTAGCGTTAGAACAGTGTATTTGAATTATATCTGAAGAATCATGTG	25553

BX927097.11	501	CCATGAATAAAAGACTGGAGATTAATGGCACAATTAAATACACAAGGCTT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25554	CCATGAATAAAAGACTGGAGATTAATGGCACAATTAAATACACAAGGCTT	25603

BX927097.11	551	AACATTAACTTTTTTGATCACCGTCCTGTGTGGCTAGTAGTTTTCCAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25604	AACATTAACTTTTTTGATCACCGTCCTGTGTGGCTAGTAGTTTTCCAACA	25653

BX927097.11	601	TTACTAGTCACTCACCATTTTCACTAGCCACAATTTTGTTGTTGAAAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25654	TTACTAGTCACTCACCATTTTCACTAGCCACAATTTTGTTGTTGAAAAAT	25703

BX927097.11	651	ATATATTTTATATGCATAAATATGACTTTGATGTGCTAAAATTACTTGAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25704	ATATATTTTATATGCATAAATATGACTTTGATGTGCTAAAATTACTTGAT	25753

BX927097.11	701	TTAGATTTTGTGGAATGTCCACATTCCTCCTCGTCATTTTACTTTTTGTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25754	TTAGATTTTGTGGAATGTCCACATTCCTCCTCGTCATTTTACTTTTTGTG	25803

BX927097.11	751	TATGTTGTGTATGAGCTTGCTCAATTAGCATGAGCACATGGGTCATGCTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25804	TATGTTGTGTATGAGCTTGCTCAATTAGCATGAGCACATGGGTCATGCTT	25853

BX927097.11	801	TCATAATGTTGTATTACAATTAGTTTTTATTTCACATGAAATAAAAGAGC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25854	TCATAATGTTGTATTACAATTAGTTTTTATTTCACATGAAATAAAAGAGC	25903

BX927097.11	851	TCAATATAATAAGTAATAAATATAAATAAAAAATATAAATATATAAAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25904	TCAATATAATAAGTAATAAATATAAATAAAAAATATAAATATATAAAAAT	25953

BX927097.11	901	AAATATAAATAAGTAATTATTTCTTAGCCACAAATTTTAAATAGTGTGTA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	25954	AAATATAAATAAGTAATTATTTCTTAGCCACAAATTTTAAATAGTGTGTA	26003

BX927097.11	951	AAAGCAAGCAAAATATTGCTGTATACTATACTTTTTATTTAACAAAACAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26004	AAAGCAAGCAAAATATTGCTGTATACTATACTTTTTATTTAACAAAACAT	26053

BX927097.11	1001	TTCTTAAAAAAGCAAAAACGGTTGACACCAGGTAACTACACATTAATGGA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26054	TTCTTAAAAAAGCAAAAACGGTTGACACCAGGTAACTACACATTAATGGA	26103

BX927097.11	1051	AAGTTAATATTCTATATCCTGTTCAAATAATAGCTAAAGTGAAAACAACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26104	AAGTTAATATTCTATATCCTGTTCAAATAATAGCTAAAGTGAAAACAACT	26153

BX927097.11	1101	GGTGCTGCTTACAAAAAGACCAATCTGGAGCAATCAACTTTTTGTCTAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26154	GGTGCTGCTTACAAAAAGACCAATCTGGAGCAATCAACTTTTTGTCTAGT	26203

BX927097.11	1151	CTATTTGAAAGAGAACCGATCACACCAGTTGCGTTTCCAGGCACAGTTGT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26204	CTATTTGAAAGAGAACCGATCACACCAGTTGCGTTTCCAGGCACAGTTGT	26253

BX927097.11	1201	TTCAAGCAAGGAATCGGGAGCTCGCACGTGTTTTAACAGTCGCAAGCATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26254	TTCAAGCAAGGAATCGGGAGCTCGCACGTGTTTTAACAGTCGCAAGCATC	26303

BX927097.11	1251	ACATCAGCTGTTGGCATGAGGGATTATCCTCTCATTTGGTATTTAACAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26304	ACATCAGCTGTTGGCATGAGGGATTATCCTCTCATTTGGTATTTAACAGG	26353

BX927097.11	1301	CTTTCTTTTGCCCGCACAAAATCAATTATATTTGTCAGTCATGCTGCTTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26354	CTTTCTTTTGCCCGCACAAAATCAATTATATTTGTCAGTCATGCTGCTTC	26403

BX927097.11	1351	TGCTGCATTTGCACAAATATTGGGCCATCCTTATTGTCGAACCCTGCTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26404	TGCTGCATTTGCACAAATATTGGGCCATCCTTATTGTCGAACCCTGCTTT	26453

BX927097.11	1401	TAAAAAAACTACAATTTAAAAATAATTTTCAACCAGCCAAAGTGGCTAGT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26454	TAAAAAAACTACAATTTAAAAATAATTTTCAACCAGCCAAAGTGGCTAGT	26503

BX927097.11	1451	GGAGGTGGCTGTCTAACCCGCCACAACTAAAATCCTAAAATGTACCCGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26504	GGAGGTGGCTGTCTAACCCGCCACAACTAAAATCCTAAAATGTACCCGCA	26553

BX927097.11	1501	TTTGGCGGGTGTTAATGTAAAGCCCTGTATATATATATATATATATATAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26554	TTTGGCGGGTGTTAATGTAAAGCCCTGTATATATATATATATATATATAT	26603

BX927097.11	1551	ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26604	ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTTGA	26653

BX927097.11	1601	AGTCAGAATTATTAGCCGCCCTGAATTATTAGCGCCCCTGTTTATTTTTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26654	AGTCAGAATTATTAGCCGCCCTGAATTATTAGCGCCCCTGTTTATTTTTT	26703

BX927097.11	1651	TTCCCAATTTCTGTTTAACAGAGAGAAGATTGTTTTAGCACATTTCTAAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26704	TTCCCAATTTCTGTTTAACAGAGAGAAGATTGTTTTAGCACATTTCTAAG	26753

BX927097.11	1701	CATAACAGTTTTAAAAACGTATTTCTAATTACTGATTTATTTTCTTTTTG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26754	CATAACAGTTTTAAAAACGTATTTCTAATTACTGATTTATTTTCTTTTTG	26803

BX927097.11	1751	TCATGATGACAGTAAATAATATTTTACTTGATTTTTTTCAAAACACTTCT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26804	TCATGATGACAGTAAATAATATTTTACTTGATTTTTTTCAAAACACTTCT	26853

BX927097.11	1801	ATACAGCTTAAAGTGACAATTAAAGGCTTAACTAGGTTAATAAGGTGAAC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26854	ATACAGCTTAAAGTGACAATTAAAGGCTTAACTAGGTTAATAAGGTGAAC	26903

BX927097.11	1851	TAGGCAGGTTAGGGTAATTAGGCAATTTATTGTATAACCATGGTTTGTTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26904	TAGGCAGGTTAGGGTAATTAGGCAATTTATTGTATAACCATGGTTTGTTC	26953

BX927097.11	1901	TGAAGATTATCGGGAAAAAAAATGCTTAAAGGGGCAAATAATTAACTGCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	26954	TGAAGATTATCGGGAAAAAAAATGCTTAAAGGGGCAAATAATTAACTGCT	27003

BX927097.11	1951	TTCATTCTAGCCAAAATAAAACAAATAAGACTTTCTCCAAAAGAAAAAAT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927110.10	27004	TTCATTCTAGCCAAAATAAAACAAATAAGACTTTCTCCAAAAGAAAAAAT	27053

Overview

Query
BX927097.11 - 97504 bps
Hit
BX927110.10 - 27053 bps
Total alignments
14
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001904200012000125054270531
287.91569055396554851114912391
390.6911216453136532991317633361
498.6132721949119562124202242731
5100336821182185-124206242731
6100336715281594-124207242731
710033681949219559-124207242741
8100336715291595124207242731
9100336721112177124207242731
10100417121072177126578266481
1110037701951119580-126579266481
12100336815281595-126581266481
1398.89619020862175-126581266701
1410033681949319560126581266481
Short-link