<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX957321.5	1	CAGTTCTGTACATTGCACAAATATGAGTGGTGTTTGATCCTGCAGTACCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84671	CAGTTCTGTACATTGCACAAATATGAGTGGTGTTTGATCCTGCAGTACCT	84720

BX957321.5	51	GCTACAATGCCAAAGTCTTGTAGGTGCTTGCCAATGCATTGAAATATCTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84721	GCTACAATGCCAAAGTCTTGTAGGTGCTTGCCAATGCATTGAAATATCTG	84770

BX957321.5	101	GGGTGCTCATGGGACTTGTTATAGGACTAGAATATTCTGAGTGGGTCCTT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84771	GGGTGCTCATGGGACTTGTTATAGGACTAGAATATTCTGAGTGGGTCCTT	84820

BX957321.5	151	TCTAATACACATTAACCGTGACACATCAAGTCATAATAGTCTGGTCAATC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84821	TCTAATACACATTAACCGTGACACATCAAGTCATAATAGTCTGGTCAATC	84870

BX957321.5	201	ACACAAAAATCCAACATGAATTACACACCAAAGATAAATACTTAAAACGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84871	ACACAAAAATCCAACATGAATTACACACCAAAGATAAATACTTAAAACGC	84920

BX957321.5	251	ATAATGCAATGTTTACGCTAATCTGCAAAAATGCATGTCTGGCCAGTAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84921	ATAATGCAATGTTTACGCTAATCTGCAAAAATGCATGTCTGGCCAGTAGA	84970

BX957321.5	301	TGACGATACTCAATTGTTATAAAATATTGTACACGCCTGCCTATATAGAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	84971	TGACGATACTCAATTGTTATAAAATATTGTACACGCCTGCCTATATAGAC	85020

BX957321.5	351	CAGGGGTGCCCAAACTTTTTCGTATAAAGGGCCACAAGCCAAACATTATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85021	CAGGGGTGCCCAAACTTTTTCGTATAAAGGGCCACAAGCCAAACATTATT	85070

BX957321.5	401	GAGAGCTGTTGGCCGAAGCCTAATATACCAAGCTGTATTACATTAAGTTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85071	GAGAGCTGTTGGCCGAAGCCTAATATACCAAGCTGTATTACATTAAGTTG	85120

BX957321.5	451	CCATGGGTAATTTCCTATTTTATTTCATAAGATTATATAAGCAGATAGAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85121	CCATGGGTAATTTCCTATTTTATTTCATAAGATTATATAAGCAGATAGAA	85170

BX957321.5	501	AACATTACTTTGAATCATATTAACTAATGCAGTATAACATTTAAAAATGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85171	AACATTACTTTGAATCATATTAACTAATGCAGTATAACATTTAAAAATGA	85220

BX957321.5	551	TAACATAATCACATTTATAACACAGTGGAGTGTAATTCTGAATTCTAGTC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85221	TAACATAATCACATTTATAACACAGTGGAGTGTAATTCTGAATTCTAGTC	85270

BX957321.5	601	AAGCAGTGTCAGCCTTTTCTTTGATTTGTCCTCGATCTGCTGAGTGACTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85271	AAGCAGTGTCAGCCTTTTCTTTGATTTGTCCTCGATCTGCTGAGTGACTT	85320

BX957321.5	651	TATGAACATTTGAAATCAAATCTGATTAATTGACACCATTTAATTGAAGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85321	TATGAACATTTGAAATCAAATCTGATTAATTGACACCATTTAATTGAAGG	85370

BX957321.5	701	ATTTCATTTTTGTTAGCTTTTAATAATAATAATTTCAATAAAACAAACAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85371	ATTTCATTTTTGTTAGCTTTTAATAATAATAATTTCAATAAAACAAACAA	85420

BX957321.5	751	ACAAAAGGTTACATTAGATATGAATTGACAACCTTTAAACCATACACATC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85421	ACAAAAGGTTACATTAGATATGAATTGACAACCTTTAAACCATACACATC	85470

BX957321.5	801	CCTCTTCCTCTCTTCTCAGATGGGATGATATCCAAATCAAAGGTTACTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85471	CCTCTTCCTCTCTTCTCAGATGGGATGATATCCAAATCAAAGGTTACTGT	85520

BX957321.5	851	GGGCTAACTTTGGTCCTATAGTTCGGGCATCCTCGCTATAGACTAAACAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85521	GGGCTAACTTTGGTCCTATAGTTCGGGCATCCTCGCTATAGACTAAACAA	85570

BX957321.5	901	GTAATATACATTTGCATTTTCACAAATTCATATTTTTGATGAGATGAAAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85571	GTAATATACATTTGCATTTTCACAAATTCATATTTTTGATGAGATGAAAC	85620

BX957321.5	951	TACATTTACATGGACATAATCTAAATAATTCAAATCTGAATAAGACAATA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85621	TACATTTACATGGACATAATCTAAATAATTCAAATCTGAATAAGACAATA	85670

BX957321.5	1001	TTTTGATTAAGGTGTTTATACTGTATGAGTTACTTTTTGAACGTTCCTTC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85671	TTTTGATTAAGGTGTTTATACTGTATGAGTTACTTTTTGAACGTTCCTTC	85720

BX957321.5	1051	TATGATCCAGTTTTACATGTTATAACAAATAATTTGATTAACTTCATTGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85721	TATGATCCAGTTTTACATGTTATAACAAATAATTTGATTAACTTCATTGC	85770

BX957321.5	1101	TATTCACATTTCCTCCAGAGTTTCATGTAATTTTGGACATTTCATTTTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85771	TATTCACATTTCCTCCAGAGTTTCATGTAATTTTGGACATTTCATTTTTA	85820

BX957321.5	1151	TTTTTGACTTTAACTGCAGTTTCACTTTCATTCAGGAACATTTCATTTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85821	TTTTTGACTTTAACTGCAGTTTCACTTTCATTCAGGAACATTTCATTTAT	85870

BX957321.5	1201	GCCCCCGCACTTGCTTGACAAACTGAGGTATTGGATGCACGGACAGGTGG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85871	GCCCCCGCACTTGCTTGACAAACTGAGGTATTGGATGCACGGACAGGTGG	85920

BX957321.5	1251	AACGTGGAAGAGTGTTGTTTTAATAAAATTTGATACCGCACGTGGAATGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85921	AACGTGGAAGAGTGTTGTTTTAATAAAATTTGATACCGCACGTGGAATGG	85970

BX957321.5	1301	AAAGAAAAAAATCACGATGCAGGTGTCTGTGGTCCTTCACTGACTCAGTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	85971	AAAGAAAAAAATCACGATGCAGGTGTCTGTGGTCCTTCACTGACTCAGTA	86020

BX957321.5	1351	GGTGCAGTTAAAAAACCCTGTGTATATGGAATATCCTGTCGCAAAACATG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86021	GGTGCAGTTAAAAAACCCTGTGTATATGGAATATCCTGTCGCAAAACATG	86070

BX957321.5	1401	GTGAAAAGTCCTACATGATGGTAATAGTTTGATGGCAGTGTTTACATGAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86071	GTGAAAAGTCCTACATGATGGTAATAGTTTGATGGCAGTGTTTACATGAC	86120

BX957321.5	1451	TGTACTGCTCTTCAATAATGCTACTAAAATTTCGGTTTAGTTTGATTATG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86121	TGTACTGCTCTTCAATAATGCTACTAAAATTTCGGTTTAGTTTGATTATG	86170

BX957321.5	1501	ACCATAATCAGATTAAATTAATCAAAAATTGCTGTTTACATTGTAGACTC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86171	ACCATAATCAGATTAAATTAATCAAAAATTGCTGTTTACATTGTAGACTC	86220

BX957321.5	1551	TTAATTAGAGATTAATTGCATTATATCATCCTTAAAATGAGTTTTTCAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86221	TTAATTAGAGATTAATTGCATTATATCATCCTTAAAATGAGTTTTTCAAA	86270

BX957321.5	1601	TTTATTTTAATCTAAATGACACCTCTGTGTTTAAGGGTTTGGTGGACGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86271	TTTATTTTAATCTAAATGACACCTCTGTGTTTAAGGGTTTGGTGGACGTT	86320

BX957321.5	1651	AAATACTGTGTGGCAGAACCATCCTATGCTCTCAAAACGTCATAAATTAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86321	AAATACTGTGTGGCAGAACCATCCTATGCTCTCAAAACGTCATAAATTAT	86370

BX957321.5	1701	GCAGAAAGTTGAAATTGAATGCGGGGGGTAAACGTACTCCATATTGTGCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86371	GCAGAAAGTTGAAATTGAATGCGGGGGGTAAACGTACTCCATATTGTGCC	86420

BX957321.5	1751	CAAATCTAACTCAATCCTTTACTCAACCCTAAAATTTTAAGTGTATAGAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86421	CAAATCTAACTCAATCCTTTACTCAACCCTAAAATTTTAAGTGTATAGAG	86470

BX957321.5	1801	TGGTAAATATTTTTTAATTTCAAAATCATACAAAATATTGTAAGTCATAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86471	TGGTAAATATTTTTTAATTTCAAAATCATACAAAATATTGTAAGTCATAT	86520

BX957321.5	1851	ATTCATTCAGAACTGGGTAGGCTAAATTGACCGTAGTGTACGTGTGTGAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86521	ATTCATTCAGAACTGGGTAGGCTAAATTGACCGTAGTGTACGTGTGTGAA	86570

BX957321.5	1901	TGAGTGAATGGCTGTTTCTCAGTGATGGGTTGCAGCTGCAAGAGCATCCG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86571	TGAGTGAATGGCTGTTTCTCAGTGATGGGTTGCAGCTGCAAGAGCATCCG	86620

BX957321.5	1951	CTGTGACCCCAGATAAATAAAGAGACTAAGCAGTAAAAATGAGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX927080.12	86621	CTGTGACCCCAGATAAATAAAGAGACTAAGCAGTAAAAATGAGTGAATTC	86670

Overview

Query
BX957321.5 - 51999 bps
Hit
BX927080.12 - 86670 bps
Total alignments
27
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001925200012000184671866701
295.437871879518881-1561657021
398.2112816833823549-1730574721
492.17961664611946284-1730574701
598.0811015633823537-1787380281
691.56791544611946272-1787380261
783.291423051736517669-114035143391
884.389118719972183114042142331
993.089013194239553127543276721
10100425632453300145352454071
11100435734333489145354454101
1210042564612046175145354454091
1394.55391103202232131-145908460171
1496.9442983202732124145925460221
1510038795076450842145926460041
1610038795076450842-145927460051
1710046881884318930162969630561
1810043815076450844-165162652421
1910040823202132102-165164652451
2010041843204132124165164652471
2110038795076450842165165652431
2298.6336735077250844-165605656771
2398.6536745077150844165609656821
2499.26631361879418929-172910730451
2588.941231971747517671-173436736341
2689.251251861027010455-173636738211
2794.1241511729717347-173772738221
Short-link