<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX908761.10	1	AAGCTTCTTTTTGTATCAAGCCTAAGGCAACAAACTTTTTTTTAAAAGAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57486	AAGCTTCTTTTTGTATCAAGCCTAAGGCAACAAACTTTTTTTTAAAAGAA	57535

BX908761.10	51	CATTGATGAAATTAGCACTGTCAGATGGTCGGCATGGCAAGTTTTGCATG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57536	CATTGATGAAATTAGCACTGTCAGATGGTCGGCATGGCAAGTTTTGCATG	57585

BX908761.10	101	ACCAACTTGAACATGAGCAAAATCTGCAAGAGTAAGACCTTCATGTAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57586	ACCAACTTGAACATGAGCAAAATCTGCAAGAGTAAGACCTTCATGTAAAA	57635

BX908761.10	151	CTCCCATCACACAAATTGTTGTTAGAATGACTGGACTTTACTTTTAAAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57636	CTCCCATCACACAAATTGTTGTTAGAATGACTGGACTTTACTTTTAAAAT	57685

BX908761.10	201	AAAAAACAGGTATTTTTTTTCTACATTCAGCTTCAAGAACACACACAGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57686	AAAAAACAGGTATTTTTTTTCTACATTCAGCTTCAAGAACACACACAGAT	57735

BX908761.10	251	CAGCCTTTTATCCAAACAACTGATTCATAAAATCAAGTCCCAGCCCTTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57736	CAGCCTTTTATCCAAACAACTGATTCATAAAATCAAGTCCCAGCCCTTCT	57785

BX908761.10	301	TTTTTCTTTTTCAGTAATGAGTTTTATTTATGTCACAATAGGGAAGAAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57786	TTTTTCTTTTTCAGTAATGAGTTTTATTTATGTCACAATAGGGAAGAAAG	57835

BX908761.10	351	CACTTGTCGCTATGCCAGCACCAAAATATTGCCAAGTGGTGCTCGCTGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57836	CACTTGTCGCTATGCCAGCACCAAAATATTGCCAAGTGGTGCTCGCTGCA	57885

BX908761.10	401	AAGCCATTTGGGCGAGCTGAGCTCCGGCGAGGGGGAGCTTGAGCTTGAGC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57886	AAGCCATTTGGGCGAGCTGAGCTCCGGCGAGGGGGAGCTTGAGCTTGAGC	57935

BX908761.10	451	TCCACCTTTTTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57936	TCCACCTTTTTTGCACTTCTTCTACGAGTGATGTCACTGGGGGTAGGGTT	57985

BX908761.10	501	AGGGGTGGAGTTGGTGTACGCACTAAAACAGCTTACAGGAGGAGGAGCGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	57986	AGGGGTGGAGTTGGTGTACGCACTAAAACAGCTTACAGGAGGAGGAGCGA	58035

BX908761.10	551	GAGCTCATGCTCCCCCTCGCTGGAGCTCAGCTCTGCTCAAATGGCTCTGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58036	GAGCTCATGCTCCCCCTCGCTGGAGCTCAGCTCTGCTCAAATGGCTCTGC	58085

BX908761.10	601	AGCGAGCACCCTCTCAAATATTGTTCCAGCATTAATATCGCAATGTTCAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58086	AGCGAGCACCCTCTCAAATATTGTTCCAGCATTAATATCGCAATGTTCAT	58135

BX908761.10	651	TCATTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCCTTTTTTAATCCGGGGTCGCCAC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58136	TCATTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCCTTTTTTAATCCGGGGTCGCCAC	58185

BX908761.10	701	AGCAGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCAAGTTTTTACGCAGCGTATGCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58186	AGCAGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCAAGTTTTTACGCAGCGTATGCC	58235

BX908761.10	751	CTTCCAGCCGCAACCCATCTCTGGGAAACATCCACACACACATTCACACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58236	CTTCCAGCCGCAACCCATCTCTGGGAAACATCCACACACACATTCACACA	58285

BX908761.10	801	CACACACATACATACACTACGGACAATTTAGCCTACTCAATTCACCTGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58286	CACACACATACATACACTACGGACAATTTAGCCTACTCAATTCACCTGTA	58335

BX908761.10	851	CCGCATGTCTTTGGACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCCA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58336	CCGCATGTCTTTGGACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGAAACCCA	58385

BX908761.10	901	CGCAAACGCAGGGAGAACACGCAAACTCTACACAGAAACGCCAACTGAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58386	CGCAAACGCAGGGAGAACACGCAAACTCTACACAGAAACGCCAACTGAGC	58435

BX908761.10	951	CGAGGCTCGAACCAGTGACCCAGCGAGCTTCTTGCTGTGAGGTGACAGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58436	CGAGGCTCGAACCAGTGACCCAGCGAGCTTCTTGCTGTGAGGTGACAGCA	58485

BX908761.10	1001	TTTACATTTAGTTATTTAGCAGACGCTTTTATCCAAAGCGACTTACAAAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58486	TTTACATTTAGTTATTTAGCAGACGCTTTTATCCAAAGCGACTTACAAAT	58535

BX908761.10	1051	GAGGACAAGGAAGCAATTTACACAACTATAAGAGCAACAATGAATAAGTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58536	GAGGACAAGGAAGCAATTTACACAACTATAAGAGCAACAATGAATAAGTA	58585

BX908761.10	1101	CTATAGGCAAGTTTCAGGTCTGTAAAGTCTAAGAAGGAAAGTATTAGTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58586	CTATAGGCAAGTTTCAGGTCTGTAAAGTCTAAGAAGGAAAGTATTAGTAA	58635

BX908761.10	1151	AAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTACATTACCTGCATTACCTGCGCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58636	AAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTACATTACCTGCATTACCTGCGCCA	58685

BX908761.10	1201	CTGCTTCGCCAATATCGCAATGTGTGAATCTGCAATAGTAGCATTGCAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58686	CTGCTTCGCCAATATCGCAATGTGTGAATCTGCAATAGTAGCATTGCAGA	58735

BX908761.10	1251	ATGCGCAATGTGGATGCAGGATTATAGTTGACCAGGTACAACTCTACAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58736	ATGCGCAATGTGGATGCAGGATTATAGTTGACCAGGTACAACTCTACAGA	58785

BX908761.10	1301	ACACGTTCAGTAAATTGTGAAGTCATTTCAGTTTAACCATGATAAAGTGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58786	ACACGTTCAGTAAATTGTGAAGTCATTTCAGTTTAACCATGATAAAGTGA	58835

BX908761.10	1351	ATGTTTATCAGTTGCTATTTTTAAGGTCTGTGATTAAAACATTTTAATCG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58836	ATGTTTATCAGTTGCTATTTTTAAGGTCTGTGATTAAAACATTTTAATCG	58885

BX908761.10	1401	AGTTTAACACATACATTTGTAGCTTTGATAAAGATTAATTAATTAAGTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58886	AGTTTAACACATACATTTGTAGCTTTGATAAAGATTAATTAATTAAGTCA	58935

BX908761.10	1451	TTCATTTTTTTAGTACCTTTTTTCATCTGGGGTCGCCACTATGGACAATT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58936	TTCATTTTTTTAGTACCTTTTTTCATCTGGGGTCGCCACTATGGACAATT	58985

BX908761.10	1501	TAGCTTACCCAATACACCTATGTCTTTGGACTTGTGGGGGAAACCAGAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	58986	TAGCTTACCCAATACACCTATGTCTTTGGACTTGTGGGGGAAACCAGAGC	59035

BX908761.10	1551	ACCCGGAGGAAACTCACACAAACACGGGTTGAACATGCTAAGTTCACACA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59036	ACCCGGAGGAAACTCACACAAACACGGGTTGAACATGCTAAGTTCACACA	59085

BX908761.10	1601	GAAATGACAACTGATCCAGCCGGGGCTCGAACCAGCGATCTTCTGGATAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59086	GAAATGACAACTGATCCAGCCGGGGCTCGAACCAGCGATCTTCTGGATAT	59135

BX908761.10	1651	GAGGCGATTGTTCTACCTACTGTGCCACCATGCGCCACTTAATAAAGATT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59136	GAGGCGATTGTTCTACCTACTGTGCCACCATGCGCCACTTAATAAAGATT	59185

BX908761.10	1701	AATTGTATTTCATTACTCAAGTTTTACTGGAGGTCTGGAAGCTTAATAGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59186	AATTGTATTTCATTACTCAAGTTTTACTGGAGGTCTGGAAGCTTAATAGG	59235

BX908761.10	1751	AGGAGAAACAGCAGTGGAAAACATGAGAGAGCTAGGCCTGGATGCTTTAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59236	AGGAGAAACAGCAGTGGAAAACATGAGAGAGCTAGGCCTGGATGCTTTAA	59285

BX908761.10	1801	TTTTAGTTTTGCTATTAGTTTAGCAGTAGTCTCCGTGAAAGAATGTCGCT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59286	TTTTAGTTTTGCTATTAGTTTAGCAGTAGTCTCCGTGAAAGAATGTCGCT	59335

BX908761.10	1851	GCCTGTGTTTTTATGTTTATTGATCATTTTTTAAAATTTCATTGAAAGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59336	GCCTGTGTTTTTATGTTTATTGATCATTTTTTAAAATTTCATTGAAAGAT	59385

BX908761.10	1901	TTAAAAATTTGTTGGTTCCCCGCCTCCTCCTTCCCAATGGCTAGGGAGTC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59386	TTAAAAATTTGTTGGTTCCCCGCCTCCTCCTTCCCAATGGCTAGGGAGTC	59435

BX908761.10	1951	ATTAAACCTTATTACATATCGTATCAATGAAGACTATATATACTATTAAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX914221.6	59436	ATTAAACCTTATTACATATCGTATCAATGAAGACTATATATACTATTAAA	59485

Overview

Query
BX908761.10 - 47038 bps
Hit
BX914221.6 - 59485 bps
Total alignments
11
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001977200012000157486594851
281.2112434124827251671482351521
388.679214725201253471515253011
494.05658411266113491666567481
586.9225643612408128431678272171
682.231885283644536972-113774143021
788.262624351240812842122000224421
887.742574291241412842-129183296061
982.51062901126211551-153112534081
1089.862203361857818913-158131584851
1193.781531932978829980-158284584761
Short-link