<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927110.10	1	GAAGTGCATGTTGTTTTTAGCTATGCCAAACAAAGCCCGTGCACTGGCAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	171802	GAAGTGCATGTTGTTTTTAGCTATGCCAAACAAAGCCCGTGCACTGGCAT	171851

BX927110.10	51	CATTTGCTTTGCCACATGTTGTAGATAGGTAGGTGTTCAACAACATTAGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	171852	CATTTGCTTTGCCACATGTTGTAGATAGGTAGGTGTTCAACAACATTAGT	171901

BX927110.10	101	TAGCACAACATTAACTGTAGTTTTGTTTTGAAGTGAATTAAACACACTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	171902	TAGCACAACATTAACTGTAGTTTTGTTTTGAAGTGAATTAAACACACTGA	171951

BX927110.10	151	ATAAAGGGTCTTAATGAGTTATCTGTTTTAAACAGCTAATGGATGAGGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	171952	ATAAAGGGTCTTAATGAGTTATCTGTTTTAAACAGCTAATGGATGAGGAT	172001

BX927110.10	201	GGAGAGGATGGACTGGTCGGGGGACGCCCTGACACTGGTAGCCCAAGAGG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172002	GGAGAGGATGGACTGGTCGGGGGACGCCCTGACACTGGTAGCCCAAGAGG	172051

BX927110.10	251	CCAGTGTACTGGTGGACTTGCTCTGCGAACAGGATAGTAGTGTTTTGGAC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172052	CCAGTGTACTGGTGGACTTGCTCTGCGAACAGGATAGTAGTGTTTTGGAC	172101

BX927110.10	301	CATATCTTTGACTTGTTGGAATCTAACACACAGGATGAGATACGATCACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172102	CATATCTTTGACTTGTTGGAATCTAACACACAGGATGAGATACGATCACT	172151

BX927110.10	351	GATCAACAATAGAGATCGTGTCTCAGCCATCGTGGATTACTTCAAGACTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172152	GATCAACAATAGAGATCGTGTCTCAGCCATCGTGGATTACTTCAAGACTT	172201

BX927110.10	401	CAGACAATATCACATGTAGAAAGTTTTTCTGCACCATATATGAGTACTGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172202	CAGACAATATCACATGTAGAAAGTTTTTCTGCACCATATATGAGTACTGT	172251

BX927110.10	451	AAAGACATCCCTTTCTATCTTGAAACTGCACTAGTGTCTATAGCTGGAGA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172252	AAAGACATCCCTTTCTATCTTGAAACTGCACTAGTGTCTATAGCTGGAGA	172301

BX927110.10	501	TCCAATTGGTAAGTCATGTTCTGCAATAATTTTTTAATGTAGTTATACTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172302	TCCAATTGGTAAGTCATGTTCTGCAATAATTTTTTAATGTAGTTATACTG	172351

BX927110.10	551	CAGCATTTCTCTTGTTCTACCATATAAAATGCTTAATATTTAATATTAAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172352	CAGCATTTCTCTTGTTCTACCATATAAAATGCTTAATATTTAATATTAAA	172401

BX927110.10	601	GCATAATTGCATTACTTTATGACTACTTTAGTTTATAACTACTTTAATTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172402	GCATAATTGCATTACTTTATGACTACTTTAGTTTATAACTACTTTAATTA	172451

BX927110.10	651	CTGCATAATTTAAGAACATATTAGTTCATAATTTGTTTTATTTAACTCAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172452	CTGCATAATTTAAGAACATATTAGTTCATAATTTGTTTTATTTAACTCAT	172501

BX927110.10	701	ACACTTTTTTTTAGAAAGTATTTAAAGTGAAAGTGAAAGTATCCTTGCAC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172502	ACACTTTTTTTTAGAAAGTATTTAAAGTGAAAGTGAAAGTATCCTTGCAC	172551

BX927110.10	751	GTTAAATAAAAGAAACAATGAATGCTACTAAATTCTGTGTTATAAATATT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172552	GTTAAATAAAAGAAACAATGAATGCTACTAAATTCTGTGTTATAAATATT	172601

BX927110.10	801	TTCTAAATGACTTTTCTTTGCTTTTAAGACACAAACTTTCCTCTTACAGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172602	TTCTAAATGACTTTTCTTTGCTTTTAAGACACAAACTTTCCTCTTACAGA	172651

BX927110.10	851	TAATTATTCATCATCAAGAAATGTGAAACGTCTACGACTAGGTATGTTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172652	TAATTATTCATCATCAAGAAATGTGAAACGTCTACGACTAGGTATGTTTT	172701

BX927110.10	901	ATTGTTAAAGGAACACACCCATTTTGACTCTGTTATTAAGACTCTGATCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172702	ATTGTTAAAGGAACACACCCATTTTGACTCTGTTATTAAGACTCTGATCC	172751

BX927110.10	951	CCAGCAGTTCAATTTAAACAGTGAACAGAAAGCCTTTAAATGATCTACAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172752	CCAGCAGTTCAATTTAAACAGTGAACAGAAAGCCTTTAAATGATCTACAT	172801

BX927110.10	1001	TTCTCGGTGTTTTTAATTTATTTTGTATTTATCATTTTTGTATAACATTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172802	TTCTCGGTGTTTTTAATTTATTTTGTATTTATCATTTTTGTATAACATTA	172851

BX927110.10	1051	TTAATTTTTTTTATGCTTTTACAATAAATTAAACCCCAATACCCAAAACT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172852	TTAATTTTTTTTATGCTTTTACAATAAATTAAACCCCAATACCCAAAACT	172901

BX927110.10	1101	TACCCCAGACAGATTTATTCAATCATTCATTTTCTTTTTGGCTTAGTACC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172902	TACCCCAGACAGATTTATTCAATCATTCATTTTCTTTTTGGCTTAGTACC	172951

BX927110.10	1151	TTTATTAATCAGGGGTCGTCATAGCGGAATGAACCGCCAACTTATGCAGC	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	172952	TTTATTAATCAGGGGTCGTCATAGCGGAATGAACCGCCAACTTATGCAGC	173001

BX927110.10	1201	ATATGTTTTACGCAGCGGATGCCCTTCCAGCCGCAACCCTACACCCATAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173002	ATATGTTTTACGCAGCGGATGCCCTTCCAGCCGCAACCCTACACCCATAC	173051

BX927110.10	1251	ACTCTTGCATTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173052	ACTCTTGCATTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACTA	173101

BX927110.10	1301	TGGTTAATTTAGCTTATTCAGTTCATGTACACTGCATGTCTTTGGACTGT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173102	TGGTTAATTTAGCTTATTCAGTTCATGTACACTGCATGTCTTTGGACTGT	173151

BX927110.10	1351	GGGGGAAACCGGAGCACCCAGAGGAAACCCACGCAAACACGGGGAGAACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173152	GGGGGAAACCGGAGCACCCAGAGGAAACCCACGCAAACACGGGGAGAACA	173201

BX927110.10	1401	TGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGATCCAGCTGGGGCTCAAACCAG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173202	TGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGATCCAGCTGGGGCTCAAACCAG	173251

BX927110.10	1451	CGATGTTCTTGCTGTGAGGCAATCGTGCTACCCACTTTGATACCTACAGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173252	CGATGTTCTTGCTGTGAGGCAATCGTGCTACCCACTTTGATACCTACAGA	173301

BX927110.10	1501	CAGGTTTGGTAAAAAACAAATGAAATAATAATCATTATTTAACTAAAATA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173302	CAGGTTTGGTAAAAAACAAATGAAATAATAATCATTATTTAACTAAAATA	173351

BX927110.10	1551	ATAATAATAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATCTAATCAAACACCAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173352	ATAATAATAATTAAAAATAAATAAATAAATAAATCTAATCAAACACCAAT	173401

BX927110.10	1601	TCATTCATTAATTTTTTTTGGCTTAGTCCCTTTATTAATCTGGGGTCACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173402	TCATTCATTAATTTTTTTTGGCTTAGTCCCTTTATTAATCTGGGGTCACC	173451

BX927110.10	1651	ACAGCAGAATGAACCGCTAATTTATCCAGCATATGTTTTACGCAGCGGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173452	ACAGCAGAATGAACCGCTAATTTATCCAGCATATGTTTTACGCAGCGGAT	173501

BX927110.10	1701	GCCCTTCCAGCTGCAACCCATTTCTGGGAATCACCCATACACACTCATTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173502	GCCCTTCCAGCTGCAACCCATTTCTGGGAATCACCCATACACACTCATTC	173551

BX927110.10	1751	ACACTCAGACACTAGGGACAATATAGCCCTATTCACCTATAGCGTATGTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173552	ACACTCAGACACTAGGGACAATATAGCCCTATTCACCTATAGCGTATGTC	173601

BX927110.10	1801	TTTAGACTGTGGGGGAAACTGGAGCACCAGGAGAAAACCCACGCGAATGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173602	TTTAGACTGTGGGGGAAACTGGAGCACCAGGAGAAAACCCACGCGAATGC	173651

BX927110.10	1851	GGGGAGAACATGCAAACTCCACAAAGAAACACCAACTGACCCTGCCGAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173652	GGGGAGAACATGCAAACTCCACAAAGAAACACCAACTGACCCTGCCGAGG	173701

BX927110.10	1901	CTTGAACCAGCGACCTTCTTTCTGTGGGGCGACAGCACTACCTACAAACG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173702	CTTGAACCAGCGACCTTCTTTCTGTGGGGCGACAGCACTACCTACAAACG	173751

BX927110.10	1951	CCAAACACCAAATCACAATAATCAATAAACAATCCACCCTTCCAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908772.11	173752	CCAAACACCAAATCACAATAATCAATAAACAATCCACCCTTCCAAAGCTT	173801

Overview

Query
BX927110.10 - 27053 bps
Hit
BX908772.11 - 173801 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194920001200011718021738011
291.249813713311467112897130331
39641501005410103-126850268991
498.5337682657926646145716457831
579.63391552178221936152768529291
690.67497613731448-153951540251
784.9811221212751486170693709051
876.839036711171483-189984903241
981.4613134415991942-189985903241
1084.15438212861367-11140501141311
1192.5960793260333811140501141301
1291.6420331624892804-11292361295461
1396.154352100541010511343511344021
1483.91603471599194511411591415121
1592.7312216331763338-11413181414821
1695.838396238992399411440911441861
1785.65122233237302396211595051597411
1880.2752154240502420311598201599661
1988.246410213341435-11697631698641
2088.61771211599171911729181730401
2182.796714931983346-11730801732301
2288.43761231117123911734001735201
2398.1849553352340611735021735561
Short-link