<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX572633.7	1	GAATTCCTCATCCATGATTTCTGCATGAGTCCCAGAGGATGTAATGAAGA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	92962	GAATTCCTCATCCATGATTTCTGCATGAGTCCCAGAGGATGTAATGAAGA	93011

BX572633.7	51	TGAAAACTCTTTATTCCACACTCAGTCATGGCATCATCAAACTACGCCTT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93012	TGAAAACTCTTTATTCCACACTCAGTCATGGCATCATCAAACTACGCCTT	93061

BX572633.7	101	TGTTTGTTGTGAATATATGCCCTCTAGCAGTAAAGATCACATGCTGTGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93062	TGTTTGTTGTGAATATATGCCCTCTAGCAGTAAAGATCACATGCTGTGCC	93111

BX572633.7	151	TTTAATGTAAAAACAGACTTGTATTTATTTTGAAATTTACAGTGCCAAGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93112	TTTAATGTAAAAACAGACTTGTATTTATTTTGAAATTTACAGTGCCAAGC	93161

BX572633.7	201	TCTTATTTCTCCCTCATACCTGCATCTGAAGATGTACGCGATTGTAAAAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93162	TCTTATTTCTCCCTCATACCTGCATCTGAAGATGTACGCGATTGTAAAAC	93211

BX572633.7	251	TCCATTTCCACATGTGACATACAGTAGCACACCGAGTCTCTGTAGAGAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93212	TCCATTTCCACATGTGACATACAGTAGCACACCGAGTCTCTGTAGAGAGG	93261

BX572633.7	301	ACGAGTATCTCAAAAACCAGCCCATCAAGTTGTGTGTGAAAACAGCATTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93262	ACGAGTATCTCAAAAACCAGCCCATCAAGTTGTGTGTGAAAACAGCATTG	93311

BX572633.7	351	CCTATAAACCCTTAGGATTTTATGTCAAAATGAAACAGGGGAACTGAAGT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93312	CCTATAAACCCTTAGGATTTTATGTCAAAATGAAACAGGGGAACTGAAGT	93361

BX572633.7	401	GACCTATGCGGAACTACAGTATAATTGTTTAATTAAATCTAGTGAGGATA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93362	GACCTATGCGGAACTACAGTATAATTGTTTAATTAAATCTAGTGAGGATA	93411

BX572633.7	451	AAAATTGAAGAACAAGAACAGAAGAGACCAAAATGTGGCTGTTTACAATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93412	AAAATTGAAGAACAAGAACAGAAGAGACCAAAATGTGGCTGTTTACAATC	93461

BX572633.7	501	TAGTTCTCAAATCACGTTTACATTTCTGCATTTTAAGACATCTTTTACAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93462	TAGTTCTCAAATCACGTTTACATTTCTGCATTTTAAGACATCTTTTACAT	93511

BX572633.7	551	TCAAATCAGATTTAGTTTCACAAATGGATTCTTAATTGGGTGTTTTCAGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93512	TCAAATCAGATTTAGTTTCACAAATGGATTCTTAATTGGGTGTTTTCAGA	93561

BX572633.7	601	TTGTACAGTATGTATTTAGTTTTGGTAATTGTAGTTCATTATAATTAGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93562	TTGTACAGTATGTATTTAGTTTTGGTAATTGTAGTTCATTATAATTAGAA	93611

BX572633.7	651	TTAAGTTACATCAATTCATTAACACAATAATTGCATTCACAAGAACAGTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93612	TTAAGTTACATCAATTCATTAACACAATAATTGCATTCACAAGAACAGTA	93661

BX572633.7	701	TTTACAAGGACAGTAGTTACAGTAAAGCATTTGATCTTATCTGTATAAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93662	TTTACAAGGACAGTAGTTACAGTAAAGCATTTGATCTTATCTGTATAAGG	93711

BX572633.7	751	ACAAATACATAAAAAGTATATATATTTATGTACATCTCTTCATTCAGTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93712	ACAAATACATAAAAAGTATATATATTTATGTACATCTCTTCATTCAGTTT	93761

BX572633.7	801	GTAATTAGTTTTATTGCATTGTGACTGTTTTTAGTTTTCATATTACGTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93762	GTAATTAGTTTTATTGCATTGTGACTGTTTTTAGTTTTCATATTACGTTT	93811

BX572633.7	851	GGATTTGCCTTGCAGGCAACGGAAATATTTTAAACCAGTAGGTTTACCTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93812	GGATTTGCCTTGCAGGCAACGGAAATATTTTAAACCAGTAGGTTTACCTT	93861

BX572633.7	901	TCATGTAGGTTTATCCTGTTTAAAGGTATAGTTCATGTCAAAATGAACAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93862	TCATGTAGGTTTATCCTGTTTAAAGGTATAGTTCATGTCAAAATGAACAT	93911

BX572633.7	951	ACTAATCCTCCACTACATTACTCATCCTCCACTTGTTCCAAATCTGTTTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93912	ACTAATCCTCCACTACATTACTCATCCTCCACTTGTTCCAAATCTGTTTG	93961

BX572633.7	1001	TTTCTTCCTTCTGTTAAACATAAAAGAAGTTACACTGGAGAATGTTGAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	93962	TTTCTTCCTTCTGTTAAACATAAAAGAAGTTACACTGGAGAATGTTGAAA	94011

BX572633.7	1051	AAACTGTCATTTACCTCCTTAGTATGTTTTGTCTCTACTATGGATGTCTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94012	AAACTGTCATTTACCTCCTTAGTATGTTTTGTCTCTACTATGGATGTCTA	94061

BX572633.7	1101	TGGCGGCGTTTTCCTACATTCTTTAGAATATCTTGCTTGCGTTCAACAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94062	TGGCGGCGTTTTCCTACATTCTTTAGAATATCTTGCTTGCGTTCAACAGA	94111

BX572633.7	1151	ACAAAGAATAAAAGTTCATAAAAGTTTAGAACCATTTGAGTGTGAGGAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94112	ACAAAGAATAAAAGTTCATAAAAGTTTAGAACCATTTGAGTGTGAGGAAA	94161

BX572633.7	1201	GGATGAGGAAATGTTCATTTTTAGGCAAACGGTCCCTTTAAAGCAGGGGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94162	GGATGAGGAAATGTTCATTTTTAGGCAAACGGTCCCTTTAAAGCAGGGGT	94211

BX572633.7	1251	GCCCAAACTCTCTAGTATGAAGGCCCAATAACCAAATATCATCGAGAGCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94212	GCCCAAACTCTCTAGTATGAAGGCCCAATAACCAAATATCATCGAGAGCT	94261

BX572633.7	1301	GTAGGCCGAAGATAAATAAACTACTATTTTATTTACTATTATAAGTTATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94262	GTAGGCCGAAGATAAATAAACTACTATTTTATTTACTATTATAAGTTATT	94311

BX572633.7	1351	TCGTAATATTTCGAAATAAATAGAAAACATCACTTTGAATCATAATAACT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94312	TCGTAATATTTCGAAATAAATAGAAAACATCACTTTGAATCATAATAACT	94361

BX572633.7	1401	AATGAAGCATAACGTTTTAAATGAAAACTTATTACAATTAAAACAAACAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94362	AATGAAGCATAACGTTTTAAATGAAAACTTATTACAATTAAAACAAACAA	94411

BX572633.7	1451	TCAGGGCGAAGCAGTGTAGAGAGCAGTGTAGCAGTGTAAGTAGTGCTATC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94412	TCAGGGCGAAGCAGTGTAGAGAGCAGTGTAGCAGTGTAAGTAGTGCTATC	94461

BX572633.7	1501	GCCTCACAGCAAGAAGGTCGCTGGGTTGCTGGTTCAATCCTAGGCTCAGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94462	GCCTCACAGCAAGAAGGTCGCTGGGTTGCTGGTTCAATCCTAGGCTCAGT	94511

BX572633.7	1551	TGGCGTTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCCCTGCGTTCGCGTGGGTTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94512	TGGCGTTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCCCTGCGTTCGCGTGGGTTT	94561

BX572633.7	1601	CTTCTGGGTGCTCCGGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGCGGTACAGGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94562	CTTCTGGGTGCTCCGGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGCGGTACAGGT	94611

BX572633.7	1651	GAAATGGGTGGGCTAAATTGTCCGTAATGTGTGTGTGAATGTTTCCCAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94612	GAAATGGGTGGGCTAAATTGTCCGTAATGTGTGTGTGAATGTTTCCCAGA	94661

BX572633.7	1701	GATGGGTTGCGGCTGGAAAAAACTTACTGGAAAAAGTTGGCAGTTCATTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94662	GATGGGTTGCGGCTGGAAAAAACTTACTGGAAAAAGTTGGCAGTTCATTC	94711

BX572633.7	1751	CACTGTGGGGAACCCGTATTAATAAAGAGACTGAGCCAACAAGAAAATGA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94712	CACTGTGGGGAACCCGTATTAATAAAGAGACTGAGCCAACAAGAAAATGA	94761

BX572633.7	1801	ATGAACGAACATAAATAATCACATTTATAACACAGTGAAGTTCAATGTGG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94762	ATGAACGAACATAAATAATCACATTTATAACACAGTGAAGTTCAATGTGG	94811

BX572633.7	1851	CTGTCATGATCACCAGCAATCATACCCTCATAGATGGCTGGAGAACATTC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94812	CTGTCATGATCACCAGCAATCATACCCTCATAGATGGCTGGAGAACATTC	94861

BX572633.7	1901	ATTTTAACTTGACTACAATTCTGTCACTATACAGACTACAAATCCTGTCA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94862	ATTTTAACTTGACTACAATTCTGTCACTATACAGACTACAAATCCTGTCA	94911

BX572633.7	1951	TGCACCACACACACACCTGTTCCAGTTCTCCTTTGATTACATACATACAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908754.8	94912	TGCACCACACACACACCTGTTCCAGTTCTCCTTTGATTACATACATACAG	94961

Overview

Query
BX572633.7 - 184987 bps
Hit
BX908754.8 - 94961 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001945200012000192962949611
289.42243493014730495120462208101
389.52223487945679803120468208101
489.852133343054130874-128847291911
584.854238417948280322-128848296851
691.052173093014730455-129406297181
780.61243323839038721141082414161
884.531723632200922371-142239426131
984.5323955991909748144653452081
1085.12197458111997112454-144743451991
1182.66129302101249101550-154229545281
1275.272011072108841109912163238643131
1384.77136280133629133908170059703471
1490.9118826932933561-181047813101
1582.221323379094791283-181047813891
1692.91961273886538991-181279814051
17821423499797598323-181511818601
1881.651152783844738724-181532818091
1982.3942386487465111-187567878091
2087.58891571058610742-194451946111
Short-link