<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR354545.5	1	CTAGTACCTCTTATAACAAACCCATGGGCACAGCTTCCAGAGTCCCTGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	99861	CTAGTACCTCTTATAACAAACCCATGGGCACAGCTTCCAGAGTCCCTGTA	99910

CR354545.5	51	AAGGGCATGCTCAGTTACAAGGGTCACTGCATTTGGAAATACCCAAACTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	99911	AAGGGCATGCTCAGTTACAAGGGTCACTGCATTTGGAAATACCCAAACTA	99960

CR354545.5	101	TGGGTCCCCGTCATTTGTTACGGTTCATGAAATATTCTTCCCAGTAAAGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	99961	TGGGTCCCCGTCATTTGTTACGGTTCATGAAATATTCTTCCCAGTAAAGA	100010

CR354545.5	151	TACAAAATGCCAACCAGAAGCCATTTGTGCCATAAGCAATGTTGTCTAAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100011	TACAAAATGCCAACCAGAAGCCATTTGTGCCATAAGCAATGTTGTCTAAA	100060

CR354545.5	201	AATCCAGCTGACATTCTTCCTCCATCAGGTTTCCAGAAAACAGCTAGAAA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100061	AATCCAGCTGACATTCTTCCTCCATCAGGTTTCCAGAAAACAGCTAGAAA	100110

CR354545.5	251	ATTAGCCTAAGATTAAATACATCATGGAGAAGTAGAAAGGGTGTTATAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100111	ATTAGCCTAAGATTAAATACATCATGGAGAAGTAGAAAGGGTGTTATAAA	100160

CR354545.5	301	GCATTTATCCACAAGATTCAAAATGAAATACAGTTAATTTTGTCCGTTTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100161	GCATTTATCCACAAGATTCAAAATGAAATACAGTTAATTTTGTCCGTTTT	100210

CR354545.5	351	AAGACATTATTTCAACCTTCAAATTATTTAAAAGAAGTACATCCTATATT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100211	AAGACATTATTTCAACCTTCAAATTATTTAAAAGAAGTACATCCTATATT	100260

CR354545.5	401	TTGTGTGCTTATTCAAAAAAGGCATGGTAATACTTATAAAAAGACTTTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100261	TTGTGTGCTTATTCAAAAAAGGCATGGTAATACTTATAAAAAGACTTTAA	100310

CR354545.5	451	ATATTTTTATAAGTTTTAAATATTTTATAAGTAATTTTATAAATAAAATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100311	ATATTTTTATAAGTTTTAAATATTTTATAAGTAATTTTATAAATAAAATT	100360

CR354545.5	501	ACAAACCATTTAAGTGACCTAATTAAATCAAACACACTTTGAGTATGCAC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100361	ACAAACCATTTAAGTGACCTAATTAAATCAAACACACTTTGAGTATGCAC	100410

CR354545.5	551	ATAAGAAAAAAATTAGTTGAAGCATCCTGACTTAAGAAATCCTTGATCTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100411	ATAAGAAAAAAATTAGTTGAAGCATCCTGACTTAAGAAATCCTTGATCTT	100460

CR354545.5	601	TCATAAGGTGTCTGAATACTCAATGTCAAAAACACTTATGAAGAATTAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100461	TCATAAGGTGTCTGAATACTCAATGTCAAAAACACTTATGAAGAATTAAA	100510

CR354545.5	651	CACTGTTGACCACAAGAGGGAAACCTAGTCCCAGTTATACTATAAATTAG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100511	CACTGTTGACCACAAGAGGGAAACCTAGTCCCAGTTATACTATAAATTAG	100560

CR354545.5	701	AAAATCAAGGGAAAAATATGTGTCCTGAGAACTTTTGAAATAGTCACATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100561	AAAATCAAGGGAAAAATATGTGTCCTGAGAACTTTTGAAATAGTCACATA	100610

CR354545.5	751	TAAACATAGTATACAAGAAAAAACCAACCGTCATCCCTACCCAAGGACAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100611	TAAACATAGTATACAAGAAAAAACCAACCGTCATCCCTACCCAAGGACAT	100660

CR354545.5	801	GTTTGTGGTATGAGTGGTTTTAGTGTTTTGAGTGGACTGGTTCTTGGACT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100661	GTTTGTGGTATGAGTGGTTTTAGTGTTTTGAGTGGACTGGTTCTTGGACT	100710

CR354545.5	851	CCACATATTATTGGCTACAGAGATAGAGACTTGATTTAGAAAATCACAGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100711	CCACATATTATTGGCTACAGAGATAGAGACTTGATTTAGAAAATCACAGT	100760

CR354545.5	901	TGCCACTTTCTAAGTAAGCCCTTGACCAAAAGACTAGATTTCTTTAAACC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100761	TGCCACTTTCTAAGTAAGCCCTTGACCAAAAGACTAGATTTCTTTAAACC	100810

CR354545.5	951	CAGTTTTCTCAGGTAAAATGGAAATACAACTATTATCTAATAAATATAAG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100811	CAGTTTTCTCAGGTAAAATGGAAATACAACTATTATCTAATAAATATAAG	100860

CR354545.5	1001	TAAGCTTTAGTGTCATAGTCATAGCAGTAGTATTTTCAATTGGTAAAAAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100861	TAAGCTTTAGTGTCATAGTCATAGCAGTAGTATTTTCAATTGGTAAAAAG	100910

CR354545.5	1051	AAAATGGACCCCAAAAAAGAATTTCAGTGAAAGCAGTAACAGTCTTCTGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100911	AAAATGGACCCCAAAAAAGAATTTCAGTGAAAGCAGTAACAGTCTTCTGG	100960

CR354545.5	1101	CATATTTCTCACCTTTCTTTCTACCTTAAAGGTTCAAAGTTCCTAAGTAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	100961	CATATTTCTCACCTTTCTTTCTACCTTAAAGGTTCAAAGTTCCTAAGTAA	101010

CR354545.5	1151	TCTCAGAAACCTAAAATAGTTTATTCTCTATCCTCACTATTGGTTTTTAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101011	TCTCAGAAACCTAAAATAGTTTATTCTCTATCCTCACTATTGGTTTTTAA	101060

CR354545.5	1201	AAAACATTTTGCAGCATGGACCACTGCTCGTGTACAGATGCTCTCCAACT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101061	AAAACATTTTGCAGCATGGACCACTGCTCGTGTACAGATGCTCTCCAACT	101110

CR354545.5	1251	TAACAATAGGGTTATGTCCCAATAAACCCATTATAACTTGAAAATATCTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101111	TAACAATAGGGTTATGTCCCAATAAACCCATTATAACTTGAAAATATCTT	101160

CR354545.5	1301	AAGCTGAAAATGCATTTAATACACCAATAAACCCATCATAAAGTTGAACA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101161	AAGCTGAAAATGCATTTAATACACCAATAAACCCATCATAAAGTTGAACA	101210

CR354545.5	1351	ATCATAAGCCAAATTATAAGTCAGAGACCATCTGTATTAGCTTAAGTCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101211	ATCATAAGCCAAATTATAAGTCAGAGACCATCTGTATTAGCTTAAGTCTT	101260

CR354545.5	1401	GGAATGGTTTATTTTTTAGATGCCATTTAGCCACTTATATTCTCTTCTAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101261	GGAATGGTTTATTTTTTAGATGCCATTTAGCCACTTATATTCTCTTCTAT	101310

CR354545.5	1451	TTTATTGTGAGAACTAATTCCCCTCTTACATTCTGTGCTTGACCCATGCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101311	TTTATTGTGAGAACTAATTCCCCTCTTACATTCTGTGCTTGACCCATGCT	101360

CR354545.5	1501	ATACTTAGTGTGAACAAGAGCCACCTTCTTCTCATGACTTCTATTTTTTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101361	ATACTTAGTGTGAACAAGAGCCACCTTCTTCTCATGACTTCTATTTTTTT	101410

CR354545.5	1551	GTGAAAATTTCCTTCACTCATTCACGACATTTGGATTTGAAATCTTACCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101411	GTGAAAATTTCCTTCACTCATTCACGACATTTGGATTTGAAATCTTACCT	101460

CR354545.5	1601	ACTTAAGTACTTTAAAAAATCATTTTCTACCATCTTTCTTATCAGGAGGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101461	ACTTAAGTACTTTAAAAAATCATTTTCTACCATCTTTCTTATCAGGAGGC	101510

CR354545.5	1651	TCTAGTGATTCCTTCTCCACACTTCTAACTTCTCATCTTCACACTCCTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101511	TCTAGTGATTCCTTCTCCACACTTCTAACTTCTCATCTTCACACTCCTTG	101560

CR354545.5	1701	TCTTCCTAACTTCACTACAGTAAGTGTTTTACATGTTTAGAACTCAGCTC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101561	TCTTCCTAACTTCACTACAGTAAGTGTTTTACATGTTTAGAACTCAGCTC	101610

CR354545.5	1751	CTTTACTATGATTGCTAACCATGTACCTTAAATAAACCGTCTTCTAGTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101611	CTTTACTATGATTGCTAACCATGTACCTTAAATAAACCGTCTTCTAGTTT	101660

CR354545.5	1801	TTTGTTTCTTACTCTCAATTATACCTTTTAGAAAAGAATTAAGAGTAGAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101661	TTTGTTTCTTACTCTCAATTATACCTTTTAGAAAAGAATTAAGAGTAGAA	101710

CR354545.5	1851	AAAGACTGCTACATAGACATTCTTATGATCTTCAGAAATGAGCACAGATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101711	AAAGACTGCTACATAGACATTCTTATGATCTTCAGAAATGAGCACAGATC	101760

CR354545.5	1901	ATGCTTAATGAAAAAAGATTTCCAAACAATGCTGCATATGTCCAGAGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101761	ATGCTTAATGAAAAAAGATTTCCAAACAATGCTGCATATGTCCAGAGAAA	101810

CR354545.5	1951	AGGTGGCAGAAATGACTGTCGTTTGGGGGCACTATTGTCTGGACATGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX908732.13	101811	AGGTGGCAGAAATGACTGTCGTTTGGGGGCACTATTGTCTGGACATGGCC	101860

Overview

Query
CR354545.5 - 56495 bps
Hit
BX908732.13 - 101860 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link