<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  BX470257.13	2000	GAATTCTTGTTTTCTTTTTTAAATATTTCCCAAATGATGTTTAACTGAGC	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1	GAATTCTTGTTTTCTTTTTTAAATATTTCCCAAATGATGTTTAACTGAGC	50

C  BX470257.13	1950	AAGGAAATTTTCACAGTAAGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGT	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	51	AAGGAAATTTTCACAGTAAGTCTGATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGT	100

C  BX470257.13	1900	CTTATTTGTTTTATTTTGGCTAGAATAAAAGCAGTTTTTAATTTTTAAAC	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	101	CTTATTTGTTTTATTTTGGCTAGAATAAAAGCAGTTTTTAATTTTTAAAC	150

C  BX470257.13	1850	ATCATTTTAAGGTCAATATTATTAGCCCCTTAAAGCTATATATTTTTTTT	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	151	ATCATTTTAAGGTCAATATTATTAGCCCCTTAAAGCTATATATTTTTTTT	200

C  BX470257.13	1800	CGATAGTCTACAGAACAAACCATCATACTTGCCTATTTACCCTAACCTGC	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	201	CGATAGTCTACAGAACAAACCATCATACTTGCCTATTTACCCTAACCTGC	250

C  BX470257.13	1750	CTAGTTAGCCTAATTAACCTAGTTAAGCCTTTAATGTCACTTTAAGCTGT	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	251	CTAGTTAGCCTAATTAACCTAGTTAAGCCTTTAATGTCACTTTAAGCTGT	300

C  BX470257.13	1700	ATAGAAGTGTCTTGAAAAATATCTAGTCAAATATTATTTACTGTCATCAT	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	301	ATAGAAGTGTCTTGAAAAATATCTAGTCAAATATTATTTACTGTCATCAT	350

C  BX470257.13	1650	GGCAAAGATAAAATAAATCAGTTATTAGAGATGAGTTATTAAACGGCTAA	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	351	GGCAAAGATAAAATAAATCAGTTATTAGAGATGAGTTATTAAACGGCTAA	400

C  BX470257.13	1600	TAATTCTGACCTCAAATGTACATAAATATTTTTCACTTATATTTATTTTG	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	401	TAATTCTGACCTCAAATGTACATAAATATTTTTCACTTATATTTATTTTG	450

C  BX470257.13	1550	TTTTATGTAGAGATATTTAAAAAAATCTTAAATATATACATGCATTTCTA	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	451	TTTTATGTAGAGATATTTAAAAAAATCTTAAATATATACATGCATTTCTA	500

C  BX470257.13	1500	TATAATAAAATAAAATACAGTTTTAATAAAAAATAAATATACAATATATA	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	501	TATAATAAAATAAAATACAGTTTTAATAAAAAATAAATATACAATATATA	550

C  BX470257.13	1450	GAGTAGTGTGAAAAAAGTGATTCTTATTTTGTCCATGTTTGTCACACCTG	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	551	GAGTAGTGTGAAAAAAGTGATTCTTATTTTGTCCATGTTTGTCACACCTG	600

C  BX470257.13	1400	AATGTTTCAGATCATACAACTGATTTAAATATTTGTCAAAGATAAAACAA	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	601	AATGTTTCAGATCATACAACTGATTTAAATATTTGTCAAAGATAAAACAA	650

C  BX470257.13	1350	GCAAATACTCATGCAGTTTTAGATATAAAAAAAATAGTAAAACAAAAACA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	651	GCAAATACTCATGCAGTTTTAGATATAAAAAAAATAGTAAAACAAAAACA	700

C  BX470257.13	1300	CATAACCCTGTGTGGAAAAGGTGTTTCTTCACCCCTCACCACCCAGAGTT	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	701	CATAACCCTGTGTGGAAAAGGTGTTTCTTCACCCCTCACCACCCAGAGTT	750

C  BX470257.13	1250	GATATATATAATTCAGCATCAAGACAAAATGGGTCATAACAGTATAGAAA	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	751	GATATATATAATTCAGCATCAAGACAAAATGGGTCATAACAGTATAGAAA	800

C  BX470257.13	1200	ACATTAACAAATTTTGTAGTTAATAACATCTATTGGCTGTATGTGTTTTT	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	801	ACATTAACAAATTTTGTAGTTAATAACATCTATTGGCTGTATGTGTTTTT	850

C  BX470257.13	1150	TCCACATCTGATTTATGATACATGTAGTGAACTGTCTAAATGCTTTACTA	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	851	TCCACATCTGATTTATGATACATGTAGTGAACTGTCTAAATGCTTTACTA	900

C  BX470257.13	1100	TCTGGCATGAAAGAGGTTTAGTGATGCCAGACACTGTGGTCCTGCTGGTC	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	901	TCTGGCATGAAAGAGGTTTAGTGATGCCAGACACTGTGGTCCTGCTGGTC	950

C  BX470257.13	1050	AGTGTGAGAATGCTCTACATTACACTGCACAGACTGAACACCCACACCTA	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	951	AGTGTGAGAATGCTCTACATTACACTGCACAGACTGAACACCCACACCTA	1000

C  BX470257.13	1000	CCACACACACATGCATGCACGCATTCACACATACAGAAAATATCACAACT	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1001	CCACACACACATGCATGCACGCATTCACACATACAGAAAATATCACAACT	1050

C  BX470257.13	950	AAAACACACTTCATGAACCAAAAATTCTGCCCTGAAAAACATTTTTTACT	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1051	AAAACACACTTCATGAACCAAAAATTCTGCCCTGAAAAACATTTTTTACT	1100

C  BX470257.13	900	TAGAAATAGCGCTAAAACTTTCACAGATAAGTGTATTATTACTAATATTG	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1101	TAGAAATAGCGCTAAAACTTTCACAGATAAGTGTATTATTACTAATATTG	1150

C  BX470257.13	850	ATCTATATAATATTGAAGTATATAGAAAATAAATATTGAATAATGTAGAT	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1151	ATCTATATAATATTGAAGTATATAGAAAATAAATATTGAATAATGTAGAT	1200

C  BX470257.13	800	ATAATTATCCATTATAAAGGAATGTAGATTCTTATAGTCTCCTATTGAAA	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1201	ATAATTATCCATTATAAAGGAATGTAGATTCTTATAGTCTCCTATTGAAA	1250

C  BX470257.13	750	ATAATCATATAAACATTTTCCTAACATCCTTTTCAGCTGTTTTTCTATAG	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1251	ATAATCATATAAACATTTTCCTAACATCCTTTTCAGCTGTTTTTCTATAG	1300

C  BX470257.13	700	AATTGTTTTGCCGTTTTCTTTCTTATTTAACCTGTAGACAAATAAGATTT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1301	AATTGTTTTGCCGTTTTCTTTCTTATTTAACCTGTAGACAAATAAGATTT	1350

C  BX470257.13	650	TAGTTTTATGGTTTAAGTTTATATATACAGTTGAAGTCAGAATTATTAGC	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1351	TAGTTTTATGGTTTAAGTTTATATATACAGTTGAAGTCAGAATTATTAGC	1400

C  BX470257.13	600	CCACCTTAATTATTAGCACCCCTGTTTATTTTTGTCCCCTAAAAAACTCA	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1401	CCACCTTAATTATTAGCACCCCTGTTTATTTTTGTCCCCTAAAAAACTCA	1450

C  BX470257.13	550	TAGTGTGACTCATAGCTCGAGGGCCAGTCCGTCAAAAATGCATAGGTGGC	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1451	TAGTGTGACTCATAGCTCGAGGGCCAGTCCGTCAAAAATGCATAGGTGGC	1500

C  BX470257.13	500	GCTGTCGAGTCATTTTGCCACGCCTACTTCCGAACCCTACAACAAACATA	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1501	GCTGTCGAGTCATTTTGCCACGCCTACTTCCGAACCCTACAACAAACATA	1550

C  BX470257.13	450	ACTTTTCACCACTTCTGGAGCATGTGCAAAGTTTTATGAGTTTTCGGGCA	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1551	ACTTTTCACCACTTCTGGAGCATGTGCAAAGTTTTATGAGTTTTCGGGCA	1600

C  BX470257.13	400	TGTTTAGACCCTCAAAATCACGATTTATTCTATTGAAGAAGCGGAAGAAT	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1601	TGTTTAGACCCTCAAAATCACGATTTATTCTATTGAAGAAGCGGAAGAAT	1650

C  BX470257.13	350	AATAGGAAGAAACGGAGCAATTCCAATAGGGCCTACACACCGTTTCGGTA	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1651	AATAGGAAGAAACGGAGCAATTCCAATAGGGCCTACACACCGTTTCGGTA	1700

C  BX470257.13	300	CTTGGTCCCTAATGAAAAAAGTGTCACCAAATATACTTGCCGTTAATATG	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1701	CTTGGTCCCTAATGAAAAAAGTGTCACCAAATATACTTGCCGTTAATATG	1750

C  BX470257.13	250	CCTGGGCAGCCCGCCCAAGTAAAGTCTAAGTGTGGGAAGCACTGTAGTAT	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1751	CCTGGGCAGCCCGCCCAAGTAAAGTCTAAGTGTGGGAAGCACTGTAGTAT	1800

C  BX470257.13	200	CTTGTAAAATATCTGGTAAAATATTTTCTTCTGTCATCATGGCAAAGATA	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1801	CTTGTAAAATATCTGGTAAAATATTTTCTTCTGTCATCATGGCAAAGATA	1850

C  BX470257.13	150	AATTAAAGGTGCTGTAGGTGATTGTGGCGAGGGGGCGTGGCCAAGAGCAG	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1851	AATTAAAGGTGCTGTAGGTGATTGTGGCGAGGGGGCGTGGCCAAGAGCAG	1900

C  BX470257.13	100	TGGGAACAGAATGAGGCTGCCGCATAAGTGGATGCACCTGTGGTGCGCAC	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1901	TGGGAACAGAATGAGGCTGCCGCATAAGTGGATGCACCTGTGGTGCGCAC	1950

C  BX470257.13	50	CGGCCTCAAATCCCATAGAAGCTCTGGACTATAAGAGGAGGAACGATGGC	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX908724.8	1951	CGGCCTCAAATCCCATAGAAGCTCTGGACTATAAGAGGAGGAACGATGGC	2000

Overview

Query
BX470257.13 - 80589 bps
Hit
BX908724.8 - 181037 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001915200012000-1120001
2861793973748637882-113931
388.82180320166619851458249121
484.8315736437544379071458249501
587.191963504307143420-134696350541
690.852513653192532289-134702350621
786.5618940616082013147308477091
892.8934145130323482168868693171
993.623774822001120492168868693531
1092.862333043191732220-174645749521
1190.071812744307143344-174645749361
1286.941572722049320764-190058903251
1388.512013333015334711046481049861
1480.71294843199942083611046481054921
1590.95165236319293216411104711107021
1685.12168350430714342011104751108101
1789.1203309204942080211206641209751
1887.39201360319273228611271841275321
1989.482163483453834885-11492901496311
2087.782173643193032293-11672061675651
2186.441813454307243416-11672081675611
2291.932503504307143420-11722431725891
2390.552443653192532289-11722491725971
Short-link