<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR938730.10	1	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGACCAAGTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96533	TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGACCAAGTA	96582

CR938730.10	51	AGACTACCGGTATTTCCTTAAAGTAAACTATATACACTACATACAAATAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96583	AGACTACCGGTATTTCCTTAAAGTAAACTATATACACTACATACAAATAG	96632

CR938730.10	101	AAATAAACTCTACTTACACTACATAATATTTATTTTTTATTTCCTATAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96633	AAATAAACTCTACTTACACTACATAATATTTATTTTTTATTTCCTATAAG	96682

CR938730.10	151	TGTATATAAATTATTTTTAATAAATTTATTCCTATTAGAAATATTGGCAA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96683	TGTATATAAATTATTTTTAATAAATTTATTCCTATTAGAAATATTGGCAA	96732

CR938730.10	201	ATATTGGCACCACAGTTTTGGGGCTACATTATGGAATATAATCATATTTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96733	ATATTGGCACCACAGTTTTGGGGCTACATTATGGAATATAATCATATTTC	96782

CR938730.10	251	TTAACCAAGTTGATGCTACATTGTTGGGACATTTAAGGTCTCCAACACTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96783	TTAACCAAGTTGATGCTACATTGTTGGGACATTTAAGGTCTCCAACACTT	96832

CR938730.10	301	AATGTGTCTGGTACCTAGTACCTGGTATTCTTTTCAGTACTACCTTCACT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96833	AATGTGTCTGGTACCTAGTACCTGGTATTCTTTTCAGTACTACCTTCACT	96882

CR938730.10	351	TTATAGTTTCCAAGCAAACTATACCAGTATTAAAATTCATTAATTCATTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96883	TTATAGTTTCCAAGCAAACTATACCAGTATTAAAATTCATTAATTCATTC	96932

CR938730.10	401	ATTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCCTTTATTAATCCGGGGTCACCACAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96933	ATTCATTTTCTTGTCGGCTTAGTCCCTTTATTAATCCGGGGTCACCACAG	96982

CR938730.10	451	CGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCACGTTTTTACTCAGCGGATGCTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	96983	CGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGCACGTTTTTACTCAGCGGATGCTCT	97032

CR938730.10	501	TCCAGCCACAACCCATCTTTGGGAAACACACACACACACACACATACACT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97033	TCCAGCCACAACCCATCTTTGGGAAACACACACACACACACACATACACT	97082

CR938730.10	551	AAGGACAATTTAGCTTATCCAATTCACCTGTGTCGCATGTCTTTGGACTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97083	AAGGACAATTTAGCTTATCCAATTCACCTGTGTCGCATGTCTTTGGACTG	97132

CR938730.10	601	TGAGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGCAACCCATGTGAACGCAGGGAGAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97133	TGAGGGAAACCGGAGCACCCGGAGGCAACCCATGTGAACGCAGGGAGAAC	97182

CR938730.10	651	ATGCTAACTCCACACAGAAACATCAACTGAGCCAAGGATCAAACCAGCGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97183	ATGCTAACTCCACACAGAAACATCAACTGAGCCAAGGATCAAACCAGCGA	97232

CR938730.10	701	TCATCTTGCTGTGAGGCAACACCACTACCTACTGCGCCACTGCATTGCCC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97233	TCATCTTGCTGTGAGGCAACACCACTACCTACTGCGCCACTGCATTGCCC	97282

CR938730.10	751	CCAGTATTAAAATGTGACATGTAAACTGTATATCACTAATTGGCCAGATA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97283	CCAGTATTAAAATGTGACATGTAAACTGTATATCACTAATTGGCCAGATA	97332

CR938730.10	801	TGATCATCATCATTACCTGCATCATTGAACTAGCAATACAAGATAAATGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97333	TGATCATCATCATTACCTGCATCATTGAACTAGCAATACAAGATAAATGG	97382

CR938730.10	851	ACATTCAATAAGTTGAGGAAACAGGCCATAGATAATTATTATCCGTAATC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97383	ACATTCAATAAGTTGAGGAAACAGGCCATAGATAATTATTATCCGTAATC	97432

CR938730.10	901	CAGATGGATTTGGAGCTGGTAATTTCAGCAGAGAAATTATGTAATGTATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97433	CAGATGGATTTGGAGCTGGTAATTTCAGCAGAGAAATTATGTAATGTATA	97482

CR938730.10	951	ACATTTACTATTATTTATTGCACTATAAAGCTAATATCTAGTATCTCAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97483	ACATTTACTATTATTTATTGCACTATAAAGCTAATATCTAGTATCTCAAA	97532

CR938730.10	1001	AAATATCTTTATTACCAGAGTCCCCTCTGTTCTGTAAAAATGCTTCAGTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97533	AAATATCTTTATTACCAGAGTCCCCTCTGTTCTGTAAAAATGCTTCAGTA	97582

CR938730.10	1051	TGTATTTTTAAGTTTTACACAGGGTAGCTCTGCGCTAATGCCATTGGAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97583	TGTATTTTTAAGTTTTACACAGGGTAGCTCTGCGCTAATGCCATTGGAAT	97632

CR938730.10	1101	CAGAACTAGCTGCCATCTTGGAAATGAGGTTCGATCTGCTCCACATTCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97633	CAGAACTAGCTGCCATCTTGGAAATGAGGTTCGATCTGCTCCACATTCAC	97682

CR938730.10	1151	AAGTCGGATGTTCGTTTCAAGCAGTGTTCTCAATGTTCTTTCCAAGAAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97683	AAGTCGGATGTTCGTTTCAAGCAGTGTTCTCAATGTTCTTTCCAAGAAGA	97732

CR938730.10	1201	AAGCAGGCAAATTCCTAATATCAAATTGTCTGGAACTGAAAAAATTAGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97733	AAGCAGGCAAATTCCTAATATCAAATTGTCTGGAACTGAAAAAATTAGAC	97782

CR938730.10	1251	TGAATAAACTCTGTAAACAGATAAATCTTTTTAGATGGCTGAGTGGTTAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97783	TGAATAAACTCTGTAAACAGATAAATCTTTTTAGATGGCTGAGTGGTTAG	97832

CR938730.10	1301	ATGGCTCTAGTGTGTCAGAGAATGGTTGGAGGAAATCTCTCCCTGGTGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97833	ATGGCTCTAGTGTGTCAGAGAATGGTTGGAGGAAATCTCTCCCTGGTGGA	97882

CR938730.10	1351	TGGGTTTGCTCTACAATCTGCTCATGTGACAGCTGGGATTAGAGAAAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97883	TGGGTTTGCTCTACAATCTGCTCATGTGACAGCTGGGATTAGAGAAAAGA	97932

CR938730.10	1401	TTGTCATTTCTTGTCTCACTTCAGGACCCCATCAGCCCTCGGGCCACAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97933	TTGTCATTTCTTGTCTCACTTCAGGACCCCATCAGCCCTCGGGCCACAGG	97982

CR938730.10	1451	AGTGCTGAAATGGCTGGACAAGCACACTGTGTGTGACAAAAAACATCTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	97983	AGTGCTGAAATGGCTGGACAAGCACACTGTGTGTGACAAAAAACATCTCT	98032

CR938730.10	1501	GAGAGTCCTTAATAGATCCCTTCAAGCAAAGCTCTGTGTTCGACACAACT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98033	GAGAGTCCTTAATAGATCCCTTCAAGCAAAGCTCTGTGTTCGACACAACT	98082

CR938730.10	1551	TGAGCTCTATCAAGCATCTGCAGCAGGTAGCCATAGGAAATAATAAGGCA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98083	TGAGCTCTATCAAGCATCTGCAGCAGGTAGCCATAGGAAATAATAAGGCA	98132

CR938730.10	1601	ATATCACAACAGACAGACGTGTGTTATGACTGTATTATAGATGCAGGCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98133	ATATCACAACAGACAGACGTGTGTTATGACTGTATTATAGATGCAGGCTA	98182

CR938730.10	1651	ATCACTGTTACAAGTAGGAGTTTTCATTTATGCAAATATTTAAAAGACAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98183	ATCACTGTTACAAGTAGGAGTTTTCATTTATGCAAATATTTAAAAGACAA	98232

CR938730.10	1701	ACATGTTTAAGGAATGTTTAAGGAATAGACGACAAGTGACCAAGGAGTCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98233	ACATGTTTAAGGAATGTTTAAGGAATAGACGACAAGTGACCAAGGAGTCT	98282

CR938730.10	1751	ATCAGACCCCATGTACCTAAAATTCTACACTGTAAAAACGCCAACTTTCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98283	ATCAGACCCCATGTACCTAAAATTCTACACTGTAAAAACGCCAACTTTCA	98332

CR938730.10	1801	AAAAGTCCTCTGAACAAAGATTAATAAGTTAACTGAATTTAAATATTTTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98333	AAAAGTCCTCTGAACAAAGATTAATAAGTTAACTGAATTTAAATATTTTC	98382

CR938730.10	1851	ATTTGAAATGCTGACAAATAATAGTTAGTTTGTTCAAAAAATATGGTGCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98383	ATTTGAAATGCTGACAAATAATAGTTAGTTTGTTCAAAAAATATGGTGCT	98432

CR938730.10	1901	TCAATGTGAAAAACTTAAAATATTTCGTTGAACTAATACAAAATTCTTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98433	TCAATGTGAAAAACTTAAAATATTTCGTTGAACTAATACAAAATTCTTAG	98482

CR938730.10	1951	TTTAGCGTTGATGCGTGCCCTTCTTGTTGGCGCATGCGCCTTATAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897746.7	98483	TTTAGCGTTGATGCGTGCCCTTCTTGTTGGCGCATGCGCCTTATAAGCTT	98532

Overview

Query
CR938730.10 - 25749 bps
Hit
BX897746.7 - 98532 bps
Total alignments
3
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001946200012000196533985321
291.3493129398526-1279929251
381.85973051118411488-1606663791
Short-link