<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX901879.18	1	GAATTCAATAATGCCGTTAACACGAAGTAGAAGTTACGTTTTTTTTTCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	135822	GAATTCAATAATGCCGTTAACACGAAGTAGAAGTTACGTTTTTTTTTCAG	135871

BX901879.18	51	GTAACGTTACTATGGTCAAAAACTCACTCAAGATAAACTCACTGTACATT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	135872	GTAACGTTACTATGGTCAAAAACTCACTCAAGATAAACTCACTGTACATT	135921

BX901879.18	101	ATCTAATACCTCGCAAACACTACAAACACGGTCTGGCGTCGAATAACGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	135922	ATCTAATACCTCGCAAACACTACAAACACGGTCTGGCGTCGAATAACGTG	135971

BX901879.18	151	ACATAAGAACCTACAACTTAAGTACTTGGTTAATTATTTTAAATTACACA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	135972	ACATAAGAACCTACAACTTAAGTACTTGGTTAATTATTTTAAATTACACA	136021

BX901879.18	201	CACACTACACGGAAATATACACAAAACAATCCTTTAACGAACAGACTTTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136022	CACACTACACGGAAATATACACAAAACAATCCTTTAACGAACAGACTTTG	136071

BX901879.18	251	ACTTTTAAACACTTACCGAGGATGAATTTACTGGAAGAAAAGGCGACAGG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136072	ACTTTTAAACACTTACCGAGGATGAATTTACTGGAAGAAAAGGCGACAGG	136121

BX901879.18	301	TGGATTTCAAATTAGGAGAGCCGTTGCTTGCCTGGTGAAGGTCGAATCGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136122	TGGATTTCAAATTAGGAGAGCCGTTGCTTGCCTGGTGAAGGTCGAATCGA	136171

BX901879.18	351	GTCGGCTCGGTTCTATGAATCGGCTCCTTAGAGCAGTAAAGAGTCGAATC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136172	GTCGGCTCGGTTCTATGAATCGGCTCCTTAGAGCAGTAAAGAGTCGAATC	136221

BX901879.18	401	CGCCTAAAACCGATTCCTTTTTGTATATTATTGTAAGACACAACAATGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136222	CGCCTAAAACCGATTCCTTTTTGTATATTATTGTAAGACACAACAATGAC	136271

BX901879.18	451	TCATTACTATTTCGTTATACTGCTCGGCCACACGCATTTATACACATATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136272	TCATTACTATTTCGTTATACTGCTCGGCCACACGCATTTATACACATATT	136321

BX901879.18	501	GCTGAATGTGCTTGTGAACACGTGTGATAAAATAATTCCCGAGCAAACGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136322	GCTGAATGTGCTTGTGAACACGTGTGATAAAATAATTCCCGAGCAAACGG	136371

BX901879.18	551	TTCAATCCGATTCGGTTTCGTTTGAGTGCTGAACCGAACCAGTGCAAACG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136372	TTCAATCCGATTCGGTTTCGTTTGAGTGCTGAACCGAACCAGTGCAAACG	136421

BX901879.18	601	TGATATTGATAAAATAGTAATATTGTTTTTTTTTTCACTTTACCAGCAAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136422	TGATATTGATAAAATAGTAATATTGTTTTTTTTTTCACTTTACCAGCAAA	136471

BX901879.18	651	AATATTACATATATCTGACTTTAACAATAAGAATAAGGTTCGCTTGAAGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136472	AATATTACATATATCTGACTTTAACAATAAGAATAAGGTTCGCTTGAAGT	136521

BX901879.18	701	GTTTTGAGAATTAATATTTTTTTCTCCCAGAGTTCATTTCACACCAACAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136522	GTTTTGAGAATTAATATTTTTTTCTCCCAGAGTTCATTTCACACCAACAA	136571

BX901879.18	751	GCAAATATAATGGCGGATGAGAAAAGCCAGATCATATCATAAATATTACG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136572	GCAAATATAATGGCGGATGAGAAAAGCCAGATCATATCATAAATATTACG	136621

BX901879.18	801	TTTAATATGTCACGAAATGAAGTTTTATCAGTTTTTCATGCGAGAATGTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136622	TTTAATATGTCACGAAATGAAGTTTTATCAGTTTTTCATGCGAGAATGTA	136671

BX901879.18	851	GTTCTTCCAAACTCAAATCTGTGGTTTGTTTATAGATATCATGTCTAATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136672	GTTCTTCCAAACTCAAATCTGTGGTTTGTTTATAGATATCATGTCTAATT	136721

BX901879.18	901	TTAAGTGTGCTTTGCCGATAGGGGATATTCTGACCTCCAGGGGTTGACGG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136722	TTAAGTGTGCTTTGCCGATAGGGGATATTCTGACCTCCAGGGGTTGACGG	136771

BX901879.18	951	CGCTCCATCACTCATGTATACGGCAAACCTCATGCTTTAATCGGCTTAGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136772	CGCTCCATCACTCATGTATACGGCAAACCTCATGCTTTAATCGGCTTAGA	136821

BX901879.18	1001	AATTATTGAGACATGCCCCTGTCTTCGATGGCTCGATAATAAATGTGTTA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136822	AATTATTGAGACATGCCCCTGTCTTCGATGGCTCGATAATAAATGTGTTA	136871

BX901879.18	1051	TGAAATAAACTTTTAACCGTTTTTCATGCGAGAATGTAGTTGTTTTAAAC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136872	TGAAATAAACTTTTAACCGTTTTTCATGCGAGAATGTAGTTGTTTTAAAC	136921

BX901879.18	1101	TCAAGTCTGTGGTTTTTTTATTAAGATAGTGCGTATTTTAAAATGTTGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136922	TCAAGTCTGTGGTTTTTTTATTAAGATAGTGCGTATTTTAAAATGTTGTT	136971

BX901879.18	1151	TTGAAAATGCGGAGATATGTGACCTCTACAGTGGGTGCCCAATATTCTTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	136972	TTGAAAATGCGGAGATATGTGACCTCTACAGTGGGTGCCCAATATTCTTG	137021

BX901879.18	1201	AATCCGTCTAAAGCAGGTTGGTCACTCTGACATTTAAGCTGACTTTGAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137022	AATCCGTCTAAAGCAGGTTGGTCACTCTGACATTTAAGCTGACTTTGAAA	137071

BX901879.18	1251	TCATTTTGTGTGTTTAACAGTCTTTGGTTACGTGAATCAATTATTTTTGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137072	TCATTTTGTGTGTTTAACAGTCTTTGGTTACGTGAATCAATTATTTTTGT	137121

BX901879.18	1301	TCCAATTTAAGTTTTGGTTTAGCACAAAGTTATGTTTATTAAATATTATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137122	TCCAATTTAAGTTTTGGTTTAGCACAAAGTTATGTTTATTAAATATTATT	137171

BX901879.18	1351	TAATATTTCCATGTTACCTTATAAAATGAAGGTGCAGTGCACCCAAAAAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137172	TAATATTTCCATGTTACCTTATAAAATGAAGGTGCAGTGCACCCAAAAAT	137221

BX901879.18	1401	GGAAAACCAGGGGACATTTAATGCACTGAACAGTCTAAAGAAACTGGTTA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137222	GGAAAACCAGGGGACATTTAATGCACTGAACAGTCTAAAGAAACTGGTTA	137271

BX901879.18	1451	GGTTATTTACTTCACAAAATAATTTGTCTAAAAATAAATAAACATAATAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137272	GGTTATTTACTTCACAAAATAATTTGTCTAAAAATAAATAAACATAATAA	137321

BX901879.18	1501	TCATAATATATAGTGTGTGTGGAGTTGATCTTGGTCATTTGCAGTACTGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137322	TCATAATATATAGTGTGTGTGGAGTTGATCTTGGTCATTTGCAGTACTGT	137371

BX901879.18	1551	ATTTAGATGCACAGTAACTGATTTTTCTCCAAAATTCATTGTAAAATCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137372	ATTTAGATGCACAGTAACTGATTTTTCTCCAAAATTCATTGTAAAATCTA	137421

BX901879.18	1601	CAGTAACATACTGTTAACCATGTTCACAGTATAGAAAAGTTGAAAATACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137422	CAGTAACATACTGTTAACCATGTTCACAGTATAGAAAAGTTGAAAATACA	137471

BX901879.18	1651	TTATTATACTGTGAAAACAACAATATATACAGTAACAAACTGTGCACAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137472	TTATTATACTGTGAAAACAACAATATATACAGTAACAAACTGTGCACAGC	137521

BX901879.18	1701	TTATACAGTAAAAAACTGTTGAGAAATGCAGTATAATACTGTGAAAACAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137522	TTATACAGTAAAAAACTGTTGAGAAATGCAGTATAATACTGTGAAAACAA	137571

BX901879.18	1751	CAGAAATCGTTTACAGTGTAGCTAAAGCCCGCCCGAAAAGTAACTAAATG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137572	CAGAAATCGTTTACAGTGTAGCTAAAGCCCGCCCGAAAAGTAACTAAATG	137621

BX901879.18	1801	TTGCCAGATGGCGTCATGCACTAATTTACACATCAGTGACGTCATCACAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137622	TTGCCAGATGGCGTCATGCACTAATTTACACATCAGTGACGTCATCACAT	137671

BX901879.18	1851	AGTATCTGACAAGCGTCATCATGTCTCTACTCTCTGAGGAGCTGTGTATT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137672	AGTATCTGACAAGCGTCATCATGTCTCTACTCTCTGAGGAGCTGTGTATT	137721

BX901879.18	1901	TTATTATATTTAAACATTACATCCAGATGCATAATGCATAGGTTCTTATT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137722	TTATTATATTTAAACATTACATCCAGATGCATAATGCATAGGTTCTTATT	137771

BX901879.18	1951	GACATATTTCGCTGCATGAGACGTCATTGCGTAATCACAACTCAAAACTA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897745.14	137772	GACATATTTCGCTGCATGAGACGTCATTGCGTAATCACAACTCAAAACTA	137821

Overview

Query
BX901879.18 - 152392 bps
Hit
BX897745.14 - 137821 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193020001200011358221378211
290.6388131126837126967121586217131
381.94113285143742144026121603218901
487.011152265533755562-126827270801
590.6364974989449990126827269221
688.41801395542055558-129790299271
782.85166373114765115137136991373691
884.1260128134914135041-161374614991
988.342143542413624489168376687181
109292124138925139048168381685051
1190.7477109126856126964168398685051
1284.161894573369134147168884693441
1386.751883938779488186169008694071
141005811965826700169424695421
1586.3768135149346149480-170369705001
1684.29992115535255562-190626908351
1789.731282094989450102190626908391
1886.43681356167561809197477976161
1992.215777138925139001-11033381034141
2095.8347966579667411095791096741
2184.651332918959089880-11186331189121
Short-link