<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX324175.6	1	AAGCTTAAATAAGCGATTGATGTGTTTGTGTACAGTGTTTTTTGTATTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214408	AAGCTTAAATAAGCGATTGATGTGTTTGTGTACAGTGTTTTTTGTATTCT	214457

BX324175.6	51	GGAGGGTGTTTATAAGGTCACAGCCCAGACCGGTTTGATCTTATTGTTGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214458	GGAGGGTGTTTATAAGGTCACAGCCCAGACCGGTTTGATCTTATTGTTGC	214507

BX324175.6	101	AGTAGAGGTCACTGCACCTCAAAGACACAGCAACACTGCGTGCCTGGAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214508	AGTAGAGGTCACTGCACCTCAAAGACACAGCAACACTGCGTGCCTGGAGC	214557

BX324175.6	151	AACACCGCAGCTCAGGCAGATCTCAGGGAAACAGTCAGGCATATCTCAAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214558	AACACCGCAGCTCAGGCAGATCTCAGGGAAACAGTCAGGCATATCTCAAT	214607

BX324175.6	201	GTCACCTGGACACGTGCCTCTTTACCAAAGCCTTTATAAAGTTTGAATAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214608	GTCACCTGGACACGTGCCTCTTTACCAAAGCCTTTATAAAGTTTGAATAT	214657

BX324175.6	251	ATGAGAGCTATATTTGATGCTTCAAGTCGATATGCTAAAAATTGGTTAAG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214658	ATGAGAGCTATATTTGATGCTTCAAGTCGATATGCTAAAAATTGGTTAAG	214707

BX324175.6	301	TTTATGAATGGGCCACCATCTTTATTGGTAACAAACAGCCTACATAAAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214708	TTTATGAATGGGCCACCATCTTTATTGGTAACAAACAGCCTACATAAAGA	214757

BX324175.6	351	GCGTACTCACACTATGTACTTGAACCAGGTCGAAGGACGCATGTCCTCCC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214758	GCGTACTCACACTATGTACTTGAACCAGGTCGAAGGACGCATGTCCTCCC	214807

BX324175.6	401	TCCCGTCTCCCTCGACTTCCCGCACTCACATTGCATTTGGGCCTGAGCAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214808	TCCCGTCTCCCTCGACTTCCCGCACTCACATTGCATTTGGGCCTGAGCAC	214857

BX324175.6	451	GCTTACGTCAATGATGCGCTAATTAGTTTAAGAAGCACTCTCGGTCAGCA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214858	GCTTACGTCAATGATGCGCTAATTAGTTTAAGAAGCACTCTCGGTCAGCA	214907

BX324175.6	501	CAGCGAAAATTTCTTTATATTGTTAAATCATTTTGAAATGCAGTGACACA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214908	CAGCGAAAATTTCTTTATATTGTTAAATCATTTTGAAATGCAGTGACACA	214957

BX324175.6	551	CAGTCAAATATTTTGCCAAACAGATCCGCTACTTTTAACGAACATAAACA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	214958	CAGTCAAATATTTTGCCAAACAGATCCGCTACTTTTAACGAACATAAACA	215007

BX324175.6	601	ATCATTAAGTTCTCATGCTGCAGGAATTATGGGGTTTGTTAAAGGTGCAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215008	ATCATTAAGTTCTCATGCTGCAGGAATTATGGGGTTTGTTAAAGGTGCAG	215057

BX324175.6	651	CTGTCGTGCAGTGAGGGGATTGCGTCTTTAACAATCTATGAAAGTTTGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215058	CTGTCGTGCAGTGAGGGGATTGCGTCTTTAACAATCTATGAAAGTTTGTT	215107

BX324175.6	701	TTCATTGAACAGTAAGAATGATTAATAAATACATATGAAACAGTTCCTTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215108	TTCATTGAACAGTAAGAATGATTAATAAATACATATGAAACAGTTCCTTA	215157

BX324175.6	751	AAAGTCACTTCTCGTCTTCAGTTTCGGGCTCAGGCGTGCTTTGCACTCAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215158	AAAGTCACTTCTCGTCTTCAGTTTCGGGCTCAGGCGTGCTTTGCACTCAG	215207

BX324175.6	801	GGCCTACTCACACTATGCCATCCGTACCGTGCCCAGGCCCGTTTCCCGGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215208	GGCCTACTCACACTATGCCATCCGTACCGTGCCCAGGCCCGTTTCCCGGA	215257

BX324175.6	851	TCGTTTGAGAAGTGTGAGTGCGCTGAATCGGGCTCAAGCACGGTTCACTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215258	TCGTTTGAGAAGTGTGAGTGCGCTGAATCGGGCTCAAGCACGGTTCACTT	215307

BX324175.6	901	GGCCGGCCCTGGCCCGGTTAGAAGAGGTGTGCCTGAGCGCGGATCACTTG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215308	GGCCGGCCCTGGCCCGGTTAGAAGAGGTGTGCCTGAGCGCGGATCACTTG	215357

BX324175.6	951	GGCTTTGGCGCGGTACGCTTGTGTGTGAGTGCAAAACGCACCAAAGCCCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215358	GGCTTTGGCGCGGTACGCTTGTGTGTGAGTGCAAAACGCACCAAAGCCCG	215407

BX324175.6	1001	AAACTGAAAGCGAGACGTGACTTTTAAGGGGTTGTTTCATATGGATTTAT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215408	AAACTGAAAGCGAGACGTGACTTTTAAGGGGTTGTTTCATATGGATTTAT	215457

BX324175.6	1051	TAATCATTCTTACTGTTCAGTGATCGCAAATCACTGAACGCAAAGTGATC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215458	TAATCATTCTTACTGTTCAGTGATCGCAAATCACTGAACGCAAAGTGATC	215507

BX324175.6	1101	TGCCGTAGTTTTTTAAAGACGCAAACCCCTCACTGCACGTCAGCTGTGCG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215508	TGCCGTAGTTTTTTAAAGACGCAAACCCCTCACTGCACGTCAGCTGTGCG	215557

BX324175.6	1151	CCTTCAGCAGACCTCCTCTTCCTGCAGCACGAGAGCTTTATGATTGTTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215558	CCTTCAGCAGACCTCCTCTTCCTGCAGCACGAGAGCTTTATGATTGTTTA	215607

BX324175.6	1201	TGAGCGCCAAAAGTGGCGGATCTGTCCGGTGAAATATCTGACTGCGTGTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215608	TGAGCGCCAAAAGTGGCGGATCTGTCCGGTGAAATATCTGACTGCGTGTC	215657

BX324175.6	1251	ACCGCATCCCTAAGGACTGTTTGGCGAAATATTTGACTCCATGTCAATGC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215658	ACCGCATCCCTAAGGACTGTTTGGCGAAATATTTGACTCCATGTCAATGC	215707

BX324175.6	1301	ATAACAAACGACTAAGGATATAACTAGAGAAATCTCCACTGTGCTACTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215708	ATAACAAACGACTAAGGATATAACTAGAGAAATCTCCACTGTGCTACTGG	215757

BX324175.6	1351	GTGAGAGCGTATGGCAAGCTGTTTTAGCATTTAAACCTTGTTCTGACTAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215758	GTGAGAGCGTATGGCAAGCTGTTTTAGCATTTAAACCTTGTTCTGACTAT	215807

BX324175.6	1401	CCATAAATATATTTAGATATATCTCTAATTATATTTTGACTAGTCATAAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215808	CCATAAATATATTTAGATATATCTCTAATTATATTTTGACTAGTCATAAT	215857

BX324175.6	1451	TATAATTCGACTAGTCAGATTGGAGATATCTGCAAATATATTATGACTGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215858	TATAATTCGACTAGTCAGATTGGAGATATCTGCAAATATATTATGACTGA	215907

BX324175.6	1501	CTAGTCATATTCCTCCATTACCTTCCATTGAAAAATATTTGCAGATATTT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215908	CTAGTCATATTCCTCCATTACCTTCCATTGAAAAATATTTGCAGATATTT	215957

BX324175.6	1551	CTAAATAAGTTTTGACTAGTCACAATTGTAATTAGAGATTTCTCCAAATG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	215958	CTAAATAAGTTTTGACTAGTCACAATTGTAATTAGAGATTTCTCCAAATG	216007

BX324175.6	1601	AATTTTGACTAGTCAAAAATCCAATTCAAGATATCTACAACTGTAATTCG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216008	AATTTTGACTAGTCAAAAATCCAATTCAAGATATCTACAACTGTAATTCG	216057

BX324175.6	1651	ACTAGTAGTAAATTATTTAGAGATATCTTCAAATATATTTGTAAATATCT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216058	ACTAGTAGTAAATTATTTAGAGATATCTTCAAATATATTTGTAAATATCT	216107

BX324175.6	1701	CTAAATATGACGAATTAAAGATATCTCCAAATGTATTATGACTAGTAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216108	CTAAATATGACGAATTAAAGATATCTCCAAATGTATTATGACTAGTAAAA	216157

BX324175.6	1751	ACTCAGTTAGAGATATCTCTAATTACAATTGTTACTAGTCAAAATTCATT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216158	ACTCAGTTAGAGATATCTCTAATTACAATTGTTACTAGTCAAAATTCATT	216207

BX324175.6	1801	TGAAGATATATCTAATTACAATTGTGACTAATCAAAACTCATTTAGAGAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216208	TGAAGATATATCTAATTACAATTGTGACTAATCAAAACTCATTTAGAGAT	216257

BX324175.6	1851	ATCTGCAAATATTTTTCAATGGAAGTCAATGGAGGAATATGACTAGTCAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216258	ATCTGCAAATATTTTTCAATGGAAGTCAATGGAGGAATATGACTAGTCAT	216307

BX324175.6	1901	AATATATTTGCAGATATCTCCAATCTGATTTCGTACTAGTACAATTGTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216308	AATATATTTGCAGATATCTCCAATCTGATTTCGTACTAGTACAATTGTAA	216357

BX324175.6	1951	TTGCAGATATCTCTAATTGTCATTCTGAGTAGTGGAATTATAATTATGAC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX897719.9	216358	TTGCAGATATCTCTAATTGTCATTCTGAGTAGTGGAATTATAATTATGAC	216407

Overview

Query
BX324175.6 - 222879 bps
Hit
BX897719.9 - 216407 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196720001200012144082164071
283.7732872827240279671303937651
388.292153574005940415-1602463901
488.522213562133292136841602863931
586.2915729028449287381609563931
684.371643225551755838-19996103151
779.85241789118566119354-122341231241
891.671872594015840416-140428406911
982.171643615548255842-156299566571
1087.862103604005640415169856702011
1183.43181500134975135474185896863841
1283.06159359213329213687-11065181068771
1385.9619235121333021368011110391113871
1488.68300471209434209904-11198461203221
1587.62342611273552796511370101376231
1684.99191379653226570011452651456371
1783.43148314936229393511491171494361
1886.4541474019036419110311525741533111
1985.74249453184555185007-11647121651671
2086.2159291178908179198-11647581650541
2184.61149345135088135432-11764501768001
2282.3416546414651928-12158722163351
Short-link