<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571666.10	1	GTGACACCACGATCAAGTCACATTTTCCAAAAATATTACATTTTTTAATA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148299	GTGACACCACGATCAAGTCACATTTTCCAAAAATATTACATTTTTTAATA	148348

BX571666.10	51	TATTTTTAAAATATTAATCCCTATATAAATTCCCCCTTTTTGTTATATTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148349	TATTTTTAAAATATTAATCCCTATATAAATTCCCCCTTTTTGTTATATTG	148398

BX571666.10	101	ATTCACTTTTGCTCAGTGCAGATTTGCAAATGTTTTTAAATATAAAAAAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148399	ATTCACTTTTGCTCAGTGCAGATTTGCAAATGTTTTTAAATATAAAAAAG	148448

BX571666.10	151	GTTTCTAATAATTTCAAAATTATTCTCTCTTATTCTGTTTTTAATGTTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148449	GTTTCTAATAATTTCAAAATTATTCTCTCTTATTCTGTTTTTAATGTTCT	148498

BX571666.10	201	AAATTTTTCATCTTCCGCCCTTCCTCGACTTCTGGATGCAAATAAAAATC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148499	AAATTTTTCATCTTCCGCCCTTCCTCGACTTCTGGATGCAAATAAAAATC	148548

BX571666.10	251	TGCATGAATACCATTTTTTTACTCTTTCTTTTGTTTTAATAATTTGCTTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148549	TGCATGAATACCATTTTTTTACTCTTTCTTTTGTTTTAATAATTTGCTTT	148598

BX571666.10	301	CCACATTCCTTCATCCTCTTCCCTCTTCTGGCCCGCAGTCCCTCACTCAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148599	CCACATTCCTTCATCCTCTTCCCTCTTCTGGCCCGCAGTCCCTCACTCAA	148648

BX571666.10	351	ACCCCCCTTTTCTCCTTTTCCGTCTTGTTTAAAGACGTTTCAGTTCAGCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148649	ACCCCCCTTTTCTCCTTTTCCGTCTTGTTTAAAGACGTTTCAGTTCAGCT	148698

BX571666.10	401	GTCACAAATTATGTTCGCCTGCCCAGCTGTCAAAACAGGGGTGTGTTTTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148699	GTCACAAATTATGTTCGCCTGCCCAGCTGTCAAAACAGGGGTGTGTTTTT	148748

BX571666.10	451	CTCTTTGCACCCGATATACTACTAAAAGAGAGAGACTGGGAGATGTGGGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148749	CTCTTTGCACCCGATATACTACTAAAAGAGAGAGACTGGGAGATGTGGGG	148798

BX571666.10	501	GAGATGGGGGGTTAAAGAAAGAGAGAGAGATAGAAAGAGAGGAAAGGAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148799	GAGATGGGGGGTTAAAGAAAGAGAGAGAGATAGAAAGAGAGGAAAGGAGG	148848

BX571666.10	551	GAGGGGTGGAGGGGGCTTTAATGTTCATGTTTGGACACAAGCAATTATCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148849	GAGGGGTGGAGGGGGCTTTAATGTTCATGTTTGGACACAAGCAATTATCT	148898

BX571666.10	601	CTAATTATTGTTTTTCTTTTCAGTTTCCCTGTCCTGATGGAGGTCCCAGG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148899	CTAATTATTGTTTTTCTTTTCAGTTTCCCTGTCCTGATGGAGGTCCCAGG	148948

BX571666.10	651	CAGACCAACAAGCAGTAATCCGGCCTCGTTGAAGAGGCCCAGCGGGCCCC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148949	CAGACCAACAAGCAGTAATCCGGCCTCGTTGAAGAGGCCCAGCGGGCCCC	148998

BX571666.10	701	ATGGTGCAGCTCGTCCGTGGGACTCTCGGGCTTTCATCTCAATGTGAGTC	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	148999	ATGGTGCAGCTCGTCCGTGGGACTCTCGGGCTTTCATCTCAATGTGAGTC	149048

BX571666.10	751	TGGAGTTGATTCAAACACAGAGCGATGGGTGAATTAACCCCAAAGCCCTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149049	TGGAGTTGATTCAAACACAGAGCGATGGGTGAATTAACCCCAAAGCCCTG	149098

BX571666.10	801	GCTTTCAATGGGCTCAGCTAAGAGATTATATGTGTTGATGGCAGGCCTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149099	GCTTTCAATGGGCTCAGCTAAGAGATTATATGTGTTGATGGCAGGCCTTT	149148

BX571666.10	851	TATATAAGAGATTATATGTGTTGATGGCAAAACTTTTATATGTTCTGGTC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149149	TATATAAGAGATTATATGTGTTGATGGCAAAACTTTTATATGTTCTGGTC	149198

BX571666.10	901	TTTAAAGAAACTTCTGCTAGATGTTCAGTGTGGTTGTGGTGGATTAGAAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149199	TTTAAAGAAACTTCTGCTAGATGTTCAGTGTGGTTGTGGTGGATTAGAAA	149248

BX571666.10	951	TCCTCAACCCTTCATTTCTGCTCACCTTTCTTTCCTCTTCCCTTCTCCTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149249	TCCTCAACCCTTCATTTCTGCTCACCTTTCTTTCCTCTTCCCTTCTCCTT	149298

BX571666.10	1001	CCGCATTATATTTCTATATAAGTTTTATCATTTTGATTACATGAATATAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149299	CCGCATTATATTTCTATATAAGTTTTATCATTTTGATTACATGAATATAG	149348

BX571666.10	1051	GTTACCTCAAATTTATAAAACTATATTTAGGAATGATTTTCATTATCCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149349	GTTACCTCAAATTTATAAAACTATATTTAGGAATGATTTTCATTATCCCC	149398

BX571666.10	1101	TTATTCCCTGTTGCATAATGTGTATTAGAAAGTGTTATTTAGCCCACAAA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149399	TTATTCCCTGTTGCATAATGTGTATTAGAAAGTGTTATTTAGCCCACAAA	149448

BX571666.10	1151	ACTGCAAACATATGACTTTTTATTTCAATTAGTTGACAGGTACATAGGTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149449	ACTGCAAACATATGACTTTTTATTTCAATTAGTTGACAGGTACATAGGTA	149498

BX571666.10	1201	TCAATTAGTTTCTAAAACAAAAACAGATAACCCATCATATTGGACTATAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149499	TCAATTAGTTTCTAAAACAAAAACAGATAACCCATCATATTGGACTATAA	149548

BX571666.10	1251	AAATACAATGCCAGAACAACAAAATTACTACAATTTTTAAAATAATACAA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149549	AAATACAATGCCAGAACAACAAAATTACTACAATTTTTAAAATAATACAA	149598

BX571666.10	1301	TTCAAAATCTGAATATTTACGCAATCTTGTCAAAATTACAGTTTGAGATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149599	TTCAAAATCTGAATATTTACGCAATCTTGTCAAAATTACAGTTTGAGATC	149648

BX571666.10	1351	ATCAAGATTTCTTTATATATCCATTGAAAGGGGTCTCTTATGCTCGCCAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149649	ATCAAGATTTCTTTATATATCCATTGAAAGGGGTCTCTTATGCTCGCCAA	149698

BX571666.10	1401	ACGCCAATTTCGACAGGAGCACATGCTCTTGATTGACCCGGCTGGCCCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149699	ACGCCAATTTCGACAGGAGCACATGCTCTTGATTGACCCGGCTGGCCCAC	149748

BX571666.10	1451	ATCAGCTAATCACGATCCTCTAATCAAAGGATCTCAAGTCACTATACAGC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149749	ATCAGCTAATCACGATCCTCTAATCAAAGGATCTCAAGTCACTATACAGC	149798

BX571666.10	1501	ACTGTATATATATATGGATATATATATCCTCATTTCCTTTCTACAGCTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149799	ACTGTATATATATATGGATATATATATCCTCATTTCCTTTCTACAGCTAT	149848

BX571666.10	1551	CTTCGTCTGCAAGAAGTCCCCCTCCTCTCCTTCTTCCACCTTTATCCTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149849	CTTCGTCTGCAAGAAGTCCCCCTCCTCTCCTTCTTCCACCTTTATCCTGA	149898

BX571666.10	1601	ATGGGTGGCATAGTGGCCCAGTGACTAGCACTGTTGCCTCACAGCAAGAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149899	ATGGGTGGCATAGTGGCCCAGTGACTAGCACTGTTGCCTCACAGCAAGAA	149948

BX571666.10	1651	CAATGGTGCTGGGCCCTCGCTGGGCTATTGGGTATTTCTGTGTGGAGTTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149949	CAATGGTGCTGGGCCCTCGCTGGGCTATTGGGTATTTCTGTGTGGAGTTT	149998

BX571666.10	1701	GCAATGTCCTCCTCGTGTCCGTGTGGGTTTCCCCCAGGTTCCCCAGTTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	149999	GCAATGTCCTCCTCGTGTCCGTGTGGGTTTCCCCCAGGTTCCCCAGTTTT	150048

BX571666.10	1751	CTCCCACCTTCCAAATATGCTCTATATTATAGACAAAATAAGCTTAAATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	150049	CTCCCACCTTCCAAATATGCTCTATATTATAGACAAAATAAGCTTAAATC	150098

BX571666.10	1801	TTTTTTCTAAATGTCTTAATCTCAGGAAGTTCACCTTCGCCTCAGCAGCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	150099	TTTTTTCTAAATGTCTTAATCTCAGGAAGTTCACCTTCGCCTCAGCAGCG	150148

BX571666.10	1851	GGAGATTTTTGAGATCGACCTGAGCTCAATCTGCCCTCGCCCTGCGAAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	150149	GGAGATTTTTGAGATCGACCTGAGCTCAATCTGCCCTCGCCCTGCGAAAG	150198

BX571666.10	1901	GGAGGGAGCCCTGGGGCCAAGGATCCCTTCAGCTCAGGGCTTTCTCCCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	150199	GGAGGGAGCCCTGGGGCCAAGGATCCCTTCAGCTCAGGGCTTTCTCCCTG	150248

BX571666.10	1951	GACAGCATGCTAAACAAGCTATGTATAAATCATGAGCTAAGTGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX679670.2	150249	GACAGCATGCTAAACAAGCTATGTATAAATCATGAGCTAAGTGTGAATTC	150298

Overview

Query
BX571666.10 - 115940 bps
Hit
BX679670.2 - 150298 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196220001200011482991502981
288.61941597341073568-1736175181
385.92303580101383101962114993155891
488.84433668101965102632115668163301
577.789334877608107-117826181761
682.51152844295043233117886181821
791.13901245988160004135579357021
893.2392120108696108815-149371494881
983.531252754231342587-154004542641
1086.11262354299943233154042542641
1187.51742845988160164-162844631311
1286.881583296332063648-165562658811
1389.03911577341073566-165636657901
1490.09821233604736169-179176792961
1584.51362724231242583-188526887961
1680.16822364299943234188560887961
1781.961593845817158554-11199561203321
1881.061774759280975411200231204921
1984.94173333698597019111205061208371
2086.433135548366891911231191236781
2183.832875916025060840-11231291237281
Short-link