<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  AL591471.8	131871	GAATTCTTTAAGAGTAAAGAACCTATATCAAACACATTAGCATGCCTGTC	131822
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	103930	GAATTCTTTAAGAGTAAAGAACCTATATCAAACACATTAGCATGCCTGTC	103979

C  AL591471.8	131821	TGTGACAAGGGATAAGGAATAAAAAAATGAAACAAGTAAAACCAGAGAAA	131772
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	103980	TGTGACAAGGGATAAGGAATAAAAAAATGAAACAAGTAAAACCAGAGAAA	104029

C  AL591471.8	131771	CTTGTAGGAAACAATAATGATAATGTCTCATGAAGTAAAGAATGTGATTA	131722
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104030	CTTGTAGGAAACAATAATGATAATGTCTCATGAAGTAAAGAATGTGATTA	104079

C  AL591471.8	131721	ATTTTTTGCAACTGTGGTATAAAAACAGATTGTCAAAATCAAATGTAATG	131672
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104080	ATTTTTTGCAACTGTGGTATAAAAACAGATTGTCAAAATCAAATGTAATG	104129

C  AL591471.8	131671	AGCTTTAGCATAGAGCTTATTGTAGGGAAAAAATCAAATTTAAATACTTA	131622
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104130	AGCTTTAGCATAGAGCTTATTGTAGGGAAAAAATCAAATTTAAATACTTA	104179

C  AL591471.8	131621	GTTTATATAGTTTGATGCAGGAATGGTCTCCTATGTGAAGTAGTAAGATA	131572
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104180	GTTTATATAGTTTGATGCAGGAATGGTCTCCTATGTGAAGTAGTAAGATA	104229

C  AL591471.8	131571	CACTAAACAATCCATGGGTGTATGGGAAGAAAATACTCAAAATGCTACTT	131522
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104230	CACTAAACAATCCATGGGTGTATGGGAAGAAAATACTCAAAATGCTACTT	104279

C  AL591471.8	131521	ACATTTATTTTTTACTCATTTTTCCAACAGTTTAATATCTAAATGCTAGG	131472
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104280	ACATTTATTTTTTACTCATTTTTCCAACAGTTTAATATCTAAATGCTAGG	104329

C  AL591471.8	131471	GGAGGCCAGATGTGATGACTCCCTGTCATTACACCTGTAATCCCAGTGCT	131422
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104330	GGAGGCCAGATGTGATGACTCCCTGTCATTACACCTGTAATCCCAGTGCT	104379

C  AL591471.8	131421	TGGTTGGAGAGGGTGGGGGTCAAGGCAGGAAGAACACTTGAGGCCAAGAG	131372
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104380	TGGTTGGAGAGGGTGGGGGTCAAGGCAGGAAGAACACTTGAGGCCAAGAG	104429

C  AL591471.8	131371	TTCTAGACCAGCCTGGGAAACCTAGTCGGTTTTTGTGTCCACACACAAAA	131322
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104430	TTCTAGACCAGCCTGGGAAACCTAGTCGGTTTTTGTGTCCACACACAAAA	104479

C  AL591471.8	131321	AAATTAAAAATTAGCCAAGCATGATGTCATGCACCTGTAGTTCCATGTAC	131272
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104480	AAATTAAAAATTAGCCAAGCATGATGTCATGCACCTGTAGTTCCATGTAC	104529

C  AL591471.8	131271	TGGAGAGGCTGAAGCAGGAGGATCACCTGAGGGAGGAGTTTGAGGCTGCA	131222
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104530	TGGAGAGGCTGAAGCAGGAGGATCACCTGAGGGAGGAGTTTGAGGCTGCA	104579

C  AL591471.8	131221	GTGAGCAATGATTATTCCACTGCACCATAGCCTGGGTGACAGAATGAGAC	131172
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104580	GTGAGCAATGATTATTCCACTGCACCATAGCCTGGGTGACAGAATGAGAC	104629

C  AL591471.8	131171	CCTGTCTCTTAAGTGGAAATAAGTAAGTGCGAGGAGAACACGTGATCTTT	131122
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104630	CCTGTCTCTTAAGTGGAAATAAGTAAGTGCGAGGAGAACACGTGATCTTT	104679

C  AL591471.8	131121	CTAGTTTTCAGTCCCTCTTGCAGTTCCCTGTAGATTATTTTGCTTATTCC	131072
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104680	CTAGTTTTCAGTCCCTCTTGCAGTTCCCTGTAGATTATTTTGCTTATTCC	104729

C  AL591471.8	131071	CAATGTTCCAGCTGTCTGCACATTGTAGGCTTGTTCTTCTACCTACTCAA	131022
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104730	CAATGTTCCAGCTGTCTGCACATTGTAGGCTTGTTCTTCTACCTACTCAA	104779

C  AL591471.8	131021	GGCCCCAGATCCAGCAAATGTCCTCAGAGATGGGCTCTGCTGCTAATCTG	130972
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104780	GGCCCCAGATCCAGCAAATGTCCTCAGAGATGGGCTCTGCTGCTAATCTG	104829

C  AL591471.8	130971	TGATCACCAAGGAAGGGCTTGTTTTTCTCTGAAATTTAGTTCATTGACAC	130922
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104830	TGATCACCAAGGAAGGGCTTGTTTTTCTCTGAAATTTAGTTCATTGACAC	104879

C  AL591471.8	130921	TTTAGACCCACAATTTTTTGATGGCTTTAAACAAAAAAAAAATAATTTTT	130872
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104880	TTTAGACCCACAATTTTTTGATGGCTTTAAACAAAAAAAAAATAATTTTT	104929

C  AL591471.8	130871	TAAAGTTCATCCGATATTTTCTCATTATGGCAGGAGCAATTGTCTTTGGT	130822
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104930	TAAAGTTCATCCGATATTTTCTCATTATGGCAGGAGCAATTGTCTTTGGT	104979

C  AL591471.8	130821	AACTTTATTTTAATTGGAAGAAGAATTTCTAACATTGGCATTGTAATGAG	130772
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	104980	AACTTTATTTTAATTGGAAGAAGAATTTCTAACATTGGCATTGTAATGAG	105029

C  AL591471.8	130771	GTTTTTGGTCTTTGACCCTAGTGGAGCAATTAAATCCACGTCTATTTCTT	130722
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105030	GTTTTTGGTCTTTGACCCTAGTGGAGCAATTAAATCCACGTCTATTTCTT	105079

C  AL591471.8	130721	CTGTTATGCATGTATTGAAGGATCAAATGAGAAAATATATGTAGAGTGCA	130672
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105080	CTGTTATGCATGTATTGAAGGATCAAATGAGAAAATATATGTAGAGTGCA	105129

C  AL591471.8	130671	CAAAGTGTCTAATGTACACTAGTGATATACAGTTGTATTATGACTACACA	130622
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105130	CAAAGTGTCTAATGTACACTAGTGATATACAGTTGTATTATGACTACACA	105179

C  AL591471.8	130621	CCGAAAACACATAATCAACCAGATTGCTTCCTGAGAACTAGAGCCAGGCT	130572
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105180	CCGAAAACACATAATCAACCAGATTGCTTCCTGAGAACTAGAGCCAGGCT	105229

C  AL591471.8	130571	TTTCCAATGATACTTAACTGTCAAATAATTCTATTCAATTTTTCATGGGA	130522
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105230	TTTCCAATGATACTTAACTGTCAAATAATTCTATTCAATTTTTCATGGGA	105279

C  AL591471.8	130521	CTTAGGGTTTGGTCCATGAAGTGCTGCCACAGTATGCAAATCAATTATAT	130472
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105280	CTTAGGGTTTGGTCCATGAAGTGCTGCCACAGTATGCAAATCAATTATAT	105329

C  AL591471.8	130471	CAATAAATGTGCTAATTTATTCAGCAAACGTATTCTTGTAGCAATAGTTA	130422
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105330	CAATAAATGTGCTAATTTATTCAGCAAACGTATTCTTGTAGCAATAGTTA	105379

C  AL591471.8	130421	CTCAATGAAAGAAGTAACATATTTAATTTCTAGTAGAAGCTACTTCTCTC	130372
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105380	CTCAATGAAAGAAGTAACATATTTAATTTCTAGTAGAAGCTACTTCTCTC	105429

C  AL591471.8	130371	ATTGTGAACTCGGTACAAAGCTTGAATGCTCTAGCTATTTTGAGGAGCAT	130322
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105430	ATTGTGAACTCGGTACAAAGCTTGAATGCTCTAGCTATTTTGAGGAGCAT	105479

C  AL591471.8	130321	TAATAAGCATTACCTAAAGAAGATGATATATTCCCTAGACAACAAGAACT	130272
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105480	TAATAAGCATTACCTAAAGAAGATGATATATTCCCTAGACAACAAGAACT	105529

C  AL591471.8	130271	CTTATTTCTCTTTATCTTCTTTTTGATAAATGCTACAGTCTCTTGGTAGT	130222
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105530	CTTATTTCTCTTTATCTTCTTTTTGATAAATGCTACAGTCTCTTGGTAGT	105579

C  AL591471.8	130221	GAATCCAGATTCTGTGGTGTGGGGAAAAGAAAGAGAGATCAGACTGTTAC	130172
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105580	GAATCCAGATTCTGTGGTGTGGGGAAAAGAAAGAGAGATCAGACTGTTAC	105629

C  AL591471.8	130171	TGTGTCTATGTAGAAAGAAGTAGACATAAGAGACTCCATTTTGTTCTGTA	130122
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105630	TGTGTCTATGTAGAAAGAAGTAGACATAAGAGACTCCATTTTGTTCTGTA	105679

C  AL591471.8	130121	CTAAGAAAAATTCTTCTGCCTTGAGATGCTGTTAATCTGTAACCCTACCC	130072
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105680	CTAAGAAAAATTCTTCTGCCTTGAGATGCTGTTAATCTGTAACCCTACCC	105729

C  AL591471.8	130071	CCAACCCTGTGCTGGCAGAGACATGCACTGTGTTGACTCAAGGTTTAATG	130022
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105730	CCAACCCTGTGCTGGCAGAGACATGCACTGTGTTGACTCAAGGTTTAATG	105779

C  AL591471.8	130021	GATTTAGGGCTATGCAGGATGTGCTTTGTTAAACAAGTGCTTGAAGGCAG	129972
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105780	GATTTAGGGCTATGCAGGATGTGCTTTGTTAAACAAGTGCTTGAAGGCAG	105829

C  AL591471.8	129971	TTTGCTTGTTAAAAGTCATCACCACTCTCTAATCTCAAGTACCCAGGGAC	129922
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105830	TTTGCTTGTTAAAAGTCATCACCACTCTCTAATCTCAAGTACCCAGGGAC	105879

C  AL591471.8	129921	ACAATACACTACACACTACGGAAGGCTGCAGGGACCTCTGCCTAGGAAAG	129872
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX664727.7	105880	ACAATACACTACACACTACGGAAGGCTGCAGGGACCTCTGCCTAGGAAAG	105929

Overview

Query
AL591471.8 - 131871 bps
Hit
BX664727.7 - 105929 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
110002000129872131871-11039301059291
Short-link