<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX950863.8	1	TCTGTGTTTCTGACCCTGTGCTTGTTCTACGATTACGAAAGACATCTGCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214069	TCTGTGTTTCTGACCCTGTGCTTGTTCTACGATTACGAAAGACATCTGCC	214118

BX950863.8	51	TGCCCCTGATCTCCAGCCTGTTATTCTGACCAGTAAGATATCTGCCTGCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214119	TGCCCCTGATCTCCAGCCTGTTATTCTGACCAGTAAGATATCTGCCTGCC	214168

BX950863.8	101	TTTGAACTTTTGCCTGTCCCACGTTCTGTCTCCTGGATTGCCCCTTTGTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214169	TTTGAACTTTTGCCTGTCCCACGTTCTGTCTCCTGGATTGCCCCTTTGTG	214218

BX950863.8	151	TTTGTTTGTATGTGTGCTCTTAATAAAGCTTGCAAATGGATTCAATGCCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214219	TTTGTTTGTATGTGTGCTCTTAATAAAGCTTGCAAATGGATTCAATGCCT	214268

BX950863.8	201	TCTGACTCATCACAACAGAAGACTTCGCCACAACAGAATCCAGCAGCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214269	TCTGACTCATCACAACAGAAGACTTCGCCACAACAGAATCCAGCAGCTTT	214318

BX950863.8	251	AGCACAAGTTTCGACTGAACTTTCCGCTCAAGCCACTCAGTTAGCCACCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214319	AGCACAAGTTTCGACTGAACTTTCCGCTCAAGCCACTCAGTTAGCCACCC	214368

BX950863.8	301	ATCATCAACAACTCACCCATCTAACTTCTCTCACGGAGGAACTGGTGAGA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214369	ATCATCAACAACTCACCCATCTAACTTCTCTCACGGAGGAACTGGTGAGA	214418

BX950863.8	351	GCTATGCAGCAACTCCGTCATCCGAATCCTGCAGTTACCCCGCCTGCTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214419	GCTATGCAGCAACTCCGTCATCCGAATCCTGCAGTTACCCCGCCTGCTAC	214468

BX950863.8	401	CATGACAGCTTCTCAACCAACGCATGTCTCCAATGCTCCGGCTACCGTAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214469	CATGACAGCTTCTCAACCAACGCATGTCTCCAATGCTCCGGCTACCGTAA	214518

BX950863.8	451	GTCCCCGATTAGCTTTTCCTGAAAAGTTTGATGGGTCACCGTCTCGCTGC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214519	GTCCCCGATTAGCTTTTCCTGAAAAGTTTGATGGGTCACCGTCTCGCTGC	214568

BX950863.8	501	AAAGGCTTCTTATTGCAATGCAAACTATTTGTTAACCAACAACCTGCATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214569	AAAGGCTTCTTATTGCAATGCAAACTATTTGTTAACCAACAACCTGCATT	214618

BX950863.8	551	ATATCCCACTGATTCTAGTCGGGTGGCTTTTGTATGCAACCTGTTAACGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214619	ATATCCCACTGATTCTAGTCGGGTGGCTTTTGTATGCAACCTGTTAACGG	214668

BX950863.8	601	GGAAAGCGCTGGAATGGGCTACAGCGATATGGAAGGAGGAGGAATGTAAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214669	GGAAAGCGCTGGAATGGGCTACAGCGATATGGAAGGAGGAGGAATGTAAC	214718

BX950863.8	651	TATCCCACATTTGAAACTTTTCTCAAGCAATTTCGGGAAGTGTTCGAGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214719	TATCCCACATTTGAAACTTTTCTCAAGCAATTTCGGGAAGTGTTCGAGCA	214768

BX950863.8	701	CCCAGCAGATGGGAGAAGCCCCGGTGAGCAGTTACTTTCTCTTACACAGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214769	CCCAGCAGATGGGAGAAGCCCCGGTGAGCAGTTACTTTCTCTTACACAGG	214818

BX950863.8	751	GGCGTAACACAGCTGCAGAATACGCCTTGTCATTTCGCACTCTCGCCGCT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214819	GGCGTAACACAGCTGCAGAATACGCCTTGTCATTTCGCACTCTCGCCGCT	214868

BX950863.8	801	CAAACTAACTGGGTTGAGGATACACTGAAGACACTATTCAGACGGGGTCT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214869	CAAACTAACTGGGTTGAGGATACACTGAAGACACTATTCAGACGGGGTCT	214918

BX950863.8	851	GAATACCAATCTACAATCTGAATTGGCTTGCCGTGACGAAGGAAAGAAAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214919	GAATACCAATCTACAATCTGAATTGGCTTGCCGTGACGAAGGAAAGAAAT	214968

BX950863.8	901	TGAACGAACTCATTGAACTTACCATCCGTCTTGATCATCTGATTCGCAGC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	214969	TGAACGAACTCATTGAACTTACCATCCGTCTTGATCATCTGATTCGCAGC	215018

BX950863.8	951	CGTAGAAATCCTCGCACACAGCTCCATGTTTCAAGTGTCACGCCCCCTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215019	CGTAGAAATCCTCGCACACAGCTCCATGTTTCAAGTGTCACGCCCCCTGA	215068

BX950863.8	1001	TGAACCCATGCAACTGGGTTTCACCCGTCTCACCCATGAAGAAAGAATGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215069	TGAACCCATGCAACTGGGTTTCACCCGTCTCACCCATGAAGAAAGAATGC	215118

BX950863.8	1051	ATCGATTGCAAAATCATCTATGCCTGTACTGCGGTCAATCAGGGCACAGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215119	ATCGATTGCAAAATCATCTATGCCTGTACTGCGGTCAATCAGGGCACAGG	215168

BX950863.8	1101	AAATCCACCTGCAGCGTACGACCTCAGACACCAGTTCAATCGGTGAGTCC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215169	AAATCCACCTGCAGCGTACGACCTCAGACACCAGTTCAATCGGTGAGTCC	215218

BX950863.8	1151	TTCCCATGTTCCTGCACTTTTCAGTGTACTGATTCCTGTGATTATTAAAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215219	TTCCCATGTTCCTGCACTTTTCAGTGTACTGATTCCTGTGATTATTAAAT	215268

BX950863.8	1201	TTGATAAAAGAATGATTAATACTACGGCTCTTGTCGACTCTGGATCTGCC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215269	TTGATAAAAGAATGATTAATACTACGGCTCTTGTCGACTCTGGATCTGCC	215318

BX950863.8	1251	GGAAACTTTATATCTAAGAAATTTGCTTTATGTCACGAACTATCACTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215319	GGAAACTTTATATCTAAGAAATTTGCTTTATGTCACGAACTATCACTCAG	215368

BX950863.8	1301	CTCATATGATTCCTGTCTTGCAGTGGAAGCACTAGACGGTCGTCCTGTGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215369	CTCATATGATTCCTGTCTTGCAGTGGAAGCACTAGACGGTCGTCCTGTGG	215418

BX950863.8	1351	GTGAAGGACGCATCCGTATGATTACGAATAAGCTACAGTTACAAGTTGGT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215419	GTGAAGGACGCATCCGTATGATTACGAATAAGCTACAGTTACAAGTTGGT	215468

BX950863.8	1401	GTTCTACACATTGAAGAAATGCAATTCTACATTATTGATTCAGTTAATCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215469	GTTCTACACATTGAAGAAATGCAATTCTACATTATTGATTCAGTTAATCA	215518

BX950863.8	1451	TCCACTGGTGTTGGGACTGCCCTGGTTAAGGCGACATGATCCTCATATCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215519	TCCACTGGTGTTGGGACTGCCCTGGTTAAGGCGACATGATCCTCATATCT	215568

BX950863.8	1501	CCTGGAGGGACGGACAGATATTGCAGTGGAGTGAGTCATGCATGAAACAG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215569	CCTGGAGGGACGGACAGATATTGCAGTGGAGTGAGTCATGCATGAAACAG	215618

BX950863.8	1551	TGCATCCAGCCCATTCACAAAATTCCATTACGAACCACCAATGTGTTACC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215619	TGCATCCAGCCCATTCACAAAATTCCATTACGAACCACCAATGTGTTACC	215668

BX950863.8	1601	TGAACTCGTTGATGAACTAATCCCCATTGAGTACCATGACTTACATGAAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215669	TGAACTCGTTGATGAACTAATCCCCATTGAGTACCATGACTTACATGAAG	215718

BX950863.8	1651	CTTTTAGCAAACAAAAAGCTACTCAACTTCCCCCACATCGACCAAGTGAT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215719	CTTTTAGCAAACAAAAAGCTACTCAACTTCCCCCACATCGACCAAGTGAT	215768

BX950863.8	1701	TGTGCTATTGAGTTAATTCCAGGTTCAAGTCCTCCAACGGGTCGAATATT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215769	TGTGCTATTGAGTTAATTCCAGGTTCAAGTCCTCCAACGGGTCGAATATT	215818

BX950863.8	1751	CCCTCTGTCACAACCTGAGCACAAGGCAATGTCTGAATATATCGACGAGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215819	CCCTCTGTCACAACCTGAGCACAAGGCAATGTCTGAATATATCGACGAGG	215868

BX950863.8	1801	AATTGGCCAAGGGTTTCATCCGACCTTCTACATCTCCTGCTTCAGCTGGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215869	AATTGGCCAAGGGTTTCATCCGACCTTCTACATCTCCTGCTTCAGCTGGA	215918

BX950863.8	1851	TTCTTCTTTGTAAAGAAGAAAGATGGCAGTTTACGTCCCTGTATTGATTA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215919	TTCTTCTTTGTAAAGAAGAAAGATGGCAGTTTACGTCCCTGTATTGATTA	215968

BX950863.8	1901	CCGAGGGCTCAATGAAATCACCGTAAAATTCCGCTATCCATTACCCCTCG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	215969	CCGAGGGCTCAATGAAATCACCGTAAAATTCCGCTATCCATTACCCCTCG	216018

BX950863.8	1951	TACCTCCTGCCCTGGAACAATTAAGAAAGGCTAGCTATTATACCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX663607.13	216019	TACCTCCTGCCCTGGAACAATTAAGAAAGGCTAGCTATTATACCAAGCTT	216068

Overview

Query
BX950863.8 - 52390 bps
Hit
BX663607.13 - 216068 bps
Total alignments
22
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100199020001200012140692160681
284.332274531249312945173556740081
388.1664610641342414487174476755561
483.834118501080711656175560764191
583.64058501455015399175560764191
691.69232314100711038411021031024151
787.81283453124931294511025761030261
884.87184357130601341611032101035661
982.655051157142421539811040821052691
1082.01393939107171165511043081052691
1182.26227534950710040-11114811120211
1287.59248416363313674611233711237811
1382.6817239796521004811240741244771
1485.82222417141161453211263641267721
1580.561805121389114402-11366491371831
1688.851612601315813417-11375111377701
1788.992994531249312945-11379181383711
1890.044186171004910665-11385811391921
1985.62224173633136747-11398581402671
2088.317728190949374-11402351405161
2193.94355717153772312110362115921
221004534594510496812138272142851
Short-link