<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649636.8	1	CAACAAAATAATTCTCCTACTTCCTGGATTGTTTGTAGATTTTCAATTTG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82682	CAACAAAATAATTCTCCTACTTCCTGGATTGTTTGTAGATTTTCAATTTG	82731

BX649636.8	51	GCTGATCGAGCCCTAAATTCTTATCAGTGTTTATTTTGCTTATCAGTGGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82732	GCTGATCGAGCCCTAAATTCTTATCAGTGTTTATTTTGCTTATCAGTGGT	82781

BX649636.8	101	TTTCTTTCTTTCTCCTGCAGTTTCTAGCAGTGGACTGTCAGCTGGTGATG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82782	TTTCTTTCTTTCTCCTGCAGTTTCTAGCAGTGGACTGTCAGCTGGTGATG	82831

BX649636.8	151	GGCAGGCAAAAATACAGCCTCGATCCCGAAGAATACATTTTCGCCGCTCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82832	GGCAGGCAAAAATACAGCCTCGATCCCGAAGAATACATTTTCGCCGCTCT	82881

BX649636.8	201	AATTATCTATCTGGACATCATTATGATATTCCTCTACATACTTATGATCC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82882	AATTATCTATCTGGACATCATTATGATATTCCTCTACATACTTATGATCC	82931

BX649636.8	251	TGGGCGGAGGCTCCAAAAATTAAACCCACACATACCCACACCCACACACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82932	TGGGCGGAGGCTCCAAAAATTAAACCCACACATACCCACACCCACACACA	82981

BX649636.8	301	AGTCGAGATGCTCTCCAAATCTACAGGTGAGGTGACCAGCTGCATTAAAC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	82982	AGTCGAGATGCTCTCCAAATCTACAGGTGAGGTGACCAGCTGCATTAAAC	83031

BX649636.8	351	CGTCTGACCTCAGGTTTCATCATTTCATTCATCTGCACTGCTCCCTCTAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83032	CGTCTGACCTCAGGTTTCATCATTTCATTCATCTGCACTGCTCCCTCTAC	83081

BX649636.8	401	CGGCTCAATGTCTCTGCTGCTTTGTGTTTGTATTGGTAAACATGCACTTA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83082	CGGCTCAATGTCTCTGCTGCTTTGTGTTTGTATTGGTAAACATGCACTTA	83131

BX649636.8	451	CATTATCCATATATAATCACGTCGTCTACTCTTTTCTAGTTTAGTCTCAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83132	CATTATCCATATATAATCACGTCGTCTACTCTTTTCTAGTTTAGTCTCAA	83181

BX649636.8	501	TAATGTTTTGTAAGTCAGTTAAATGCCTTAATATTTACGGTATTTTGCAT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83182	TAATGTTTTGTAAGTCAGTTAAATGCCTTAATATTTACGGTATTTTGCAT	83231

BX649636.8	551	CCATTAAATTAAAAACACCCCATAATGTGAATCATGAAAAGCTTTAATAT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83232	CCATTAAATTAAAAACACCCCATAATGTGAATCATGAAAAGCTTTAATAT	83281

BX649636.8	601	GTGACTATGCTCTTTTTTTGAATGCTTTAATGATATTAATAAAGCTTTTA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83282	GTGACTATGCTCTTTTTTTGAATGCTTTAATGATATTAATAAAGCTTTTA	83331

BX649636.8	651	TATATTTTTTTGTGTATCATGCATATTTATGACCAAATCTAGTGTATTTG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83332	TATATTTTTTTGTGTATCATGCATATTTATGACCAAATCTAGTGTATTTG	83381

BX649636.8	701	AATATATTATTTTAATATATAATATATATTAAACTTTTTCCAGTACTGGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83382	AATATATTATTTTAATATATAATATATATTAAACTTTTTCCAGTACTGGG	83431

BX649636.8	751	TTGCAGCTGGAAGGACATCCGCTGTGTAAAACATACAGTATGCTAGATAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83432	TTGCAGCTGGAAGGACATCCGCTGTGTAAAACATACAGTATGCTAGATAA	83481

BX649636.8	801	GTTGGCAGTTCATTCCACTGTGGTGACCCCTGGTTAATAAAGACACTAAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83482	GTTGGCAGTTCATTCCACTGTGGTGACCCCTGGTTAATAAAGACACTAAG	83531

BX649636.8	851	CCAAAGGAAAATAAATGAATGAATCATATATTAAATCATATAAATACATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83532	CCAAAGGAAAATAAATGAATGAATCATATATTAAATCATATAAATACATT	83581

BX649636.8	901	GTAATACATAAGTTTGATTACTATTTGTAATAATAATAATAATAAGCTAT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83582	GTAATACATAAGTTTGATTACTATTTGTAATAATAATAATAATAAGCTAT	83631

BX649636.8	951	ACCACTTATGATGTGATACTATACAAATATGAATACACTATATGAATAAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83632	ACCACTTATGATGTGATACTATACAAATATGAATACACTATATGAATAAA	83681

BX649636.8	1001	TCGTAAATATCCACCCTCTACCTGTTACAAACATGTTTTAAATTATTATT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83682	TCGTAAATATCCACCCTCTACCTGTTACAAACATGTTTTAAATTATTATT	83731

BX649636.8	1051	TTTTTGTTTTTGTTCATTTTGATAGAATGATATTTTGAAGAATGTTAGAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83732	TTTTTGTTTTTGTTCATTTTGATAGAATGATATTTTGAAGAATGTTAGAA	83781

BX649636.8	1101	ACCATCGACATCCGTAGTATTTTTTCCTACTATGGGTGCCAATGGACTCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83782	ACCATCGACATCCGTAGTATTTTTTCCTACTATGGGTGCCAATGGACTCA	83831

BX649636.8	1151	TGGATTTCAGTATGTATTTGTGTGTTCAATAGAAAACAAAACCACTTAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83832	TGGATTTCAGTATGTATTTGTGTGTTCAATAGAAAACAAAACCACTTAAG	83881

BX649636.8	1201	GGTGAGCACATTTCCATGTAAACTACACCTTTTAATGTGAAAATTCAGAC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83882	GGTGAGCACATTTCCATGTAAACTACACCTTTTAATGTGAAAATTCAGAC	83931

BX649636.8	1251	TCTGCCTCACCACAGTGTGAAGTAGACTAAAGAAGTATGTGGGCTTGGTA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83932	TCTGCCTCACCACAGTGTGAAGTAGACTAAAGAAGTATGTGGGCTTGGTA	83981

BX649636.8	1301	ATAAAATTCAGTGTGACAGAGGGTGTAGCCACCTTCATGTCATTCAAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	83982	ATAAAATTCAGTGTGACAGAGGGTGTAGCCACCTTCATGTCATTCAAAAT	84031

BX649636.8	1351	CTGAGTGCTTTCATTTTTTTCCACTGAGCACAAAAGAAACACTCTAAAGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84032	CTGAGTGCTTTCATTTTTTTCCACTGAGCACAAAAGAAACACTCTAAAGA	84081

BX649636.8	1401	ATCTCCTCGCAGCTGTCTTCCGAACAATGACAGTTTACAGTTCATCACGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84082	ATCTCCTCGCAGCTGTCTTCCGAACAATGACAGTTTACAGTTCATCACGG	84131

BX649636.8	1451	CCATGTGTGTCAAGTTCCCAATAGCACAATAAAGGGGGTGACAAGAAGCC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84132	CCATGTGTGTCAAGTTCCCAATAGCACAATAAAGGGGGTGACAAGAAGCC	84181

BX649636.8	1501	TATCAGCGTTTAACTGCTTAAATTTCACTATGTTCTACACACAAAGGTAT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84182	TATCAGCGTTTAACTGCTTAAATTTCACTATGTTCTACACACAAAGGTAT	84231

BX649636.8	1551	CATCAGAAGACTTGGAATTTAGCGAGAAATTTAGATGTACTCCCTGCTGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84232	CATCAGAAGACTTGGAATTTAGCGAGAAATTTAGATGTACTCCCTGCTGA	84281

BX649636.8	1601	CAGATGCTGTAACTAACTATTCTGGTAACAAACAAGCCTATTTACACTCA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84282	CAGATGCTGTAACTAACTATTCTGGTAACAAACAAGCCTATTTACACTCA	84331

BX649636.8	1651	CTTGTCACATGGTGTGTCACATGTAGACACACATATTAAAGTGAGCACCA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84332	CTTGTCACATGGTGTGTCACATGTAGACACACATATTAAAGTGAGCACCA	84381

BX649636.8	1701	GAATAGTGAACAAGTGTGATTTAAGTGACTTTAAAGAGCATGATTATTGA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84382	GAATAGTGAACAAGTGTGATTTAAGTGACTTTAAAGAGCATGATTATTGA	84431

BX649636.8	1751	GCCAGATGAGCTAGTCTGTGTTTTTTTTTTTAGATTTTCATGTACATCAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84432	GCCAGATGAGCTAGTCTGTGTTTTTTTTTTTAGATTTTCATGTACATCAT	84481

BX649636.8	1801	CTCTAGGGTTTACAGAGATAACTGGTCCAATGAAGAATAAATATCCAGTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84482	CTCTAGGGTTTACAGAGATAACTGGTCCAATGAAGAATAAATATCCAGTG	84531

BX649636.8	1851	AGTCACATGGGTCAATAAAGCCTTGTTGATGCCAGAGAAGAATTTTTAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84532	AGTCACATGGGTCAATAAAGCCTTGTTGATGCCAGAGAAGAATTTTTAAA	84581

BX649636.8	1901	CGGTTTCCAACTGATACAAAGACAACAGTAACTCAAATGAGCACTGCTTA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84582	CGGTTTCCAACTGATACAAAGACAACAGTAACTCAAATGAGCACTGCTTA	84631

BX649636.8	1951	CAGCAGAGGATTGCAGAAGAGCAACTCTGCATCATGACAAGTTAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649316.9	84632	CAGCAGAGGATTGCAGAAGAGCAACTCTGCATCATGACAAGTTAAAGCTT	84681

Overview

Query
BX649636.8 - 22306 bps
Hit
BX649316.9 - 84681 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001936200012000182682846811
283.8265140736875114798149331
Short-link