<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX296568.4	2	GGCCAACTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGG	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9134	GGCCAACTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGG	9183

BX296568.4	52	CCAGGATGGTATTGATCTATTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCC	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9184	CCAGGATGGTATTGATCTATTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCC	9233

BX296568.4	102	CAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCTGGACTAGAT	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9234	CAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACAGTGCCTGGCTGGACTAGAT	9283

BX296568.4	152	GATTTTTATCTCCGTGTGTGAGAAACATTTAATAATGTAATGTGTTTGTG	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9284	GATTTTTATCTCCGTGTGTGAGAAACATTTAATAATGTAATGTGTTTGTG	9333

BX296568.4	202	GCACAAGGGGGGAGTACAGATGCACGGGAGGCAGGAAGGGTTAGGTAAAG	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9334	GCACAAGGGGGGAGTACAGATGCACGGGAGGCAGGAAGGGTTAGGTAAAG	9383

BX296568.4	252	GGGAGCACAAAAGTTGAAGATGAGGTGCTGCCATCAATGCCAGGACTTCA	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9384	GGGAGCACAAAAGTTGAAGATGAGGTGCTGCCATCAATGCCAGGACTTCA	9433

BX296568.4	302	GGCCAAAGGCAGGGGCTGAGGAAGCCACAAGGGAGGACATTTTCTGCAGA	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9434	GGCCAAAGGCAGGGGCTGAGGAAGCCACAAGGGAGGACATTTTCTGCAGA	9483

BX296568.4	352	GTTGCTGAACCAGTAGCAACCAGATCCTGAGAAAGCCCTCTCTTATGGAA	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9484	GTTGCTGAACCAGTAGCAACCAGATCCTGAGAAAGCCCTCTCTTATGGAA	9533

BX296568.4	402	GAATAACAGCCAGGTGGGAAAGCTTTTCATCCTGCAAAGCTGGGGAAGAA	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9534	GAATAACAGCCAGGTGGGAAAGCTTTTCATCCTGCAAAGCTGGGGAAGAA	9583

BX296568.4	452	GGTTCCTCCTTGAATGTGGTCATCTTCACTTCAGCTCAGGAGTCCTGCAA	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9584	GGTTCCTCCTTGAATGTGGTCATCTTCACTTCAGCTCAGGAGTCCTGCAA	9633

BX296568.4	502	AAGACAGAGGAGAGTGTTGTTTTCAGATCTGGCTCTACTAACAGCTTCCT	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9634	AAGACAGAGGAGAGTGTTGTTTTCAGATCTGGCTCTACTAACAGCTTCCT	9683

BX296568.4	552	TTCCCCTCTTTCAAGGACTCAGATGAGAGCACTGCAGGAAGAAGAAAAAC	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9684	TTCCCCTCTTTCAAGGACTCAGATGAGAGCACTGCAGGAAGAAGAAAAAC	9733

BX296568.4	602	AAGTTCTTAAGTCTCCATGAGCCAGTACTCCTGCAGAGCACAGGCCTTTT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9734	AAGTTCTTAAGTCTCCATGAGCCAGTACTCCTGCAGAGCACAGGCCTTTT	9783

BX296568.4	652	CTATGTGGAGAGAAGGAGTTTTGGTGTAAATTGCCTGATCAGAAATTTGA	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9784	CTATGTGGAGAGAAGGAGTTTTGGTGTAAATTGCCTGATCAGAAATTTGA	9833

BX296568.4	702	ATCCAAAGTCTTTTTATTATTTCTGTCTCATGCCTTATCACCTCCACTAT	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9834	ATCCAAAGTCTTTTTATTATTTCTGTCTCATGCCTTATCACCTCCACTAT	9883

BX296568.4	752	CATTCTAGGGAAATTGAATCTGTTTCTAAAAGAGAATTAAAAGGTATTAC	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9884	CATTCTAGGGAAATTGAATCTGTTTCTAAAAGAGAATTAAAAGGTATTAC	9933

BX296568.4	802	CTGTTGGTTGAAGTCCAGAGTGTCCCAGGAGAAAGAGGAAAAGATATACA	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9934	CTGTTGGTTGAAGTCCAGAGTGTCCCAGGAGAAAGAGGAAAAGATATACA	9983

BX296568.4	852	CTTAAAAGATATGGAAGCAAATCTGTCCTCCAACACAATGTCCCAGCCCC	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	9984	CTTAAAAGATATGGAAGCAAATCTGTCCTCCAACACAATGTCCCAGCCCC	10033

BX296568.4	902	AGATCTCCCACCTGAGATTTGTCTAACACCACAACCCACAGCAACCAGGG	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10034	AGATCTCCCACCTGAGATTTGTCTAACACCACAACCCACAGCAACCAGGG	10083

BX296568.4	952	CAGAGAGGAGCAGAAACAGACCATGTGACCCATGAAGCGTGATATGTCTG	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10084	CAGAGAGGAGCAGAAACAGACCATGTGACCCATGAAGCGTGATATGTCTG	10133

BX296568.4	1002	TCACACGATCCAGTGTAATTGCATTAGTCTTAGTGGCTCTTCCTTAATTT	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10134	TCACACGATCCAGTGTAATTGCATTAGTCTTAGTGGCTCTTCCTTAATTT	10183

BX296568.4	1052	GCTCCAGGATGTCAAACGAAAGGACTCTTTTTTTTTGAGATGGAATGTCA	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10184	GCTCCAGGATGTCAAACGAAAGGACTCTTTTTTTTTGAGATGGAATGTCA	10233

BX296568.4	1102	CTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAG	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10234	CTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAG	10283

BX296568.4	1152	CTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCACGAGTAGC	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10284	CTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCACGAGTAGC	10333

BX296568.4	1202	TGGGACTGCAGGCGCCCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10334	TGGGACTGCAGGCGCCCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAG	10383

BX296568.4	1252	TAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACC	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10384	TAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACC	10433

BX296568.4	1302	TGATGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGGCGTGA	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10434	TGATGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTAGGATTACAGGCGTGA	10483

BX296568.4	1352	GCCACCATGCCTGGCCTAAGGACTCTTTCTTATTAACCTTTCTCTTATCA	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10484	GCCACCATGCCTGGCCTAAGGACTCTTTCTTATTAACCTTTCTCTTATCA	10533

BX296568.4	1402	CTGCAGGCCATAAGCTATTATGCTTTGACATAGTAACCATGCACTGATGA	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10534	CTGCAGGCCATAAGCTATTATGCTTTGACATAGTAACCATGCACTGATGA	10583

BX296568.4	1452	TTTCTGGATTATCAGGACATTGGAGGTCATTTGCGGAAAGAAAGGCTTTA	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10584	TTTCTGGATTATCAGGACATTGGAGGTCATTTGCGGAAAGAAAGGCTTTA	10633

BX296568.4	1502	TCTAGGGCCACTCATATACTGAGAACTAACCTCAGCAAAGCCATATTTCC	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10634	TCTAGGGCCACTCATATACTGAGAACTAACCTCAGCAAAGCCATATTTCC	10683

BX296568.4	1552	TCCTCCAGATAAGTCTATGGAGAGAGCCGATACAAAAGACTCCTCAGCTT	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10684	TCCTCCAGATAAGTCTATGGAGAGAGCCGATACAAAAGACTCCTCAGCTT	10733

BX296568.4	1602	TCTGATTCCTGAAGTAGATGAACAGCCCGGCCCCAAGGAAGAGCAGGCCC	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10734	TCTGATTCCTGAAGTAGATGAACAGCCCGGCCCCAAGGAAGAGCAGGCCC	10783

BX296568.4	1652	AGCACGAAGCCCCCGACTCCACTCAGCATCTTGCTCTGTGCAGATTCAGA	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10784	AGCACGAAGCCCCCGACTCCACTCAGCATCTTGCTCTGTGCAGATTCAGA	10833

BX296568.4	1702	CCATGCTCCTGAGAGAGGAAGCAAGGATTAGTGATTTTTATCCTAAATGG	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10834	CCATGCTCCTGAGAGAGGAAGCAAGGATTAGTGATTTTTATCCTAAATGG	10883

BX296568.4	1752	AACCTCTTTAATTGAGACCCTGAGATTCAGAGCTTTGAAAATAAGAGAGA	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10884	AACCTCTTTAATTGAGACCCTGAGATTCAGAGCTTTGAAAATAAGAGAGA	10933

BX296568.4	1802	AGGCTTCCCTGCAAGAATGAAAATAACTGATCATTTCTGGAGAAAAAAAT	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10934	AGGCTTCCCTGCAAGAATGAAAATAACTGATCATTTCTGGAGAAAAAAAT	10983

BX296568.4	1852	GATTTTCAAATCACACTGCACAGTTACAAGGTTCAGGCATCAAACTCATT	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	10984	GATTTTCAAATCACACTGCACAGTTACAAGGTTCAGGCATCAAACTCATT	11033

BX296568.4	1902	CAAATATTACAGCCTTGATGTAAGGCACAACTTCAACATCTGATCAACAG	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	11034	CAAATATTACAGCCTTGATGTAAGGCACAACTTCAACATCTGATCAACAG	11083

BX296568.4	1952	AAAGTCTGAGACTCAATGAGGTTAAGTAGTTTGGCTAGAGTGACAGAGCT	2001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX649210.7	11084	AAAGTCTGAGACTCAATGAGGTTAAGTAGTTTGGCTAGAGTGACAGAGCT	11133

Overview

Query
BX296568.4 - 87738 bps
Hit
BX649210.7 - 11133 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link