<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571815.16	1	CTGACGCCGCCAACTCATTGGCATTTCATTGGCCCGTTTTATTACTCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212179	CTGACGCCGCCAACTCATTGGCATTTCATTGGCCCGTTTTATTACTCCTT	212228

BX571815.16	51	CAAATGATTGGCTTTCTGGCAAAATCCCCATAGTGGAAGTTTTTCACGTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212229	CAAATGATTGGCTTTCTGGCAAAATCCCCATAGTGGAAGTTTTTCACGTA	212278

BX571815.16	101	GTATTGGAGTTCCCCTCCTGCTGGGGAACTCAAGTGATTGGCATCGTTGA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212279	GTATTGGAGTTCCCCTCCTGCTGGGGAACTCAAGTGATTGGCATCGTTGA	212328

BX571815.16	151	TGGTAAAAGAGTCTGGCATTACTGTGACATTGTAAATTACAATAGAGAAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212329	TGGTAAAAGAGTCTGGCATTACTGTGACATTGTAAATTACAATAGAGAAG	212378

BX571815.16	201	CTTTAACAACCCTAGAACCTATAATAAAGTTTAATAGTGAAATATAAATT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212379	CTTTAACAACCCTAGAACCTATAATAAAGTTTAATAGTGAAATATAAATT	212428

BX571815.16	251	TATTGGTAGTGAAATGTAAGTTTTAACTACGAAAAGGTTGACAATATATA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212429	TATTGGTAGTGAAATGTAAGTTTTAACTACGAAAAGGTTGACAATATATA	212478

BX571815.16	301	TATTTTTTTCATATAATTTGTTATACAAGTACAGTATGTGTCCAAACTTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212479	TATTTTTTTCATATAATTTGTTATACAAGTACAGTATGTGTCCAAACTTC	212528

BX571815.16	351	TCTTTATATTAATGAAAGATTAAGAATAATCTCTCAAATTTAAGACATAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212529	TCTTTATATTAATGAAAGATTAAGAATAATCTCTCAAATTTAAGACATAA	212578

BX571815.16	401	GTGAATTTTATATACAAACCTGATATGTTTTGTCTGCCAGTTCATCATCT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212579	GTGAATTTTATATACAAACCTGATATGTTTTGTCTGCCAGTTCATCATCT	212628

BX571815.16	451	TCATCCTTTTTTATAGGAAAGCCACAGAAAGAAGAAATTACTTATTTATT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212629	TCATCCTTTTTTATAGGAAAGCCACAGAAAGAAGAAATTACTTATTTATT	212678

BX571815.16	501	TTATCAATGGGACAATTGTTTTTTCTTGTTCTTTTTTTTTTACACAGATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212679	TTATCAATGGGACAATTGTTTTTTCTTGTTCTTTTTTTTTTACACAGATA	212728

BX571815.16	551	TTTTGTTTAGGTGTTGTACATGAATTGTAAAGTTGACAAACCTACAATTT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212729	TTTTGTTTAGGTGTTGTACATGAATTGTAAAGTTGACAAACCTACAATTT	212778

BX571815.16	601	AATGATGTTACCTCTGTCTCCTGTGTCTCATTGTCTGCAGCTGATTCTCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212779	AATGATGTTACCTCTGTCTCCTGTGTCTCATTGTCTGCAGCTGATTCTCT	212828

BX571815.16	651	CTTCCTTATATCTTTGCTTAAATCCGTTGTTACTGGCACTTGACAAGGAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212829	CTTCCTTATATCTTTGCTTAAATCCGTTGTTACTGGCACTTGACAAGGAA	212878

BX571815.16	701	ACGTATACAAAGCAGAAGAATACAAATACATAAACATTTGAATGGTCATT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212879	ACGTATACAAAGCAGAAGAATACAAATACATAAACATTTGAATGGTCATT	212928

BX571815.16	751	GCAGTTCCCCATTTAAGGTTTAAGCAATAAAAACAAGTAAATGGATGGAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212929	GCAGTTCCCCATTTAAGGTTTAAGCAATAAAAACAAGTAAATGGATGGAA	212978

BX571815.16	801	GGGTTTGGCTTTTAAATTTGATTTGTTTTAATTTTGCATGCACTTCTAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	212979	GGGTTTGGCTTTTAAATTTGATTTGTTTTAATTTTGCATGCACTTCTAAA	213028

BX571815.16	851	TTACCATACAAATTTTAACTAAATAATTTATACAGATGAATAATGTTGAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213029	TTACCATACAAATTTTAACTAAATAATTTATACAGATGAATAATGTTGAT	213078

BX571815.16	901	GATGGTACATTTAAATACTTTTGACTCACCCAAGAGTAATACATTTTCCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213079	GATGGTACATTTAAATACTTTTGACTCACCCAAGAGTAATACATTTTCCT	213128

BX571815.16	951	CATCAAAAGCTGTTCTTAATCTTATCTTATTTTTTGTTTTACTTTTTAAC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213129	CATCAAAAGCTGTTCTTAATCTTATCTTATTTTTTGTTTTACTTTTTAAC	213178

BX571815.16	1001	CTCAAAGGACACTTGCACAATATTTTTATCAGTTTGTACTAAACTCCTAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213179	CTCAAAGGACACTTGCACAATATTTTTATCAGTTTGTACTAAACTCCTAG	213228

BX571815.16	1051	TTCATAAACGATTTGGTAGAGCAAAAAGAAAATAAAATCCAAATATTTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213229	TTCATAAACGATTTGGTAGAGCAAAAAGAAAATAAAATCCAAATATTTAA	213278

BX571815.16	1101	GCTCAGATATTGAAGTTAATAAAAAAATGTTTTCTAATCTTCCAGTTGTT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213279	GCTCAGATATTGAAGTTAATAAAAAAATGTTTTCTAATCTTCCAGTTGTT	213328

BX571815.16	1151	TTATCATTTGTGTGATATATTCACAGAGACTGCTATTCTTAACCTTTCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213329	TTATCATTTGTGTGATATATTCACAGAGACTGCTATTCTTAACCTTTCTG	213378

BX571815.16	1201	TTTAAAAAAAAAAAACTTTTTTATTAATACTATTATTATTGTTATTTTTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213379	TTTAAAAAAAAAAAACTTTTTTATTAATACTATTATTATTGTTATTTTTG	213428

BX571815.16	1251	CCCATGTAATATCTATAATTTACTTCGTGAGTTATAAGAATAAAATATGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213429	CCCATGTAATATCTATAATTTACTTCGTGAGTTATAAGAATAAAATATGG	213478

BX571815.16	1301	CATATATACCTATAATATCTTACATCATTGTATTATGTCTCATATAAAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213479	CATATATACCTATAATATCTTACATCATTGTATTATGTCTCATATAAAAT	213528

BX571815.16	1351	TTTAGACATTTTTAGACACATTAACACATTGAACAAATTCCTCGTTTCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213529	TTTAGACATTTTTAGACACATTAACACATTGAACAAATTCCTCGTTTCTT	213578

BX571815.16	1401	GCTTGCAATAATCTGGCATCCTGAACTGAATGATGTAATTTCATTCCACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213579	GCTTGCAATAATCTGGCATCCTGAACTGAATGATGTAATTTCATTCCACA	213628

BX571815.16	1451	TCACAACGACTTTTTAAAACGTGAAGAAACATGAAACAGCGGTTAACATC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213629	TCACAACGACTTTTTAAAACGTGAAGAAACATGAAACAGCGGTTAACATC	213678

BX571815.16	1501	AGCTATAAAGAGAAATGTAACTTACCAGCAGGTAATATTTTGTCTCTGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213679	AGCTATAAAGAGAAATGTAACTTACCAGCAGGTAATATTTTGTCTCTGGA	213728

BX571815.16	1551	GTACACATAATATGATCCCAAATATATGAATATATAAAAAAGTATGCATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213729	GTACACATAATATGATCCCAAATATATGAATATATAAAAAAGTATGCATA	213778

BX571815.16	1601	TGATAAGCAAATAAAAAAAGTAAACCATCAACCTGCGCTGGTTTAATGTT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213779	TGATAAGCAAATAAAAAAAGTAAACCATCAACCTGCGCTGGTTTAATGTT	213828

BX571815.16	1651	CTCAATGCCAACATTTTGCTGGACACTGAGGAACAAAATGATGTACAGAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213829	CTCAATGCCAACATTTTGCTGGACACTGAGGAACAAAATGATGTACAGAA	213878

BX571815.16	1701	GGCATGTCGTGTTTTACACCGCTTCTACGGAAAACCGGATAAACGAGATA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213879	GGCATGTCGTGTTTTACACCGCTTCTACGGAAAACCGGATAAACGAGATA	213928

BX571815.16	1751	GGAGTTTGTATGACAAAGATTAGTTGAATGTCCTGTTGGACGTACTACTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213929	GGAGTTTGTATGACAAAGATTAGTTGAATGTCCTGTTGGACGTACTACTA	213978

BX571815.16	1801	TATTCAAAATAAACATGTAAATTTCTGCCGAGACCTGTGTCTGCGTAGGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	213979	TATTCAAAATAAACATGTAAATTTCTGCCGAGACCTGTGTCTGCGTAGGT	214028

BX571815.16	1851	AGAAATACTATGTTGATAAAACCAGGGTAAAATAAACGTAAAAGGTCAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	214029	AGAAATACTATGTTGATAAAACCAGGGTAAAATAAACGTAAAAGGTCAAA	214078

BX571815.16	1901	ATGTTTTATAAATGCTGAATGATTTAGGGTGAGGATCACATGATTATGTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	214079	ATGTTTTATAAATGCTGAATGATTTAGGGTGAGGATCACATGATTATGTT	214128

BX571815.16	1951	GAGCTCTTCTGAATTTTAAGTATTCCCATTGTTCCAATTTTTACAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640577.17	214129	GAGCTCTTCTGAATTTTAAGTATTCCCATTGTTCCAATTTTTACAAGCTT	214178

Overview

Query
BX571815.16 - 105739 bps
Hit
BX640577.17 - 214178 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link