<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX649222.6	1	AGGTTAAACAGTTAGGTAAGAACAAGGATTGGTGTTTTGGGGCCAACTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134521	AGGTTAAACAGTTAGGTAAGAACAAGGATTGGTGTTTTGGGGCCAACTTA	134570

BX649222.6	51	ATCTACTGCAGAGCTCTTCAGAAGGATCTGTTTCAATCTTACTGCCTCTA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134571	ATCTACTGCAGAGCTCTTCAGAAGGATCTGTTTCAATCTTACTGCCTCTA	134620

BX649222.6	101	ATTTTCATGGTAAGGCAATTGTATGCGAAATGACAGACCTTAGAAACATA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134621	ATTTTCATGGTAAGGCAATTGTATGCGAAATGACAGACCTTAGAAACATA	134670

BX649222.6	151	AAGACATGTTATAAGCTTACTTCCTTGGTAAGGAGAAGATTTTTTGGCCG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134671	AAGACATGTTATAAGCTTACTTCCTTGGTAAGGAGAAGATTTTTTGGCCG	134720

BX649222.6	201	CACTTTTTTAGCAAGTACAGGTTTTTGAGAGAGACTGCACTTACCATCCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134721	CACTTTTTTAGCAAGTACAGGTTTTTGAGAGAGACTGCACTTACCATCCT	134770

BX649222.6	251	CTCCACAATTATGATCTTTGGTCCAAGTTGTCTGTGAATCGCAAAAATGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134771	CTCCACAATTATGATCTTTGGTCCAAGTTGTCTGTGAATCGCAAAAATGT	134820

BX649222.6	301	GTATAAGTCTAAGTGTAAACACCATAAAATCAATGGCGAGGATTGTGCGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134821	GTATAAGTCTAAGTGTAAACACCATAAAATCAATGGCGAGGATTGTGCGG	134870

BX649222.6	351	CCAGCTTGAAAAGTTGAGTTCAGCATCCTGAAGAACAAATGAAAGATAAT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134871	CCAGCTTGAAAAGTTGAGTTCAGCATCCTGAAGAACAAATGAAAGATAAT	134920

BX649222.6	401	ACCAGATCTCAACAAGTACTACTGAGAAATCAGTTCTCAACTATTGCACT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134921	ACCAGATCTCAACAAGTACTACTGAGAAATCAGTTCTCAACTATTGCACT	134970

BX649222.6	451	GTTTCCAGCCATTGTCGAGTTAGGAAAAGGCAAGTGCTTCAGGCTTGTGG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	134971	GTTTCCAGCCATTGTCGAGTTAGGAAAAGGCAAGTGCTTCAGGCTTGTGG	135020

BX649222.6	501	TAGCTTATGTCAAGGTCATCACAGCTGTTAGAAAAATGCAACAATATCTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135021	TAGCTTATGTCAAGGTCATCACAGCTGTTAGAAAAATGCAACAATATCTG	135070

BX649222.6	551	TACTTTGGTGAGAAATGACCACAACGTGGAGGGACTCTGATTTGCTTGGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135071	TACTTTGGTGAGAAATGACCACAACGTGGAGGGACTCTGATTTGCTTGGC	135120

BX649222.6	601	TTCAAGGAGATACTAAGGGATAAATAAAGAAAAGGATTGTTTTGACTGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135121	TTCAAGGAGATACTAAGGGATAAATAAAGAAAAGGATTGTTTTGACTGAA	135170

BX649222.6	651	AGGGCTTGTAAAAAAAAGGAAAAGCAGAGCTTCTCTGCACAAGTGTTTGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135171	AGGGCTTGTAAAAAAAAGGAAAAGCAGAGCTTCTCTGCACAAGTGTTTGA	135220

BX649222.6	701	ATTTTCCAGTAAGGTTGTTGTGGTCTCTGGAACAACATCTGCAGGTCAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135221	ATTTTCCAGTAAGGTTGTTGTGGTCTCTGGAACAACATCTGCAGGTCAAT	135270

BX649222.6	751	AGGAATTTAGAGTCTCTTGTTGCAGAAACATAGCTCAAAACTCATAAAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135271	AGGAATTTAGAGTCTCTTGTTGCAGAAACATAGCTCAAAACTCATAAAAT	135320

BX649222.6	801	TAAATGTCATAGCTTGCCCTTGTGTGCGCGTGTATGCCAAGTGACAGGAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135321	TAAATGTCATAGCTTGCCCTTGTGTGCGCGTGTATGCCAAGTGACAGGAT	135370

BX649222.6	851	AGTCATAGCCCTTGCCCATAGCCCTGATGCTGACCATGCAAAACAGGTGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135371	AGTCATAGCCCTTGCCCATAGCCCTGATGCTGACCATGCAAAACAGGTGT	135420

BX649222.6	901	ATACATACCTGCAGGTTACCCCAATTATGAAGAGGAATATGGTCACCATA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135421	ATACATACCTGCAGGTTACCCCAATTATGAAGAGGAATATGGTCACCATA	135470

BX649222.6	951	TCACATTTATTCCAGTTATCCTCTACGTATAGTTTAAACTTTTTCATTAA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135471	TCACATTTATTCCAGTTATCCTCTACGTATAGTTTAAACTTTTTCATTAA	135520

BX649222.6	1001	ATTTGTGTCTTCATCTGTAAAGAAGCTCTGAAAAAGAGAAATGGTCATTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135521	ATTTGTGTCTTCATCTGTAAAGAAGCTCTGAAAAAGAGAAATGGTCATTG	135570

BX649222.6	1051	ACAGTGATCTGTTTGAAGTTTCACTATTTCGGTGGGAATTTTGACTTAAT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135571	ACAGTGATCTGTTTGAAGTTTCACTATTTCGGTGGGAATTTTGACTTAAT	135620

BX649222.6	1101	ACCTGTTTCATGTTTCTCTTTCACTGTAAAAACCATCAAAAATTCCTAGT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135621	ACCTGTTTCATGTTTCTCTTTCACTGTAAAAACCATCAAAAATTCCTAGT	135670

BX649222.6	1151	GTAGCATGTAAACAAGGTCAGTTTACTGTCTTAAAACACACACACACACA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135671	GTAGCATGTAAACAAGGTCAGTTTACTGTCTTAAAACACACACACACACA	135720

BX649222.6	1201	CACGCAAACTTTTTAATCTTGTGATGTAGGCCTAAGGATTTTTTAGGCCT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135721	CACGCAAACTTTTTAATCTTGTGATGTAGGCCTAAGGATTTTTTAGGCCT	135770

BX649222.6	1251	GATTTAAGGCTTCATCATCCTTCAGGCTGTTAAGAGATGTAACAAACATC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135771	GATTTAAGGCTTCATCATCCTTCAGGCTGTTAAGAGATGTAACAAACATC	135820

BX649222.6	1301	TAGAAAATAAATGTTGACAGGATATTGCTATCTAAACAGCATGTACAGAC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135821	TAGAAAATAAATGTTGACAGGATATTGCTATCTAAACAGCATGTACAGAC	135870

BX649222.6	1351	TGGTGTTTGAACGTGATAATTGCCTGTGAGCGCATGTTGGATTATCTACA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135871	TGGTGTTTGAACGTGATAATTGCCTGTGAGCGCATGTTGGATTATCTACA	135920

BX649222.6	1401	TAAGGAGCTGTCTCAACTGGCTTATAGCCTGGCATTCTCCATGTTTTACA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135921	TAAGGAGCTGTCTCAACTGGCTTATAGCCTGGCATTCTCCATGTTTTACA	135970

BX649222.6	1451	GGTTTATAATGAAATACTGTTTGTTTCAAACATTCTTGGTGTACTCTTCT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	135971	GGTTTATAATGAAATACTGTTTGTTTCAAACATTCTTGGTGTACTCTTCT	136020

BX649222.6	1501	GTTTATGGCCTTTCTGAATAACTTCAAATTAATAACAGAGATCCCCTTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136021	GTTTATGGCCTTTCTGAATAACTTCAAATTAATAACAGAGATCCCCTTTG	136070

BX649222.6	1551	CTGTCCCTGTTGCTTAAATTTCAAACACCTCTTCTTCTGGAGGAAGTGTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136071	CTGTCCCTGTTGCTTAAATTTCAAACACCTCTTCTTCTGGAGGAAGTGTT	136120

BX649222.6	1601	TATAACTGCTTTTCAGCCTAAAGAAGATTGCGAGGATAGTTTTATGCACC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136121	TATAACTGCTTTTCAGCCTAAAGAAGATTGCGAGGATAGTTTTATGCACC	136170

BX649222.6	1651	CACGATCGTCAGTGCACCAGCACCGTTGTTCCTGTATTATTTTGGTTGTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136171	CACGATCGTCAGTGCACCAGCACCGTTGTTCCTGTATTATTTTGGTTGTT	136220

BX649222.6	1701	GGACTGAAGAGTGCTCTGTTCCCCTTTCAGGGGCAGAGTATGGTTTCCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136221	GGACTGAAGAGTGCTCTGTTCCCCTTTCAGGGGCAGAGTATGGTTTCCAG	136270

BX649222.6	1751	TGTATGCTAATTGTGGATCTAGGAGTGTGGGGTGAAACCAGACAGATTTG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136271	TGTATGCTAATTGTGGATCTAGGAGTGTGGGGTGAAACCAGACAGATTTG	136320

BX649222.6	1801	CAAAGTGAAGGACACTTGAGTCTTAGCAGCCCGCTTGTTTATTGGCTGTA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136321	CAAAGTGAAGGACACTTGAGTCTTAGCAGCCCGCTTGTTTATTGGCTGTA	136370

BX649222.6	1851	GCTGAAGTGCTCTGGAAAAACAGAGGAGTATCTGCAGGTTTATGTGGAGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136371	GCTGAAGTGCTCTGGAAAAACAGAGGAGTATCTGCAGGTTTATGTGGAGG	136420

BX649222.6	1901	AGGAAGATGTTGGTTTGGGGGAGAGATTGTTTTGGGTAAGGTAACGTTTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136421	AGGAAGATGTTGGTTTGGGGGAGAGATTGTTTTGGGTAAGGTAACGTTTG	136470

BX649222.6	1951	TATTGCTTTTCTATGCAAAGCTGCATTTGGCAGTTGAAATCTTCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX640404.2	136471	TATTGCTTTTCTATGCAAAGCTGCATTTGGCAGTTGAAATCTTCAAGCTT	136520

Overview

Query
BX649222.6 - 121741 bps
Hit
BX640404.2 - 136520 bps
Total alignments
2
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100020001200011345211365201
2100196420001200011345211365201
Short-link