<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX005289.15	1	AGAGGGGCGCAACCAGCAACCTGTTCCTCGTCCTCCCTGACCTTGCACAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	182988	AGAGGGGCGCAACCAGCAACCTGTTCCTCGTCCTCCCTGACCTTGCACAG	183037

BX005289.15	51	TAACTGCGCGAGCAGGCTCACTGGGGGAAACGCGTATTTGCACATGCCCC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183038	TAACTGCGCGAGCAGGCTCACTGGGGGAAACGCGTATTTGCACATGCCCC	183087

BX005289.15	101	GAGGCCAGCTGTAAGCCAGTGCATCCGTGCCGAGAGCACTCGGTCAGGAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183088	GAGGCCAGCTGTAAGCCAGTGCATCCGTGCCGAGAGCACTCGGTCAGGAA	183137

BX005289.15	151	AGAACAACTGGCAATGAGCGATCTCGGGGGAAGCAACAGATCGATCTGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183138	AGAACAACTGGCAATGAGCGATCTCGGGGGAAGCAACAGATCGATCTGGG	183187

BX005289.15	201	CTTCCCCGAATCGCGCCCATATCAGCTGAACAGACTCGGGGTGGAGTCTC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183188	CTTCCCCGAATCGCGCCCATATCAGCTGAACAGACTCGGGGTGGAGTCTC	183237

BX005289.15	251	CATTCTCCAGGACGTAAGGCTGCCGTGAGAGCGCATCGGCTGCACGGTTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183238	CATTCTCCAGGACGTAAGGCTGCCGTGAGAGCGCATCGGCTGCACGGTTG	183287

BX005289.15	301	AGCTTGTCTGAATATGAATGGTGTGCAGCGATTTCAGCCACGGATGACTC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183288	AGCTTGTCTGAATATGAATGGTGTGCAGCGATTTCAGCCACGGATGACTC	183337

BX005289.15	351	CAGAGGAGCAGACGGCGGGCGAGCTGAGACATGCGGCGAGAGCGCATACC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183338	CAGAGGAGCAGACGGCGGGCGAGCTGAGACATGCGGCGAGAGCGCATACC	183387

BX005289.15	401	CCCATACGGCTGATATACGCCACCGCCGCCGTACTGTCCGTACTGACCAG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183388	CCCATACGGCTGATATACGCCACCGCCGCCGTACTGTCCGTACTGACCAG	183437

BX005289.15	451	CACGTGTTGCACTGCCAACAGCTCCAGGTGATATGCCAATGCAACTGGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183438	CACGTGTTGCACTGCCAACAGCTCCAGGTGATATGCCAATGCAACTGGGT	183487

BX005289.15	501	ACCTTTCCACAGGTCCGCAGCCACATGCCCGCATTGCACAGCCCCCTAGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183488	ACCTTTCCACAGGTCCGCAGCCACATGCCCGCATTGCACAGCCCCCTAGC	183537

BX005289.15	551	CCGTGTTGGAAGCGTCTGCTGAAACGACAACAAGACTGGACGCCTGTTCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183538	CCGTGTTGGAAGCGTCTGCTGAAACGACAACAAGACTGGACGCCTGTTCT	183587

BX005289.15	601	AGAGACACCCAGGCCTGTAGGAACGAGGGGTCGCTCCAAGGGCTGAGGGC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183588	AGAGACACCCAGGCCTGTAGGAACGAGGGGTCGCTCCAAGGGCTGAGGGC	183637

BX005289.15	651	GCGGCGACACAGCGCAGTAACAGAGACTCGGTGTGCGCGCGCGTGCCATG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183638	GCGGCGACACAGCGCAGTAACAGAGACTCGGTGTGCGCGCGCGTGCCATG	183687

BX005289.15	701	AGCGTCTGGGGACTCGATCGTGAAGCCAGTGCTGAAGTGGTCTCATATAG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183688	AGCGTCTGGGGACTCGATCGTGAAGCCAGTGCTGAAGTGGTCTCATATAG	183737

BX005289.15	751	AGTAATCCGAGCGGCATGAAGCGGCTGCGGATGCCATATGCCCCAGGAGC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183738	AGTAATCCGAGCGGCATGAAGCGGCTGCGGATGCCATATGCCCCAGGAGC	183787

BX005289.15	801	CTCTGAAATAGTTTCAGTTGGACCACTATTTTACTGTCAAGCTCTCTCAG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183788	CTCTGAAATAGTTTCAGTTGGACCACTATTTTACTGTCAAGCTCTCTCAG	183837

BX005289.15	851	ACAGTACAGCATCAGCTGAGCGCGCTCTCCGGAGAGGCGCGCTGCCATGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183838	ACAGTACAGCATCAGCTGAGCGCGCTCTCCGGAGAGGCGCGCTGCCATGG	183887

BX005289.15	901	TGACCGAGTCCAGCTCCAGCACGAGAGAAGAGATCCTCTGCACGGTTGCG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183888	TGACCGAGTCCAGCTCCAGCACGAGAGAAGAGATCCTCTGCACGGTTGCG	183937

BX005289.15	951	AGTTTGCTCTTTTCTCGGTTGACCTGAAACCCCAACAGGTGGAAGTGCCG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183938	AGTTTGCTCTTTTCTCGGTTGACCTGAAACCCCAACAGGTGGAAGTGCCG	183987

BX005289.15	1001	GAGCACTTTGTCTCTGTGCATAATCAATTGCTCCGAGAGAGGGCAAAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	183988	GAGCACTTTGTCTCTGTGCATAATCAATTGCTCCGAGAGAGGGCAAAAAA	184037

BX005289.15	1051	TCAGCCAGTCGTCAAGAAATTGAGTATGCAGATGCCCGCGAGCCGAAGGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184038	TCAGCCAGTCGTCAAGAAATTGAGTATGCAGATGCCCGCGAGCCGAAGGG	184087

BX005289.15	1101	GCGCTAAGGCACCCTCCGCGGGCTTGGTGAGGACCCGCGTAGACAGAGAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184088	GCGCTAAGGCACCCTCCGCGGGCTTGGTGAGGACCCGCGTAGACAGAGAG	184137

BX005289.15	1151	AGCCCGAAGGGTAGGGCTTTGTATTGCCTAGCTCGACCTTCAAACGCAAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184138	AGCCCGAAGGGTAGGGCTTTGTATTGCCTAGCTCGACCTTCAAACGCAAA	184187

BX005289.15	1201	CCGCAGAAACTGACGGTGGCGAGGAAGAGTGGAGACATGGAAATACGCGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184188	CCGCAGAAACTGACGGTGGCGAGGAAGAGTGGAGACATGGAAATACGCGT	184237

BX005289.15	1251	CCATCAGGTCTAATGCTGCAGACCAACCCAGAGGACGAACGCACCGGAGG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184238	CCATCAGGTCTAATGCTGCAGACCAACCCAGAGGACGAACGCACCGGAGG	184287

BX005289.15	1301	ATGCGCTTCTGCGTGAGCATTCTGAACAGCAGCTTGTGCAGACAGTGGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184288	ATGCGCTTCTGCGTGAGCATTCTGAACAGCAGCTTGTGCAGACAGTGGTT	184337

BX005289.15	1351	CAAAACGCGCAGATCTAGGATTGGCCGTGACCCACCGCTCTTTTTGGGCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184338	CAAAACGCGCAGATCTAGGATTGGCCGTGACCCACCGCTCTTTTTGGGCA	184387

BX005289.15	1401	CGATGAAGTGTGGGCTGTAAAACCCGCTCTCCATCTCGGCTGGAGGGAGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184388	CGATGAAGTGTGGGCTGTAAAACCCGCTCTCCATCTCGGCTGGAGGGAGC	184437

BX005289.15	1451	GGCTCGATTGCATCCTTCGCCAGGAGAACAGCAATCTCCTCCCGCAAGAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184438	GGCTCGATTGCATCCTTCGCCAGGAGAACAGCAATCTCCTCCCGCAAGAC	184487

BX005289.15	1501	AGGGGCGGACAGGGGGCTGACCCTGGTGAATACACACCCGTGACTTGGGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184488	AGGGGCGGACAGGGGGCTGACCCTGGTGAATACACACCCGTGACTTGGGG	184537

BX005289.15	1551	GGCCGTTTCGCGAACTGAATCGCATAGCCGAGTCTGATTGTGCGTATGTG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184538	GGCCGTTTCGCGAACTGAATCGCATAGCCGAGTCTGATTGTGCGTATGTG	184587

BX005289.15	1601	CCACCGCGAAGAGCTGGCCCGCGCTAACCAGGCAGGCCGAGCTCTCGCTA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184588	CCACCGCGAAGAGCTGGCCCGCGCTAACCAGGCAGGCCGAGCTCTCGCTA	184637

BX005289.15	1651	ATGGACTCATCGCTACAATCGCTGACGTACCAGCAGTGGGGCAGCGCGGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184638	ATGGACTCATCGCTACAATCGCTGACGTACCAGCAGTGGGGCAGCGCGGA	184687

BX005289.15	1701	GTGGGTGTGCTGATCCGGAAAGCGCGCGCGTCCCACGGAAAAGCTGGAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184688	GTGGGTGTGCTGATCCGGAAAGCGCGCGCGTCCCACGGAAAAGCTGGAGT	184737

BX005289.15	1751	TGAGATATTTGCTTCGCGGTCCGTTGCCAGACTTAGCGGCGTTCTGGGCA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184738	TGAGATATTTGCTTCGCGGTCCGTTGCCAGACTTAGCGGCGTTCTGGGCA	184787

BX005289.15	1801	GGGGGGCTGCCTGCTTCCGAGGTGCCCGACGCGCTCGTTTCGCCAGAGGC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184788	GGGGGGCTGCCTGCTTCCGAGGTGCCCGACGCGCTCGTTTCGCCAGAGGC	184837

BX005289.15	1851	GTGTGCGGGGGCGGAGCAGCTCTCGTAGACGGGCGCCTTCGGCGAGGAGC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184838	GTGTGCGGGGGCGGAGCAGCTCTCGTAGACGGGCGCCTTCGGCGAGGAGC	184887

BX005289.15	1901	AGGTATGAATGGCACGGCGGGCGGAGCGGGCTTACGGGGCCGCCGATTAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184888	AGGTATGAATGGCACGGCGGGCGGAGCGGGCTTACGGGGCCGCCGATTAG	184937

BX005289.15	1951	ACATCACCCATCAACTGCTCTCTCACCGCCTTGAATTCCTGGGTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX572633.7	184938	ACATCACCCATCAACTGCTCTCTCACCGCCTTGAATTCCTGGGTGAATTC	184987

Overview

Query
BX005289.15 - 155905 bps
Hit
BX572633.7 - 184987 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100197020001200011829881849871
285.83183348137594137941-1322435761
385.2617738589700900841930696851
483.841783707634076709110402107661
585.4190359137599137957110402107571
686.74216377132710133086-130160305361
787.32197344143554143897-138390387281
888.7233355115697116051143795441481
989.581772848013480417-175339756261
1087.21460795132292133086-179463802521
1195.86252314103407103720-185919862321
1285.742204838964390125-11120171124931
1382.1189454466244707711515781520241
1482.67197461707407120011515781520331
1579.95244753738277457911524341531911
1686.48485850768387768711550001558501
1787.56412695512555194911550841558071
1888.97181272785097878011563751566461
1981.61224604564095701211572711578681
2082.57247599806378123511573091578991
2187.558141356814308278511584391597951
2285.618071522575495907011585161600241
2395.3218121332883500-11809681811811
Short-link