<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX571844.6	1	AATGTCTGCCTTATATGAACTCGGCCACAACAAACATAAAGACTCACATC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181463	AATGTCTGCCTTATATGAACTCGGCCACAACAAACATAAAGACTCACATC	181512

BX571844.6	51	AAATGTGAAGCTTGGTCCTGGTTAATATCTGAAAAGTAAATGGAAAAAAA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181513	AAATGTGAAGCTTGGTCCTGGTTAATATCTGAAAAGTAAATGGAAAAAAA	181562

BX571844.6	101	TGTCTCTAGCCAGCAGTTATGCATATGCACAACCTATTGCAGTCTTTTCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181563	TGTCTCTAGCCAGCAGTTATGCATATGCACAACCTATTGCAGTCTTTTCC	181612

BX571844.6	151	TTTAAAGAGAGCATATAGAATTATGCCCATTGTCATAAGATAAAATATAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181613	TTTAAAGAGAGCATATAGAATTATGCCCATTGTCATAAGATAAAATATAC	181662

BX571844.6	201	ATCTATGGTGTCCTCAGAAATAGACTGAAATACCCCCAAACTGATCATTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181663	ATCTATGGTGTCCTCAGAAATAGACTGAAATACCCCCAAACTGATCATTT	181712

BX571844.6	251	ATTAGAACTTGTCAAATTTACCCCTACTTAGGTGTGAGCAAACACTCTCT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181713	ATTAGAACTTGTCAAATTTACCCCTACTTAGGTGTGAGCAAACACTCTCT	181762

BX571844.6	301	GCTTTTGTGTGTCCCTTTAAATGCAAATGAGCTGCTGTTTCTAGAAGAGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181763	GCTTTTGTGTGTCCCTTTAAATGCAAATGAGCTGCTGTTTCTAGAAGAGG	181812

BX571844.6	351	TGGAGCCCATTGGACTGACTGATTAAACCCTGTGAGAGAAAATTAGGCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181813	TGGAGCCCATTGGACTGACTGATTAAACCCTGTGAGAGAAAATTAGGCAC	181862

BX571844.6	401	GGGATATCATTAATATGCTTGCCCCAGTCAGCCTTTAATTGGCCACAATG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181863	GGGATATCATTAATATGCTTGCCCCAGTCAGCCTTTAATTGGCCACAATG	181912

BX571844.6	451	CTTTTTATCGAGATTACAATAATGTTCTGTTATTTTTATGTATATCTAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181913	CTTTTTATCGAGATTACAATAATGTTCTGTTATTTTTATGTATATCTAAG	181962

BX571844.6	501	CTTGTATTAAACATAGTATGTAGGACTCTTATTTTGAAAACGGGAGATCC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	181963	CTTGTATTAAACATAGTATGTAGGACTCTTATTTTGAAAACGGGAGATCC	182012

BX571844.6	551	AGGGAGACTAAAAAAGGAGAAGTTTTGTGAGACAGGTGCCCATGCATGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182013	AGGGAGACTAAAAAAGGAGAAGTTTTGTGAGACAGGTGCCCATGCATGAC	182062

BX571844.6	601	TAATGTGAGATATTTGGATTATTATAGATGTCTTTAGCATCACCCCGAAG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182063	TAATGTGAGATATTTGGATTATTATAGATGTCTTTAGCATCACCCCGAAG	182112

BX571844.6	651	AGGCAGAGCTGAACTGTATCTTTTGTTAGTTTAACATGTATATTGTAAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182113	AGGCAGAGCTGAACTGTATCTTTTGTTAGTTTAACATGTATATTGTAAAA	182162

BX571844.6	701	TCTACCACATGTTTGTAATGAGGCAACAAACACATCAAAACTGCTGTATA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182163	TCTACCACATGTTTGTAATGAGGCAACAAACACATCAAAACTGCTGTATA	182212

BX571844.6	751	TAAGTGTTTATAAAACAATTCTGTATGGTTCTTGAATCTGATTGGCTGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182213	TAAGTGTTTATAAAACAATTCTGTATGGTTCTTGAATCTGATTGGCTGAT	182262

BX571844.6	801	AGCTGTGTGATATTTTGCAATAACAGCACTCTTACAACCATTCACCCTTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182263	AGCTGTGTGATATTTTGCAATAACAGCACTCTTACAACCATTCACCCTTG	182312

BX571844.6	851	TGTGTTACTCTGTCCACATGACAAGCAGAGAAATAAATTCACTTAAGTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182313	TGTGTTACTCTGTCCACATGACAAGCAGAGAAATAAATTCACTTAAGTTT	182362

BX571844.6	901	GACCAATATCGCAGCTGTTGGACAACATAATGAACTTTTTAGGCTTTTAG	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182363	GACCAATATCGCAGCTGTTGGACAACATAATGAACTTTTTAGGCTTTTAG	182412

BX571844.6	951	GCGAGAATGTAGTTGTTTAAATTGCAACTATGCAATTTATTTATACGGAT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182413	GCGAGAATGTAGTTGTTTAAATTGCAACTATGCAATTTATTTATACGGAT	182462

BX571844.6	1001	AGTGTCAATTTTTTAAACATTTATAATTTGTGAAACTCAGCACATCGGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182463	AGTGTCAATTTTTTAAACATTTATAATTTGTGAAACTCAGCACATCGGCA	182512

BX571844.6	1051	GCCATCAGCATGCAGAGCAAAGAAATTGACGGTTGACCGCGACAAAATGG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182513	GCCATCAGCATGCAGAGCAAAGAAATTGACGGTTGACCGCGACAAAATGG	182562

BX571844.6	1101	CATTCATTTATCCATTCATTTATCCATCCATTCATCCATCTATTCGTCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182563	CATTCATTTATCCATTCATTTATCCATCCATTCATCCATCTATTCGTCCA	182612

BX571844.6	1151	TCCATCCATTTATCCATCCATTCATTTTCATTCATCCATCCATTCATTTA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182613	TCCATCCATTTATCCATCCATTCATTTTCATTCATCCATCCATTCATTTA	182662

BX571844.6	1201	TCCATCCATTCATTTATCCATCCATTCATCCATCCATCCATCCATCCATC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182663	TCCATCCATTCATTTATCCATCCATTCATCCATCCATCCATCCATCCATC	182712

BX571844.6	1251	CATCCATCCATCCTTCAATTCATCCATTCATCTGTCCATCCATCGATCCA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182713	CATCCATCCATCCTTCAATTCATCCATTCATCTGTCCATCCATCGATCCA	182762

BX571844.6	1301	TTCATTTATCCATCCATTCATCCATCCATTCATCCATCCATTCATCCATC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182763	TTCATTTATCCATCCATTCATCCATCCATTCATCCATCCATTCATCCATC	182812

BX571844.6	1351	CATTCATTTATCCATCCATCCATTTATCTATCCATCCATTCATCCATCTA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182813	CATTCATTTATCCATCCATCCATTTATCTATCCATCCATTCATCCATCTA	182862

BX571844.6	1401	TTCCTCCATCCATTCATTCATCCATCCATCCATCTGTCCATCGATCCATC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182863	TTCCTCCATCCATTCATTCATCCATCCATCCATCTGTCCATCGATCCATC	182912

BX571844.6	1451	CATCCATCCATCCATTCATCCATCCATTCATTTATCCATCTATTTATCCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182913	CATCCATCCATCCATTCATCCATCCATTCATTTATCCATCTATTTATCCA	182962

BX571844.6	1501	TCCATCCATTCATCTATTCATCCATCCATCCATTCATCAATCCATTCATC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	182963	TCCATCCATTCATCTATTCATCCATCCATCCATTCATCAATCCATTCATC	183012

BX571844.6	1551	TATTCATCCATCCATCCATCCATCCAGTCTCCATCCACAGAGACTGCATA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183013	TATTCATCCATCCATCCATCCATCCAGTCTCCATCCACAGAGACTGCATA	183062

BX571844.6	1601	ATAAGTCTTTAGGGGAGAAAATATCAACATTTTCTCAGCTTAAATTTCAA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183063	ATAAGTCTTTAGGGGAGAAAATATCAACATTTTCTCAGCTTAAATTTCAA	183112

BX571844.6	1651	ACTACAGCTGATCAAATCATTATAAAACAGTTAAGTGACATTCTCAGTTG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183113	ACTACAGCTGATCAAATCATTATAAAACAGTTAAGTGACATTCTCAGTTG	183162

BX571844.6	1701	ATCTCTCTTTTTTGTAGTGCTGTATTTATCCCATATTAGTTTGGTAGAGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183163	ATCTCTCTTTTTTGTAGTGCTGTATTTATCCCATATTAGTTTGGTAGAGT	183212

BX571844.6	1751	TTGCTTTGCTTTGGCTTTTTCGGTGTTAATTATTGTGATATACCGATTGC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183213	TTGCTTTGCTTTGGCTTTTTCGGTGTTAATTATTGTGATATACCGATTGC	183262

BX571844.6	1801	AACAGAGAAATACTGTACTGTGAAATTTCTGTGAAATTTCATGCCATTCA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183263	AACAGAGAAATACTGTACTGTGAAATTTCTGTGAAATTTCATGCCATTCA	183312

BX571844.6	1851	GCCATATAATCTTAAAGCAAAATCACCTGTTTTGTTCAATAGTATCTGGA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183313	GCCATATAATCTTAAAGCAAAATCACCTGTTTTGTTCAATAGTATCTGGA	183362

BX571844.6	1901	TACAGCCTTGCTGCAAGCTAAGACTGCATATCTCAGTGATGCAATGTCAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183363	TACAGCCTTGCTGCAAGCTAAGACTGCATATCTCAGTGATGCAATGTCAC	183412

BX571844.6	1951	TGATAGGGGTAGGGTTAGTGGTGAGATTAGTTGAGTGCATTAAAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571976.11	183413	TGATAGGGGTAGGGTTAGTGGTGAGATTAGTTGAGTGCATTAAAAAGCTT	183462

Overview

Query
BX571844.6 - 148679 bps
Hit
BX571976.11 - 183462 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100193420001200011814631834621
279.711233609428094639-112525128691
381.951082846562865911-130203304901
486.59981809008890267134027342051
583.32791721992220093-134619347861
682.854821093108060109152140525416321
785.57971843424934432143892440851
884.01187403108704109106-147675480681
981.52112278107973108250-148553488281
1083.6512926953585626148569488311
1177.45153559108364108922158061586321
128475157108999109155158632587811
1379.54100302147971148272-162066623681
1493.9475981245912556193955940531
1589.81181941266912862194113943181
1682.35100253762647651611062391064931
1782.5615844612085412129911078741083261
1885.26130282167521703311079701082541
1979.097832112089112121111200751204041
2080.897344167521709511201361204891
2181.0887235993189955211454921457341
2289.7681127405564068211595381596641
2386.341092019444294642-11777461779501
Short-link