<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX470126.27	1	GAATTCATCACAGAAATTAACATCAATATTTTGGTATTGATATTATTATT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	103740	GAATTCATCACAGAAATTAACATCAATATTTTGGTATTGATATTATTATT	103789

BX470126.27	51	TATATTTTAGCTTCTTGTGGGCCACCAAATAATGCAGTTGTCATTCGAAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	103790	TATATTTTAGCTTCTTGTGGGCCACCAAATAATGCAGTTGTCATTCGAAC	103839

BX470126.27	101	ATTAAAATTAACAGTATCAAAATTAAGATTGAGATTTTTATCACTGCTCA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	103840	ATTAAAATTAACAGTATCAAAATTAAGATTGAGATTTTTATCACTGCTCA	103889

BX470126.27	151	CTTAAGGTGCATGTGAATATCAGATAATTAACTACTTTTAAATGGGGCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	103890	CTTAAGGTGCATGTGAATATCAGATAATTAACTACTTTTAAATGGGGCAC	103939

BX470126.27	201	CAATCCCAGTTTTCACTGTGACATTAATTAACAATCAAAGTTTGTTGAAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	103940	CAATCCCAGTTTTCACTGTGACATTAATTAACAATCAAAGTTTGTTGAAT	103989

BX470126.27	251	TAAATTATACACATTTTGAAAGAGTTTATTATCAGGCAAAATCTGATCAT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	103990	TAAATTATACACATTTTGAAAGAGTTTATTATCAGGCAAAATCTGATCAT	104039

BX470126.27	301	CTGACCTGTAGAGCCTATTACTTTATCATCAAATAATTTGTATTTGAAAG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104040	CTGACCTGTAGAGCCTATTACTTTATCATCAAATAATTTGTATTTGAAAG	104089

BX470126.27	351	AATAAACAAGGGTAGATAAAGTCATTGATGAGGTTTGGGAAGTAATATGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104090	AATAAACAAGGGTAGATAAAGTCATTGATGAGGTTTGGGAAGTAATATGA	104139

BX470126.27	401	TTGCGTTCCTGCTGATGTGTGGTTAGAAGAAGTTGGATCTTCCTGCAGGT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104140	TTGCGTTCCTGCTGATGTGTGGTTAGAAGAAGTTGGATCTTCCTGCAGGT	104189

BX470126.27	451	CTTGATGCATGGAACAGGAAGGCTTGGTTCTCTTGAGCTTTGAGAAGAAG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104190	CTTGATGCATGGAACAGGAAGGCTTGGTTCTCTTGAGCTTTGAGAAGAAG	104239

BX470126.27	501	AAATCTGGCATCTTCCATGGTGTGACCGGTCTTTGCATAGTCATAGTCTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104240	AAATCTGGCATCTTCCATGGTGTGACCGGTCTTTGCATAGTCATAGTCTA	104289

BX470126.27	551	TAGTTAAATGTTTTTTATATTTAAAAGTCTTATTATTCCTATGCATAACT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104290	TAGTTAAATGTTTTTTATATTTAAAAGTCTTATTATTCCTATGCATAACT	104339

BX470126.27	601	CACTTTCCAAACCACTTCTAGTTTACCCAAGACAGTGTGCAGAAATTATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104340	CACTTTCCAAACCACTTCTAGTTTACCCAAGACAGTGTGCAGAAATTATA	104389

BX470126.27	651	AAGACTAAACATCATCACCATGATCCTGGACCCAGCCCGTTTCCCAAGCA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104390	AAGACTAAACATCATCACCATGATCCTGGACCCAGCCCGTTTCCCAAGCA	104439

BX470126.27	701	AATGCTGTGGTGGTCGTGGAAGAGTGGAGAGCATGAGACGGAATCCTGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104440	AATGCTGTGGTGGTCGTGGAAGAGTGGAGAGCATGAGACGGAATCCTGAA	104489

BX470126.27	751	AGATGCCAGTGACAGTCTTTGAAGGGTCTTTGCAGGAATGGTCTCACACT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104490	AGATGCCAGTGACAGTCTTTGAAGGGTCTTTGCAGGAATGGTCTCACACT	104539

BX470126.27	801	ACCCAATTACTCAATTCAGTTCAATTCACCTTTATTTGTATAGCGCTTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104540	ACCCAATTACTCAATTCAGTTCAATTCACCTTTATTTGTATAGCGCTTTT	104589

BX470126.27	851	ACAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTCACATAAATGGTCATAGTAAATT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104590	ACAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGCTTCACATAAATGGTCATAGTAAATT	104639

BX470126.27	901	GGAACAGTGTAGTTCAGTTTTTTTAGTGTTTAAAGAGCGCCTGTTATACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104640	GGAACAGTGTAGTTCAGTTTTTTTAGTGTTTAAAGAGCGCCTGTTATACA	104689

BX470126.27	951	TAATATAGGGTCATATTTTGGTTGTAAGGGTCTCCAACAACAGGTCATGC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104690	TAATATAGGGTCATATTTTGGTTGTAAGGGTCTCCAACAACAGGTCATGC	104739

BX470126.27	1001	AAGGTCAAATAACACTTTCATTATCTTGTAATCTGCATTTATTTTTACCT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104740	AAGGTCAAATAACACTTTCATTATCTTGTAATCTGCATTTATTTTTACCT	104789

BX470126.27	1051	AAATATCGCAGCGACTCCCATATGAATTGTCAAGTGATTCATTTGTTCCC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104790	AAATATCGCAGCGACTCCCATATGAATTGTCAAGTGATTCATTTGTTCCC	104839

BX470126.27	1101	AAACCCCTCCTTAGTGCGAAGCTAATCTGCACTGATTGGACCGATCACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104840	AAACCCCTCCTTAGTGCGAAGCTAATCTGCACTGATTGGACCGATCACAG	104889

BX470126.27	1151	TCTGTTGCGACTGGGCAACACTGACTGTCTTTAGTGCGAGACAGAGTGAA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104890	TCTGTTGCGACTGGGCAACACTGACTGTCTTTAGTGCGAGACAGAGTGAA	104939

BX470126.27	1201	ATGCCCAATATAATCAACAATATAAAATTAGTCACGGGCATACACGCTTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104940	ATGCCCAATATAATCAACAATATAAAATTAGTCACGGGCATACACGCTTC	104989

BX470126.27	1251	ATAGTGTAAGGCGTGGATTTTGGCTGCCAGTGGGTGAAAGTAAATACAGA	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	104990	ATAGTGTAAGGCGTGGATTTTGGCTGCCAGTGGGTGAAAGTAAATACAGA	105039

BX470126.27	1301	CGATAGACTTGAAAATACAGATGACTAACTATTTTATTGAGCAAAAACTC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105040	CGATAGACTTGAAAATACAGATGACTAACTATTTTATTGAGCAAAAACTC	105089

BX470126.27	1351	CAAGAACTGGCAAGGAGATCTCCTAGCCCGCCACACCCTACCTGCTCTTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105090	CAAGAACTGGCAAGGAGATCTCCTAGCCCGCCACACCCTACCTGCTCTTT	105139

BX470126.27	1401	TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105140	TCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC	105189

BX470126.27	1451	ACACACACACACACACACACACACACACACACATATTACCCTCCTCCTCG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105190	ACACACACACACACACACACACACACACACACATATTACCCTCCTCCTCG	105239

BX470126.27	1501	GACGACACCGCACACACACACACACACACATTACCCTCCTCCTCGGAGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105240	GACGACACCGCACACACACACACACACACATTACCCTCCTCCTCGGAGGA	105289

BX470126.27	1551	CACAGCACTCACACACACACACATATTACCTTTCTCCTCGGAGGACACCG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105290	CACAGCACTCACACACACACACATATTACCTTTCTCCTCGGAGGACACCG	105339

BX470126.27	1601	CACACACACACACATACACATACACACAATACCCTCCTTCACTGAGGTCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105340	CACACACACACACATACACATACACACAATACCCTCCTTCACTGAGGTCC	105389

BX470126.27	1651	GTAAACAAAGCGGCACGCATCGCGTTTTTAACGTGGCTTTACATGCAATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105390	GTAAACAAAGCGGCACGCATCGCGTTTTTAACGTGGCTTTACATGCAATA	105439

BX470126.27	1701	TGAGAATATAGCGAGTTAACCTAATACAGTACACGCGGTTACAAGTAACA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105440	TGAGAATATAGCGAGTTAACCTAATACAGTACACGCGGTTACAAGTAACA	105489

BX470126.27	1751	AATCACAACTAAATACATTTGCAAGCTACAGTAAACGAGGCAACAACTTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105490	AATCACAACTAAATACATTTGCAAGCTACAGTAAACGAGGCAACAACTTT	105539

BX470126.27	1801	AATCGCACATAACGTTACTTACACTTGAGAAATGGAGGAAGATACCGATC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105540	AATCGCACATAACGTTACTTACACTTGAGAAATGGAGGAAGATACCGATC	105589

BX470126.27	1851	CAGGTTCTGACATAGTCCATTGAGTATACACTCAATGCATCACTTAACGG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105590	CAGGTTCTGACATAGTCCATTGAGTATACACTCAATGCATCACTTAACGG	105639

BX470126.27	1901	TTTTCCACACAGGTTCCTACATCTTTAGCTTTACTAAACAGATAGGTCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105640	TTTTCCACACAGGTTCCTACATCTTTAGCTTTACTAAACAGATAGGTCTT	105689

BX470126.27	1951	TAATCTAGTTTTGAATTAGTAGAGTGTGTCTGAGCCTCAAACATTATCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571815.16	105690	TAATCTAGTTTTGAATTAGTAGAGTGTGTCTGAGCCTCAAACATTATCAG	105739

Overview

Query
BX470126.27 - 153182 bps
Hit
BX571815.16 - 105739 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link