<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX470212.6	92122	AAGCTTCTCATTCACTTGGTGGTGAAATGGGTGACATCAAGCATTGCCAA	92171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1	AAGCTTCTCATTCACTTGGTGGTGAAATGGGTGACATCAAGCATTGCCAA	50

BX470212.6	92172	ACTGAATTGTAGGTCCGTCATCACTGCTTCAGTGGCATTGCTTGCTGTAG	92221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	51	ACTGAATTGTAGGTCCGTCATCACTGCTTCAGTGGCATTGCTTGCTGTAG	100

BX470212.6	92222	AAGATGGGAATTTCTCAATGTTTCAAGCGCCAATGGAAGCGTCTATCAAT	92271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	101	AAGATGGGAATTTCTCAATGTTTCAAGCGCCAATGGAAGCGTCTATCAAT	150

BX470212.6	92272	CAGATCGCTTCATGCAAATACCCCTGCTCAGACAGTAGCCGATTGCGGAC	92321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	151	CAGATCGCTTCATGCAAATACCCCTGCTCAGACAGTAGCCGATTGCGGAC	200

BX470212.6	92322	TTTTTTAATTGGCTGATGCTGCTATGACGATCGTGTCAGCCCTAACTTTA	92371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	201	TTTTTTAATTGGCTGATGCTGCTATGACGATCGTGTCAGCCCTAACTTTA	250

BX470212.6	92372	GACACGCCCTCCGTCAAGCATTGATGATAAATCCCTGTGTGAATCGGGCA	92421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	251	GACACGCCCTCCGTCAAGCATTGATGATAAATCCCTGTGTGAATCGGGCA	300

BX470212.6	92422	TAAGTGTCACCTAAAGAACCTCAAGGTGGGAATACCCACTAGTTGCTTCA	92471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	301	TAAGTGTCACCTAAAGAACCTCAAGGTGGGAATACCCACTAGTTGCTTCA	350

BX470212.6	92472	GTGGCCACCTAGGATGAGAGGCAGCTACAAAGTCACTGCTAGTGTGAATG	92521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	351	GTGGCCACCTAGGATGAGAGGCAGCTACAAAGTCACTGCTAGTGTGAATG	400

BX470212.6	92522	AGGCTGAAAGTCATCAAAGTGAAACAAGAACACTGAAGTAAATGTTGATG	92571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	401	AGGCTGAAAGTCATCAAAGTGAAACAAGAACACTGAAGTAAATGTTGATG	450

BX470212.6	92572	AGAGATTAGTGTTACAGTGAAGCTTTTGTTATGCCAGAGTCCATCACTTC	92621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	451	AGAGATTAGTGTTACAGTGAAGCTTTTGTTATGCCAGAGTCCATCACTTC	500

BX470212.6	92622	CAGTTCTTCCACTCATGATCATATTGGTGCTGTTTTATCACTAAATGCAT	92671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	501	CAGTTCTTCCACTCATGATCATATTGGTGCTGTTTTATCACTAAATGCAT	550

BX470212.6	92672	TTAAGGGTTCTGTTGTAATTCTGCTCTTTGTAGTCTAGTAGAGAGCTCAA	92721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	551	TTAAGGGTTCTGTTGTAATTCTGCTCTTTGTAGTCTAGTAGAGAGCTCAA	600

BX470212.6	92722	CATGTTAAGGTGTGTTTGGTGTTTCCTTGTTTTCTATCAAAGCAAACTGG	92771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	601	CATGTTAAGGTGTGTTTGGTGTTTCCTTGTTTTCTATCAAAGCAAACTGG	650

BX470212.6	92772	ACATCAAGGGTGTGTGATGCCATTAGCATGGTCAAATAGGAGATGGTGTG	92821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	651	ACATCAAGGGTGTGTGATGCCATTAGCATGGTCAAATAGGAGATGGTGTG	700

BX470212.6	92822	TTAAAATTGATTATTTCTCTGGACTTGAACATTTTATAAAGCAGTTTTCA	92871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	701	TTAAAATTGATTATTTCTCTGGACTTGAACATTTTATAAAGCAGTTTTCA	750

BX470212.6	92872	TGGTACAAGTATTACAATCTAGAAGAGTCTTGTTTATTGAGTAGTCATAC	92921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	751	TGGTACAAGTATTACAATCTAGAAGAGTCTTGTTTATTGAGTAGTCATAC	800

BX470212.6	92922	TACAAGCGCTTATATTTTATGCACCTGTACCTTTAAAAGATGTTAGTAAT	92971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	801	TACAAGCGCTTATATTTTATGCACCTGTACCTTTAAAAGATGTTAGTAAT	850

BX470212.6	92972	TGTTCATACCTGTTATTATTTATAAGATACTATACTTATTATTTAGGTCC	93021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	851	TGTTCATACCTGTTATTATTTATAAGATACTATACTTATTATTTAGGTCC	900

BX470212.6	93022	TAGTATTTATTCATTATGATGGTGCGGTGACGCAGTGGGTAATGCTGTTG	93071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	901	TAGTATTTATTCATTATGATGGTGCGGTGACGCAGTGGGTAATGCTGTTG	950

BX470212.6	93072	CCTCACAGCAAGAAGTTTGCTAGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTT	93121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	951	CCTCACAGCAAGAAGTTTGCTAGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTT	1000

BX470212.6	93122	GCTTGTCCTCCCTGTGTTGATGCGGGTTTCCTCCGGGTGGTCCAGTTTCT	93171
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1001	GCTTGTCCTCCCTGTGTTGATGCGGGTTTCCTCCGGGTGGTCCAGTTTCT	1050

BX470212.6	93172	CCCACAGTCCAAAGACATGCGCTCTAGGTGAATTGGGTAAGCTAAATTTT	93221
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1051	CCCACAGTCCAAAGACATGCGCTCTAGGTGAATTGGGTAAGCTAAATTTT	1100

BX470212.6	93222	CCATATTGTATGTGTGTGAATGAGTGTGTACGTGTGTTATCCAGTAATGG	93271
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1101	CCATATTGTATGTGTGTGAATGAGTGTGTACGTGTGTTATCCAGTAATGG	1150

BX470212.6	93272	GTTGGAGCCAGAAGGGCATATGCTGTGTAAAACGTATGCTGGATAAGTTG	93321
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1151	GTTGGAGCCAGAAGGGCATATGCTGTGTAAAACGTATGCTGGATAAGTTG	1200

BX470212.6	93322	GCGGGTCATTCTGCTGTGGCAACCCCTGATTAATAAAGGGACTAAGCCAA	93371
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1201	GCGGGTCATTCTGCTGTGGCAACCCCTGATTAATAAAGGGACTAAGCCAA	1250

BX470212.6	93372	AAAGAAAATGTTTGACTGAATGAATTGATTCATTAGATGCCAGTACTTAT	93421
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1251	AAAGAAAATGTTTGACTGAATGAATTGATTCATTAGATGCCAGTACTTAT	1300

BX470212.6	93422	GATTAGATACTTGCACTGATTCATAAAACATTATAGTTCCAGCCTGATCT	93471
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1301	GATTAGATACTTGCACTGATTCATAAAACATTATAGTTCCAGCCTGATCT	1350

BX470212.6	93472	CACGAGAAAATGTAAGTATTTTGATTTCTCAGTTTAGTGGCAAATTCGTT	93521
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1351	CACGAGAAAATGTAAGTATTTTGATTTCTCAGTTTAGTGGCAAATTCGTT	1400

BX470212.6	93522	ACAGTTCAGTCATACAAAAATGTACGATTTTAAAAAGGAGGCGTGGCACC	93571
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1401	ACAGTTCAGTCATACAAAAATGTACGATTTTAAAAAGGAGGCGTGGCACC	1450

BX470212.6	93572	CAACCCCACCCCTAAACCCAACCGTCATTGAGGGAAGAGCAAATCGTACT	93621
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1451	CAACCCCACCCCTAAACCCAACCGTCATTGAGGGAAGAGCAAATCGTACT	1500

BX470212.6	93622	CAATTGTATGAATTAGATTGTACAAATTGTATACGATTTAGCCACTAAAT	93671
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1501	CAATTGTATGAATTAGATTGTACAAATTGTATACGATTTAGCCACTAAAT	1550

BX470212.6	93672	CAAAAAGTTACGAATTACCGTGAGATTGCGTTGTATAGTTTCTAATTCAA	93721
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1551	CAAAAAGTTACGAATTACCGTGAGATTGCGTTGTATAGTTTCTAATTCAA	1600

BX470212.6	93722	TAATGACTGCAGTTGAATAAATGGCCACTGGTGTGGATACTAATAAGTGT	93771
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1601	TAATGACTGCAGTTGAATAAATGGCCACTGGTGTGGATACTAATAAGTGT	1650

BX470212.6	93772	TTCTTCTGCATATACCCAACTTGAAAAAAACAACAACAGGAAAAACGTTG	93821
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1651	TTCTTCTGCATATACCCAACTTGAAAAAAACAACAACAGGAAAAACGTTG	1700

BX470212.6	93822	TGGTCACACTACAATTCTCGCCATTATTAAACCATTAATTAAGATTTTAG	93871
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1701	TGGTCACACTACAATTCTCGCCATTATTAAACCATTAATTAAGATTTTAG	1750

BX470212.6	93872	CTCTTTTTTGCTTATTATTAGTTCACAATGTAGTATTTGGGTTTATGTAT	93921
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1751	CTCTTTTTTGCTTATTATTAGTTCACAATGTAGTATTTGGGTTTATGTAT	1800

BX470212.6	93922	TGGGTAGTATAAGGGATGTACAATGAAATAATACTTTATATTTACTAATT	93971
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1801	TGGGTAGTATAAGGGATGTACAATGAAATAATACTTTATATTTACTAATT	1850

BX470212.6	93972	AACATCCAATATCTTAACAATAAGCACGTAATAATAAGTGGGAATTTCCC	94021
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1851	AACATCCAATATCTTAACAATAAGCACGTAATAATAAGTGGGAATTTCCC	1900

BX470212.6	94022	ACTAAAACGATACCAACATTTTTAATAGTACTGCAATCTGCATAAGTCAA	94071
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1901	ACTAAAACGATACCAACATTTTTAATAGTACTGCAATCTGCATAAGTCAA	1950

BX470212.6	94072	GATGTAAAGACAGTAGATCACTACTTCTTGGTAGAATATCCATTTATTCA	94121
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571718.9	1951	GATGTAAAGACAGTAGATCACTACTTCTTGGTAGAATATCCATTTATTCA	2000

Overview

Query
BX470212.6 - 94121 bps
Hit
BX571718.9 - 168697 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001956200092122941211120001
287.0512722032005322241940596281
387.442033762479825173113524139051
485.381162175171551931-116110163211
581.71635358322483758-120830213591
681.511324506267463123120876213291
785.441152096177861986127149273611
886.991452543200532258-153353535981
987.451763063606336368153425537191
1082.251192787163071907185292855671
1184.211162373202332259192101923281
1290.751802852228622570-11128071130871
1382.37189531832328376211315511320721
1483.241363456261762961-11317471320801
1589.321842913606336353-11521121523921
1684.48160326484584878311547031550241
1779.31347115517122866-11547031558521
1889.281612493200932257-11664941667451
1983.371593596906726411664951668671
2083.11135298516825197911664981667931
2190.2209306360633636811665651668701
Short-link