<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX510330.20	1	CTATAGATCAGAAACGTGGACAATGACAAAAGCCATAGAACAAAAGCTCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191198	CTATAGATCAGAAACGTGGACAATGACAAAAGCCATAGAACAAAAGCTCT	191247

BX510330.20	51	TAGTTTTTTAAAGAAAAATTCTGAGGAGAATATATGGCCCAATAAAAGAC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191248	TAGTTTTTTAAAGAAAAATTCTGAGGAGAATATATGGCCCAATAAAAGAC	191297

BX510330.20	101	AATAATCAATGGAGGAAACGTCACAACAATGAGCTTGCAGCTTTGTATAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191298	AATAATCAATGGAGGAAACGTCACAACAATGAGCTTGCAGCTTTGTATAA	191347

BX510330.20	151	GGAAATTGATATAGTTAAATATATCAGACTTGTAAGGCTAAGGTGGGCAG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191348	GGAAATTGATATAGTTAAATATATCAGACTTGTAAGGCTAAGGTGGGCAG	191397

BX510330.20	201	GACACGTCATACGTATGGATGAAAATGCCATTCCAAAAAAAAAAAATCTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191398	GACACGTCATACGTATGGATGAAAATGCCATTCCAAAAAAAAAAAATCTT	191447

BX510330.20	251	CAGCACTGACCCGGTAGGCAAAAGAAAAGAAGGCCTAAACCAAGATGGCA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191448	CAGCACTGACCCGGTAGGCAAAAGAAAAGAAGGCCTAAACCAAGATGGCA	191497

BX510330.20	301	AGACTGCATTAGCAGTGAGGCCAATGTTTTAGGAATAAGGATCTGGTGGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191498	AGACTGCATTAGCAGTGAGGCCAATGTTTTAGGAATAAGGATCTGGTGGG	191547

BX510330.20	351	CAGTTGCCTGGGACAAAGAACATTGGCGGAAATTACTTGAGGCAGCCAGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191548	CAGTTGCCTGGGACAAAGAACATTGGCGGAAATTACTTGAGGCAGCCAGG	191597

BX510330.20	401	ATCCAGAAATGGGCTGTCGCGCTAAGGATGATGATGATGATGATGATGAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191598	ATCCAGAAATGGGCTGTCGCGCTAAGGATGATGATGATGATGATGATGAT	191647

BX510330.20	451	GATGATGATGATGATGATGATAAAGATAAAATATTAAAGTAACATAACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191648	GATGATGATGATGATGATGATAAAGATAAAATATTAAAGTAACATAACTA	191697

BX510330.20	501	AACTATTAAACTGAAAATAAAAATCCTTTTCTAGATCTTCTGTAAATGGA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191698	AACTATTAAACTGAAAATAAAAATCCTTTTCTAGATCTTCTGTAAATGGA	191747

BX510330.20	551	AAAAGTTAGGACACCCTACCCCTTAATAGCTAGTGTTACCCTCTTTGGCT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191748	AAAAGTTAGGACACCCTACCCCTTAATAGCTAGTGTTACCCTCTTTGGCT	191797

BX510330.20	601	GAAATAACTGCATATTATCAGACAAACTGTGAACATTTTCTTGCTCTGAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191798	GAAATAACTGCATATTATCAGACAAACTGTGAACATTTTCTTGCTCTGAA	191847

BX510330.20	651	AAAATTCAAAGGTGGGCTAATTATTCTGACTTCAACTGTATATCCAGAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191848	AAAATTCAAAGGTGGGCTAATTATTCTGACTTCAACTGTATATCCAGAAA	191897

BX510330.20	701	AATGTTATTTATTATGCATGTCATGCCTGTATTTGGCCTTTATTTTCTAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191898	AATGTTATTTATTATGCATGTCATGCCTGTATTTGGCCTTTATTTTCTAA	191947

BX510330.20	751	AGTGACATTATGCTCCAGCACACATTGTTGATTTGTTTGTCACACACACA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191948	AGTGACATTATGCTCCAGCACACATTGTTGATTTGTTTGTCACACACACA	191997

BX510330.20	801	CACACACACATCTCTGTATGGACTAAATAACTATACAATAATGATTGTTT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	191998	CACACACACATCTCTGTATGGACTAAATAACTATACAATAATGATTGTTT	192047

BX510330.20	851	CTTAAGTTCATACACACTTTCAACCCTTAAAACAACATAACTCAAACTGC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192048	CTTAAGTTCATACACACTTTCAACCCTTAAAACAACATAACTCAAACTGC	192097

BX510330.20	901	AGTCCTACAGAAATACATTTCACCCTACAGAAAACAGTACACAGGGCCCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192098	AGTCCTACAGAAATACATTTCACCCTACAGAAAACAGTACACAGGGCCCC	192147

BX510330.20	951	ATTTTTACAGACTTTTTGTAAGAGCATAAAACTTTTCACTTTAGTTTCTG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192148	ATTTTTACAGACTTTTTGTAAGAGCATAAAACTTTTCACTTTAGTTTCTG	192197

BX510330.20	1001	TATAAGGTTTGTTCATGCTTATTAAGGTAAAACTAAGAGAGAGAGAAAAA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192198	TATAAGGTTTGTTCATGCTTATTAAGGTAAAACTAAGAGAGAGAGAAAAA	192247

BX510330.20	1051	ACTTTTCGCTCCAGGGCTTCTGTGTACACCATAATTCTACATTTCTGTTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192248	ACTTTTCGCTCCAGGGCTTCTGTGTACACCATAATTCTACATTTCTGTTT	192297

BX510330.20	1101	CCTTCTCTCTTTTTGTTCCCTCTCGACTGACGGCTCTAAATTCAAACACT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192298	CCTTCTCTCTTTTTGTTCCCTCTCGACTGACGGCTCTAAATTCAAACACT	192347

BX510330.20	1151	CTTTCCTCGTATAGCCACAATGACCCCTCAGTGTTTTTCTGCCCAGCTAT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192348	CTTTCCTCGTATAGCCACAATGACCCCTCAGTGTTTTTCTGCCCAGCTAT	192397

BX510330.20	1201	GTCCATCACTTCAGAAATAAAGTTCCAATCACTCAGCTCTAGAGTCCTGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192398	GTCCATCACTTCAGAAATAAAGTTCCAATCACTCAGCTCTAGAGTCCTGC	192447

BX510330.20	1251	TGACAGGCCCATTTTCCTCAGGCATAGGCAGGGCTGCCACTGTTAGGCCT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192448	TGACAGGCCCATTTTCCTCAGGCATAGGCAGGGCTGCCACTGTTAGGCCT	192497

BX510330.20	1301	GTGGGGCATAATGGGTCCTCACAGCTTCTTCGGTAACCAAAAATGGCAGC	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192498	GTGGGGCATAATGGGTCCTCACAGCTTCTTCGGTAACCAAAAATGGCAGC	192547

BX510330.20	1351	CGTGCCGGTGCTATCGGTGCCAGTTAACCAGCTGGATGGCACAGCTGCTT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192548	CGTGCCGGTGCTATCGGTGCCAGTTAACCAGCTGGATGGCACAGCTGCTT	192597

BX510330.20	1401	TGACCTGGGTACGGTATTTGTGCTTTCAGGCAGGGGGAAAGGAGTCGCAC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192598	TGACCTGGGTACGGTATTTGTGCTTTCAGGCAGGGGGAAAGGAGTCGCAC	192647

BX510330.20	1451	CCCGTCCCATTTATTTAGAGTTTCTTGGAAAGACAGCTTTTGAGTTTTAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192648	CCCGTCCCATTTATTTAGAGTTTCTTGGAAAGACAGCTTTTGAGTTTTAA	192697

BX510330.20	1501	GAGTCCATTTAGAGCTTAAGCTACAAACTCCGCTTTCCTGTTCCTGCTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192698	GAGTCCATTTAGAGCTTAAGCTACAAACTCCGCTTTCCTGTTCCTGCTGA	192747

BX510330.20	1551	TATAGCACAGTGTACTTCGGGGAAATGTTCAAAGTAGAAATGTACTGCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192748	TATAGCACAGTGTACTTCGGGGAAATGTTCAAAGTAGAAATGTACTGCAC	192797

BX510330.20	1601	GGACAATAGCCGTAGCCGAAGCAGTCAAACTTAACACTGTGTTTTTCAAC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192798	GGACAATAGCCGTAGCCGAAGCAGTCAAACTTAACACTGTGTTTTTCAAC	192847

BX510330.20	1651	TTTTCAACATTTACACACGCACTAAAGGAAAAAAAGCCACACGCACAAAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192848	TTTTCAACATTTACACACGCACTAAAGGAAAAAAAGCCACACGCACAAAC	192897

BX510330.20	1701	TTCACACACCTTTAGATGAAGGTCCCACAAGTGTGAGTCGTAGTTATCGT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192898	TTCACACACCTTTAGATGAAGGTCCCACAAGTGTGAGTCGTAGTTATCGT	192947

BX510330.20	1751	AGCGGCACACTCTCAGGCCTACGCTCTCTGCCAGTCGGCTGAATTCTGCC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192948	AGCGGCACACTCTCAGGCCTACGCTCTCTGCCAGTCGGCTGAATTCTGCC	192997

BX510330.20	1801	AGTGTGTCTCCTCTGGTAGGGGCAAATACTAGAGCCGTGCCCTAAAGAGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	192998	AGTGTGTCTCCTCTGGTAGGGGCAAATACTAGAGCCGTGCCCTAAAGAGA	193047

BX510330.20	1851	CAAAACACACACAAACACAGTGTTGAGAGATTTAACTTTACAATTAACAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	193048	CAAAACACACACAAACACAGTGTTGAGAGATTTAACTTTACAATTAACAA	193097

BX510330.20	1901	AATGTGGTAACATATGATAAGTAAAAGTGACTAAATGTAAAAGGGTCTAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	193098	AATGTGGTAACATATGATAAGTAAAAGTGACTAAATGTAAAAGGGTCTAA	193147

BX510330.20	1951	ACTTTAAAATATATTTCAAGAGTTCACACTTAGCTGATGATTTAAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571708.4	193148	ACTTTAAAATATATTTCAAGAGTTCACACTTAGCTGATGATTTAAAGCTT	193197

Overview

Query
BX510330.20 - 96887 bps
Hit
BX571708.4 - 193197 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100196720001200011911981931971
290.261262348843188664122371
382.74257624686074831178123941
482.0714534318894192361761679551
591.51782458150881752-132888331341
687.861382369435194586132888331341
782.852255352295523489-150026505731
882.61925185868559202152688532041
987.341893324677347104-156343566661
1087.641442689580396070-11138361141021
1185.21207454587475920011138361142881
1281.921544715866859138-11200791205481
1383.64156408956599606611200791204751
1489.52127210587435895211209911212001
1583.511483839579096172-11243711247461
1684.85197450586885913711244111248591
1784.47141366322953266011626251630041
1881.62145456587455920011721651726101
1987.292133628141881779-11769731773261
2087.04125224477584798111771111773261
2185.661242302681627045-11799631801921
Short-link