<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX546445.7	1	CACACCTGAGATTGTACAAAGTTCTAGAAAAGGGAGGTTTGGCCTCAGGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81283	CACACCTGAGATTGTACAAAGTTCTAGAAAAGGGAGGTTTGGCCTCAGGC	81332

BX546445.7	51	ATGAGAGAATCTACAGTGTCTACTGTAACATTCAGCTACAAAGCACAAGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81333	ATGAGAGAATCTACAGTGTCTACTGTAACATTCAGCTACAAAGCACAAGC	81382

BX546445.7	101	CTGTTCTAACTGTATTGATAGCATATACAGGACTTTTCAAAGAGTTTCAG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81383	CTGTTCTAACTGTATTGATAGCATATACAGGACTTTTCAAAGAGTTTCAG	81432

BX546445.7	151	ATACAGAAGAAGTAAGAAATACATAATAAATAAATGGAACAACAATTGAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81433	ATACAGAAGAAGTAAGAAATACATAATAAATAAATGGAACAACAATTGAT	81482

BX546445.7	201	AAATTAATAACACTTCAAAATGGATGCTTGAACTGCTTTGCATGCTCTTT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81483	AAATTAATAACACTTCAAAATGGATGCTTGAACTGCTTTGCATGCTCTTT	81532

BX546445.7	251	TCATAAATATTGGAGATCAACTCTTGCAGTTAGTGAGGGAATAATGACGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81533	TCATAAATATTGGAGATCAACTCTTGCAGTTAGTGAGGGAATAATGACGC	81582

BX546445.7	301	TACAAATGAAAGCTGGGCTGAATCACAAAGACGTTCGAAGTAAGATACTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81583	TACAAATGAAAGCTGGGCTGAATCACAAAGACGTTCGAAGTAAGATACTT	81632

BX546445.7	351	AATACGTAAAGTTAAACAGACTTGATCTGAAAGTGCAGATTTTCTACCCT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81633	AATACGTAAAGTTAAACAGACTTGATCTGAAAGTGCAGATTTTCTACCCT	81682

BX546445.7	401	CTACCCACAAGTTTACACCAAAAAGTCACAATGCAGGTAAGCTTTTCTGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81683	CTACCCACAAGTTTACACCAAAAAGTCACAATGCAGGTAAGCTTTTCTGG	81732

BX546445.7	451	TGCTTCAGACTTTTCTTCTACTTCCAGCTGCATGAAGGGGAAAAATAGGT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81733	TGCTTCAGACTTTTCTTCTACTTCCAGCTGCATGAAGGGGAAAAATAGGT	81782

BX546445.7	501	TTTGCATAGCATTTTAAAATCATTAGCCTATGTACTGACTTTTTGTGAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81783	TTTGCATAGCATTTTAAAATCATTAGCCTATGTACTGACTTTTTGTGAGG	81832

BX546445.7	551	CGCACAAGCAACATTAAGCACTTGCATGTTCACGCTAATGAGCAAAATGA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81833	CGCACAAGCAACATTAAGCACTTGCATGTTCACGCTAATGAGCAAAATGA	81882

BX546445.7	601	AAAGTCATGCAAGCTAGAGATCAACTATAGTAACGCTGCCTTCACTTGCA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81883	AAAGTCATGCAAGCTAGAGATCAACTATAGTAACGCTGCCTTCACTTGCA	81932

BX546445.7	651	ATGGGACATTTCAGGAACACTTTATTTTAAAGTTGCCCATGTTACGTGTT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81933	ATGGGACATTTCAGGAACACTTTATTTTAAAGTTGCCCATGTTACGTGTT	81982

BX546445.7	701	CTATGCACTTACTATGTTAATTACAATTCATAATTACATAATTCATAAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	81983	CTATGCACTTACTATGTTAATTACAATTCATAATTACATAATTCATAAAT	82032

BX546445.7	751	GCATAATTGCATGCAACTAACCATAGAACTAACTCTCATCCTGATTCTAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82033	GCATAATTGCATGCAACTAACCATAGAACTAACTCTCATCCTGATTCTAA	82082

BX546445.7	801	CCACAGTAAGTACATGTAATCAATATTACTCGGTAGTAGTTACACTGAAA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82083	CCACAGTAAGTACATGTAATCAATATTACTCGGTAGTAGTTACACTGAAA	82132

BX546445.7	851	CAAGGACATCTTAAAGTAACACTCCACCTTTTTATTTTCAAATAAGAGTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82133	CAAGGACATCTTAAAGTAACACTCCACCTTTTTATTTTCAAATAAGAGTT	82182

BX546445.7	901	AAACGGTTGAGTTTTACTTTTTTTGAATCCTTTCAGCCGAATCTCCAGGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82183	AAACGGTTGAGTTTTACTTTTTTTGAATCCTTTCAGCCGAATCTCCAGGT	82232

BX546445.7	951	TTGGCAGGAGCACGTTTAGCTTAGCTTAGCTTAGCATAAATCATTGAATC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82233	TTGGCAGGAGCACGTTTAGCTTAGCTTAGCTTAGCATAAATCATTGAATC	82282

BX546445.7	1001	GGATTAGACCATTAGCATCTCGCTTCAAACAAACTCTTTTTTTAAAAATA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82283	GGATTAGACCATTAGCATCTCGCTTCAAACAAACTCTTTTTTTAAAAATA	82332

BX546445.7	1051	ATTTATAAAACGTGACTCTTCTGTAATTACATCGTGTACTAGGACTGATG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82333	ATTTATAAAACGTGACTCTTCTGTAATTACATCGTGTACTAGGACTGATG	82382

BX546445.7	1101	GAAAATGATTAATACATGGCCAACTATACTTTCATTTTAGCATAATAATC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82383	GAAAATGATTAATACATGGCCAACTATACTTTCATTTTAGCATAATAATC	82432

BX546445.7	1151	AAGGAACCTTGATGTCATACTATGGCTGCAGTAGGCGCAATGATATTAAG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82433	AAGGAACCTTGATGTCATACTATGGCTGCAGTAGGCGCAATGATATTAAG	82482

BX546445.7	1201	GCAATTATACCATGCTCCCTGGATTTGAAATAATTAAAAAAAATGAATTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82483	GCAATTATACCATGCTCCCTGGATTTGAAATAATTAAAAAAAATGAATTT	82532

BX546445.7	1251	TTAATAAAAGAATTGTTATTTTCTAATCTGATTTAGATAAACTTTAAACT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82533	TTAATAAAAGAATTGTTATTTTCTAATCTGATTTAGATAAACTTTAAACT	82582

BX546445.7	1301	GATTGAGTGATTTACGGCACAGTAAGGTTTCTTTTTTTTTTAAACCTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82583	GATTGAGTGATTTACGGCACAGTAAGGTTTCTTTTTTTTTTAAACCTGTT	82632

BX546445.7	1351	TTTAATCATTTCTATCTATGATCTGCTGCAAAAAACATATGCTGGAATAG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82633	TTTAATCATTTCTATCTATGATCTGCTGCAAAAAACATATGCTGGAATAG	82682

BX546445.7	1401	TTGGCAGTTCATTTTGTTGTGGTGATCCCTAAAAAATATAGGACTAAGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82683	TTGGCAGTTCATTTTGTTGTGGTGATCCCTAAAAAATATAGGACTAAGGC	82732

BX546445.7	1451	AAAGGAAAACGAATGAATGAATGAATAATTTTTATCCTTCGTTATTTTTA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82733	AAAGGAAAACGAATGAATGAATGAATAATTTTTATCCTTCGTTATTTTTA	82782

BX546445.7	1501	TATCTTATAGATGTTGTATTTTATGTCATTTAATCTTGTTTATTTAAAGC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82783	TATCTTATAGATGTTGTATTTTATGTCATTTAATCTTGTTTATTTAAAGC	82832

BX546445.7	1551	ACTTTGAATTACCATCATGTATGAAATGTCCTTTGACAGGGTCTTAAAAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82833	ACTTTGAATTACCATCATGTATGAAATGTCCTTTGACAGGGTCTTAAAAA	82882

BX546445.7	1601	GTATTAAAAGTTGATAAATCAATTATGAGAAAATGAAGGCCCTTAAAAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82883	GTATTAAAAGTTGATAAATCAATTATGAGAAAATGAAGGCCCTTAAAAGG	82932

BX546445.7	1651	TATAAAAATTCTTAATCGCGTTTTTAAGAGGTCTTAAATTTTGTTCAAGC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82933	TATAAAAATTCTTAATCGCGTTTTTAAGAGGTCTTAAATTTTGTTCAAGC	82982

BX546445.7	1701	GTTGTACAAAGTGTTTGACTCCAAAAAAAGCATAAATATATTGATTTTCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	82983	GTTGTACAAAGTGTTTGACTCCAAAAAAAGCATAAATATATTGATTTTCC	83032

BX546445.7	1751	TCCTAATATTAAAAACAATGTGCTCGATCCATGCGATTGGATCGGGCCGG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	83033	TCCTAATATTAAAAACAATGTGCTCGATCCATGCGATTGGATCGGGCCGG	83082

BX546445.7	1801	GCCACGTGCGGCCAAGCTCCTCTTTTCGGGTGATGTCACGTAATTTTGCG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	83083	GCCACGTGCGGCCAAGCTCCTCTTTTCGGGTGATGTCACGTAATTTTGCG	83132

BX546445.7	1851	ACAAATGTGGGGAGGTGATGTGAAGCCAGTTAAAAAGATGGCAAAATGAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	83133	ACAAATGTGGGGAGGTGATGTGAAGCCAGTTAAAAAGATGGCAAAATGAG	83182

BX546445.7	1901	AAAATGTAAGTTTGTGTACTCCTGGTTGGAGAAAGACGAGTTTAAACAGT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	83183	AAAATGTAAGTTTGTGTACTCCTGGTTGGAGAAAGACGAGTTTAAACAGT	83232

BX546445.7	1951	GGCTGAAGCCTGTTGCTTAAAACAACCGTGTGATTTATTCTTTCAAGCTT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX571697.3	83233	GGCTGAAGCCTGTTGCTTAAAACAACCGTGTGATTTATTCTTTCAAGCTT	83282

Overview

Query
BX546445.7 - 141601 bps
Hit
BX571697.3 - 83282 bps
Total alignments
8
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001924200012000181283832821
292.252783688562785994-113723140961
392.482613578524185597-115712160701
484.811232391259412832-153578538141
581.411022711009910369160154604381
678.9542166114689114854160240604101
789.5832481038210429160440604871
884.171202543943939692178851790901
Short-link