<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CU463850.5	1	CATCCACCACCTAAAGATGATGAGCACCTGAGGCAATGGCTGAAGGCGCT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173162	CATCCACCACCTAAAGATGATGAGCACCTGAGGCAATGGCTGAAGGCGCT	173211

CU463850.5	51	CAATTTAAAACAGCCACCCAAGCGCCCTTACGTGTGTTCTTACCATTTCG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173212	CAATTTAAAACAGCCACCCAAGCGCCCTTACGTGTGTTCTTACCATTTCG	173261

CU463850.5	101	TTGACGGAAAGCCAACTGATAGACACCCTTACCCCGAGAAATGGCTCGGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173262	TTGACGGAAAGCCAACTGATAGACACCCTTACCCCGAGAAATGGCTCGGC	173311

CU463850.5	151	TACGAAGCTCCGGTAAAAAAGCCACGCCGGGTGCTGGAAAGGTTGTACGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173312	TACGAAGCTCCGGTAAAAAAGCCACGCCGGGTGCTGGAAAGGTTGTACGA	173361

CU463850.5	201	TTCAGGTAAGCCAACTTGTGTAGTGATTGCTCGCCTAACGTCATATTTCT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173362	TTCAGGTAAGCCAACTTGTGTAGTGATTGCTCGCCTAACGTCATATTTCT	173411

CU463850.5	251	GAAATGCATTCTATAAACACGTTTAAGCTCAGCAATGATGAGTTAAAAGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173412	GAAATGCATTCTATAAACACGTTTAAGCTCAGCAATGATGAGTTAAAAGT	173461

CU463850.5	301	AATGTTACAAGAAGTCTTGTATGATTACAATTGGCCACATGATGTTATAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173462	AATGTTACAAGAAGTCTTGTATGATTACAATTGGCCACATGATGTTATAT	173511

CU463850.5	351	TTCATATTTATGAATGCATTTCATAGTGAAGGTAATACAGGAATCATAGA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173512	TTCATATTTATGAATGCATTTCATAGTGAAGGTAATACAGGAATCATAGA	173561

CU463850.5	401	CGTTAGCAGGCCAGCTAACTTACCAATCTAGCGCAGACATTTGGGCTGTG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173562	CGTTAGCAGGCCAGCTAACTTACCAATCTAGCGCAGACATTTGGGCTGTG	173611

CU463850.5	451	ACTACACATCTATTAAGCTTTCAGCTCGAATATACCAACATCTAAAAATC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173612	ACTACACATCTATTAAGCTTTCAGCTCGAATATACCAACATCTAAAAATC	173661

CU463850.5	501	ATTAAACATATATGTTTAAAAAAAAACTACTTATTATAAACATTTAAAAG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173662	ATTAAACATATATGTTTAAAAAAAAACTACTTATTATAAACATTTAAAAG	173711

CU463850.5	551	AATAACTTTAAATAAATTTAAGGAATGAAATTAAAATACATTTTGTAGTG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173712	AATAACTTTAAATAAATTTAAGGAATGAAATTAAAATACATTTTGTAGTG	173761

CU463850.5	601	TTCCTTTAATTTTACTTTACATATTCCTAAAGTCCATTTTCTCAAACTAC	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173762	TTCCTTTAATTTTACTTTACATATTCCTAAAGTCCATTTTCTCAAACTAC	173811

CU463850.5	651	ATTTCTTATTCAGATAATAATACCGACCTGTATTACTATTGAATTAACTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173812	ATTTCTTATTCAGATAATAATACCGACCTGTATTACTATTGAATTAACTA	173861

CU463850.5	701	ATACACACAATGTTCTATTGGTGCAATAATGTATTAATTGTCATTATGTA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173862	ATACACACAATGTTCTATTGGTGCAATAATGTATTAATTGTCATTATGTA	173911

CU463850.5	751	TATTATGTACTAATGTAAAAATGATTATGATTACATTTATTTCAACAGAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173912	TATTATGTACTAATGTAAAAATGATTATGATTACATTTATTTCAACAGAT	173961

CU463850.5	801	CCATCAGTGGCTGCCAGTAATGCAGTGGACAGCTGTGAAGATGAACCTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	173962	CCATCAGTGGCTGCCAGTAATGCAGTGGACAGCTGTGAAGATGAACCTGT	174011

CU463850.5	851	GTGCATGCCCCTAAATTGTGATGCAGAAACACAATGGGAGGATCTATCCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174012	GTGCATGCCCCTAAATTGTGATGCAGAAACACAATGGGAGGATCTATCCG	174061

CU463850.5	901	TCTCTGACCACAGCTACACAAAGTCACAGCTCAACCTGAAGCCACCGACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174062	TCTCTGACCACAGCTACACAAAGTCACAGCTCAACCTGAAGCCACCGACA	174111

CU463850.5	951	AGGGATATGCAAACCCAGTGCAATGAGTCACAGCCGCTGTATATAACACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174112	AGGGATATGCAAACCCAGTGCAATGAGTCACAGCCGCTGTATATAACACT	174161

CU463850.5	1001	ACTAAGAAAAAATTACCTTTGTCTGCTCTATACAGGGTTGACATTGGATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174162	ACTAAGAAAAAATTACCTTTGTCTGCTCTATACAGGGTTGACATTGGATG	174211

CU463850.5	1051	CATTTCATTCAGTTGCAGAGCACCTTACAAATGCATACAGCAACAGCTTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174212	CATTTCATTCAGTTGCAGAGCACCTTACAAATGCATACAGCAACAGCTTC	174261

CU463850.5	1101	CAGCTTCATCCATGGGATCAGCTCCTAATGACTCTGATGAAGTTGCGTCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174262	CAGCTTCATCCATGGGATCAGCTCCTAATGACTCTGATGAAGTTGCGTCT	174311

CU463850.5	1151	TAATTTACTGCAGGGCGATCTTGCTGAAAGGTTTGCTGTTTCTCAATCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174312	TAATTTACTGCAGGGCGATCTTGCTGAAAGGTTTGCTGTTTCTCAATCCA	174361

CU463850.5	1201	TCGTAAGCAAGGTGATTTCATGTTGGATTGACATCATGGAGGAGAACATG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174362	TCGTAAGCAAGGTGATTTCATGTTGGATTGACATCATGGAGGAGAACATG	174411

CU463850.5	1251	AGGGATTACGTACCATGGCTTCCCAAGGAAACGATCCAAGCAACAATGCC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174412	AGGGATTACGTACCATGGCTTCCCAAGGAAACGATCCAAGCAACAATGCC	174461

CU463850.5	1301	TCAGTGCTTCAGAGAACAGTTTCCAAATACAACCTGCATTATTGACTGTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174462	TCAGTGCTTCAGAGAACAGTTTCCAAATACAACCTGCATTATTGACTGTT	174511

CU463850.5	1351	CTGAGACACCACTTCAAAAGCCACACAACCTTGACTCAAGAGGCGAGTCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174512	CTGAGACACCACTTCAAAAGCCACACAACCTTGACTCAAGAGGCGAGTCC	174561

CU463850.5	1401	TACAGTCACTACTATGGGCAGAACACAATAAAATACCTGGTCTCCATTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174562	TACAGTCACTACTATGGGCAGAACACAATAAAATACCTGGTCTCCATTGC	174611

CU463850.5	1451	ACCATGTGGACTGATTATGTTCATCTCACCTGCATATGGAGGAAGGTGCA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174612	ACCATGTGGACTGATTATGTTCATCTCACCTGCATATGGAGGAAGGTGCA	174661

CU463850.5	1501	GTGATAAATTCATAACTGCAAACTCTGGTTTCCTTGAATACCTTCGTCCA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174662	GTGATAAATTCATAACTGCAAACTCTGGTTTCCTTGAATACCTTCGTCCA	174711

CU463850.5	1551	GGAGATGAAGTAATGGCAGATAGAGGCTTCACGATTAGTGATCTCCTCTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174712	GGAGATGAAGTAATGGCAGATAGAGGCTTCACGATTAGTGATCTCCTCTA	174761

CU463850.5	1601	TGAAAAAAAAGTAAAACTGGTTATTCCAGCATTCACCAAGAAAGGCATGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174762	TGAAAAAAAAGTAAAACTGGTTATTCCAGCATTCACCAAGAAAGGCATGC	174811

CU463850.5	1651	AACTCTCGGAGGAAGACACCACCAACACTAGGCGCATTGCCAATGTACGT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174812	AACTCTCGGAGGAAGACACCACCAACACTAGGCGCATTGCCAATGTACGT	174861

CU463850.5	1701	GTCCATGTTGAGCGGGTAATCTGTAGATTGAAAACCTTCAAAATCAATCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174862	GTCCATGTTGAGCGGGTAATCTGTAGATTGAAAACCTTCAAAATCAATCA	174911

CU463850.5	1751	ACCTTACCCCTAAAATTGACAAAATTTTGAGAATTTGTGCAGCCCTGTGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174912	ACCTTACCCCTAAAATTGACAAAATTTTGAGAATTTGTGCAGCCCTGTGT	174961

CU463850.5	1801	AATTTACGTAGCGACATAATTTCTGATGTAGAGGATGAATAAATGTTTAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	174962	AATTTACGTAGCGACATAATTTCTGATGTAGAGGATGAATAAATGTTTAT	175011

CU463850.5	1851	TTGTAGGCGCATTGTATTTGTCATTAAATTTTGTTGTTTTGTCTTTAACA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	175012	TTGTAGGCGCATTGTATTTGTCATTAAATTTTGTTGTTTTGTCTTTAACA	175061

CU463850.5	1901	GTTGTGTAAATAAAAAAATTAAGCAGGTATTTTAATAAACACTTACAATG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	175062	GTTGTGTAAATAAAAAAATTAAGCAGGTATTTTAATAAACACTTACAATG	175111

CU463850.5	1951	ATGAGATGTTACATATTAACATGTTAGCTGTAACAAATACTATTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548076.6	175112	ATGAGATGTTACATATTAACATGTTAGCTGTAACAAATACTATTGAATTC	175161

Overview

Query
CU463850.5 - 30474 bps
Hit
BX548076.6 - 175161 bps
Total alignments
20
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100195720001200011731621751611
291.0113818989629150-139187393751
391.0516524981508398191378916231
495.9923227584038677191706919791
594.0811715386918843192063922141
691.6922231791549470192462927861
794.271191578682883811392281393841
888.272584579154961011396431400851
993.161832349620985311403011405341
1092.5329145198801033011406421410961
1191.563675561037210927-11410931416721
1282.668122055109721302611417281438091
1390.361401978957915311453391455351
1493.26134178150781525511493931495701
1591.84130192272222741311504091506041
1693.844746225850647111504611510761
1797.5945095084105361561911648201699161
1897.15440490161971668611699151704061
1998.14597645263512699511704041710481
2094.34161207270182722411711541713651
Short-link