<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX914216.14	1	TTGTCTGTAGAGAAAATGAGGAAATCCGTTTGGAATCTTGCACGGATTCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93340	TTGTCTGTAGAGAAAATGAGGAAATCCGTTTGGAATCTTGCACGGATTCC	93389

BX914216.14	51	TCTAGAAATTACTGAAATTGACCTATCTGACTGAACAGGCAATAGAACGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93390	TCTAGAAATTACTGAAATTGACCTATCTGACTGAACAGGCAATAGAACGA	93439

BX914216.14	101	TGACTATAACCATGAAGTTGTTATTATTGTTTAATAACAACTGCATGAGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93440	TGACTATAACCATGAAGTTGTTATTATTGTTTAATAACAACTGCATGAGC	93489

BX914216.14	151	ATAGGGAAATCCACGACACAACTTCAGAGTAATAATGATAATAATAATTG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93490	ATAGGGAAATCCACGACACAACTTCAGAGTAATAATGATAATAATAATTG	93539

BX914216.14	201	ATTAACAATATTGCTTAAAATCCCTTTTTCAATGTCATCACAAGATTTAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93540	ATTAACAATATTGCTTAAAATCCCTTTTTCAATGTCATCACAAGATTTAC	93589

BX914216.14	251	AGCTGATGAACAATTAAAAAAAAGTGCAGCAAATCGAACCTCAGATTTAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93590	AGCTGATGAACAATTAAAAAAAAGTGCAGCAAATCGAACCTCAGATTTAA	93639

BX914216.14	301	TACATTTAATTTTAATACAACAAAATACAAAACTCCAGCACACCACACTT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93640	TACATTTAATTTTAATACAACAAAATACAAAACTCCAGCACACCACACTT	93689

BX914216.14	351	GCAATAAACAGAATGCTATTTTGCAATGGTGAGAACTGAGAATGCTAGCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93690	GCAATAAACAGAATGCTATTTTGCAATGGTGAGAACTGAGAATGCTAGCA	93739

BX914216.14	401	TAGTTAAGGCTGATTTATACTTCTGCGTCAAAAGCCGGCGTATGCTACGG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93740	TAGTTAAGGCTGATTTATACTTCTGCGTCAAAAGCCGGCGTATGCTACGG	93789

BX914216.14	451	CGCTGACGCATAGCCCTTCGCCGTTGCCGTCGGCGTCGCTGACGTGCACC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93790	CGCTGACGCATAGCCCTTCGCCGTTGCCGTCGGCGTCGCTGACGTGCACC	93839

BX914216.14	501	TCTCAAAAAATGTAACTACACGTCGCAACAACGCGTAGCGCAAGCTCTGT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93840	TCTCAAAAAATGTAACTACACGTCGCAACAACGCGTAGCGCAAGCTCTGT	93889

BX914216.14	551	GATTGGTCGGCTTGGTAGCGCCGACGAGTCTGGCGAGCGATTGTTTACAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93890	GATTGGTCGGCTTGGTAGCGCCGACGAGTCTGGCGAGCGATTGTTTACAA	93939

BX914216.14	601	GTGTGGAGTCCCGTGAAGGAGCTCCGGATGGAAAGTTTTGTTCTGTGTTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93940	GTGTGGAGTCCCGTGAAGGAGCTCCGGATGGAAAGTTTTGTTCTGTGTTT	93989

BX914216.14	651	ACCTCATGGTTAAAGTTGTTGCACGTCCGCAGGTTCCTGCTTCAAAATGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	93990	ACCTCATGGTTAAAGTTGTTGCACGTCCGCAGGTTCCTGCTTCAAAATGA	94039

BX914216.14	701	GCGAGTTTGAGTCACTTGTACATTCAGGAAGTGTTCAGAAAAGCAAAACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94040	GCGAGTTTGAGTCACTTGTACATTCAGGAAGTGTTCAGAAAAGCAAAACA	94089

BX914216.14	751	GAAGTGAAGAAACTCGACACAGAGGAACATTTACACCTCACTGCCCACTA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94090	GAAGTGAAGAAACTCGACACAGAGGAACATTTACACCTCACTGCCCACTA	94139

BX914216.14	801	GCGTTTCGGAAGTGTTAATGCAGACCAACAGAGACAGCGCGCAGAAGTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94140	GCGTTTCGGAAGTGTTAATGCAGACCAACAGAGACAGCGCGCAGAAGTAT	94189

BX914216.14	851	AAATGCACAGCTGCGCGCGTTGCCTGCGCCGTGAGTTACGCCGGTCACTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94190	AAATGCACAGCTGCGCGCGTTGCCTGCGCCGTGAGTTACGCCGGTCACTT	94239

BX914216.14	901	GAGGGAGAAGTATAAACCAGGCTTTAATACTACAGCTATCTGCATTCTCT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94240	GAGGGAGAAGTATAAACCAGGCTTTAATACTACAGCTATCTGCATTCTCT	94289

BX914216.14	951	TTTCCTAATATGAATTATGTTTTTGGATGTTTTTAGAATTGTTTTCAGCT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94290	TTTCCTAATATGAATTATGTTTTTGGATGTTTTTAGAATTGTTTTCAGCT	94339

BX914216.14	1001	GAGTCATAATACATAGAAATTAAAAACTTAAAGCGGTAAATCACAAAAGT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94340	GAGTCATAATACATAGAAATTAAAAACTTAAAGCGGTAAATCACAAAAGT	94389

BX914216.14	1051	GCAAGAGATTGTTTTCAAGAAGCAAGATAACAAACACCTCATTCAGCTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94390	GCAAGAGATTGTTTTCAAGAAGCAAGATAACAAACACCTCATTCAGCTTA	94439

BX914216.14	1101	TCTCAGGCCAATTGTTATGGTGCAGATTTGAGCGCAACTGCCATGTTCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94440	TCTCAGGCCAATTGTTATGGTGCAGATTTGAGCGCAACTGCCATGTTCAC	94489

BX914216.14	1151	ATTGGCCTCAGCACACCAGGTTCCAATACAATGAGTCAGGTGTGAAATCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94490	ATTGGCCTCAGCACACCAGGTTCCAATACAATGAGTCAGGTGTGAAATCA	94539

BX914216.14	1201	GCCACAGACTCCTTACCCCAGATCGGTGAGCGGTGGTTTATCTCTGCCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94540	GCCACAGACTCCTTACCCCAGATCGGTGAGCGGTGGTTTATCTCTGCCTC	94589

BX914216.14	1251	TCCTATAGCACAGGAAGATCTGCGGCCCCATGAGGCTTCCACCATTCAGT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94590	TCCTATAGCACAGGAAGATCTGCGGCCCCATGAGGCTTCCACCATTCAGT	94639

BX914216.14	1301	TCAGCAGGGAGTCCGGAGGGGGTGCATTCAACACAGGTATACCCTCTAGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94640	TCAGCAGGGAGTCCGGAGGGGGTGCATTCAACACAGGTATACCCTCTAGG	94689

BX914216.14	1351	TACTTCCTCCCCTAGAGAGCGAATCACCACTGCCACATCAGTGATCGGTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94690	TACTTCCTCCCCTAGAGAGCGAATCACCACTGCCACATCAGTGATCGGTG	94739

BX914216.14	1401	CCTTGAGTTGAGCTGAGCTTCGGTGAGCTCCATCTTCAGGGTGAACATCT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94740	CCTTGAGTTGAGCTGAGCTTCGGTGAGCTCCATCTTCAGGGTGAACATCT	94789

BX914216.14	1451	TCCTCCAGGGGCTTTGAAGAGACGGTGAGTCCTGCCACCACAAAGTAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94790	TCCTCCAGGGGCTTTGAAGAGACGGTGAGTCCTGCCACCACAAAGTAGTC	94839

BX914216.14	1501	TGCTACACGAAGGCTTTTTTCCTCCATCTTCGATCATCCCCATAAAACGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94840	TGCTACACGAAGGCTTTTTTCCTCCATCTTCGATCATCCCCATAAAACGA	94889

BX914216.14	1551	GGACTGTATGTGCTGGGGGGAAAAAAAAACAGAGTAATGTGAACGGGGGA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94890	GGACTGTATGTGCTGGGGGGAAAAAAAAACAGAGTAATGTGAACGGGGGA	94939

BX914216.14	1601	GGAAATCATGACATGCTGTAGGCTAGTAAACAGTGTTGCTTAATAATGCC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94940	GGAAATCATGACATGCTGTAGGCTAGTAAACAGTGTTGCTTAATAATGCC	94989

BX914216.14	1651	AGGTGCTCTGACACAAATGAAAACATCCTTCTTTAAACCGGCAGGGATTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	94990	AGGTGCTCTGACACAAATGAAAACATCCTTCTTTAAACCGGCAGGGATTT	95039

BX914216.14	1701	TAAGAAACAAATCAGCACATTGCGGCACGGTTATACAACGCTCTCAGGAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	95040	TAAGAAACAAATCAGCACATTGCGGCACGGTTATACAACGCTCTCAGGAC	95089

BX914216.14	1751	ATATCATTTTAACTCTGGTTACATTTTGGTCCCTTATGTGCTTAGAAAAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	95090	ATATCATTTTAACTCTGGTTACATTTTGGTCCCTTATGTGCTTAGAAAAA	95139

BX914216.14	1801	GGATATGAGCATTATACCTTCACAGATGCAGAGTACAACCACATGTAACA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	95140	GGATATGAGCATTATACCTTCACAGATGCAGAGTACAACCACATGTAACA	95189

BX914216.14	1851	ATCTCAGTGAGAAATATAAACTGGACAAACGGATGCAATTACCCATTCCT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	95190	ATCTCAGTGAGAAATATAAACTGGACAAACGGATGCAATTACCCATTCCT	95239

BX914216.14	1901	GCCGGGGATATATGCCTTTGAATCATGACTCATACTGTTTGTACCTGCAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	95240	GCCGGGGATATATGCCTTTGAATCATGACTCATACTGTTTGTACCTGCAG	95289

BX914216.14	1951	AATAAGTGCACAAAATGGAAGAGGGAAAGAATGTACTAAAAAGGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX548058.9	95290	AATAAGTGCACAAAATGGAAGAGGGAAAGAATGTACTAAAAAGGGAATTC	95339

Overview

Query
BX914216.14 - 72914 bps
Hit
BX548058.9 - 95339 bps
Total alignments
17
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001984200012000193340953391
285.821442676899716519812100861
399.01721016282462924-116564166641
410046626279462855-116784168451
510049666279562860-116955170201
686.041212191467014888119121193421
786.9319634368237165-124906252571
810050666273162796141721417861
983.51901885736657553-142035422221
1080.6310831768437159142061423801
1186.6733605121551274-157001570601
1210069936279562887-170840709321
1386.09902656265862922-170933711981
1486.1132746265962732-171280713511
15100851146279462907-171323714361
1685.3339731489614968173060731341
1792.522203254614746471-191540918601
Short-link