<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX537302.12	1	GAATTCTGAACCTCTGGAATTCTGCTTTAAAATGCTAAGAGGTCACTTAT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67109	GAATTCTGAACCTCTGGAATTCTGCTTTAAAATGCTAAGAGGTCACTTAT	67158

BX537302.12	51	CCTCTGACCTCCATACAAGTGCTTGGCATGTGCATGTACACACACGCGCA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67159	CCTCTGACCTCCATACAAGTGCTTGGCATGTGCATGTACACACACGCGCA	67208

BX537302.12	101	CACACACACATACATACATACATGCATAGACACAATATTTTCTTTTATGT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67209	CACACACACATACATACATACATGCATAGACACAATATTTTCTTTTATGT	67258

BX537302.12	151	ATGAGAGTTCATCTGCACATATACCCCATGTGTGCCTGGAGGCAGTGGCA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67259	ATGAGAGTTCATCTGCACATATACCCCATGTGTGCCTGGAGGCAGTGGCA	67308

BX537302.12	201	GTCAGAAGGTATCAGATCCCCTGGAACTGGAGTTACAGAAGGTCCTGAGC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67309	GTCAGAAGGTATCAGATCCCCTGGAACTGGAGTTACAGAAGGTCCTGAGC	67358

BX537302.12	251	CACTACATGGGTGCGAGGAACCAAACCCAGGTCCTCTACCAGAGCAGCTG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67359	CACTACATGGGTGCGAGGAACCAAACCCAGGTCCTCTACCAGAGCAGCTG	67408

BX537302.12	301	CACTCTTAACTTAAACAGTGCTCTAGCACTGAGGCATCTCTCCAGTCACA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67409	CACTCTTAACTTAAACAGTGCTCTAGCACTGAGGCATCTCTCCAGTCACA	67458

BX537302.12	351	TACAAAACAATTTTTTAAAAAATAATATCATTTTCTTTGAGACTGGGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67459	TACAAAACAATTTTTTAAAAAATAATATCATTTTCTTTGAGACTGGGGAG	67508

BX537302.12	401	ATGTTGGCTAAAGAATGTATCCTGTTCTTGCAGAGGACACCACATAGGTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67509	ATGTTGGCTAAAGAATGTATCCTGTTCTTGCAGAGGACACCACATAGGTT	67558

BX537302.12	451	CCCAACAGCCAAGACTGACAATTGCCTGTAACCCAGGCCCCGGTGAATAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67559	CCCAACAGCCAAGACTGACAATTGCCTGTAACCCAGGCCCCGGTGAATAC	67608

BX537302.12	501	AGTGCCTGAAGCTTACCTCAGGCTGGCTCCCTCATGTGCAGAATCCCATA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67609	AGTGCCTGAAGCTTACCTCAGGCTGGCTCCCTCATGTGCAGAATCCCATA	67658

BX537302.12	551	CACACACGCACATGCACTTCATTAAAAATAAATCTTAAAAAAAAGAAATC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67659	CACACACGCACATGCACTTCATTAAAAATAAATCTTAAAAAAAAGAAATC	67708

BX537302.12	601	TTTTCATCTGTGTATGTTTGGTTATGCATGTGTATGAAGGCCATAGGACA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67709	TTTTCATCTGTGTATGTTTGGTTATGCATGTGTATGAAGGCCATAGGACA	67758

BX537302.12	651	ACTTTAGCTGTTAGTTCTGACCCTCCACCTTGTATAAGACAGTTTCTCTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67759	ACTTTAGCTGTTAGTTCTGACCCTCCACCTTGTATAAGACAGTTTCTCTC	67808

BX537302.12	701	TCCTTCTCAGTTTTCTTTTTGAGCCAGGGTTTCTCTGTGAAGCCCTGGCT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67809	TCCTTCTCAGTTTTCTTTTTGAGCCAGGGTTTCTCTGTGAAGCCCTGGCT	67858

BX537302.12	751	GTCCTGTAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGTTTTAACTCAGGGAGATCC	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67859	GTCCTGTAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGTTTTAACTCAGGGAGATCC	67908

BX537302.12	801	ACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGTTATAGGACTGTGCCACCACCAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67909	ACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGTTATAGGACTGTGCCACCACCAC	67958

BX537302.12	851	CTAGTTGACACAGATTGCAGATTTGTTACTGTGTCCAGATTCATGTGGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	67959	CTAGTTGACACAGATTGCAGATTTGTTACTGTGTCCAGATTCATGTGGGT	68008

BX537302.12	901	TCAAGAGACCTAGACCAGGCCCTGCTGCTCCCACAGCAAGTGCCTTACAC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68009	TCAAGAGACCTAGACCAGGCCCTGCTGCTCCCACAGCAAGTGCCTTACAC	68058

BX537302.12	951	ACAGAATTGTCTTCCCAGTTCACCAGCAAGTTTAATGCTAGCTTGAACTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68059	ACAGAATTGTCTTCCCAGTTCACCAGCAAGTTTAATGCTAGCTTGAACTA	68108

BX537302.12	1001	TGAAGTGAAGTGCTGTCTTTAAAAACACATAAAAAGACCAGGCCTGGCAG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68109	TGAAGTGAAGTGCTGTCTTTAAAAACACATAAAAAGACCAGGCCTGGCAG	68158

BX537302.12	1051	TGAACACTTTTAGCCCCATCACTTGAGAGGCAGAGTAAATGGGTTTCTAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68159	TGAACACTTTTAGCCCCATCACTTGAGAGGCAGAGTAAATGGGTTTCTAA	68208

BX537302.12	1101	GAGTTCAAGACTAGCCTGGTCTACACAGCTAGTTTATAGGACAGCCAGTG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68209	GAGTTCAAGACTAGCCTGGTCTACACAGCTAGTTTATAGGACAGCCAGTG	68258

BX537302.12	1151	GTACACAAAGAAACCCTGATTCAGAAAACCTACATAGATAGATAGATAGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68259	GTACACAAAGAAACCCTGATTCAGAAAACCTACATAGATAGATAGATAGA	68308

BX537302.12	1201	TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGGATGGATGGAGA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68309	TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGGATGGATGGAGA	68358

BX537302.12	1251	TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68359	TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATG	68408

BX537302.12	1301	GATGGATATGGATGGATGGATGGATGGATATGGATGGATGGATGGATGGA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68409	GATGGATATGGATGGATGGATGGATGGATATGGATGGATGGATGGATGGA	68458

BX537302.12	1351	TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATATGGATAGATGGATGGATGGA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68459	TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATATGGATAGATGGATGGATGGA	68508

BX537302.12	1401	TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATATGGATATGGATGGATGGATG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68509	TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATATGGATATGGATGGATGGATG	68558

BX537302.12	1451	GATGGATGGATGGATATGGATGGATGGATGGATATGGATAGATGGATGGA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68559	GATGGATGGATGGATATGGATGGATGGATGGATATGGATAGATGGATGGA	68608

BX537302.12	1501	TGGATGGATGGATGGATGGATATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68609	TGGATGGATGGATGGATGGATATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGA	68658

BX537302.12	1551	TGGATGGATGGATGGATGGATAAAAGGTGCTGTAGAGATGACTCAACAGT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68659	TGGATGGATGGATGGATGGATAAAAGGTGCTGTAGAGATGACTCAACAGT	68708

BX537302.12	1601	TAACCACACTAACTGTTCTTGAGGACACAGGTTCCACTCCAGCACCACAT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68709	TAACCACACTAACTGTTCTTGAGGACACAGGTTCCACTCCAGCACCACAT	68758

BX537302.12	1651	GTCACCTAACAACTGTCTGCAAATCCAATTACAAGAAGTGACACCCTCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68759	GTCACCTAACAACTGTCTGCAAATCCAATTACAAGAAGTGACACCCTCTT	68808

BX537302.12	1701	CTGGCCTCTGTGGCATTCACATGATGCACACACATACATAACACATAAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68809	CTGGCCTCTGTGGCATTCACATGATGCACACACATACATAACACATAAAA	68858

BX537302.12	1751	TGAATTGTTGTTCTTGTTACTTTAAAAAAATAAGATAGGGTGTCATCTAT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68859	TGAATTGTTGTTCTTGTTACTTTAAAAAAATAAGATAGGGTGTCATCTAT	68908

BX537302.12	1801	AATATAGTTTTATGCATCCTGGATCTCACTATTTGAATCAGCCTGACATG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68909	AATATAGTTTTATGCATCCTGGATCTCACTATTTGAATCAGCCTGACATG	68958

BX537302.12	1851	GAACTCACAGAGCTCCACCTGAACTATGCCTCTCCGGTACTGGGATTATA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	68959	GAACTCACAGAGCTCCACCTGAACTATGCCTCTCCGGTACTGGGATTATA	69008

BX537302.12	1901	GGTGTGTGCCTATGCCTGGCTAAAAACAGCTTTAAAAAAAAAAAAAAACA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	69009	GGTGTGTGCCTATGCCTGGCTAAAAACAGCTTTAAAAAAAAAAAAAAACA	69058

BX537302.12	1951	AGGCTTGCCAAGGGCCAGTGTTCCAAACACCTCTCCCACCTTGTGCAACT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX539331.7	69059	AGGCTTGCCAAGGGCCAGTGTTCCAAACACCTCTCCCACCTTGTGCAACT	69108

Overview

Query
BX537302.12 - 214393 bps
Hit
BX539331.7 - 69108 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link