<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2001 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL954865.13	1	GGCCGCGTCCGAGCGGATGCCGGCGGCAGCGTAAACCCCACCCCAGCGCG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10533	GGCCGCGTCCGAGCGGATGCCGGCGGCAGCGTAAACCCCACCCCAGCGCG	10582

AL954865.13	51	AGCGGAAGAGGCGGCTCGCGGGGGCGGGGCTTGGCTCGCGCTTCCAGCGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10583	AGCGGAAGAGGCGGCTCGCGGGGGCGGGGCTTGGCTCGCGCTTCCAGCGA	10632

AL954865.13	101	GTGACAAGGTTTCGTGGCCTGGGGGCCTGAGCTGTTTCCTCTTGGAAAGG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10633	GTGACAAGGTTTCGTGGCCTGGGGGCCTGAGCTGTTTCCTCTTGGAAAGG	10682

AL954865.13	151	CCGAGGAGGCTCCGCCACTCTCCTTTGGACTGGTCGCGCTGAAGCTCTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10683	CCGAGGAGGCTCCGCCACTCTCCTTTGGACTGGTCGCGCTGAAGCTCTAT	10732

AL954865.13	201	CCTAGGGCACTGGTCGCAAGAGCAGATGGTGCCACACGCTCCGGGCCTAC	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10733	CCTAGGGCACTGGTCGCAAGAGCAGATGGTGCCACACGCTCCGGGCCTAC	10782

AL954865.13	251	AAACTTCAGCGGCTGCCGGGCCCGGGCCCCTCGTCTTTTGTTGGGTTTCC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10783	AAACTTCAGCGGCTGCCGGGCCCGGGCCCCTCGTCTTTTGTTGGGTTTCC	10832

AL954865.13	301	TCTTGGTGCCAGGTCTCAGCCCCTGCAAAAGAAAGCTGGCTTTGGCCGCG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10833	TCTTGGTGCCAGGTCTCAGCCCCTGCAAAAGAAAGCTGGCTTTGGCCGCG	10882

AL954865.13	351	CGCAGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCATTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10883	CGCAGTGGCTCGCGCCTGTAATCCCAGCATTTGGGAGGCCAAGGCAGGTG	10932

AL954865.13	401	GATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACTATCCTGGCCAACATGGTAAAACCC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10933	GATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACTATCCTGGCCAACATGGTAAAACCC	10982

AL954865.13	451	CATCTCTACTACCAATAGAAAAATTGGCCGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	10983	CATCTCTACTACCAATAGAAAAATTGGCCGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTG	11032

AL954865.13	501	TAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCCCTTGAACCCAGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11033	TAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGCAGAATCCCTTGAACCCAGG	11082

AL954865.13	551	AGGCGGAGGTTGCAGTGACCCGAGATCGCCACTGCACTCCAGCCTGCGGG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11083	AGGCGGAGGTTGCAGTGACCCGAGATCGCCACTGCACTCCAGCCTGCGGG	11132

AL954865.13	601	ACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACG	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11133	ACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACG	11182

AL954865.13	651	AAAAAATGAAAGCTGGCTTTGTATAGGTGCTGGGGAGCGCAAACACCTGG	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11183	AAAAAATGAAAGCTGGCTTTGTATAGGTGCTGGGGAGCGCAAACACCTGG	11232

AL954865.13	701	CCTCCCCAAGAGGCTGGAGGATGAGGAGGGTCACCGACTGAGCCCACCTG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11233	CCTCCCCAAGAGGCTGGAGGATGAGGAGGGTCACCGACTGAGCCCACCTG	11282

AL954865.13	751	ATAAGTGAGGCCTTTTATTAAACAGCCCCATTTGTAGGCACTTGCAGTTT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11283	ATAAGTGAGGCCTTTTATTAAACAGCCCCATTTGTAGGCACTTGCAGTTT	11332

AL954865.13	801	TGTTTAGAAAAAGAAAGGTTTAATTATCAGATGGTAACATTTCTGTGTGT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11333	TGTTTAGAAAAAGAAAGGTTTAATTATCAGATGGTAACATTTCTGTGTGT	11382

AL954865.13	851	CAATAACAAGCCCAGTTCTGCTACCTCTCACTTGTGCCCAAGCAAGTTGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11383	CAATAACAAGCCCAGTTCTGCTACCTCTCACTTGTGCCCAAGCAAGTTGG	11432

AL954865.13	901	TTTACCATTCATTTACCTCAGTTTCTCCTCGTGTGAAATGGGGATGATAA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11433	TTTACCATTCATTTACCTCAGTTTCTCCTCGTGTGAAATGGGGATGATAA	11482

AL954865.13	951	TTGTACCGCAGTAAGAAGTAGATTTCGTTACATCTTTTACTTTTTGAACC	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11483	TTGTACCGCAGTAAGAAGTAGATTTCGTTACATCTTTTACTTTTTGAACC	11532

AL954865.13	1001	ATAAGATTGTTTATCCATTAAAATGGTATTAAAATGCCCACTACGTAGGG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11533	ATAAGATTGTTTATCCATTAAAATGGTATTAAAATGCCCACTACGTAGGG	11582

AL954865.13	1051	TTGTTGTATTGAGTAGCAACTAAAAATTGCTTGCTCCTTTCTGAAGTATA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11583	TTGTTGTATTGAGTAGCAACTAAAAATTGCTTGCTCCTTTCTGAAGTATA	11632

AL954865.13	1101	GAGAAACTAAGAATCCTGCGGTGACCCAGGGTCTTGGAGTCCCACAATAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11633	GAGAAACTAAGAATCCTGCGGTGACCCAGGGTCTTGGAGTCCCACAATAC	11682

AL954865.13	1151	TCATTGTCTTATCATCCAGTAGACCTCCAGCATTTTTAAGTTGCTTTCTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11683	TCATTGTCTTATCATCCAGTAGACCTCCAGCATTTTTAAGTTGCTTTCTT	11732

AL954865.13	1201	ATCCCTTACTTGGTGTTTCCTAGTTTTCTTTGAGATTTTCTCAATATTGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11733	ATCCCTTACTTGGTGTTTCCTAGTTTTCTTTGAGATTTTCTCAATATTGT	11782

AL954865.13	1251	CTTGCTATCTGAGCAAGGCGGGCTTCTGCTTCCAGACCATCACTTTATTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11783	CTTGCTATCTGAGCAAGGCGGGCTTCTGCTTCCAGACCATCACTTTATTT	11832

AL954865.13	1301	TTATTTTTTCAAAGTGAAAGTAAGATTATTAAGAAAATAAAGGAATAAAG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11833	TTATTTTTTCAAAGTGAAAGTAAGATTATTAAGAAAATAAAGGAATAAAG	11882

AL954865.13	1351	AATGGCTACTCCGTAGGCAAAGCAGCCCACATCATCACTTTAGAGAGTTC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11883	AATGGCTACTCCGTAGGCAAAGCAGCCCACATCATCACTTTAGAGAGTTC	11932

AL954865.13	1401	CACTCTGGTCCTCTTCCCCATGGGACAAGAAGTCTGAGGGATTAAGTGGA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11933	CACTCTGGTCCTCTTCCCCATGGGACAAGAAGTCTGAGGGATTAAGTGGA	11982

AL954865.13	1451	CTTGCCAGCCCCAAACCCACATCTACCTTCTCAACCATACTCTGAGTACC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	11983	CTTGCCAGCCCCAAACCCACATCTACCTTCTCAACCATACTCTGAGTACC	12032

AL954865.13	1501	CAGTCATTCAAATTCCAGTCCCAAATAGCTTTAGCCCATTTCCAGAAAAA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12033	CAGTCATTCAAATTCCAGTCCCAAATAGCTTTAGCCCATTTCCAGAAAAA	12082

AL954865.13	1551	TGTAGAGTACTTGGGCCAGGCCACACCACAGTCTGGTCTTGGTTTGAGAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12083	TGTAGAGTACTTGGGCCAGGCCACACCACAGTCTGGTCTTGGTTTGAGAT	12132

AL954865.13	1601	TGGGTCAACAATGAAATTTGTAAGAATTAAAGGATATGTCTATTCTCATT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12133	TGGGTCAACAATGAAATTTGTAAGAATTAAAGGATATGTCTATTCTCATT	12182

AL954865.13	1651	TACTCCAAAAAGGACTAATAAGCATTGCAATACAGTGCAGAAATATGAGA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12183	TACTCCAAAAAGGACTAATAAGCATTGCAATACAGTGCAGAAATATGAGA	12232

AL954865.13	1701	GATATGGATAGGTAGATAAAGCTGCCCTTCATCTTCTCCTTTACTTGGGG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12233	GATATGGATAGGTAGATAAAGCTGCCCTTCATCTTCTCCTTTACTTGGGG	12282

AL954865.13	1751	GATGCAAGCCTTGAGTTTGGCTTTGTTTTTCAGAATTGATTGTGTTTATC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12283	GATGCAAGCCTTGAGTTTGGCTTTGTTTTTCAGAATTGATTGTGTTTATC	12332

AL954865.13	1801	TTACCAACCCTTTATTACCTCTGGAGGCAGGTGACCTGGGGGTAAAGAAA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12333	TTACCAACCCTTTATTACCTCTGGAGGCAGGTGACCTGGGGGTAAAGAAA	12382

AL954865.13	1851	GGTAGAACAGGCAGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCATCACTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12383	GGTAGAACAGGCAGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCATCACTTTG	12432

AL954865.13	1901	GGAGGCTGAGGCGGGTGGATCGCTTAAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12433	GGAGGCTGAGGCGGGTGGATCGCTTAAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCT	12482

AL954865.13	1951	GACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAAAACTCGATGG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX537153.6	12483	GACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAAAACTCGATGG	12532

AL954865.13	2001	G	2001
			|
BX537153.6	12533	G	12533

Overview

Query
AL954865.13 - 41127 bps
Hit
BX537153.6 - 12533 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2001 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link