<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX248244.7	1	GGCCATTCAAGAACCCTTCCCACTTCCCACTCCTTAGCTCACCAGAAACA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67010	GGCCATTCAAGAACCCTTCCCACTTCCCACTCCTTAGCTCACCAGAAACA	67059

BX248244.7	51	AAGCCAGCTGCCGCCGTCCATCTGCACTCATGTCCTCCCCTGCAGAGAGG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67060	AAGCCAGCTGCCGCCGTCCATCTGCACTCATGTCCTCCCCTGCAGAGAGG	67109

BX248244.7	101	AGGCGCTCAAAATAGGCCACACATCTGGGTATTCATCCCCTTCCTAGGCC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67110	AGGCGCTCAAAATAGGCCACACATCTGGGTATTCATCCCCTTCCTAGGCC	67159

BX248244.7	151	CTTCCCACCCTCTCTCCTGCCCCAGGAGCTCCTTACCCACGCTCCAGGGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67160	CTTCCCACCCTCTCTCCTGCCCCAGGAGCTCCTTACCCACGCTCCAGGGG	67209

BX248244.7	201	AAGTCAGGCCCGTGTTCTGCCTGGTAGGAGCGGAGGACAGACAGACACCA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67210	AAGTCAGGCCCGTGTTCTGCCTGGTAGGAGCGGAGGACAGACAGACACCA	67259

BX248244.7	251	GTCCTCTTCCACCTCCCATCGGCTATAAATTGAGGCTGGTCAGGGAGAGA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67260	GTCCTCTTCCACCTCCCATCGGCTATAAATTGAGGCTGGTCAGGGAGAGA	67309

BX248244.7	301	GATGACAGCCAGTCAGCAACCTGACCTTGCTGGGCCCCCGCCCCAAGCCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67310	GATGACAGCCAGTCAGCAACCTGACCTTGCTGGGCCCCCGCCCCAAGCCT	67359

BX248244.7	351	CACTGGATCCCTTCTCACCTTCCTCCAGCTGTGAGGAGGCCTCCAACCAC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67360	CACTGGATCCCTTCTCACCTTCCTCCAGCTGTGAGGAGGCCTCCAACCAC	67409

BX248244.7	401	TGCCTCACCACTCGAAGACCCTCCTCTGCCATCACCCGGGGATACCTACG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67410	TGCCTCACCACTCGAAGACCCTCCTCTGCCATCACCCGGGGATACCTACG	67459

BX248244.7	451	GAGGAAGTGCCAGGACAGGTCAGGGCTGATTTTTTTTCATTCACCATCCC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67460	GAGGAAGTGCCAGGACAGGTCAGGGCTGATTTTTTTTCATTCACCATCCC	67509

BX248244.7	501	TGAACCTTCCTCCCTCCTTCCCTGTGCTGGTATCAGTATCTGTGTGTGTA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67510	TGAACCTTCCTCCCTCCTTCCCTGTGCTGGTATCAGTATCTGTGTGTGTA	67559

BX248244.7	551	CACTGCCCCCAGCGCGCACACACCCTGGCTCTCACCGATGCTGCAGGAGC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67560	CACTGCCCCCAGCGCGCACACACCCTGGCTCTCACCGATGCTGCAGGAGC	67609

BX248244.7	601	TTCAGCAGGAGGTCATTGCCTCGGTTGGACATGATGTCCTCAGGAACCCT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67610	TTCAGCAGGAGGTCATTGCCTCGGTTGGACATGATGTCCTCAGGAACCCT	67659

BX248244.7	651	GGGGGTGAGAAGAATGTACCCTGGAGGGGCTGGAGGTTAGGAGGAAGGGT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67660	GGGGGTGAGAAGAATGTACCCTGGAGGGGCTGGAGGTTAGGAGGAAGGGT	67709

BX248244.7	701	CTAGATACCCAGGTTTCTGGTGGGCAGAGGTAGAAGGGACAAGTTCCTGG	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67710	CTAGATACCCAGGTTTCTGGTGGGCAGAGGTAGAAGGGACAAGTTCCTGG	67759

BX248244.7	751	CCATCTCTGGGGTTCCTGAGGGCCGAGATTCCCACGCACGCACTCACGTG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67760	CCATCTCTGGGGTTCCTGAGGGCCGAGATTCCCACGCACGCACTCACGTG	67809

BX248244.7	801	GTGGTGATGATCTCATCCTTGGTTCTCCGGATCAGCAGTACAGGACCCTG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67810	GTGGTGATGATCTCATCCTTGGTTCTCCGGATCAGCAGTACAGGACCCTG	67859

BX248244.7	851	GTATCTTCAGAGAACAGAGCAGTGGGAAGGGAGAGCTCAGAGGGAGACGG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67860	GTATCTTCAGAGAACAGAGCAGTGGGAAGGGAGAGCTCAGAGGGAGACGG	67909

BX248244.7	901	GTGACAACTGGCCCACCCCTATCCCTGCACTGGTAGCATTCTTACCCTCC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67910	GTGACAACTGGCCCACCCCTATCCCTGCACTGGTAGCATTCTTACCCTCC	67959

BX248244.7	951	CCTTGCTATAGCACAGCCCTTGACCTAGCCCTTCACTCAGGGGTGAGAGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	67960	CCTTGCTATAGCACAGCCCTTGACCTAGCCCTTCACTCAGGGGTGAGAGG	68009

BX248244.7	1001	GGATTATTTAAGGGGCATGGTTCAGTCTGGCCCTGCTGGGAGACCCCTGC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68010	GGATTATTTAAGGGGCATGGTTCAGTCTGGCCCTGCTGGGAGACCCCTGC	68059

BX248244.7	1051	CGTGCCAGGCCTTAACCCTTTGGTTGCCAGATCCTGAGGTGGTCCAGAGT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68060	CGTGCCAGGCCTTAACCCTTTGGTTGCCAGATCCTGAGGTGGTCCAGAGT	68109

BX248244.7	1101	CCCAGGGGACCTGGGAGGGGTTAGGCCAGTTGAGGTGGTGGCAGGGTCAC	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68110	CCCAGGGGACCTGGGAGGGGTTAGGCCAGTTGAGGTGGTGGCAGGGTCAC	68159

BX248244.7	1151	TCAGGATGTGAGCCAGTGGCCTTTTACCAACTTGCACTTTAGTACTAGTT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68160	TCAGGATGTGAGCCAGTGGCCTTTTACCAACTTGCACTTTAGTACTAGTT	68209

BX248244.7	1201	TCAGGGTTTGAGCGCCCAGCAGAGCTGTATGGGGGGCAGGTGTTCAATGC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68210	TCAGGGTTTGAGCGCCCAGCAGAGCTGTATGGGGGGCAGGTGTTCAATGC	68259

BX248244.7	1251	CGGACGCTGGCCGGCCCTCACCTGCACAGCTGCTCCGCGTTGTTTAGATT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68260	CGGACGCTGGCCGGCCCTCACCTGCACAGCTGCTCCGCGTTGTTTAGATT	68309

BX248244.7	1301	GAGATGCTGCCTCACGGTCCTGGTCACCAGGCCCCCTAGAGTGGGATAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68310	GAGATGCTGCCTCACGGTCCTGGTCACCAGGCCCCCTAGAGTGGGATAAA	68359

BX248244.7	1351	GGTGAAGGGATGGCAGAGACAAAGCCCTTGCCCAACATAAAGGTCCTCAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68360	GGTGAAGGGATGGCAGAGACAAAGCCCTTGCCCAACATAAAGGTCCTCAC	68409

BX248244.7	1401	TATTCACGGAGAAAGAAAACTGAGGCCCCCAGACAAAGGAGTCCTCCTGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68410	TATTCACGGAGAAAGAAAACTGAGGCCCCCAGACAAAGGAGTCCTCCTGC	68459

BX248244.7	1451	TTCCAACAATGGGGCGACTTACTCCCCACCCAAGAAAAGGGAGCCATCTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68460	TTCCAACAATGGGGCGACTTACTCCCCACCCAAGAAAAGGGAGCCATCTC	68509

BX248244.7	1501	AGAACAGTTCCCAGTTCCAGCCCACCCCTTCCCAGGAAGGGCAGGCCTGG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68510	AGAACAGTTCCCAGTTCCAGCCCACCCCTTCCCAGGAAGGGCAGGCCTGG	68559

BX248244.7	1551	GAGCTGCACTCACTCCAGCTGTCTGGCATGACCTTCAAGGCCAAGGGCAC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68560	GAGCTGCACTCACTCCAGCTGTCTGGCATGACCTTCAAGGCCAAGGGCAC	68609

BX248244.7	1601	CAGGTCATCAAAGGAGGCATCCAGGATCATGGCACTAACATCTGGGTAGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68610	CAGGTCATCAAAGGAGGCATCCAGGATCATGGCACTAACATCTGGGTAGG	68659

BX248244.7	1651	ACATGGCTGCCCACGTGGCTGGTACCAGGGCAGGGAAGAAGAGTAAGAAC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68660	ACATGGCTGCCCACGTGGCTGGTACCAGGGCAGGGAAGAAGAGTAAGAAC	68709

BX248244.7	1701	TGAGAAAGGCTCCTTTCTCCCCACCACCCATGCTCTCATCCCACTGACCC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68710	TGAGAAAGGCTCCTTTCTCCCCACCACCCATGCTCTCATCCCACTGACCC	68759

BX248244.7	1751	TATAGGCCAACCCCATTCCCCCTATGTTATCCCTTGTTTTTTTCTTAACC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68760	TATAGGCCAACCCCATTCCCCCTATGTTATCCCTTGTTTTTTTCTTAACC	68809

BX248244.7	1801	TACTTCACTTGGTTAGGGAACTATCTGGAGAGGATGGGGATAGAACACTG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68810	TACTTCACTTGGTTAGGGAACTATCTGGAGAGGATGGGGATAGAACACTG	68859

BX248244.7	1851	GAGATAGTGCACTGAAGATAATGGGCAGGAAACATTCACTTTCCCTGATC	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68860	GAGATAGTGCACTGAAGATAATGGGCAGGAAACATTCACTTTCCCTGATC	68909

BX248244.7	1901	TCCCCACCCAGGACCTGGGTCTGCTTTTCCTTTTAATGACTGGGCACAAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68910	TCCCCACCCAGGACCTGGGTCTGCTTTTCCTTTTAATGACTGGGCACAAG	68959

BX248244.7	1951	AGGGGAAGGAAAGGTGAAGTGTATGCAAATAGGATAGCTTCTTCCAGGCC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511262.7	68960	AGGGGAAGGAAAGGTGAAGTGTATGCAAATAGGATAGCTTCTTCCAGGCC	69009

Overview

Query
BX248244.7 - 54146 bps
Hit
BX511262.7 - 69009 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link