<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX000476.5	1	GATCTATCCAGCCGTGCAGGATATAGCGTCTCATGTGTCCAGACCTGCAG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	23947	GATCTATCCAGCCGTGCAGGATATAGCGTCTCATGTGTCCAGACCTGCAG	23996

BX000476.5	51	GCTGGAGTGCAGTGTGTGATCACAGCGTGATCCATTTTTATTCTACTTGT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	23997	GCTGGAGTGCAGTGTGTGATCACAGCGTGATCCATTTTTATTCTACTTGT	24046

BX000476.5	101	TTTTCGAGACACGGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGTGAT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24047	TTTTCGAGACACGGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGTGAT	24096

BX000476.5	151	CACAGCGTGATCCATTTTTATTCTACTTGTTTTTCGAGACACGGTCTTGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24097	CACAGCGTGATCCATTTTTATTCTACTTGTTTTTCGAGACACGGTCTTGC	24146

BX000476.5	201	TGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGTGATCACAGCGTGATCCATTTTTA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24147	TGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGTGTGATCACAGCGTGATCCATTTTTA	24196

BX000476.5	251	TTCTACTTGTTTTTCGAGACACGGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24197	TTCTACTTGTTTTTCGAGACACGGTCTTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGC	24246

BX000476.5	301	AGTGTGTGATCACAGCTCAGTGCAGTCTCAACTTCACGGGCTCAAGCAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24247	AGTGTGTGATCACAGCTCAGTGCAGTCTCAACTTCACGGGCTCAAGCAAT	24296

BX000476.5	351	CCTCCCACCTTAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGTGCGCGCTATCA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24297	CCTCCCACCTTAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGTGCGCGCTATCA	24346

BX000476.5	401	TGCCTGGGTAATTTTTTTAATTTCTACAGTGAAGTCTCACTATGTTGCCG	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24347	TGCCTGGGTAATTTTTTTAATTTCTACAGTGAAGTCTCACTATGTTGCCG	24396

BX000476.5	451	AGGCTGGTCTGGAACCCTTGGCCGCAAGCCATCCTCCCGCCTTGGCCTCT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24397	AGGCTGGTCTGGAACCCTTGGCCGCAAGCCATCCTCCCGCCTTGGCCTCT	24446

BX000476.5	501	CAAAGTGCTGGGACTACAGGGATGACACTGCAACCAGAGACAGCTGCACC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24447	CAAAGTGCTGGGACTACAGGGATGACACTGCAACCAGAGACAGCTGCACC	24496

BX000476.5	551	CCCGGCGTCTGGGGGATGAGAACTGAGCGGGAGAGTGCTGGGCACACAGT	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24497	CCCGGCGTCTGGGGGATGAGAACTGAGCGGGAGAGTGCTGGGCACACAGT	24546

BX000476.5	601	CCCCCCACCACACCAAACCCGAAAATTACCTCCAAATGAATTAGCTCATA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24547	CCCCCCACCACACCAAACCCGAAAATTACCTCCAAATGAATTAGCTCATA	24596

BX000476.5	651	ATTTAAAATAATCCTAAAGTAAATGGAGATAATCAACTCTAAAATGCAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24597	ATTTAAAATAATCCTAAAGTAAATGGAGATAATCAACTCTAAAATGCAAA	24646

BX000476.5	701	AGATACAAAGGAAAGCAGTTTTACCTGAATGTCACAAAATCCTTATGGGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24647	AGATACAAAGGAAAGCAGTTTTACCTGAATGTCACAAAATCCTTATGGGA	24696

BX000476.5	751	AAGGGAATAAAACATCAGATACCCTGATCTGACTTTTAAAAGTCTTTTCG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24697	AAGGGAATAAAACATCAGATACCCTGATCTGACTTTTAAAAGTCTTTTCG	24746

BX000476.5	801	TGATCGACACACAGAAAGACCGACTCCTTGTGGGGCCCGGCAACGCGGCG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24747	TGATCGACACACAGAAAGACCGACTCCTTGTGGGGCCCGGCAACGCGGCG	24796

BX000476.5	851	GCACGCCCACCCGCACGGCCAGGACAGGGAACGAGGCCGCCAGCCCTGAC	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24797	GCACGCCCACCCGCACGGCCAGGACAGGGAACGAGGCCGCCAGCCCTGAC	24846

BX000476.5	901	AGTCCCTTCGGCCCCTCCGCAGTCCGCTACGGCGACGGCCCCCAGGCCTC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24847	AGTCCCTTCGGCCCCTCCGCAGTCCGCTACGGCGACGGCCCCCAGGCCTC	24896

BX000476.5	951	CTCCCCGTGGCTCCAGTTCACCTTTTCCAGGACACGGCAACGGGACCCGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24897	CTCCCCGTGGCTCCAGTTCACCTTTTCCAGGACACGGCAACGGGACCCGG	24946

BX000476.5	1001	CCATCTGCGGACTTTTAGACCTGGCTTCCCTCGCTCAGCACATGCGTGTG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24947	CCATCTGCGGACTTTTAGACCTGGCTTCCCTCGCTCAGCACATGCGTGTG	24996

BX000476.5	1051	GGACTCACACACCTTGCTCTGTGTGGATCGTCTGCCCACCTTGCTCTGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	24997	GGACTCACACACCTTGCTCTGTGTGGATCGTCTGCCCACCTTGCTCTGTG	25046

BX000476.5	1101	TGGATCGTCTGCCTGTGTACTGCTGAACCCTATTCCATTATGGCTCTGCT	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25047	TGGATCGTCTGCCTGTGTACTGCTGAACCCTATTCCATTATGGCTCTGCT	25096

BX000476.5	1151	GACCTCAGAGTAGCTCCCTGAGCAGGAAACACCGCCGGCCCCAAGGCCCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25097	GACCTCAGAGTAGCTCCCTGAGCAGGAAACACCGCCGGCCCCAAGGCCCA	25146

BX000476.5	1201	CGTGATGGTGCTGCTGAGGGGGACTCGCGAGGCAGACAAAGTCCCGAGCG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25147	CGTGATGGTGCTGCTGAGGGGGACTCGCGAGGCAGACAAAGTCCCGAGCG	25196

BX000476.5	1251	TCTACAGTCGCACAGGGCACGCCGACACCAACCGACAGGTGTGAGAGGAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25197	TCTACAGTCGCACAGGGCACGCCGACACCAACCGACAGGTGTGAGAGGAG	25246

BX000476.5	1301	AAAGGAGGACGCCACAACCACGGCCGGCAAGTTCAGCACGCGTTCCTCGG	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25247	AAAGGAGGACGCCACAACCACGGCCGGCAAGTTCAGCACGCGTTCCTCGG	25296

BX000476.5	1351	CGGGTGACGGGACAAGAGGACGATCTGCAGACACGTAAAGATGTGAAAAC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25297	CGGGTGACGGGACAAGAGGACGATCTGCAGACACGTAAAGATGTGAAAAC	25346

BX000476.5	1401	GCTGCCAAGCTATGTGAGCGAGTGACATCGCGGAGCCGGAGGAGTCTTCA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25347	GCTGCCAAGCTATGTGAGCGAGTGACATCGCGGAGCCGGAGGAGTCTTCA	25396

BX000476.5	1451	GGGTCACATGAACCAGTGGTGGGCTGTGGCTCGGAGCCCCCACCCAAGTC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25397	GGGTCACATGAACCAGTGGTGGGCTGTGGCTCGGAGCCCCCACCCAAGTC	25446

BX000476.5	1501	TCACGGGGAACTGTGATCCTGAGTGTTGGAGCAGGGCTCTGCTGGGGGGT	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25447	TCACGGGGAACTGTGATCCTGAGTGTTGGAGCAGGGCTCTGCTGGGGGGT	25496

BX000476.5	1551	GACTGGGTGATGAGGGTGGACAGCCCCCTTGCTGGTCTCGTAATCCTGAG	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25497	GACTGGGTGATGAGGGTGGACAGCCCCCTTGCTGGTCTCGTAATCCTGAG	25546

BX000476.5	1601	TTCTTGTGAGATCCGATGGTCTAAAAGTGGGTGGCAGTGGCCGGGTGCGG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25547	TTCTTGTGAGATCCGATGGTCTAAAAGTGGGTGGCAGTGGCCGGGTGCGG	25596

BX000476.5	1651	TGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGAGACGCCAAGGCGGGTGGATC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25597	TGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGAGACGCCAAGGCGGGTGGATC	25646

BX000476.5	1701	ACCCGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACATGGTGAAACCCCA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25647	ACCCGAGGTCAAGAGTTCGAGACCAGCATGGCCAACATGGTGAAACCCCA	25696

BX000476.5	1751	TCTCTCCTAAAAATACACAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25697	TCTCTCCTAAAAATACACAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTA	25746

BX000476.5	1801	ATCCCAGCTACCCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCAGGAG	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25747	ATCCCAGCTACCCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCAGGAG	25796

BX000476.5	1851	GCGGAGGTTGCAGTGAGGTGAGATGGTGCCATTGCACTCCAGCTTGGGTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25797	GCGGAGGTTGCAGTGAGGTGAGATGGTGCCATTGCACTCCAGCTTGGGTG	25846

BX000476.5	1901	ACAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAAAAAGAGAAAAGATGATACAGAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25847	ACAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAAAAAGAGAAAAGATGATACAGAC	25896

BX000476.5	1951	AGCCTGTGTTTATTGAAACAATTCATGCTGTCATTAAAAACCTTCCCACA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511099.12	25897	AGCCTGTGTTTATTGAAACAATTCATGCTGTCATTAAAAACCTTCCCACA	25946

Overview

Query
BX000476.5 - 33340 bps
Hit
BX511099.12 - 25946 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link