<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927102.12	164616	CTCCCCTTCAGCTCCGTGGAGAACGTGTTGAAGACGCTAGTCAAAAGCTG	164665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1	CTCCCCTTCAGCTCCGTGGAGAACGTGTTGAAGACGCTAGTCAAAAGCTG	50

BX927102.12	164666	CAGAGTGTAAGTGCTCTTTCAATCCTCTGTCATTCACTAATGTGCCTATA	164715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	51	CAGAGTGTAAGTGCTCTTTCAATCCTCTGTCATTCACTAATGTGCCTATA	100

BX927102.12	164716	AATGTTCAACCCCTTTCACAAAGGAATTGCACATTGTGTTAATCAGCTTT	164765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	101	AATGTTCAACCCCTTTCACAAAGGAATTGCACATTGTGTTAATCAGCTTT	150

BX927102.12	164766	CCGTCGAGCTGGTGAAAGAATCATGTAATCAGGCCGTTGTTAGACAAGCC	164815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	151	CCGTCGAGCTGGTGAAAGAATCATGTAATCAGGCCGTTGTTAGACAAGCC	200

BX927102.12	164816	CACAGCTTTCACACTGAGCCGATTACAGCTCTCTTAACACATTATACTGT	164865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	201	CACAGCTTTCACACTGAGCCGATTACAGCTCTCTTAACACATTATACTGT	250

BX927102.12	164866	CGACCCGTTTTATTCATATAACAACCTCTTTTCATCATTTCGCAAGAGCT	164915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	251	CGACCCGTTTTATTCATATAACAACCTCTTTTCATCATTTCGCAAGAGCT	300

BX927102.12	164916	CACATAACAAATAAACAACCGTGGAGCTGAGGAAATGACATGTGATTTTG	164965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	301	CACATAACAAATAAACAACCGTGGAGCTGAGGAAATGACATGTGATTTTG	350

BX927102.12	164966	CTATCAGAATGTCACATAATGTGTGTGTGTGTGTAGATATTTTCCTGAAT	165015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	351	CTATCAGAATGTCACATAATGTGTGTGTGTGTGTAGATATTTTCCTGAAT	400

BX927102.12	165016	CGGCCACACAGGAGATGCTGGATGAGTGGCGACCATTACTATGTCCGTTT	165065
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	401	CGGCCACACAGGAGATGCTGGATGAGTGGCGACCATTACTATGTCCGTTT	450

BX927102.12	165066	GATGTCACTATGCAGAAGGCCATTGGCTACTTTGAGCTCTTCTTGCCCAC	165115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	451	GATGTCACTATGCAGAAGGCCATTGGCTACTTTGAGCTCTTCTTGCCCAC	500

BX927102.12	165116	CATTATGCCCCCTGAACAGCACGACAAAGGCTTCAAGTATGTACAACTAG	165165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	501	CATTATGCCCCCTGAACAGCACGACAAAGGCTTCAAGTATGTACAACTAG	550

BX927102.12	165166	CAGTGAAATAAGTGTTGCACTCAAATGAGAAATGGCTCGATAGTGATTAA	165215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	551	CAGTGAAATAAGTGTTGCACTCAAATGAGAAATGGCTCGATAGTGATTAA	600

BX927102.12	165216	AGGATAGTTCACTCCAAAACTAAAATTTACTCCGTATTTACTCTGTCTCT	165265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	601	AGGATAGTTCACTCCAAAACTAAAATTTACTCCGTATTTACTCTGTCTCT	650

BX927102.12	165266	AATAGCTCCTTTTATAAGTTTCATATTTTTTTGTTGAACACTAAAGAAGA	165315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	651	AATAGCTCCTTTTATAAGTTTCATATTTTTTTGTTGAACACTAAAGAAGA	700

BX927102.12	165316	TATTTTGAAGAAAGCTGAAAACCACTGACTTCCATTGTAGGAAAAACAAA	165365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	701	TATTTTGAAGAAAGCTGAAAACCACTGACTTCCATTGTAGGAAAAACAAA	750

BX927102.12	165366	TACCATGGAAGTCAATAGTTACAGGTTTTCAACATCTTTCAAATATATTC	165415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	751	TACCATGGAAGTCAATAGTTACAGGTTTTCAACATCTTTCAAATATATTC	800

BX927102.12	165416	TTTTGTGTTTAACAGAATATAGAGAGGTTTGAATCAAGTAAAGGGTGAGT	165465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	801	TTTTGTGTTTAACAGAATATAGAGAGGTTTGAATCAAGTAAAGGGTGAGT	850

BX927102.12	165466	AAATGATGACAGAATTTTCATTTTTGGGTGAACTATCACTTTAAGTGCAA	165515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	851	AAATGATGACAGAATTTTCATTTTTGGGTGAACTATCACTTTAAGTGCAA	900

BX927102.12	165516	GCAACAAGTGTGAGTCGGGTTAATAGAGGATTTGTATGTGTGTTTTAGGT	165565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	901	GCAACAAGTGTGAGTCGGGTTAATAGAGGATTTGTATGTGTGTTTTAGGT	950

BX927102.12	165566	TATGGTTTGATGAAATGATGAATCTCTGGGTCTCAGTGCAAAACCTGCCT	165615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	951	TATGGTTTGATGAAATGATGAATCTCTGGGTCTCAGTGCAAAACCTGCCT	1000

BX927102.12	165616	GCTTGGGAGGGTGTAAGTACATCTCATTTGTCAGTTCATTTGTTAAGTGC	165665
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1001	GCTTGGGAGGGTGTAAGTACATCTCATTTGTCAGTTCATTTGTTAAGTGC	1050

BX927102.12	165666	TAAATGCTATGTGTCACATTGGCTTTCTGTGCTCTCGTTTGATCTTGCAG	165715
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1051	TAAATGCTATGTGTCACATTGGCTTTCTGTGCTCTCGTTTGATCTTGCAG	1100

BX927102.12	165716	AATCTAGTGAATCTCTTTGCACGCCTGGCTAATGACAACATTGGTTATGT	165765
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1101	AATCTAGTGAATCTCTTTGCACGCCTGGCTAATGACAACATTGGTTATGT	1150

BX927102.12	165766	GAACTGGGATCCATATATTCCCAAGGTACTGTCCTGCTGCTGTGAGAGTT	165815
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1151	GAACTGGGATCCATATATTCCCAAGGTACTGTCCTGCTGCTGTGAGAGTT	1200

BX927102.12	165816	TTGACCCTCTGAATGCATTCAATCTCTGTATACTTTTGCATTCTTATTAT	165865
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1201	TTGACCCTCTGAATGCATTCAATCTCTGTATACTTTTGCATTCTTATTAT	1250

BX927102.12	165866	GTTTAAACTCATTACTTTTTCAATTATTTTGAAATGATAAAAAAGGCCTT	165915
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1251	GTTTAAACTCATTACTTTTTCAATTATTTTGAAATGATAAAAAAGGCCTT	1300

BX927102.12	165916	CTATTCTGTGAATATTTTAACCGTAATCGTTCTGCATTTATTCTTTTTAT	165965
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1301	CTATTCTGTGAATATTTTAACCGTAATCGTTCTGCATTTATTCTTTTTAT	1350

BX927102.12	165966	TAATAAATTATGGATTAATTTCTTTCAGGTATCAAATTACTTATGATTGG	166015
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1351	TAATAAATTATGGATTAATTTCTTTCAGGTATCAAATTACTTATGATTGG	1400

BX927102.12	166016	GGCCAGACAGAATCTGTGGACGTTTTTTTACTATTTCTGTAGAGAATTGT	166065
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1401	GGCCAGACAGAATCTGTGGACGTTTTTTTACTATTTCTGTAGAGAATTGT	1450

BX927102.12	166066	GTAAAATATCAGCAGATTTATGCAGAATAATTTTAAGAGTATCATAACTA	166115
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1451	GTAAAATATCAGCAGATTTATGCAGAATAATTTTAAGAGTATCATAACTA	1500

BX927102.12	166116	AACTTAATAAATAAAATAAAAAAATACCTGTTTAGCTTTTATTAAATCTC	166165
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1501	AACTTAATAAATAAAATAAAAAAATACCTGTTTAGCTTTTATTAAATCTC	1550

BX927102.12	166166	TACAGTGCAAGTTCAGTTAAATCTACTTATTTAGTAAACAAAGCAAGTCT	166215
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1551	TACAGTGCAAGTTCAGTTAAATCTACTTATTTAGTAAACAAAGCAAGTCT	1600

BX927102.12	166216	CTCTGATTGTGTTATATCTCTTAAAAGACTTCTCTTTTCCCAAGTATAAA	166265
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1601	CTCTGATTGTGTTATATCTCTTAAAAGACTTCTCTTTTCCCAAGTATAAA	1650

BX927102.12	166266	TAGGAATAGGCTACATATTGTGTTCATCCAGTACTGCATAGAGAGGAAGG	166315
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1651	TAGGAATAGGCTACATATTGTGTTCATCCAGTACTGCATAGAGAGGAAGG	1700

BX927102.12	166316	AGAGTTCCGCTTATTATCAAAGAGATGCCCTGGATTATCCCCAAATGCAA	166365
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1701	AGAGTTCCGCTTATTATCAAAGAGATGCCCTGGATTATCCCCAAATGCAA	1750

BX927102.12	166366	AGATCATTTCAAGAAATCAGTGCAATTTTGATTTTCTGTGATACTTCACA	166415
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1751	AGATCATTTCAAGAAATCAGTGCAATTTTGATTTTCTGTGATACTTCACA	1800

BX927102.12	166416	CATTAACGTATGTAAACAAATCCTTAACAGAGACTGGCTGTACCTACAGA	166465
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1801	CATTAACGTATGTAAACAAATCCTTAACAGAGACTGGCTGTACCTACAGA	1850

BX927102.12	166466	CATTATAATAGGAGGTGGCCACGTGTCAAAGCAACAGACCGAAAGCGGAT	166515
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1851	CATTATAATAGGAGGTGGCCACGTGTCAAAGCAACAGACCGAAAGCGGAT	1900

BX927102.12	166516	CATGCTTTCTATTATAATGTCTATGAGCAGTATATCAAATGTATGGACAC	166565
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1901	CATGCTTTCTATTATAATGTCTATGAGCAGTATATCAAATGTATGGACAC	1950

BX927102.12	166566	ACACACACACCAAGCAGCAGCAGAGGAGAGGTGTGCCAGTCACTGAATTC	166615
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511090.8	1951	ACACACACACCAAGCAGCAGCAGAGGAGAGGTGTGCCAGTCACTGAATTC	2000

Overview

Query
BX927102.12 - 166615 bps
Hit
BX511090.8 - 49603 bps
Total alignments
14
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194920001646161666151120001
288.325209138282983741-1454654351
388.095149139880399715-1454654351
488.2517913114786115698-1454654351
5100387846969470461865387301
6100387872032721091865387301
790.916199153191153289-124519246171
887.71911774023340409-127856280341
91004083154233154315-128028281101
101004083154232154314128028281101
1190.41271982904129238128130283271
1290.99145222153732153953128132283531
1398.653674154230154303128348284211
141003470154232154301-128352284211
Short-link