<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX511014.4	152862	AGAGGCTCTCTGCCCTTGAAGGTACACCCACCATGACTCACAGAAGAGCT	152911
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1	AGAGGCTCTCTGCCCTTGAAGGTACACCCACCATGACTCACAGAAGAGCT	50

BX511014.4	152912	GGTTTTCCCCCAATACCCCGGAGGATTACTCGGCCTTTCTGCACGTATTG	152961
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	51	GGTTTTCCCCCAATACCCCGGAGGATTACTCGGCCTTTCTGCACGTATTG	100

BX511014.4	152962	AGAATCATTTGAAGCATAAACATTGAGTATTATCATAACCCAGATATGGC	153011
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	101	AGAATCATTTGAAGCATAAACATTGAGTATTATCATAACCCAGATATGGC	150

BX511014.4	153012	CAGTGATTTCTGTTGTCTGTTTTGGCAGTTTGTCTGAGATGTGCATCACT	153061
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	151	CAGTGATTTCTGTTGTCTGTTTTGGCAGTTTGTCTGAGATGTGCATCACT	200

BX511014.4	153062	ATTGTTCATCCTCATATCGCAGTTTACACTGTAAAACTGTTATTTTCAGG	153111
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	201	ATTGTTCATCCTCATATCGCAGTTTACACTGTAAAACTGTTATTTTCAGG	250

BX511014.4	153112	TTGCATCATTCCATATTCTCCTGTACAGATCTTTACATATCTACGCTTTA	153161
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	251	TTGCATCATTCCATATTCTCCTGTACAGATCTTTACATATCTACGCTTTA	300

BX511014.4	153162	TTAGTAGTGCAAGACAAAAGTGGTCATGTGACAAAAGATAGCTAAATTAG	153211
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	301	TTAGTAGTGCAAGACAAAAGTGGTCATGTGACAAAAGATAGCTAAATTAG	350

BX511014.4	153212	GATTCGTGAGATAAACATTGGAAATTATAGTTTGTTGTTAGGATCCATTG	153261
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	351	GATTCGTGAGATAAACATTGGAAATTATAGTTTGTTGTTAGGATCCATTG	400

BX511014.4	153262	TTACAGGGAGAGCCATTAACATCAATGGTATTGTTTTATTGCGCAAAAAT	153311
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	401	TTACAGGGAGAGCCATTAACATCAATGGTATTGTTTTATTGCGCAAAAAT	450

BX511014.4	153312	TATAGTAAAGAAATTTATAGTATAGAAAAATTGTAGTTAAAGATTGCTTT	153361
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	451	TATAGTAAAGAAATTTATAGTATAGAAAAATTGTAGTTAAAGATTGCTTT	500

BX511014.4	153362	ATATTATTCAAATATTCTATATTTTTATTTTAACTATGGTAACATAATTA	153411
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	501	ATATTATTCAAATATTCTATATTTTTATTTTAACTATGGTAACATAATTA	550

BX511014.4	153412	CAAATATGTCTTTGTATATGCACGCGTGTCTATTTACACTCACTGGCCAC	153461
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	551	CAAATATGTCTTTGTATATGCACGCGTGTCTATTTACACTCACTGGCCAC	600

BX511014.4	153462	TTTATTAGGTACACTTTACTAGTACCGGGTTGGACCCCGTTTTGCCTTCA	153511
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	601	TTTATTAGGTACACTTTACTAGTACCGGGTTGGACCCCGTTTTGCCTTCA	650

BX511014.4	153512	GAACTGTCTTAAAAGTAGCCATGGGTACACTGTGGTCATAAAGGGATGGA	153561
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	651	GAACTGTCTTAAAAGTAGCCATGGGTACACTGTGGTCATAAAGGGATGGA	700

BX511014.4	153562	CATGGTCAGCAACAATACTCAAGTAGGTTGTGGCATTGACATGATGCTCA	153611
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	701	CATGGTCAGCAACAATACTCAAGTAGGTTGTGGCATTGACATGATGCTCA	750

BX511014.4	153612	ATTGGTACTAATAGGCTCAAAGTTTGCAAAACTTTCATCAAAAGTTGGTC	153661
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	751	ATTGGTACTAATAGGCTCAAAGTTTGCAAAACTTTCATCAAAAGTTGGTC	800

BX511014.4	153662	ATCAGACCAGGCAATGTTTTTCCTATCTTCTATTGTGCGATTTTGGTGAG	153711
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	801	ATCAGACCAGGCAATGTTTTTCCTATCTTCTATTGTGCGATTTTGGTGAG	850

BX511014.4	153712	TCTGTGTGAATTTTGGACTCAGTTTCCTGTTCTTAGCTGACAGAACTGGC	153761
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	851	TCTGTGTGAATTTTGGACTCAGTTTCCTGTTCTTAGCTGACAGAACTGGC	900

BX511014.4	153762	ACCCGGTGTGGTCTTTTGATGCTGCAGCTCATCTGCCTCAAGGTTCAATG	153811
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	901	ACCCGGTGTGGTCTTTTGATGCTGCAGCTCATCTGCCTCAAGGTTCAATG	950

BX511014.4	153812	TGTGTTGTGCGTTCAGAGATGCTCTTCTGCATACCTCAGTTGTAACAAGT	153861
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	951	TGTGTTGTGCGTTCAGAGATGCTCTTCTGCATACCTCAGTTGTAACAAGT	1000

BX511014.4	153862	GGCTATTTGAGTTACTGTTGCCCTTCTATCAGCTTGAACTAGTCTGGCCA	153911
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1001	GGCTATTTGAGTTACTGTTGCCCTTCTATCAGCTTGAACTAGTCTGGCCA	1050

BX511014.4	153912	TTCTCCTCTAACCTCTGGCATCAACAAAGCATTTGCGCCAACAGAACTAC	153961
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1051	TTCTCCTCTAACCTCTGGCATCAACAAAGCATTTGCGCCAACAGAACTAC	1100

BX511014.4	153962	CGCTCACTGGATATTTTCTTTTTTTTTGGACCATTCTCTGTAAACCCTAA	154011
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1101	CGCTCACTGGATATTTTCTTTTTTTTTGGACCATTCTCTGTAAACCCTAA	1150

BX511014.4	154012	AGAGGGTTGTGCGTGAAAATCCCAGTAGATCAGCAGTTTCTGAAATACTC	154061
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1151	AGAGGGTTGTGCGTGAAAATCCCAGTAGATCAGCAGTTTCTGAAATACTC	1200

BX511014.4	154062	AGACCAGCACATACTGGCACTAACAACCAAGCCACATTCAAAGTCACTTA	154111
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1201	AGACCAGCACATACTGGCACTAACAACCAAGCCACATTCAAAGTCACTTA	1250

BX511014.4	154112	AATCACATTTTCCCCCCATCCTATTGAATTTTTCACAGTATTTCCTGTAA	154161
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1251	AATCACATTTTCCCCCCATCCTATTGAATTTTTCACAGTATTTCCTGTAA	1300

BX511014.4	154162	TATGTTTTCTTCTATAGAGTCAATAAGTCTTATTTATTTTATTTTGGCTA	154211
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1301	TATGTTTTCTTCTATAGAGTCAATAAGTCTTATTTATTTTATTTTGGCTA	1350

BX511014.4	154212	TAATAAAAGTAGTTTTTAATTTTATTAAATAGGGAAATATTTTGGGAAAT	154261
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1351	TAATAAAAGTAGTTTTTAATTTTATTAAATAGGGAAATATTTTGGGAAAT	1400

BX511014.4	154262	ATTATTAGTCCCCTTAAGCATTATTATTATTATTTTTTTTATTTTAAACA	154311
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1401	ATTATTAGTCCCCTTAAGCATTATTATTATTATTTTTTTTATTTTAAACA	1450

BX511014.4	154312	AATTGGGAGGCTAATAATTTTGACTTATACATATTTATGAACTAAGAATT	154361
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1451	AATTGGGAGGCTAATAATTTTGACTTATACATATTTATGAACTAAGAATT	1500

BX511014.4	154362	ATGAAAAAAGTATGATTTGCCAGGTGTAAAAAAAAAGCAAGGTTTTATCT	154411
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1501	ATGAAAAAAGTATGATTTGCCAGGTGTAAAAAAAAAGCAAGGTTTTATCT	1550

BX511014.4	154412	TGGTTCTAGGGAAAACATTCAGACTTGTGGAATGGAAACTCAAAGTTGCG	154461
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1551	TGGTTCTAGGGAAAACATTCAGACTTGTGGAATGGAAACTCAAAGTTGCG	1600

BX511014.4	154462	AGAACTTTTATTTTTAAAGCACAGGATGCCATAAAAACCTAAGACGTTGG	154511
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1601	AGAACTTTTATTTTTAAAGCACAGGATGCCATAAAAACCTAAGACGTTGG	1650

BX511014.4	154512	TGTGTGTTGAATATGAGCTGGAGGAGGTTACTGCAGGTGTGGTGTTTGGT	154561
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1651	TGTGTGTTGAATATGAGCTGGAGGAGGTTACTGCAGGTGTGGTGTTTGGT	1700

BX511014.4	154562	CTGGTTGCAATTGTTGGCCCTGGGGCTAAACAGCGTGGGAGAGACAGAGC	154611
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1701	CTGGTTGCAATTGTTGGCCCTGGGGCTAAACAGCGTGGGAGAGACAGAGC	1750

BX511014.4	154612	TGAAGGAATGGCAGCTCTCTTCTATTCCCAGTCACATTCACTTCATACCA	154661
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1751	TGAAGGAATGGCAGCTCTCTTCTATTCCCAGTCACATTCACTTCATACCA	1800

BX511014.4	154662	CAACACTGTTAAGTCATTCTTTTTATGCACTACATATGCAAGTCACAATT	154711
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1801	CAACACTGTTAAGTCATTCTTTTTATGCACTACATATGCAAGTCACAATT	1850

BX511014.4	154712	TATGTCTTAACACACTGCATGAAAGCTGAATTACTTTTAGTTCATTAGCT	154761
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1851	TATGTCTTAACACACTGCATGAAAGCTGAATTACTTTTAGTTCATTAGCT	1900

BX511014.4	154762	GAACACTATGGTTTCACTGTAGTATTGTGTGAACAGATGTTGATATGTCC	154811
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1901	GAACACTATGGTTTCACTGTAGTATTGTGTGAACAGATGTTGATATGTCC	1950

BX511014.4	154812	CTCTGGTACTATGCAGATTATAAAACTAAAACTGTCACTTGATTGAATTC	154861
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX511074.10	1951	CTCTGGTACTATGCAGATTATAAAACTAAAACTGTCACTTGATTGAATTC	2000

Overview

Query
BX511014.4 - 154861 bps
Hit
BX511074.10 - 87054 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194620001528621548611120001
291.1912619310596107881894491361
384.0794195134262134456-110256104561
484.19107221151394151614-110534107481
585.99171308153814154121110776110821
692.9524031032683577131631319421
789.89234352139648139999-131633319781
887.023586255659757221134911355341
985.57202387143142143528143377437571
1091.982743783253832915143381437541
1181.33108326146395146720-162824631391
1285.8615528832683555-163351636471
1385.831372495446254710-163399636451
1486.651152438041880660-165919661651
1585.71146273149187149459175118753831
1681.941854525667157122-175118755491
1786.62180320139684140003-175861761741
1888.7820031032683577175863761741
1980.651223394520745545175863761981
2087.342714745674557218177921783861
2187.9202338149109149446-178028783741
Short-link