<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX927227.11	1	CTTTGGCCCGATTAGGCCCCGGAAGTGACAGTGGAAACGCCACTGGCCTT	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197448	CTTTGGCCCGATTAGGCCCCGGAAGTGACAGTGGAAACGCCACTGGCCTT	197497

BX927227.11	51	GGCTCGCCCTGGCTCGCTCGCTTTAGGCGCGATAGTGGAAACGCGGCTAG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197498	GGCTCGCCCTGGCTCGCTCGCTTTAGGCGCGATAGTGGAAACGCGGCTAG	197547

BX927227.11	101	TGATTAGGCCTAAAATCAAAATCATTTTAACTCTTACGCATTGCCAAAAA	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197548	TGATTAGGCCTAAAATCAAAATCATTTTAACTCTTACGCATTGCCAAAAA	197597

BX927227.11	151	CAAACTGTCACTTTTTCTTCTTATAAAAAGTGAAAGTAAATAACTTGCAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197598	CAAACTGTCACTTTTTCTTCTTATAAAAAGTGAAAGTAAATAACTTGCAC	197647

BX927227.11	201	TTTTGAAAACGACATCAATTATTTTCTGTGTTTTTCATATTAAAAGGAGA	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197648	TTTTGAAAACGACATCAATTATTTTCTGTGTTTTTCATATTAAAAGGAGA	197697

BX927227.11	251	AAATGAGCAGCATCTCTTCTAAATAAATCCGCTCTTTTATATCCTGTAAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197698	AAATGAGCAGCATCTCTTCTAAATAAATCCGCTCTTTTATATCCTGTAAA	197747

BX927227.11	301	TACAGTGCATTTGTTGCATCTTCTGTAAACAAATATTTTAATGTAAATAA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197748	TACAGTGCATTTGTTGCATCTTCTGTAAACAAATATTTTAATGTAAATAA	197797

BX927227.11	351	TAATTTTATTATAATGGAAAATATGCTTTCTCAAGGCATCTCTGGTGTAA	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197798	TAATTTTATTATAATGGAAAATATGCTTTCTCAAGGCATCTCTGGTGTAA	197847

BX927227.11	401	CTTCCATTTATCGTCGATGTAGTGCAAATGTGCAACGTGTAGTTGCATTT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197848	CTTCCATTTATCGTCGATGTAGTGCAAATGTGCAACGTGTAGTTGCATTT	197897

BX927227.11	451	TTTTGAGAGGTTTCAGGGATTGGGGGGTTAGCAAGCTCGCAAAGGGTGCG	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197898	TTTTGAGAGGTTTCAGGGATTGGGGGGTTAGCAAGCTCGCAAAGGGTGCG	197947

BX927227.11	501	CCAGACCATTCCGGTGGGTTCGCAGAAGGATAAATTAGCTCTAACAGAGC	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197948	CCAGACCATTCCGGTGGGTTCGCAGAAGGATAAATTAGCTCTAACAGAGC	197997

BX927227.11	551	GGGGTCACGTAACTTCACACACTGTAGGGAAAATAATTTTAAAAATGGAC	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	197998	GGGGTCACGTAACTTCACACACTGTAGGGAAAATAATTTTAAAAATGGAC	198047

BX927227.11	601	TTGAAAAAAATGTATAGATTATAGGTTCAGAATGTTGATTTCGATTACTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198048	TTGAAAAAAATGTATAGATTATAGGTTCAGAATGTTGATTTCGATTACTT	198097

BX927227.11	651	TTTAATTAGTTGCCCAGCCCTAGTGTGAATATCTTTTATAACTGGTGTTC	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198098	TTTAATTAGTTGCCCAGCCCTAGTGTGAATATCTTTTATAACTGGTGTTC	198147

BX927227.11	701	TTGATGTGAATTTTGAAAGTATCAATTCTCTAACAGATTGAGTTGGATGT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198148	TTGATGTGAATTTTGAAAGTATCAATTCTCTAACAGATTGAGTTGGATGT	198197

BX927227.11	751	GTTGTTCTCTGTTAAAGGTGATCTGAATGTTGGAGGCATTGTTGCAGGGG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198198	GTTGTTCTCTGTTAAAGGTGATCTGAATGTTGGAGGCATTGTTGCAGGGG	198247

BX927227.11	801	TTATTGTGGCATTGCTGGCAGTAGGTTTGCTGCTCTTTGGTCTCTGGTAT	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198248	TTATTGTGGCATTGCTGGCAGTAGGTTTGCTGCTCTTTGGTCTCTGGTAT	198297

BX927227.11	851	GCCAGCAAAAAGGGATATCTGCCAAGTAAGTTCTCACTATAATTAAAAAA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198298	GCCAGCAAAAAGGGATATCTGCCAAGTAAGTTCTCACTATAATTAAAAAA	198347

BX927227.11	901	TTCTAAATGGTTAACTTTATTTAGAATGACCTAATTTTATTTTTTCTTTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198348	TTCTAAATGGTTAACTTTATTTAGAATGACCTAATTTTATTTTTTCTTTT	198397

BX927227.11	951	CCTCACAGAATTATCTGAAACGTAAGTGTAGAATTTGTTTTCTTCTTTGA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198398	CCTCACAGAATTATCTGAAACGTAAGTGTAGAATTTGTTTTCTTCTTTGA	198447

BX927227.11	1001	TGCATGCGTCTTAAAGCTTTATCTTTCATAACAAATCTCCTGAATGTAAC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198448	TGCATGCGTCTTAAAGCTTTATCTTTCATAACAAATCTCCTGAATGTAAC	198497

BX927227.11	1051	TAAATGATATAAATGATCTCTTGCAGAAAACAGAAACCGCAAGCTGTTTA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198498	TAAATGATATAAATGATCTCTTGCAGAAAACAGAAACCGCAAGCTGTTTA	198547

BX927227.11	1101	TACACAGCCTCAGACAGATGATGTGGATGAGGCTAACGTAAGTACAACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198548	TACACAGCCTCAGACAGATGATGTGGATGAGGCTAACGTAAGTACAACAG	198597

BX927227.11	1151	ATGTTGCCCATTTGTGTAAATGATATTAAACAGATTAATCTAATTCCTCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198598	ATGTTGCCCATTTGTGTAAATGATATTAAACAGATTAATCTAATTCCTCA	198647

BX927227.11	1201	GTTTTGGTTTATTCCTCTGTGTCTTTTTGTAATTGTCTCATCTGAATAGT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198648	GTTTTGGTTTATTCCTCTGTGTCTTTTTGTAATTGTCTCATCTGAATAGT	198697

BX927227.11	1251	GTTAATTGTGGAATTTATATTCACAGTTTGTTTGTTGTTGTCTCTTTCAG	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198698	GTTAATTGTGGAATTTATATTCACAGTTTGTTTGTTGTTGTCTCTTTCAG	198747

BX927227.11	1301	GGATTCAGACAGAAATCATCTTTTGTGGTGTAGCCTGTGCTCATCTGAAT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198748	GGATTCAGACAGAAATCATCTTTTGTGGTGTAGCCTGTGCTCATCTGAAT	198797

BX927227.11	1351	GAAATTCTGATTGTTGCCTAGATAAAAAAAAAAAGGTCTGCATAGGTTCA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198798	GAAATTCTGATTGTTGCCTAGATAAAAAAAAAAAGGTCTGCATAGGTTCA	198847

BX927227.11	1401	AGCACATCAGGATTTGTGTGTATGTGAAAGGTGTGACTTAGATCATAGAA	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198848	AGCACATCAGGATTTGTGTGTATGTGAAAGGTGTGACTTAGATCATAGAA	198897

BX927227.11	1451	ATGTGCAGAAAGCTTTAAAACATGCCAGGCAGATTCATTTTGCATATTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198898	ATGTGCAGAAAGCTTTAAAACATGCCAGGCAGATTCATTTTGCATATTGG	198947

BX927227.11	1501	CTTTTAGAAATGTAAAATCTGTGCATCTCTCTTTTGCAGAAATGATTAGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198948	CTTTTAGAAATGTAAAATCTGTGCATCTCTCTTTTGCAGAAATGATTAGA	198997

BX927227.11	1551	AATGTAATTTATTGAGGTACACGAGTAATTTGTGAGTGGAAAACAAATTT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	198998	AATGTAATTTATTGAGGTACACGAGTAATTTGTGAGTGGAAAACAAATTT	199047

BX927227.11	1601	AATATGGTTTAATATTGATCCTTTTGTTAATGTAATTTACTCTGATTTGT	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199048	AATATGGTTTAATATTGATCCTTTTGTTAATGTAATTTACTCTGATTTGT	199097

BX927227.11	1651	TGCATTGGTATGGATTAAAGTATCCATTTAATGTGATTCTGCACTATGAG	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199098	TGCATTGGTATGGATTAAAGTATCCATTTAATGTGATTCTGCACTATGAG	199147

BX927227.11	1701	ATGAACTTTGTGTGTTCTCCATTCAGGTAAAACAATGCCCTTTGCCCTAC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199148	ATGAACTTTGTGTGTTCTCCATTCAGGTAAAACAATGCCCTTTGCCCTAC	199197

BX927227.11	1751	ATATAAACATTTGCTGTACATTGCAGTCATGATATGTTGTTCTTTTACTT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199198	ATATAAACATTTGCTGTACATTGCAGTCATGATATGTTGTTCTTTTACTT	199247

BX927227.11	1801	CTGTTACTTTTTATGATGGTTTGCTCCGTGTTTTTGTGTTTTATACATAT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199248	CTGTTACTTTTTATGATGGTTTGCTCCGTGTTTTTGTGTTTTATACATAT	199297

BX927227.11	1851	TTCATGAAATGTAAATATCGCTTTCAAACTTTTATTGCATTTTATAGGAT	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199298	TTCATGAAATGTAAATATCGCTTTCAAACTTTTATTGCATTTTATAGGAT	199347

BX927227.11	1901	TTTAAATCAAGCTTCATTGACCTCTCTGACTTGTTCACATCTTCCCTCTT	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199348	TTTAAATCAAGCTTCATTGACCTCTCTGACTTGTTCACATCTTCCCTCTT	199397

BX927227.11	1951	ATTTTTCTTGTTTGAAGTTTTAATGTCTGACTTCCAATTCTTCTGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510918.13	199398	ATTTTTCTTGTTTGAAGTTTTAATGTCTGACTTCCAATTCTTCTGAATTC	199447

Overview

Query
BX927227.11 - 135384 bps
Hit
BX510918.13 - 199447 bps
Total alignments
21
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100192020001200011974481994471
282.111744067164672051-1482352301
377.82732513054730797-1525255081
482.851954147163672049-141096415091
581.593037713045931229-141247420171
680.77601534159041742145616457711
793.71662319138291612-146974471951
887.6210819233273518153212534131
992.056588133726133813174859749461
1081.37842762277823053183439837011
1185.221022096891569123-199265994671
1283.22661546406864221-11009021010561
1391.6110716584748638-11111601113261
1480.811574952269623190-11153891158571
1582.9199544226952323811162931168361
1685.04202409304763088411313441317641
1789.41100153718527200411319101320601
1885.3667126312353136011319741320961
1986.17175358227122306911393891397421
2086.5910218113314413332411475101476881
2188.8415824813334813359511477621480031
Short-link