<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

CR759847.4	1	AATTTGTTTGAAAACACGCCGAGTGTGTTTGGGGTCAGAAAGATTTTTTA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196696	AATTTGTTTGAAAACACGCCGAGTGTGTTTGGGGTCAGAAAGATTTTTTA	196745

CR759847.4	51	ATGTCTTTTAATGTTTTTTTTAATGTTTTTTTAATGTCTTTGAAAGATAT	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196746	ATGTCTTTTAATGTTTTTTTTAATGTTTTTTTAATGTCTTTGAAAGATAT	196795

CR759847.4	101	GCTCAGTGAACTTGCTAGACAACTTGTGGGTGCTAATAGAACTGCAACAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196796	GCTCAGTGAACTTGCTAGACAACTTGTGGGTGCTAATAGAACTGCAACAC	196845

CR759847.4	151	TTTAAATGTAACAAAGTTTCAGCAGCCATTACATCACAAGAGCCTTCAGA	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196846	TTTAAATGTAACAAAGTTTCAGCAGCCATTACATCACAAGAGCCTTCAGA	196895

CR759847.4	201	AATCATTTTTTACTTTACGTTTTAAGTAACGTTGAATTATCAAATTCAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196896	AATCATTTTTTACTTTACGTTTTAAGTAACGTTGAATTATCAAATTCAAG	196945

CR759847.4	251	TGTTGTGACAACACTAGTTGAGTGTTTAAAAAAAATCTTTGTATAAGATG	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196946	TGTTGTGACAACACTAGTTGAGTGTTTAAAAAAAATCTTTGTATAAGATG	196995

CR759847.4	301	ATTCCACAGTAATATGATTATTAGGCACACTGAATTAACGAAAGCAGGTA	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	196996	ATTCCACAGTAATATGATTATTAGGCACACTGAATTAACGAAAGCAGGTA	197045

CR759847.4	351	AATATTGGCTCTTTGGCATTCCTTTGGCTCCTTCACACAGGAGCGCCCTC	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197046	AATATTGGCTCTTTGGCATTCCTTTGGCTCCTTCACACAGGAGCGCCCTC	197095

CR759847.4	401	TGGCCTTTGGAGAAGATATACTGCTGATCACACAACAGTGCTTCCCTGAC	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197096	TGGCCTTTGGAGAAGATATACTGCTGATCACACAACAGTGCTTCCCTGAC	197145

CR759847.4	451	AAGATGTGCATTACAATCGCAACTTTGACCATTTTCGTTTGCAGTTTACT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197146	AAGATGTGCATTACAATCGCAACTTTGACCATTTTCGTTTGCAGTTTACT	197195

CR759847.4	501	TTCGATTAATCACCCAGCCCTACACTACCTTCAAATAATATAATAGGATG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197196	TTCGATTAATCACCCAGCCCTACACTACCTTCAAATAATATAATAGGATG	197245

CR759847.4	551	GTTAAAAAAAGCAGTTTGCAAAATCAAGCAGCGTAAAAAGTTACTTTGCA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197246	GTTAAAAAAAGCAGTTTGCAAAATCAAGCAGCGTAAAAAGTTACTTTGCA	197295

CR759847.4	601	CAGCTTAAAATTAGCTGGGAGAGAATGACACCTGACGCCAGACACATTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197296	CAGCTTAAAATTAGCTGGGAGAGAATGACACCTGACGCCAGACACATTAA	197345

CR759847.4	651	ATTTGCAAATGGCTCTTCCCATTCCTAAGTGAAAAATAAGCTTACAACTA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197346	ATTTGCAAATGGCTCTTCCCATTCCTAAGTGAAAAATAAGCTTACAACTA	197395

CR759847.4	701	TTACTGTAATTATACATTAATGCAATAATGGGTCAGCAGTTCAATTCACA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197396	TTACTGTAATTATACATTAATGCAATAATGGGTCAGCAGTTCAATTCACA	197445

CR759847.4	751	GAGACAACTGTGTTCAACACTAAATCCAAGCAATTTTCTCTGGAGCGAAT	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197446	GAGACAACTGTGTTCAACACTAAATCCAAGCAATTTTCTCTGGAGCGAAT	197495

CR759847.4	801	CTCGTGATCACTTTAAGACCAAGATCTGCTACTGATCAAAGCTAAACTTA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197496	CTCGTGATCACTTTAAGACCAAGATCTGCTACTGATCAAAGCTAAACTTA	197545

CR759847.4	851	CACATTAAAAAATGTCTGCTTTGAAGCATAATTTTTTAATGGGCATTTAT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197546	CACATTAAAAAATGTCTGCTTTGAAGCATAATTTTTTAATGGGCATTTAT	197595

CR759847.4	901	TGAGTTTTATTTATTGAACAGGAGTTCATAAAATCGTGATAATTATTGTT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197596	TGAGTTTTATTTATTGAACAGGAGTTCATAAAATCGTGATAATTATTGTT	197645

CR759847.4	951	CAGTTAATGAGTTTTATAGCCCAACCCCACAGAAGAGTGCTAATTTTTTT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197646	CAGTTAATGAGTTTTATAGCCCAACCCCACAGAAGAGTGCTAATTTTTTT	197695

CR759847.4	1001	GTAAATATTATTAATATTATTCATTTCCATCAGGAAATCACAAGAGAACA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197696	GTAAATATTATTAATATTATTCATTTCCATCAGGAAATCACAAGAGAACA	197745

CR759847.4	1051	GGAGAGAGTTCTCTGAGGAGCAGATGAAAGAAGGCCAGAGTGTAATCGGC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197746	GGAGAGAGTTCTCTGAGGAGCAGATGAAAGAAGGCCAGAGTGTAATCGGC	197795

CR759847.4	1101	CTACAGATGGGCACCAACAAAGGGGCATCGCAAGCAGGAATGACCGGTTA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197796	CTACAGATGGGCACCAACAAAGGGGCATCGCAAGCAGGAATGACCGGTTA	197845

CR759847.4	1151	CGGACGACCTCGGCAGATCCTAAACAACCAATAAAAAGCCGGATGACCTG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197846	CGGACGACCTCGGCAGATCCTAAACAACCAATAAAAAGCCGGATGACCTG	197895

CR759847.4	1201	TGATCGGTCTTTCTCAGCCCATCAGAAAGACTGACCAGTTGCATAGTCTT	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197896	TGATCGGTCTTTCTCAGCCCATCAGAAAGACTGACCAGTTGCATAGTCTT	197945

CR759847.4	1251	ACTTAAACCTTCAGCAGACCCCAGCTGGACAAAAACAATGATCATAACAC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197946	ACTTAAACCTTCAGCAGACCCCAGCTGGACAAAAACAATGATCATAACAC	197995

CR759847.4	1301	ACAGCTTAAACCAAAGTTTACAAATGCGTTGTATCATTTCAAGCAAAAAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	197996	ACAGCTTAAACCAAAGTTTACAAATGCGTTGTATCATTTCAAGCAAAAAA	198045

CR759847.4	1351	ACTAAACAAAACTGCTCTGGGTCCTTGTTTCAGAATCCAATCTTTACCCC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198046	ACTAAACAAAACTGCTCTGGGTCCTTGTTTCAGAATCCAATCTTTACCCC	198095

CR759847.4	1401	TCCCTTGAGCCAGTGTTCCATACATTCCATTTAGATCTCAATTCTATTAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198096	TCCCTTGAGCCAGTGTTCCATACATTCCATTTAGATCTCAATTCTATTAT	198145

CR759847.4	1451	GGCGCAGACAGACATACATTCCATTATTCTATTATTAACATTCCAGAGAA	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198146	GGCGCAGACAGACATACATTCCATTATTCTATTATTAACATTCCAGAGAA	198195

CR759847.4	1501	ACGCACTCTGCTGCACACCATGGGAACAAAAAGCCTGTAAGGTAAATTTG	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198196	ACGCACTCTGCTGCACACCATGGGAACAAAAAGCCTGTAAGGTAAATTTG	198245

CR759847.4	1551	GCTTCGCACAGTCAGGTGTTTGTCTTGTCTTGTGTTTCTGTAGATTAAAT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198246	GCTTCGCACAGTCAGGTGTTTGTCTTGTCTTGTGTTTCTGTAGATTAAAT	198295

CR759847.4	1601	TTGTATGCTCGGCTATAAACTTATTTTGTGATCTAAAAAAAATCAATACA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198296	TTGTATGCTCGGCTATAAACTTATTTTGTGATCTAAAAAAAATCAATACA	198345

CR759847.4	1651	AATCTAGATCTTCACATCATTATGTTTATACATTGTATATGAGTAACTAA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198346	AATCTAGATCTTCACATCATTATGTTTATACATTGTATATGAGTAACTAA	198395

CR759847.4	1701	TAATTGATTTTGCTAATAAAATTCAGTTAATAAAAGTCTCAGTTGTGTTT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198396	TAATTGATTTTGCTAATAAAATTCAGTTAATAAAAGTCTCAGTTGTGTTT	198445

CR759847.4	1751	CATTTAGCTTCCTTTGTCTCACACTGACAATTACGTAACCGTTCCGGTAG	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198446	CATTTAGCTTCCTTTGTCTCACACTGACAATTACGTAACCGTTCCGGTAG	198495

CR759847.4	1801	TTACAGATGCCAGATAAGATTTTCTCCCACCCCTCTGACCCAAAAATATT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198496	TTACAGATGCCAGATAAGATTTTCTCCCACCCCTCTGACCCAAAAATATT	198545

CR759847.4	1851	TCTTGCTTCATCTCTTTATGCAGTCTGAGCTTTCTGCTTTTACTGAAAAA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198546	TCTTGCTTCATCTCTTTATGCAGTCTGAGCTTTCTGCTTTTACTGAAAAA	198595

CR759847.4	1901	AGGTCATGCTTTAGTTGTGGAAGAAGGAAAACAGAACTGAGCAGAAGAAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198596	AGGTCATGCTTTAGTTGTGGAAGAAGGAAAACAGAACTGAGCAGAAGAAA	198645

CR759847.4	1951	AAGAGGGAGTGAGAGAGTAAGAGGCTGATCTGAGCGCTGACATGGAATTC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510647.10	198646	AAGAGGGAGTGAGAGAGTAAGAGGCTGATCTGAGCGCTGACATGGAATTC	198695

Overview

Query
CR759847.4 - 22543 bps
Hit
BX510647.10 - 198695 bps
Total alignments
6
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194720001200011966961986951
287.3414724571267370-11176481178921
387.1813222969067134-11185181187511
481.67781843433361611325021326811
587.081001891015010338-11427321429091
68195296100481034311878671881661
Short-link