<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 1940 bps / non-identical: 150 bps

Full alignment

BX255933.7	229684	AACCCTGTTTCTTATCGTTTGTATCTTCCTCGTTCACTTAGAATTAATCC	229733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1	AACCCTGTTTCTTATCGTTTGTATCTTCCTCGTTCACTTAGAATTAATCC	50

BX255933.7	229734	CACATTTCATGTCTCTTTATTAAAACCTGTCTTGTCTTCTCCCTTTGCCC	229783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	51	CACATTTCATGTCTCTTTATTAAAACCTGTCTTGTCTTCTCCCTTTGCCC	100

BX255933.7	229784	CCCCTCGCAGACCCCCTCCACCTCCCAGGATCATTGACGGCCAGCCAGCC	229833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	101	CCCCTCGCAGACCCCCTCCACCTCCCAGGATCATTGACGGCCAGCCAGCC	150

BX255933.7	229834	TACACGGTCCACCGGATACTGGACTCCAGGAGGGTCCAGAACTCACTTCA	229883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	151	TACACGGTCCACCGGATACTGGACTCCAGGAGGGTCCAGAACTCACTTCA	200

BX255933.7	229884	GTATCTGGTTGACTGGGAGGGCTACGGGCCAGAGGAGCGCTCCTGGATTC	229933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	201	GTATCTGGTTGACTGGGAGGGCTACGGGCCAGAGGAGCGCTCCTGGATTC	250

BX255933.7	229934	CTGCCAAAGACATCCTGGACCCTAGTTTAATCCGGGAGTTTCATACCCAG	229983
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	251	CTGCCAAAGACATCCTGGACCCTAGTTTAATCCGGGAGTTTCATACCCAG	300

BX255933.7	229984	AGGCCAGGGTGTTCTGGTAGGAACGTCAGGAGCCGTTCCTAAAGGAGGGG	230033
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	301	AGGCCAGGGTGTTCTGGTAGGAACGTCAGGAGCCGTTCCTAAAGGAGGGG	350

BX255933.7	230034	GTCCTGTCACCATCCTGCAGTTTGTCTCCATTCCCCTAGAGGTCCCCGTG	230083
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	351	GTCCTGTCACCATCCTGCAGTTTGTCTCCATTCCCCTAGAGGTCCCCGTG	400

BX255933.7	230084	TTTCCACTCTGTATTTGTTCTTCCTCATGTGTTCTTGTTTACTTAATTTA	230133
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	401	TTTCCACTCTGTATTTGTTCTTCCTCATGTGTTCTTGTTTACTTAATTTA	450

BX255933.7	230134	GATCACCTGTGACTTGTTCCAGCCAGTGTATTTAAGTTGTCACTTTGTCT	230183
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	451	GATCACCTGTGACTTGTTCCAGCCAGTGTATTTAAGTTGTCACTTTGTCT	500

BX255933.7	230184	GTGTTCCTCACTCGGTGTTTGAGTCATCTCTGGTGAACTTGCCTTGCGTT	230233
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	501	GTGTTCCTCACTCGGTGTTTGAGTCATCTCTGGTGAACTTGCCTTGCGTT	550

BX255933.7	230234	TCCCTTGATCTCCTGAGCTACGTCTAGTAAGAGTGTTTTATTTTCCTTGT	230283
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	551	TCCCTTGATCTCCTGAGCTACGTCTAGTAAGAGTGTTTTATTTTCCTTGT	600

BX255933.7	230284	TGCTGACTGCATTAATTATCTGTTTGTTTTCTCCCCTCGTGGAGTTTTCT	230333
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	601	TGCTGACTGCATTAATTATCTGTTTGTTTTCTCCCCTCGTGGAGTTTTCT	650

BX255933.7	230334	TTACATGTTTATTATACTGTTAGAGTATTTTGTATACCTCATTCTGAGAA	230383
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	651	TTACATGTTTATTATACTGTTAGAGTATTTTGTATACCTCATTCTGAGAA	700

BX255933.7	230384	GAACCTAAGTTGTCTGTTTTGCTACCTCATTTTTGAGAAGAACCTAAGTT	230433
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	701	GAACCTAAGTTGTCTGTTTTGCTACCTCATTTTTGAGAAGAACCTAAGTT	750

BX255933.7	230434	GATCTTTTTTTTAATAAATCCTTGTTTTCTGGATTCCCTCTTGGAGTGTT	230483
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	751	GATCTTTTTTTTAATAAATCCTTGTTTTCTGGATTCCCTCTTGGAGTGTT	800

BX255933.7	230484	TTCGTTTGGGTCCAACACAACTTCCTCTGTGGCTTAGTGGTATACACATC	230533
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	801	TTCGTTTGGGTCCAACACAACTTCCTCTGTGGCTTAGTGGTATACACATC	850

BX255933.7	230534	GGTTTCCACACCAGAGACCCGGGTTCAAGACCCGGTCGTGACAATACTGG	230583
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	851	GGTTTCCACACCAGAGACCCGGGTTCAAGACCCGGTCGTGACAATACTGG	900

BX255933.7	230584	CTAAAAAACTTTGAAAATCTGTAAGTATACTTTAAAAATAGCAGAAATCA	230633
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	901	CTAAAAAACTTTGAAAATCTGTAAGTATACTTTAAAAATAGCAGAAATCA	950

BX255933.7	230634	CTCAGTCAGAATTATTAGCCCTCTTGAATTGTTAATCCCCCTGTATTTGC	230683
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	951	CTCAGTCAGAATTATTAGCCCTCTTGAATTGTTAATCCCCCTGTATTTGC	1000

BX255933.7	230684	TTTTCCCCATTTTCTGTTTAACGGGAGATTTTTTTCAACACATTTCTAAA	230733
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1001	TTTTCCCCATTTTCTGTTTAACGGGAGATTTTTTTCAACACATTTCTAAA	1050

BX255933.7	230734	CAAAATTGTTTTAATAACTTATTTCCAATTAACTAATTTCTATTATCTTT	230783
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1051	CAAAATTGTTTTAATAACTTATTTCCAATTAACTAATTTCTATTATCTTT	1100

BX255933.7	230784	GCCATGATGACAGTAAATACTATTTTACTATATATTTTAGAGATACTGGT	230833
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1101	GCCATGATGACAGTAAATACTATTTTACTATATATTTTAGAGATACTGGT	1150

BX255933.7	230834	ATTCAGCTTAATTTGCACTTTAAAGGCTTAACTAGGTTAATTAGGCAAGT	230883
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1151	ATTCAGCTTAATTTGCACTTTAAAGGCTTAACTAGGTTAATTAGGCAAGT	1200

BX255933.7	230884	TAGGGTAATTAGGGCAAATTTTTGTATAATGATGGTTTGTTCTGTAGACT	230933
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1201	TAGGGTAATTAGGGCAAATTTTTGTATAATGATGGTTTGTTCTGTAGACT	1250

BX255933.7	230934	ATCAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATAT--------	230975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
BX510310.14	1251	ATCAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1300

BX255933.7	230976	--------------------------------------------------	230975
			                                                  
BX510310.14	1301	ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1350

BX255933.7	230976	--TGCTTAAAGGGGCTAATAATTCTGTCCTTAAAATGGTTATAAAAATAG	231023
			  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1351	ATTGCTTAAAGGGGCTAATAATTCTGTCCTTAAAATGGTTATAAAAATAG	1400

BX255933.7	231024	AAAATTAAAAAATATATAAAAAATAAAACAAATAAGACTTTCAACAGAAG	231073
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1401	AAAATTAAAAAATATATAAAAAATAAAACAAATAAGACTTTCAACAGAAG	1450

BX255933.7	231074	ACAAAAATATTATAGGTACTGTGAATAATTCTTTGCTCTGTTAACATAAT	231123
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1451	ACAAAAATATTATAGGTACTGTGAATAATTCTTTGCTCTGTTAACATAAT	1500

BX255933.7	231124	TTGGTAAATATTTGAAAAAGAAAAAGTTAATAATAATAATTATTATTAAA	231173
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1501	TTGGTAAATATTTGAAAAAGAAAAAGTTAATAATAATAATTATTATTAAA	1550

BX255933.7	231174	TAATGATAATAGTTTTATAATAATTAAAAATAATTTTGACTTCAACTATA	231223
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1551	TAATGATAATAGTTTTATAATAATTAAAAATAATTTTGACTTCAACTATA	1600

BX255933.7	231224	TATACAGTTAATAACCGTAAATTTACTTTTTTTTCAGAATTTCCTGCATG	231273
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1601	TATACAGTTAATAACCGTAAATTTACTTTTTTTTCAGAATTTCCTGCATG	1650

BX255933.7	231274	ACACTACTTTTTTTTGCTTTTTGTTGAAATTACTATGATTCTTTTCAGTT	231323
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1651	ACACTACTTTTTTTTGCTTTTTGTTGAAATTACTATGATTCTTTTCAGTT	1700

BX255933.7	231324	TTTTTCCCCATCAGTTATTTACATAAGAGTTTTATGTTACAGCTAATGTT	231373
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1701	TTTTTCCCCATCAGTTATTTACATAAGAGTTTTATGTTACAGCTAATGTT	1750

BX255933.7	231374	AATGAATAATGTTTATTGCAATGCTTTAATTTATGTCAAGTACCATATTG	231423
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1751	AATGAATAATGTTTATTGCAATGCTTTAATTTATGTCAAGTACCATATTG	1800

BX255933.7	231424	TTGTTTCGTAGATTGAATGACACCTTCTACTATACTAGTATATATCACTG	231473
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1801	TTGTTTCGTAGATTGAATGACACCTTCTACTATACTAGTATATATCACTG	1850

BX255933.7	231474	CTTGCTGGAAAAGTGTAGGTAAGGACAAATTAAATTGCTTAAATCAGGGA	231523
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1851	CTTGCTGGAAAAGTGTAGGTAAGGACAAATTAAATTGCTTAAATCAGGGA	1900

BX255933.7	231524	GTGTCCAAACTCAGTCCTGGAGGGCCAGTGTCCTGCTGAGTTTAGCTCCA	231573
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1901	GTGTCCAAACTCAGTCCTGGAGGGCCAGTGTCCTGCTGAGTTTAGCTCCA	1950

BX255933.7	231574	ACTTGCTTCAACACACCTGCAAGGAAGTTTCTAGTATGTCTAGTAAGCTT	231623
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1951	ACTTGCTTCAACACACCTGCAAGGAAGTTTCTAGTATGTCTAGTAAGCTT	2000

Compact alignment

skip 1250 bps 100% identity alignment

BX255933.7	230934	ATCAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATAT--------	230975
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
BX510310.14	1251	ATCAAGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1300

BX255933.7	230976	--------------------------------------------------	230975
			                                                  
BX510310.14	1301	ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	1350

BX255933.7	230976	--TGCTTAAAGGGGCTAATAATTCTGTCCTTAAAATGGTTATAAAAATAG	231023
			  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX510310.14	1351	ATTGCTTAAAGGGGCTAATAATTCTGTCCTTAAAATGGTTATAAAAATAG	1400

skip 600 bps 100% identity alignment

Overview

Query
BX255933.7 - 231623 bps
Hit
BX510310.14 - 19216 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 1940 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link