<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX544890.7	91994	GAATTCCAAAAAGCTAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA	92043
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1	GAATTCCAAAAAGCTAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA	50

BX544890.7	92044	ATAATAATAATAATAATAATAAAGCAGAACAGTTGAATGCAGCACAAGGA	92093
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	51	ATAATAATAATAATAATAATAAAGCAGAACAGTTGAATGCAGCACAAGGA	100

BX544890.7	92094	AAACACAAATAATTAGGTTATTTGTCACTATAGTTTATTGTATTTTTCTT	92143
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	101	AAACACAAATAATTAGGTTATTTGTCACTATAGTTTATTGTATTTTTCTT	150

BX544890.7	92144	AAAACTGAAAAAACCCTGCACTGTTTACAATCGATGATGGGAAACTGTTT	92193
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	151	AAAACTGAAAAAACCCTGCACTGTTTACAATCGATGATGGGAAACTGTTT	200

BX544890.7	92194	TGCTGTTTACTGGCACAGAATGAACTACTTATCTACTGTTTTCTTCAGAA	92243
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	201	TGCTGTTTACTGGCACAGAATGAACTACTTATCTACTGTTTTCTTCAGAA	250

BX544890.7	92244	AACACACACAAGGGAAAACTCATTAGCATTTAGCATTCGAATGTGCTATG	92293
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	251	AACACACACAAGGGAAAACTCATTAGCATTTAGCATTCGAATGTGCTATG	300

BX544890.7	92294	ATTTGTTATTCATGCAGCTTCTTGATAACAGCATGCGTGTCGCAGTGGTC	92343
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	301	ATTTGTTATTCATGCAGCTTCTTGATAACAGCATGCGTGTCGCAGTGGTC	350

BX544890.7	92344	ACACGGTGATTGATTGCGAAGTCATTTGCATATTTGGTACCCACCAAACG	92393
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	351	ACACGGTGATTGATTGCGAAGTCATTTGCATATTTGGTACCCACCAAACG	400

BX544890.7	92394	TCAAGATTTTATCTAGTCAAAATCTGACACAGTGACTGTAGCTAACAATA	92443
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	401	TCAAGATTTTATCTAGTCAAAATCTGACACAGTGACTGTAGCTAACAATA	450

BX544890.7	92444	AAAATCATGCAGTCTGAACGGGGCTTTATGGACTTTCATTGTCAAGGCAT	92493
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	451	AAAATCATGCAGTCTGAACGGGGCTTTATGGACTTTCATTGTCAAGGCAT	500

BX544890.7	92494	TACCTGCCTTGCCTATTGAAAAATGGCCCCTCTGAGTGTGGCTACCCAAG	92543
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	501	TACCTGCCTTGCCTATTGAAAAATGGCCCCTCTGAGTGTGGCTACCCAAG	550

BX544890.7	92544	ACTGAGGTGATATTTACCTGCAGCATTGTGCTGATGGTAATTAATAAGCT	92593
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	551	ACTGAGGTGATATTTACCTGCAGCATTGTGCTGATGGTAATTAATAAGCT	600

BX544890.7	92594	CTGGGATATTGGTAAAGTTGTGCTTCTCCGCTAGATAGAACTGGCCGTCT	92643
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	601	CTGGGATATTGGTAAAGTTGTGCTTCTCCGCTAGATAGAACTGGCCGTCT	650

BX544890.7	92644	GCAGTGAGCAGTATGTTGTAGTGTCTGCAGCTGCCAGAAGTCTCCCTGCA	92693
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	651	GCAGTGAGCAGTATGTTGTAGTGTCTGCAGCTGCCAGAAGTCTCCCTGCA	700

BX544890.7	92694	AGACCAGAAATGAAGTTCACACTTTATAGTAAGCTTATTAAATATATTTA	92743
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	701	AGACCAGAAATGAAGTTCACACTTTATAGTAAGCTTATTAAATATATTTA	750

BX544890.7	92744	CTAACATGAACTATTAATGAACAACACCTGTAAAGCATATAAATTATAGT	92793
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	751	CTAACATGAACTATTAATGAACAACACCTGTAAAGCATATAAATTATAGT	800

BX544890.7	92794	TAAACTCTTACTTATGCATTATTATAATCCATATTAAAGCTAATTAACAT	92843
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	801	TAAACTCTTACTTATGCATTATTATAATCCATATTAAAGCTAATTAACAT	850

BX544890.7	92844	TAGTTAATGCACCGTGAGCTAACAGTGATCAACTTTATCTCCCATTAACT	92893
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	851	TAGTTAATGCACCGTGAGCTAACAGTGATCAACTTTATCTCCCATTAACT	900

BX544890.7	92894	GACTTAACAAAGATGAATAAATACTGTTTGTGCATTATAAATGTATGGTC	92943
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	901	GACTTAACAAAGATGAATAAATACTGTTTGTGCATTATAAATGTATGGTC	950

BX544890.7	92944	TTATTGTAAATTCATACCCACATGATCAACTCAGGACACCGTTGATCTTA	92993
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	951	TTATTGTAAATTCATACCCACATGATCAACTCAGGACACCGTTGATCTTA	1000

BX544890.7	92994	CAAAGGGCAATTGAGAGAGCGACAACAACAATCTCGTGACAATTTACACA	93043
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1001	CAAAGGGCAATTGAGAGAGCGACAACAACAATCTCGTGACAATTTACACA	1050

BX544890.7	93044	GCGTGACTTTTCCTACTTTGCATGGAGGGATTGATATCTCTGTTTCGGCT	93093
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1051	GCGTGACTTTTCCTACTTTGCATGGAGGGATTGATATCTCTGTTTCGGCT	1100

BX544890.7	93094	GGGTCAGTTTTCCACTTTCATTTCGATAAGTTAACAGTGAAACAAATGTG	93143
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1101	GGGTCAGTTTTCCACTTTCATTTCGATAAGTTAACAGTGAAACAAATGTG	1150

BX544890.7	93144	TAACTTGATCAAACTCACCCTCCAGCCTTGGTGAACACAGAAACAGTGTA	93193
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1151	TAACTTGATCAAACTCACCCTCCAGCCTTGGTGAACACAGAAACAGTGTA	1200

BX544890.7	93194	TTTTCCAGTGAATTTGCCAGAGTCTCTCACCAAGAAACCGCCATCTTTGT	93243
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1201	TTTTCCAGTGAATTTGCCAGAGTCTCTCACCAAGAAACCGCCATCTTTGT	1250

BX544890.7	93244	TCTATGTTGATTTAAAAAAAATGTTGCATAGTAAACAAACATATATGGTG	93293
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1251	TCTATGTTGATTTAAAAAAAATGTTGCATAGTAAACAAACATATATGGTG	1300

BX544890.7	93294	AATTCAAGTTGGTTTCACACAATGGTTTAATAGGGTATATGCAGAAGTAT	93343
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1301	AATTCAAGTTGGTTTCACACAATGGTTTAATAGGGTATATGCAGAAGTAT	1350

BX544890.7	93344	GCAGAAGGACTTAAAATTTTTCAGTAACCTGGGTCAGATGTTTCAGGTGA	93393
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1351	GCAGAAGGACTTAAAATTTTTCAGTAACCTGGGTCAGATGTTTCAGGTGA	1400

BX544890.7	93394	ACTGTATGCTGTTACAAAATTTGCGAGTTTAAGGTCTGTTTTCTTTAAAA	93443
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1401	ACTGTATGCTGTTACAAAATTTGCGAGTTTAAGGTCTGTTTTCTTTAAAA	1450

BX544890.7	93444	ATCAACGATCTTCACTGCCTGATTGGTATACGATATAAAGTCGGTCTTAG	93493
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1451	ATCAACGATCTTCACTGCCTGATTGGTATACGATATAAAGTCGGTCTTAG	1500

BX544890.7	93494	ATTGAACAGGAAGCACTGCGTTAAATGACATTTTCTCACACCATGTCTTT	93543
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1501	ATTGAACAGGAAGCACTGCGTTAAATGACATTTTCTCACACCATGTCTTT	1550

BX544890.7	93544	AAAATATGAAAATGTATTTTACCTCAGTATATTTTAACGGACTTTCTGTG	93593
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1551	AAAATATGAAAATGTATTTTACCTCAGTATATTTTAACGGACTTTCTGTG	1600

BX544890.7	93594	CTCGCCTGCTAATGCTGACCTGATCCTGATGTGCATGTGCGTGTGAACAG	93643
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1601	CTCGCCTGCTAATGCTGACCTGATCCTGATGTGCATGTGCGTGTGAACAG	1650

BX544890.7	93644	CTTTTCATCTCGTTTTAAGCTTGAGTGCTGAAGTCTATTTAAATAATTAT	93693
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1651	CTTTTCATCTCGTTTTAAGCTTGAGTGCTGAAGTCTATTTAAATAATTAT	1700

BX544890.7	93694	ACACTCAACGGCCACTTTATTAGGTACACCTTTCAAGTACCGGGTTGGAC	93743
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1701	ACACTCAACGGCCACTTTATTAGGTACACCTTTCAAGTACCGGGTTGGAC	1750

BX544890.7	93744	CCCTTTTTTGCCTTCAGAACTGCCTTAATCCTTTGTGGCATAGATTCAAC	93793
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1751	CCCTTTTTTGCCTTCAGAACTGCCTTAATCCTTTGTGGCATAGATTCAAC	1800

BX544890.7	93794	AAGGTACTGGAAATATTCCTCAGAGATGTTGGTCCATATTGAAATATTTG	93843
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1801	AAGGTACTGGAAATATTCCTCAGAGATGTTGGTCCATATTGAAATATTTG	1850

BX544890.7	93844	TCAGCTGCACATTCATGATGCAAATCTCTCTTTTCACCACATCCCAAAGG	93893
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1851	TCAGCTGCACATTCATGATGCAAATCTCTCTTTTCACCACATCCCAAAGG	1900

BX544890.7	93894	TGCCCTATTGGATTGAGCTCTGGTGACTGTGGAGGCCATTTGAGTACAGT	93943
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1901	TGCCCTATTGGATTGAGCTCTGGTGACTGTGGAGGCCATTTGAGTACAGT	1950

BX544890.7	93944	GAATTCATTGTCATGTTCAAGAACCTAGTCTGAGATGATTGGTGCTTTAT	93993
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470212.6	1951	GAATTCATTGTCATGTTCAAGAACCTAGTCTGAGATGATTGGTGCTTTAT	2000

Overview

Query
BX544890.7 - 93993 bps
Hit
BX470212.6 - 94121 bps
Total alignments
23
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001947200091994939931120001
281.7837696469459704221185428191
384.6617436245816461771690672701
480.561253168170182016110362106801
585.3310218475847767-110367105501
680.69926319392201-110454107211
778.39983488208582432-123156235161
887.061412468208382328-132005322591
983.471673624581346174136006363681
1086.271532878215682442136063363681
1184.79671699049490662139781399511
1292.94668521172201141798418821
1382.731072628208982350144496447731
1481.071283438208982431151682520351
1586.818514475877730151857520001
1695.9563749156991642154294543671
1791.4659829375293833-161901619821
1896.2721581535015507-166629667861
19100641331537715509166630667621
2083.45671529156991720171319714631
2180.09652375925859494182375826051
2281.1810226910971365188740890101
2376.17673198209482412-189809901271
Short-link