<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

C  CR450846.7	2000	AAGCTTTGTGGTCTGCAAAGATCACTAAAATTGGACATTTGGTTTCTGGA	1951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1	AAGCTTTGTGGTCTGCAAAGATCACTAAAATTGGACATTTGGTTTCTGGA	50

C  CR450846.7	1950	GGACAATGGATAAATGCTGAGGCCTTAGCCTTAAGATTGGGCATGAGATC	1901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	51	GGACAATGGATAAATGCTGAGGCCTTAGCCTTAAGATTGGGCATGAGATC	100

C  CR450846.7	1900	AGTACGGGTGGCTGAAAGACTGTTGATTGAAATACAGGAGAATGTACCAG	1851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	101	AGTACGGGTGGCTGAAAGACTGTTGATTGAAATACAGGAGAATGTACCAG	150

C  CR450846.7	1850	TGAACATTAGATTGACTTCAGAGGAGGACGTTTCAGTATTTCCAGAGTTG	1801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	151	TGAACATTAGATTGACTTCAGAGGAGGACGTTTCAGTATTTCCAGAGTTG	200

C  CR450846.7	1800	ATTCTCTCAGCGGATACAGGAGAATGGCAGGAGACAGAAGGAGGACTTCT	1751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	201	ATTCTCTCAGCGGATACAGGAGAATGGCAGGAGACAGAAGGAGGACTTCT	250

C  CR450846.7	1750	CTCTTTTAGAATACCTCAGCCAAGTCTGTTCGAAGATGCAGGGAAAAAAA	1701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	251	CTCTTTTAGAATACCTCAGCCAAGTCTGTTCGAAGATGCAGGGAAAAAAA	300

C  CR450846.7	1700	CTCTGTATACACTTTGTGTAAAAGTAGTGCATTTCCACATGCTTGAAAGC	1651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	301	CTCTGTATACACTTTGTGTAAAAGTAGTGCATTTCCACATGCTTGAAAGC	350

C  CR450846.7	1650	CTGAAGGAATCAAAGTGGCAGACTCTTTTTGAACCAGATTCTTCTCCCAA	1601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	351	CTGAAGGAATCAAAGTGGCAGACTCTTTTTGAACCAGATTCTTCTCCCAA	400

C  CR450846.7	1600	AGGTTGCTGGAGGACCCTGTACAAACCTCCTATTGAAAAAAGGTCTGGAG	1551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	401	AGGTTGCTGGAGGACCCTGTACAAACCTCCTATTGAAAAAAGGTCTGGAG	450

C  CR450846.7	1550	ACCTTCAGTGGAGGATAGTGCATGGTATAATAGCCACAAACAGACACAGA	1501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	451	ACCTTCAGTGGAGGATAGTGCATGGTATAATAGCCACAAACAGACACAGA	500

C  CR450846.7	1500	GCACACATTGATCCACAGGTGATGGAGGGGTGTCCTTTTTGCAATATGGG	1451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	501	GCACACATTGATCCACAGGTGATGGAGGGGTGTCCTTTTTGCAATATGGG	550

C  CR450846.7	1450	AGAAACAGTGTTTCACTTATTTTTAAATTGCTCTAGATTAGAAATGTTCC	1401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	551	AGAAACAGTGTTTCACTTATTTTTAAATTGCTCTAGATTAGAAATGTTCC	600

C  CR450846.7	1400	TTTATCAACTGAATGGATACTGTCAAATGTTAGGAGAAGTTTTTACACCC	1351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	601	TTTATCAACTGAATGGATACTGTCAAATGTTAGGAGAAGTTTTTACACCC	650

C  CR450846.7	1350	AGTCTTTTTATTTATGGGCCTAAATACAACAGGAACAAGATGCATGTCCA	1301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	651	AGTCTTTTTATTTATGGGCCTAAATACAACAGGAACAAGATGCATGTCCA	700

C  CR450846.7	1300	TGTTTTATTAAATTTTATTTTTGGAAAAGCAAAATTGGCTATTTGGTTGT	1251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	701	TGTTTTATTAAATTTTATTTTTGGAAAAGCAAAATTGGCTATTTGGTTGT	750

C  CR450846.7	1250	CACGGAAAAGGAAACTGACAGGTCTGGGTTTGACTGATGTTTTTTTGGTT	1201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	751	CACGGAAAAGGAAACTGACAGGTCTGGGTTTGACTGATGTTTTTTTGGTT	800

C  CR450846.7	1200	TTTAAGGAACTTATTAAATCCCGTATTAAAATAGAATATGCGTATTATAA	1151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	801	TTTAAGGAACTTATTAAATCCCGTATTAAAATAGAATATGCGTATTATAA	850

C  CR450846.7	1150	GTTGATTGATGATTTGGACACTTTTAGATCTAAATGGTGTATTAATCAAT	1101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	851	GTTGATTGATGATTTGGACACTTTTAGATCTAAATGGTGTATTAATCAAT	900

C  CR450846.7	1100	GCCTCTGTGAAATTGGTCAAAATGGTTGTTTGGAAATACTTGTTTGATTG	1051
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	901	GCCTCTGTGAAATTGGTCAAAATGGTTGTTTGGAAATACTTGTTTGATTG	950

C  CR450846.7	1050	TTGAATGTTAGCCAGCTCTTATATATATATATATATATATATATATATAT	1001
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	951	TTGAATGTTAGCCAGCTCTTATATATATATATATATATATATATATATAT	1000

C  CR450846.7	1000	ATATATATATGTTTATTTTCTAATGTATGTATATGTATAAGGTTTGTGAT	951
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1001	ATATATATATGTTTATTTTCTAATGTATGTATATGTATAAGGTTTGTGAT	1050

C  CR450846.7	950	TTTTCATTAATGTGGTAAAAAAATGGTTGTAAATAAAGAGATTGTTAAAG	901
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1051	TTTTCATTAATGTGGTAAAAAAATGGTTGTAAATAAAGAGATTGTTAAAG	1100

C  CR450846.7	900	TCAAAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	851
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1101	TCAAAGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	1150

C  CR450846.7	850	TCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTT	801
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1151	TCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTT	1200

C  CR450846.7	800	ACAAAATCTGTGCAGAAATAGCAAAAATTAATAATAATGCTGCCTGGTCC	751
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1201	ACAAAATCTGTGCAGAAATAGCAAAAATTAATAATAATGCTGCCTGGTCC	1250

C  CR450846.7	750	TGGCCACAAGTGACTAATTAGTTATTTCTTTACATCATAATAAAATATCC	701
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1251	TGGCCACAAGTGACTAATTAGTTATTTCTTTACATCATAATAAAATATCC	1300

C  CR450846.7	700	AAGGATATTATGAATACATAGGACAGACAAACAGAAGGCGTTTTTGCAAT	651
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1301	AAGGATATTATGAATACATAGGACAGACAAACAGAAGGCGTTTTTGCAAT	1350

C  CR450846.7	650	TTCTGAAGAACACTTCTATCATGTGCGTCAACAACACTTCAGAAAAGCTG	601
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1351	TTCTGAAGAACACTTCTATCATGTGCGTCAACAACACTTCAGAAAAGCTG	1400

C  CR450846.7	600	TCAAAACGTTGTCTGTTCTTTCACAATCCCTTTAAAACGCACTTCCTAGG	551
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1401	TCAAAACGTTGTCTGTTCTTTCACAATCCCTTTAAAACGCACTTCCTAGG	1450

C  CR450846.7	550	AAAGCATATCACCAGAAACCTGATATGATAAGATAAACATCTGGCAGGTT	501
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1451	AAAGCATATCACCAGAAACCTGATATGATAAGATAAACATCTGGCAGGTT	1500

C  CR450846.7	500	ATTTCCAGATAAATAATAAGCAGCCCGTTTCTGTCACTTAGTAAAGACAT	451
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1501	ATTTCCAGATAAATAATAAGCAGCCCGTTTCTGTCACTTAGTAAAGACAT	1550

C  CR450846.7	450	ATGAAGGAATTGTAGGAGAAAAGACGTCAAACCTCGTATTTTGCTGGTCA	401
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1551	ATGAAGGAATTGTAGGAGAAAAGACGTCAAACCTCGTATTTTGCTGGTCA	1600

C  CR450846.7	400	CGTGTTCTTTGGAAGTGATGATCTGGTCCATGTCTGTGCGGATGGTGGTT	351
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1601	CGTGTTCTTTGGAAGTGATGATCTGGTCCATGTCTGTGCGGATGGTGGTT	1650

C  CR450846.7	350	TCAAGAGGAGGTCGACCTGCTTCACAGCTCTGCACTACAGCTTCATACTG	301
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1651	TCAAGAGGAGGTCGACCTGCTTCACAGCTCTGCACTACAGCTTCATACTG	1700

C  CR450846.7	300	AGCCTGAGCCTGACTCTGAACCAGGCCGTACACTGCATCTGATATCTGAA	251
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1701	AGCCTGAGCCTGACTCTGAACCAGGCCGTACACTGCATCTGATATCTGAA	1750

C  CR450846.7	250	CACAAAACACACTGGAGTAAAGCCAGGCTGCTGGAAAATAGAAAGATCTG	201
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1751	CACAAAACACACTGGAGTAAAGCCAGGCTGCTGGAAAATAGAAAGATCTG	1800

C  CR450846.7	200	ATTCCTTACAAAGCAGACTTTATACTACTAATGTGCTACACCAACGTCAA	151
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1801	ATTCCTTACAAAGCAGACTTTATACTACTAATGTGCTACACCAACGTCAA	1850

C  CR450846.7	150	TAAAATTAGGACCCTTATATTATACATATCATTGTGAATTAAAACACAAC	101
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1851	TAAAATTAGGACCCTTATATTATACATATCATTGTGAATTAAAACACAAC	1900

C  CR450846.7	100	AAAATAAAATATACAGTGCTCAGCATATACAAGTATACCCCTCACAAATC	51
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1901	AAAATAAAATATACAGTGCTCAGCATATACAAGTATACCCCTCACAAATC	1950

C  CR450846.7	50	TATCTTTTAATTTAATATTTTTATAGGATGCTATAGTTTTTTTATTTGTG	1
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  BX470198.7	1951	TATCTTTTAATTTAATATTTTTATAGGATGCTATAGTTTTTTTATTTGTG	2000

Overview

Query
CR450846.7 - 29852 bps
Hit
BX470198.7 - 217036 bps
Total alignments
24
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001940200012000-1120001
297.8946951577215866-110515106091
310047781580015877132838329151
488.222253732451524887163425638061
580.91541331754817680165301654311
693.7544962701927114-181811819061
784.781062411845318693-11066811069101
891.895374100701014311068081068811
995.2450632978629848-11068421069041
1086.7549831754617628-11071701072521
1186.671222102266922878-11170941173031
1296.2356106157541585911719751720801
1398.9246931577315865-11719891720811
141004694157751586811761201762131
1510046941577515868-11761201762131
1685.2101198226682286511830131832081
1784.2969139242762441411846651848041
1810048100157721587112044512045501
1910048981577415871-12044532045501
2083.189207226682287412046012048071
2190.492383472453824884-12048102051561
2283.211102561757217827-12048872051541
2388.6280123175591768112053482054701
2482.9107307203362064212078212081301
Short-link