<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

BX119924.8	1	GGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATTCCATCTCACAC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	41834	GGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATTCCATCTCACAC	41883

BX119924.8	51	CAGTTAGGATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	41884	CAGTTAGGATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGA	41933

BX119924.8	101	GGATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	41934	GGATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACT	41983

BX119924.8	151	AGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAAC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	41984	AGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCTAGAAC	42033

BX119924.8	201	TAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42034	TAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAG	42083

BX119924.8	251	GATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42084	GATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGT	42133

BX119924.8	301	GGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTGCCTTCT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42134	GGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTGCCTTCT	42183

BX119924.8	351	ATATGTAAGGCACATGTCCATCAATGATAGACTGAATTTAACAAACGTGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42184	ATATGTAAGGCACATGTCCATCAATGATAGACTGAATTTAACAAACGTGG	42233

BX119924.8	401	CACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGGATGAGTTCAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42234	CACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAAGGATGAGTTCAT	42283

BX119924.8	451	GTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGGAACCATCATTCTGAACAAAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42284	GTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGGAACCATCATTCTGAACAAAC	42333

BX119924.8	501	TATCACAAGGACAGAAAACCAAACACTGCACGTTCTCACTCATAGGTGGG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42334	TATCACAAGGACAGAAAACCAAACACTGCACGTTCTCACTCATAGGTGGG	42383

BX119924.8	551	AATTGAACAATGAGAACATTTGGACACAGGGTGGGGAACATCACACACCG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42384	AATTGAACAATGAGAACATTTGGACACAGGGTGGGGAACATCACACACCG	42433

BX119924.8	601	GGGCCTGTCGCGGGGTGGGGTGATAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42434	GGGCCTGTCGCGGGGTGGGGTGATAGGGGAGGGATAGCATTAGGAGAAAT	42483

BX119924.8	651	ACCTAATGTAAATGAGGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42484	ACCTAATGTAAATGAGGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACAT	42533

BX119924.8	701	GTATACATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACAGGTACCCTAGAACTT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42534	GTATACATATGTAACAAACCTGCACGTTGTGCACAGGTACCCTAGAACTT	42583

BX119924.8	751	AAAGTATAATGATTAAAAAAAAAAATCTTAAAAAAAAAAGAGGCCGGGCG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42584	AAAGTATAATGATTAAAAAAAAAAATCTTAAAAAAAAAAGAGGCCGGGCG	42633

BX119924.8	801	CGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGACAGGCGG	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42634	CGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTCAAGACAGGCGG	42683

BX119924.8	851	ATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCG	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42684	ATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCG	42733

BX119924.8	901	GTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCATAGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42734	GTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGCATAGT	42783

BX119924.8	951	GGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGAATGG	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42784	GGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCTGGAGAATGG	42833

BX119924.8	1001	TGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCA	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42834	TGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCA	42883

BX119924.8	1051	CTCCAGCCTGGGCGACTGAGTGAGACTCCATCTCTAAAAAAAAAAAAAAA	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42884	CTCCAGCCTGGGCGACTGAGTGAGACTCCATCTCTAAAAAAAAAAAAAAA	42933

BX119924.8	1101	AAAACAGAAATTAACGTCTTGGGGTCACGTGTTTACTTCTCATGTGACAG	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42934	AAAACAGAAATTAACGTCTTGGGGTCACGTGTTTACTTCTCATGTGACAG	42983

BX119924.8	1151	GCAACGAAAAGAGAGTAGGACACCTGAATGTGCTTTGTACTAAGGAGTGG	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	42984	GCAACGAAAAGAGAGTAGGACACCTGAATGTGCTTTGTACTAAGGAGTGG	43033

BX119924.8	1201	TATTAAGAACTCGGAAACTGACCGTTGAAGGTTCTCGGGAGCTGAACCTG	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43034	TATTAAGAACTCGGAAACTGACCGTTGAAGGTTCTCGGGAGCTGAACCTG	43083

BX119924.8	1251	AGGCCTCCTATATGTAAGGCACACGTTCTATCACTGAACTACATCTCCTC	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43084	AGGCCTCCTATATGTAAGGCACACGTTCTATCACTGAACTACATCTCCTC	43133

BX119924.8	1301	ATGCCAAGAGATATTTGTGTCGTCCTCCAAGTACTATTGCAGTATATGAA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43134	ATGCCAAGAGATATTTGTGTCGTCCTCCAAGTACTATTGCAGTATATGAA	43183

BX119924.8	1351	AACAATAAAAATATGGAAATAAAAAATAACTTAAAAATTAAAAAGGTGGC	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43184	AACAATAAAAATATGGAAATAAAAAATAACTTAAAAATTAAAAAGGTGGC	43233

BX119924.8	1401	CGGGCACGGTAGCTCACGCTTGTAATCGCAGCAGTTTGGAAGTTGGAGGC	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43234	CGGGCACGGTAGCTCACGCTTGTAATCGCAGCAGTTTGGAAGTTGGAGGC	43283

BX119924.8	1451	GGTCAGATCATTTAAGGTCAGAAGTTCGAGGCCAGCCGAGCCAACAAGGT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43284	GGTCAGATCATTTAAGGTCAGAAGTTCGAGGCCAGCCGAGCCAACAAGGT	43333

BX119924.8	1501	GAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCAC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43334	GAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCAC	43383

BX119924.8	1551	GTGCCTGTAACCCCAGCTGCTCAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43384	GTGCCTGTAACCCCAGCTGCTCAGAGGTTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAA	43433

BX119924.8	1601	CCTGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCGGAGATGGCGCCACTGCACTCCAG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43434	CCTGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCGGAGATGGCGCCACTGCACTCCAG	43483

BX119924.8	1651	CCTTGGGGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAACAAACAAAAACC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43484	CCTTGGGGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAACAAACAAACAAAAACC	43533

BX119924.8	1701	CAAAAACCCTAAAAAGGTATTTCTCCAATCTAAAGATGTAAAAAATTAAA	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43534	CAAAAACCCTAAAAAGGTATTTCTCCAATCTAAAGATGTAAAAAATTAAA	43583

BX119924.8	1751	TAAAATGAAAAATAAAGGAATATCTCGTTATATTCTGTGGGTCTCCATTC	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43584	TAAAATGAAAAATAAAGGAATATCTCGTTATATTCTGTGGGTCTCCATTC	43633

BX119924.8	1801	CTGTGTTCATTGTTTTAGCACTAAGTGTTGGGTTTAGAAGCAGGATTTGT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43634	CTGTGTTCATTGTTTTAGCACTAAGTGTTGGGTTTAGAAGCAGGATTTGT	43683

BX119924.8	1851	GACCATTTTAAGTTGGAAGACCCCCAGCTGTGGGGGATATTGAAGTTTTG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43684	GACCATTTTAAGTTGGAAGACCCCCAGCTGTGGGGGATATTGAAGTTTTG	43733

BX119924.8	1901	GCAAATAAAGCTTGAAATGGAACGCAGAATACTGGAAACTTGCGTTAGAA	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43734	GCAAATAAAGCTTGAAATGGAACGCAGAATACTGGAAACTTGCGTTAGAA	43783

BX119924.8	1951	AACTGACCAGCTTTTTCCTGAATAAAGCACTTCTGCTATTGCTGTTTGCT	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470194.8	43784	AACTGACCAGCTTTTTCCTGAATAAAGCACTTCTGCTATTGCTGTTTGCT	43833

Overview

Query
BX119924.8 - 92058 bps
Hit
BX470194.8 - 43833 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link