<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL953914.11	1	GAATTCCTAAAGGCTTCGGTTGTCTTCGCTTAGCAGACTTTCACTGTTGC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117484	GAATTCCTAAAGGCTTCGGTTGTCTTCGCTTAGCAGACTTTCACTGTTGC	117533

AL953914.11	51	TTTCAATTACACATCAAAATCTTTATTGCAAAAAAGCAGAAAGCTCAGGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117534	TTTCAATTACACATCAAAATCTTTATTGCAAAAAAGCAGAAAGCTCAGGC	117583

AL953914.11	101	AGTGATGAGTCTTTCTGGCTAAGGTTTCAGTCCTCTGTTTAAATTACATT	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117584	AGTGATGAGTCTTTCTGGCTAAGGTTTCAGTCCTCTGTTTAAATTACATT	117633

AL953914.11	151	TAGAGATAAAAGATAAACGAGACTGCTGAACTGACGGATGCATTGACTAT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117634	TAGAGATAAAAGATAAACGAGACTGCTGAACTGACGGATGCATTGACTAT	117683

AL953914.11	201	TTCAGGCATTTAAGATGGAAAGCTTGACCTGTTTTGGGATGTTTGCCACT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117684	TTCAGGCATTTAAGATGGAAAGCTTGACCTGTTTTGGGATGTTTGCCACT	117733

AL953914.11	251	TTCAGGGAATAAAAATAAAAGTAGCATTAATATTATATTGAAATTGATTT	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117734	TTCAGGGAATAAAAATAAAAGTAGCATTAATATTATATTGAAATTGATTT	117783

AL953914.11	301	AATTGTAAATCAAATGAGCTGTTGATGTTATTTAAAAGCTAATAAAATCC	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117784	AATTGTAAATCAAATGAGCTGTTGATGTTATTTAAAAGCTAATAAAATCC	117833

AL953914.11	351	TATCCGCTTATTAAGTTGTGACATGCAATACTGTTTCTAGATACAAAACT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117834	TATCCGCTTATTAAGTTGTGACATGCAATACTGTTTCTAGATACAAAACT	117883

AL953914.11	401	AGACTCATTTGAATTCTCGATAGTTATTTATGAACACTTTATATTCATAT	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117884	AGACTCATTTGAATTCTCGATAGTTATTTATGAACACTTTATATTCATAT	117933

AL953914.11	451	CACACATTAAAAGCAAATCTTTTCTAAAATCGTGGTCATTAACTTCAGTT	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117934	CACACATTAAAAGCAAATCTTTTCTAAAATCGTGGTCATTAACTTCAGTT	117983

AL953914.11	501	TCTGAACTTGCTGCTTTCCAGACACCATTATTTTAACCAAAATATAAATT	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	117984	TCTGAACTTGCTGCTTTCCAGACACCATTATTTTAACCAAAATATAAATT	118033

AL953914.11	551	ACATCTCTGACTATCTGAGATTTAGCATAGATATAAACATTGCAATCATG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118034	ACATCTCTGACTATCTGAGATTTAGCATAGATATAAACATTGCAATCATG	118083

AL953914.11	601	GTTTTTCAATAGTATTTTCTCACAAAGTGAGCAGTATGTAAATACTATTT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118084	GTTTTTCAATAGTATTTTCTCACAAAGTGAGCAGTATGTAAATACTATTT	118133

AL953914.11	651	GTTGTTAATTTTGGCTCATTTTGAACCCTGAAAAATGGACCAAAAATAAA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118134	GTTGTTAATTTTGGCTCATTTTGAACCCTGAAAAATGGACCAAAAATAAA	118183

AL953914.11	701	AAAAAAGTGTAATTATTTATAAATCGTCCACTGTTGTTGAACACAAAAGA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118184	AAAAAAGTGTAATTATTTATAAATCGTCCACTGTTGTTGAACACAAAAGA	118233

AL953914.11	751	AGATATTTTGAAGAATGTTGGAAATCACCAGCTATTGACATCCACAATAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118234	AGATATTTTGAAGAATGTTGGAAATCACCAGCTATTGACATCCACAATAG	118283

AL953914.11	801	GAACCAAAATACTATGAAACTCACTCTGAAAATCTTCGTTTGTGTTCAAC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118284	GAACCAAAATACTATGAAACTCACTCTGAAAATCTTCGTTTGTGTTCAAC	118333

AL953914.11	851	AGAAGAAATAAACTTCTGAGAATGAGTAAACAGAATTTTTCTTTTTGGGT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118334	AGAAGAAATAAACTTCTGAGAATGAGTAAACAGAATTTTTCTTTTTGGGT	118383

AL953914.11	901	GTACTATTGCTTTAACGAGCCGATATTACACTTCTTAGTCAAGTATGACA	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118384	GTACTATTGCTTTAACGAGCCGATATTACACTTCTTAGTCAAGTATGACA	118433

AL953914.11	951	CCCTGACCTCTCTGTATTCTTCATTTGCAGACATCCCGTTTAGTGGGACT	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118434	CCCTGACCTCTCTGTATTCTTCATTTGCAGACATCCCGTTTAGTGGGACT	118483

AL953914.11	1001	CCACCTCCAGCTTATGTTTACGATGGCGATCGCGGGGATGACCAGCGTTT	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118484	CCACCTCCAGCTTATGTTTACGATGGCGATCGCGGGGATGACCAGCGTTT	118533

AL953914.11	1051	GCAGTCTGACATTGTGTCCTACTCTGACGACCCTCTGTTCTCTCCTCGTC	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118534	GCAGTCTGACATTGTGTCCTACTCTGACGACCCTCTGTTCTCTCCTCGTC	118583

AL953914.11	1101	TTCACCCGAAGGGCCGAAGCATTAGAGAGACTCCTTCATCGGGGTCCCCA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118584	TTCACCCGAAGGGCCGAAGCATTAGAGAGACTCCTTCATCGGGGTCCCCA	118633

AL953914.11	1151	GAGTCTACTAAATCAGTAAGATACTAGCTTTGATCGGTTGTTTGACACCA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118634	GAGTCTACTAAATCAGTAAGATACTAGCTTTGATCGGTTGTTTGACACCA	118683

AL953914.11	1201	AAAGTTCGTTTTAACATACACATTATTTGGTGGATGGCAAAACAGGCAAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118684	AAAGTTCGTTTTAACATACACATTATTTGGTGGATGGCAAAACAGGCAAA	118733

AL953914.11	1251	ATAAAATGAACACAGGCATTAATTATGTTTTGCCTGTATATGTACAGTAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118734	ATAAAATGAACACAGGCATTAATTATGTTTTGCCTGTATATGTACAGTAT	118783

AL953914.11	1301	ATGTTTAATTGTTTTGTTCTTTTGAGTGCTTTAAGCTATTAAATTGCATT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118784	ATGTTTAATTGTTTTGTTCTTTTGAGTGCTTTAAGCTATTAAATTGCATT	118833

AL953914.11	1351	TTATGAATCACCAAGATTCATCAGCTATCAATATTCATCTAATTAAGCAT	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118834	TTATGAATCACCAAGATTCATCAGCTATCAATATTCATCTAATTAAGCAT	118883

AL953914.11	1401	CTAATTGAATCTAATGTTCTACTGAAGATAATGATGGAAATGAAATGAGG	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118884	CTAATTGAATCTAATGTTCTACTGAAGATAATGATGGAAATGAAATGAGG	118933

AL953914.11	1451	GTGAGTGAAAGAGCTCATTTTCATTTATGGGTTTTTTCTACTTCAGCTTT	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118934	GTGAGTGAAAGAGCTCATTTTCATTTATGGGTTTTTTCTACTTCAGCTTT	118983

AL953914.11	1501	TAAGAGCCCTTTAATATTTATGCTTCCATGTAAACTTGCGTACGATCTGA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	118984	TAAGAGCCCTTTAATATTTATGCTTCCATGTAAACTTGCGTACGATCTGA	119033

AL953914.11	1551	ACTTTTGACCCCTGTATCTCTTATCTTTATTCTTTGGGTTGTCTCATATC	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119034	ACTTTTGACCCCTGTATCTCTTATCTTTATTCTTTGGGTTGTCTCATATC	119083

AL953914.11	1601	AGCATATAGGATTATGTTGTCCATAGCTGACATCTGTAAATCTGTACATG	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119084	AGCATATAGGATTATGTTGTCCATAGCTGACATCTGTAAATCTGTACATG	119133

AL953914.11	1651	AGCGGATTTGAGGTTTTACAAGGATTTACCCTGCTGAGGAAATTTCTATA	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119134	AGCGGATTTGAGGTTTTACAAGGATTTACCCTGCTGAGGAAATTTCTATA	119183

AL953914.11	1701	GTCTGGTACGGCATGTGTGTTTTTGGCTGAACCCTAAATGCGTTTGTGCT	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119184	GTCTGGTACGGCATGTGTGTTTTTGGCTGAACCCTAAATGCGTTTGTGCT	119233

AL953914.11	1751	TTTCTTCAATCTCTCACTCTGGACATTCCCAGTCGGAACTAGATGCGGAA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119234	TTTCTTCAATCTCTCACTCTGGACATTCCCAGTCGGAACTAGATGCGGAA	119283

AL953914.11	1801	AAAGGCCTGGAGATGAGGAAATGGGTGTTATCTGGGATCCTGGCCAGTGA	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119284	AAAGGCCTGGAGATGAGGAAATGGGTGTTATCTGGGATCCTGGCCAGTGA	119333

AL953914.11	1851	AGAGGCCTATCTCAGCCACTTGGAGGCGCTCTTAGTGGTGAGTAATGCAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119334	AGAGGCCTATCTCAGCCACTTGGAGGCGCTCTTAGTGGTGAGTAATGCAG	119383

AL953914.11	1901	TTTTCCTGCGTCTGTTTTACTGCCAGGTTTCTCACTAATAAGGGTCAGAG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119384	TTTTCCTGCGTCTGTTTTACTGCCAGGTTTCTCACTAATAAGGGTCAGAG	119433

AL953914.11	1951	GTCAATGTTCTAATACTGCTGAGGTTTGCAGATCACGCTCCAGATGGAGC	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470158.9	119434	GTCAATGTTCTAATACTGCTGAGGTTTGCAGATCACGCTCCAGATGGAGC	119483

Overview

Query
AL953914.11 - 151737 bps
Hit
BX470158.9 - 119483 bps
Total alignments
49
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100194420001200011174841194831
287.43171344137866138209-114161145021
382.051685046855669059114163146691
494.545111150076150186-117039171471
594.545111150101150211117039171471
685.232124776851968995117416178891
798.04471026336063461117965180661
899.1759120150084150203-117968180871
999.1759120150084150203117968180871
1098.8844896214462232117975180631
11100581128855188662117976180871
12100531098855588663-117979180871
1394.21431226334063461-117981181011
1493.2453756851868592128555286281
1598.948918855288642128640287301
1610046888857788664-128643287301
1710043886336263449-128644287311
181004287150084150170-128644287301
191004287150085150171128644287301
2098.9547956335963453140047401411
2110045856214962233-140050401341
221004892150113150204-140050401411
231004892150083150174140050401411
2498.9547956336063454-140051401451
2510044918855488644-140051401411
2610048928857388664140051401421
2710042792251522593140065401431
2882.68132318100210100527-142540428451
2991.6763849968499767-142964430471
3086.621572693018330451-152297525651
3186.9655921256112652155877559681
3292.9842577447674532157672577281
3398.8144846214862231175162752451
3495.7944958855488648-175163752571
3595.794495150085150179-175163752571
3695.7944956336363457175163752571
3795.8851978856988665175163752591
3895.794495150084150178175163752571
3995.7444946336463457-175164752571
4096.36541108855388662195467955761
4198.9443946336463457-195468955611
4296.33511098855588663-195468955761
4395.6158114150079150192-195468955811
4498.9443946336463457195468955611
4595.6158114150095150208195468955811
4610042792251522593-199809998871
4796.7742938855188643-199811999031
4892.1742114150085150198-199811999251
4992.1742114150085150198199811999251
Short-link