<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929595.5	1	GAATTCCACCGATTTTAGTACAGTCCGGGTAGCTTTTTGGTTAAGTCCCC	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	60980	GAATTCCACCGATTTTAGTACAGTCCGGGTAGCTTTTTGGTTAAGTCCCC	61029

AL929595.5	51	ATGCGCACCGAGCCTCTCTCTCACCACCTCTTCACTTTGTGTGCAACCGC	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61030	ATGCGCACCGAGCCTCTCTCTCACCACCTCTTCACTTTGTGTGCAACCGC	61079

AL929595.5	101	GCACATCCCCCCCCCTCCCCCAACCCCCCCACAATTTTTTTTTTTCCCAC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61080	GCACATCCCCCCCCCTCCCCCAACCCCCCCACAATTTTTTTTTTTCCCAC	61129

AL929595.5	151	TTCGCACACCCCCGGATATAATCTTCTGGATTTTATGATCCAAATGTTGG	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61130	TTCGCACACCCCCGGATATAATCTTCTGGATTTTATGATCCAAATGTTGG	61179

AL929595.5	201	CAGGTATGTAATAATCAACTTTGCAGCTTTAAGCTTAGTCCAAATTTAAG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61180	CAGGTATGTAATAATCAACTTTGCAGCTTTAAGCTTAGTCCAAATTTAAG	61229

AL929595.5	251	CTTGATTTTTAACTCAGGAAAAACAAAATAGTGCAATGAAAATTAAAACA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61230	CTTGATTTTTAACTCAGGAAAAACAAAATAGTGCAATGAAAATTAAAACA	61279

AL929595.5	301	GATGGATACCCAGGGGTTAGCAGGCATAAGGGGGTGAGGCCCGCCACCTG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61280	GATGGATACCCAGGGGTTAGCAGGCATAAGGGGGTGAGGCCCGCCACCTG	61329

AL929595.5	351	CTGCTCCTCCCGGAGGGGCTCCATTTGGAGAGAAGGGGTCTGGCTTGGAG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61330	CTGCTCCTCCCGGAGGGGCTCCATTTGGAGAGAAGGGGTCTGGCTTGGAG	61379

AL929595.5	401	ATAAGTGAATAGTTGCCCTTATCATTGACTCCTGGATGGATAAATCTACA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61380	ATAAGTGAATAGTTGCCCTTATCATTGACTCCTGGATGGATAAATCTACA	61429

AL929595.5	451	GATCATCCCCCATGTGCAGTTACCTGTCAGAAAAACAAGGTAGCTTTTAA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61430	GATCATCCCCCATGTGCAGTTACCTGTCAGAAAAACAAGGTAGCTTTTAA	61479

AL929595.5	501	AAAAAACAAACTATTTAACATCTTTACAATCTAACTAGATACAATATTAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61480	AAAAAACAAACTATTTAACATCTTTACAATCTAACTAGATACAATATTAA	61529

AL929595.5	551	AACATTACTACTACCAACATTTAAACACCTTGCTTTTACCCAATTATCAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61530	AACATTACTACTACCAACATTTAAACACCTTGCTTTTACCCAATTATCAG	61579

AL929595.5	601	CAAGATGTTTTCAAATAAATTACAATTATACCATTTAGTACAGTCAGTAA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61580	CAAGATGTTTTCAAATAAATTACAATTATACCATTTAGTACAGTCAGTAA	61629

AL929595.5	651	TAATTTCATACTGTTTTTATATAGGTACAGGCTAGTTATTTAATTCTTAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61630	TAATTTCATACTGTTTTTATATAGGTACAGGCTAGTTATTTAATTCTTAT	61679

AL929595.5	701	ATAAAGGATAATGGAACATTAATTATATATTTACTTTTTTATATAGTAAT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61680	ATAAAGGATAATGGAACATTAATTATATATTTACTTTTTTATATAGTAAT	61729

AL929595.5	751	ATGAAACAAAGTGTGCACTTTACAAATATTCTTTACATGCACAGCTGAAG	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61730	ATGAAACAAAGTGTGCACTTTACAAATATTCTTTACATGCACAGCTGAAG	61779

AL929595.5	801	TCAGAATAATTAGCCGCCTGTTAAATTTTAATTCTTTTATAATTTTCCCC	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61780	TCAGAATAATTAGCCGCCTGTTAAATTTTAATTCTTTTATAATTTTCCCC	61829

AL929595.5	851	ATGATGAACAGAGAAAACAGCTTTCTAAACATAACAGTTTTAATAACTGA	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61830	ATGATGAACAGAGAAAACAGCTTTCTAAACATAACAGTTTTAATAACTGA	61879

AL929595.5	901	TTTCTTTTATCTTTGCCATGATGACAGTTTCTAATCTTTTACTAGGCATC	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61880	TTTCTTTTATCTTTGCCATGATGACAGTTTCTAATCTTTTACTAGGCATC	61929

AL929595.5	951	GTTCAAGATGCTAGTATTCAGCTTAAAGTGCAATTTTAAAGGCTTAAGTA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61930	GTTCAAGATGCTAGTATTCAGCTTAAAGTGCAATTTTAAAGGCTTAAGTA	61979

AL929595.5	1001	GGTTAATTAGAACAACTAGGCAAGTTATTGTACAACAATGGTTTGTTATG	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	61980	GGTTAATTAGAACAACTAGGCAAGTTATTGTACAACAATGGTTTGTTATG	62029

AL929595.5	1051	TAGCCAATTGAAAAGAAATATTGCTTAAGGGGGCTAACAATATTGACGTT	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62030	TAGCCAATTGAAAAGAAATATTGCTTAAGGGGGCTAACAATATTGACGTT	62079

AL929595.5	1101	AAGCGTTCATTTCAGCTAAAACCAAAAACAATACGACTTTCTCTAGAAGA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62080	AAGCGTTCATTTCAGCTAAAACCAAAAACAATACGACTTTCTCTAGAAGA	62129

AL929595.5	1151	AATAATTTTAGCACAAATACTGTAGAAATTGCCACTTGAGAAATATTTGA	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62130	AATAATTTTAGCACAAATACTGTAGAAATTGCCACTTGAGAAATATTTGA	62179

AL929595.5	1201	AAAATAATAAATATTTACCAGAGGGCTAATAAATTTGCCCTCGATAGTAA	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62180	AAAATAATAAATATTTACCAGAGGGCTAATAAATTTGCCCTCGATAGTAA	62229

AL929595.5	1251	ACAACATACTTTCTGTAATTTTAATCAAAATCCAAATTAGGATGTAGGAT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62230	ACAACATACTTTCTGTAATTTTAATCAAAATCCAAATTAGGATGTAGGAT	62279

AL929595.5	1301	GGATCTCTGATCCATATACGTACATATAGCAACATTTTAAATTATAACTA	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62280	GGATCTCTGATCCATATACGTACATATAGCAACATTTTAAATTATAACTA	62329

AL929595.5	1351	AGCAGTAATATCAAAGCCCCTATGTGCTGTGAAGAAAGATACGGTATTAA	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62330	AGCAGTAATATCAAAGCCCCTATGTGCTGTGAAGAAAGATACGGTATTAA	62379

AL929595.5	1401	ATTACTCCCCCTAGTGTTGTAATTTGGGCATACAGAAAACAAAAGCGCAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62380	ATTACTCCCCCTAGTGTTGTAATTTGGGCATACAGAAAACAAAAGCGCAT	62429

AL929595.5	1451	GCAAATTTCATGCAAATCAAACTTGCACAAAATTCCTTGATGATAACTGG	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62430	GCAAATTTCATGCAAATCAAACTTGCACAAAATTCCTTGATGATAACTGG	62479

AL929595.5	1501	CTTTGTAATACAGCCTTGAGCTATATATAAAAACTTAAGATATGAAAGTA	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62480	CTTTGTAATACAGCCTTGAGCTATATATAAAAACTTAAGATATGAAAGTA	62529

AL929595.5	1551	TATCAAAGTTAGTTAGATGAGGCATTTAATTTAGAAAGGTTGTTTGTTTA	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62530	TATCAAAGTTAGTTAGATGAGGCATTTAATTTAGAAAGGTTGTTTGTTTA	62579

AL929595.5	1601	CATTAAAGGTTCAGGACACCCTGGAGAACTTTTTTTTATATATTAACAGA	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62580	CATTAAAGGTTCAGGACACCCTGGAGAACTTTTTTTTATATATTAACAGA	62629

AL929595.5	1651	TTTGTGTGTGTTGAGTCATCAGTTAAGACAATGTTAGCACCTGTCAGCTT	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62630	TTTGTGTGTGTTGAGTCATCAGTTAAGACAATGTTAGCACCTGTCAGCTT	62679

AL929595.5	1701	TAATTGTGGGGAAAACTGGATAATTTCGAGCTTTTGTCAGCTAATTTCAG	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62680	TAATTGTGGGGAAAACTGGATAATTTCGAGCTTTTGTCAGCTAATTTCAG	62729

AL929595.5	1751	CTTCCGGGTTTAAAAATTATTTTTGGGGCGGGATCAAAATCGGCAACGTA	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62730	CTTCCGGGTTTAAAAATTATTTTTGGGGCGGGATCAAAATCGGCAACGTA	62779

AL929595.5	1801	GCGAAGTACCGCAAGTGCAATGATGACGCGTCGGTTTCTCATTATAATTC	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62780	GCGAAGTACCGCAAGTGCAATGATGACGCGTCGGTTTCTCATTATAATTC	62829

AL929595.5	1851	AAAGCTGAGTTTCCTTATCCTATGAGAAGAGCCGACTGCTTAATTATTCA	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62830	AAAGCTGAGTTTCCTTATCCTATGAGAAGAGCCGACTGCTTAATTATTCA	62879

AL929595.5	1901	TGAGAGCACGACAGCACGTGCTTTCCGAAGGCAAGGCAGACGCAGACCTG	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62880	TGAGAGCACGACAGCACGTGCTTTCCGAAGGCAAGGCAGACGCAGACCTG	62929

AL929595.5	1951	CCAGACCAGTGCCAAGCTCAAGCTGTGAAACACGGACCCACGGCACTCAG	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470143.8	62930	CCAGACCAGTGCCAAGCTCAAGCTGTGAAACACGGACCCACGGCACTCAG	62979

Overview

Query
AL929595.5 - 106248 bps
Hit
BX470143.8 - 62979 bps
Total alignments
11
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
11001943200012000160980629791
285.141643715852458894110879112481
382.52125349104066104414110906112481
410030626946069521128061281221
51003061104556104616-128062281221
688.6510918516061790-154402545861
788.6830532479024842-158091581431
883.7540802467024749-158178582571
987.343195412804728587-158258588021
1081.251233152411624430-158497588161
1192.5692124102062102185-158692588121
Short-link