<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2000 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AL929458.7	135479	GGCTTGAGGTGTGTTCAGGCACAGGACATTTTACCAATTGGAAGTTAAAT	135528
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1	GGCTTGAGGTGTGTTCAGGCACAGGACATTTTACCAATTGGAAGTTAAAT	50

AL929458.7	135529	AGGAAGTTTATTAAGGGGATATTAAAGAATAATCATATTAAATTATTTAT	135578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	51	AGGAAGTTTATTAAGGGGATATTAAAGAATAATCATATTAAATTATTTAT	100

AL929458.7	135579	ACAATGAATGCATTGCAGTGTAATTTTTACATGTCTAAAACCACAAAACA	135628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	101	ACAATGAATGCATTGCAGTGTAATTTTTACATGTCTAAAACCACAAAACA	150

AL929458.7	135629	TGCACAGCTTATTTCACTTTATTCTTTGCTTTATTGAATTTTTCTATGAT	135678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	151	TGCACAGCTTATTTCACTTTATTCTTTGCTTTATTGAATTTTTCTATGAT	200

AL929458.7	135679	TGTTATTCGTTTATCGCGTCCATAGCCAGCCTATTGAGGGGTTGTAGTCT	135728
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	201	TGTTATTCGTTTATCGCGTCCATAGCCAGCCTATTGAGGGGTTGTAGTCT	250

AL929458.7	135729	TTCAAAAGTGGAGCTTTTTGCAGTTATTCACTTCATTTTGTATTTAATTA	135778
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	251	TTCAAAAGTGGAGCTTTTTGCAGTTATTCACTTCATTTTGTATTTAATTA	300

AL929458.7	135779	TGAGGTTTAAATTCTGCATTTTAGTGACATTTTAAGCACTAATCATTGCT	135828
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	301	TGAGGTTTAAATTCTGCATTTTAGTGACATTTTAAGCACTAATCATTGCT	350

AL929458.7	135829	GGATTAGCTTGTCGCATGGTGATCATAACCACACCTTTTTGATGCAACAA	135878
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	351	GGATTAGCTTGTCGCATGGTGATCATAACCACACCTTTTTGATGCAACAA	400

AL929458.7	135879	AAATATTTTCCACATTTTTGTCAAAGTGCTTACCATACTATTTTACCACA	135928
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	401	AAATATTTTCCACATTTTTGTCAAAGTGCTTACCATACTATTTTACCACA	450

AL929458.7	135929	AAGTGTTTATTTACAAATGTGCATTTGAACTGTAAAGTATTACAGTTTTA	135978
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	451	AAGTGTTTATTTACAAATGTGCATTTGAACTGTAAAGTATTACAGTTTTA	500

AL929458.7	135979	TAAGTAATGTAATGAGATTATTAGACAAATTTTAAACAAAGATACATCAA	136028
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	501	TAAGTAATGTAATGAGATTATTAGACAAATTTTAAACAAAGATACATCAA	550

AL929458.7	136029	AAATACTTATTTTTTAAAATATAAATTTATTATCATCCATCGTTTAAAAC	136078
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	551	AAATACTTATTTTTTAAAATATAAATTTATTATCATCCATCGTTTAAAAC	600

AL929458.7	136079	AAAAAACAATTAGGAATCTGTTTTAAACTTGTTTTATGTCACCTAGACAA	136128
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	601	AAAAAACAATTAGGAATCTGTTTTAAACTTGTTTTATGTCACCTAGACAA	650

AL929458.7	136129	ACAAAAAAAAGCTGGCCAGCTCATTTTCCCGGTCAGAATTTGTCCATTTG	136178
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	651	ACAAAAAAAAGCTGGCCAGCTCATTTTCCCGGTCAGAATTTGTCCATTTG	700

AL929458.7	136179	GATAATTAAAAATGTAATTTGTCTTAAAGCTGCCTTCTATTGCTTATTTT	136228
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	701	GATAATTAAAAATGTAATTTGTCTTAAAGCTGCCTTCTATTGCTTATTTT	750

AL929458.7	136229	CACAATTTATGATGTCATACTGTGAAAAAGGTGATAAATGAGCTCATATA	136278
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	751	CACAATTTATGATGTCATACTGTGAAAAAGGTGATAAATGAGCTCATATA	800

AL929458.7	136279	GCACCCAAATTCTGGACATTGTCAGTAAGGGGGGGTTGGTCTTTTGAACC	136328
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	801	GCACCCAAATTCTGGACATTGTCAGTAAGGGGGGGTTGGTCTTTTGAACC	850

AL929458.7	136329	ACACAAACCCCCTCTGGCTACGGGCCTGTTTATTACATTTTATGCATGAT	136378
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	851	ACACAAACCCCCTCTGGCTACGGGCCTGTTTATTACATTTTATGCATGAT	900

AL929458.7	136379	TCACTCGTCCCAGCAGAATAATATCAATCAATAAAGGTGAATACATTTGA	136428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	901	TCACTCGTCCCAGCAGAATAATATCAATCAATAAAGGTGAATACATTTGA	950

AL929458.7	136429	TAACACTTTATAGATGTATTCACATCAACTAGTTGCTTATTAGCATGCAT	136478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	951	TAACACTTTATAGATGTATTCACATCAACTAGTTGCTTATTAGCATGCAT	1000

AL929458.7	136479	GTTATTGAAATATTGGGTGCTTATTAGTACTTAAAAACTATATTTTCTGC	136528
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1001	GTTATTGAAATATTGGGTGCTTATTAGTACTTAAAAACTATATTTTCTGC	1050

AL929458.7	136529	ATGATCTTATTCTACATCATAGCCAATACCTAAAATACCTTAGTAATTAT	136578
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1051	ATGATCTTATTCTACATCATAGCCAATACCTAAAATACCTTAGTAATTAT	1100

AL929458.7	136579	TGAGAAAGAGCAAATGAAAAACTTATTGAAGCAAAAGTCATAGTTAATGG	136628
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1101	TGAGAAAGAGCAAATGAAAAACTTATTGAAGCAAAAGTCATAGTTAATGG	1150

AL929458.7	136629	TATGCTAATAACAAAAAGGAACCTCAAAATGAAGTGTGCCTAAATTCTTT	136678
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1151	TATGCTAATAACAAAAAGGAACCTCAAAATGAAGTGTGCCTAAATTCTTT	1200

AL929458.7	136679	CTAAATAGTGCCATTCAATCAATTCTTTAGATGCAGTGTATCACAAAATA	136728
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1201	CTAAATAGTGCCATTCAATCAATTCTTTAGATGCAGTGTATCACAAAATA	1250

AL929458.7	136729	TCACTTTAAAAAAAAAAAAAACATTGCAATGTCACATTTTTCTAATTTTG	136778
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1251	TCACTTTAAAAAAAAAAAAAACATTGCAATGTCACATTTTTCTAATTTTG	1300

AL929458.7	136779	TGTGTCCCTAATTCACATTATTAAAAATTATTAAATAAATTAAAAATTAT	136828
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1301	TGTGTCCCTAATTCACATTATTAAAAATTATTAAATAAATTAAAAATTAT	1350

AL929458.7	136829	TAAATAAATTTCATAATTCCTACATTTTTTATAGTGCATTAAAGCCAATT	136878
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1351	TAAATAAATTTCATAATTCCTACATTTTTTATAGTGCATTAAAGCCAATT	1400

AL929458.7	136879	AAGAACCCTTCATTTCTAAGTCTAACTTAACAAATGCAAACAGTGCAGTT	136928
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1401	AAGAACCCTTCATTTCTAAGTCTAACTTAACAAATGCAAACAGTGCAGTT	1450

AL929458.7	136929	CTCCAAACATCAAAGATCCCATTGAAGCCTGGAATAGCTTTCTCAACTCA	136978
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1451	CTCCAAACATCAAAGATCCCATTGAAGCCTGGAATAGCTTTCTCAACTCA	1500

AL929458.7	136979	TTGTAAACAAAACAAAGTTGCCTCAACTTAAAATTTGAAGACTCAATTTT	137028
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1501	TTGTAAACAAAACAAAGTTGCCTCAACTTAAAATTTGAAGACTCAATTTT	1550

AL929458.7	137029	TAACCCAATTACTTCACTTGACTCGATTTAAGTTGACTAAACTAAAAATA	137078
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1551	TAACCCAATTACTTCACTTGACTCGATTTAAGTTGACTAAACTAAAAATA	1600

AL929458.7	137079	TCAATAATGTTTCAATAATTTCAATAATGCTAGTTTAGATTAATATATAT	137128
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1601	TCAATAATGTTTCAATAATTTCAATAATGCTAGTTTAGATTAATATATAT	1650

AL929458.7	137129	TAACAAAATATCTTTGTCATAAAATCTTTGTCATGCATTTATGTAGATAA	137178
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1651	TAACAAAATATCTTTGTCATAAAATCTTTGTCATGCATTTATGTAGATAA	1700

AL929458.7	137179	TATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAA	137228
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1701	TATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAA	1750

AL929458.7	137229	TATAATATAATATAATATAATATAATACAATATAATATAAATAATATAAT	137278
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1751	TATAATATAATATAATATAATATAATACAATATAATATAAATAATATAAT	1800

AL929458.7	137279	ATAATATAATAAACTGTTTTAGCTTTAAGTTAATACTTAATGAGTAAATA	137328
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1801	ATAATATAATAAACTGTTTTAGCTTTAAGTTAATACTTAATGAGTAAATA	1850

AL929458.7	137329	ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAATGATGATGAC	137378
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1851	ATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAATGATGATGAC	1900

AL929458.7	137379	AAACTGTAATTTGCATATGTGGTCATATGCTGCTTAATTAATGCAGAAAC	137428
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1901	AAACTGTAATTTGCATATGTGGTCATATGCTGCTTAATTAATGCAGAAAC	1950

AL929458.7	137429	TAATATTTTAGGCTTTTTGTATGAAAACCTGGCAGATCATTAAAGAATTC	137478
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BX470134.5	1951	TAATATTTTAGGCTTTTTGTATGAAAACCTGGCAGATCATTAAAGAATTC	2000

Overview

Query
AL929458.7 - 137478 bps
Hit
BX470134.5 - 91865 bps
Total alignments
26
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2000 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
1100183420001354791374781120001
285.391022254787748101118150183681
379.99622038613186333-123309234981
494.581041669350593670-128772289371
595.061041629309193252-128776289371
686.71583084459244899128935292421
787.631793088613186438-133718340161
890.16436154395499136921369811
989.0251847489074973163376634571
1090.712213218613186451165240655621
1183.3314133354395771165264656051
129062901529115380165397654861
1386.981161932569525887166310665011
1491.6739597216872226169953700121
1583.14226531104482105012-174631751641
1694.792733263798738312178333786581
1710037702143421503181239813081
1810039802254522624181242813211
1910040839755997641181242813241
2098.8442869755697641-181259813441
2110038792254622624-181262813401
2210039802254622625-182147822261
2397.840909755297641-182149822391
2410038792254622624182149822271
2510044849756097643182149822321
2698.2149566633566390184880849351
Short-link